Cucsat.G13186 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTCCATTTTTGGTCAACATTTTTTCTCGATATTTTGACGAACTCTACAAACCAGCTTTTTTGAGCTTCCTCCACTTATCACCCTTCTTCTAAACCATCTTTTTTGCTGGTGAATTAGGGAATCTCCTGCCCACTCTGAAAAGCCCCCAACTTTCCCACTCTTTCTTGCTTTCAATCTCCTTCTATTTTTCTTCAATCTTCTTCTTCTTCTCTGTTTCATCATCCCCTTGTTGCGAAGCAACACAGAGAGCCAGAAAGAATCTGCGACATATCAGCAATCTTCTTCTCCATTGTTCAAATTTGTCCTCCCCGAGGTTTCGTTCGGGAAAGAAAATCGTTAAGAGTGGTGTTCCTTAATCAATATATGCCAGGTATTCGAAATTTCTAATGGGGTTTTTTCTTTTTCTTCAAATCTAGATCCATCCTCTACATAGCGACGGGGAATAGCTGACCGGGATGTGGAACCCTAACGTTGTTATATCGTAAATTCTTGAACTGGGTATCGGGTGAAATTGTTTTTTTCTTTTTGTTGACAATGATAGTCATGCCTGCTAATATTGGGAAGGCAGCTTCAATGAAAATTCGTTTTTGTTTACAATTTAAATTCTTAGTATTTTTAGAGCTTACGTAACTACAATGAACTGCAATTTTTTTTTTGAACTCTCTTGCAGGGTAATGTAACAAAATTATCGCTACGGGATGAACAACGAGGTTTTTGAAGCACAGGTATTGGCTGAGAAGTTATCCAAGCTCAACAATTCTCAGCAGAGCATCGAGTGTATCCTTTCTCTAATTATTATCTTTTATTTATTTCCTTTTTTTTAAAAAAATAATGCATTGCACGTTCTATAACACACCTGCCATTTACAGTTTTTGTTTGGATACCTTTTCCGCCTATGTTACTGTGTTTATAATCATGGATGTCAAAAAGCAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGAAAAAGCAATGTAATGGTTTTTATCATTTACTAATCATGTATGTACAAATTCTCTCATTGTGCCACTTATTACCTTGGAAGTAACTAGATATGTTACGAGGGTGGTGATTATCTATCAATACTCGATTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTAAACATTAATCATTTATATTAATTGAGGTATTGGGGTCTCACTCCTTGCTCATGGCTTATCCCACTGATCCTTGGGAGGCTTGCCCACCCCAATGGTTGCTTCAAGAGGCAAGGGGGGACCTTGGGAGGTGGCTTAGTAGAACCCTGACAAGTCAGCATTGATGATCAGAGTTGGTCACAGCTTACGTTTTAGGATTCTTTATTGCCTTGGAACACCTATGGATTAGGTTTTAACATGGGCTACAAGCCTACAAACCTCTAGAAAGCTGGTGATAACACAAACGCCCAAGTCCAATTTACCTTTCACAATTTGTTGTGTTCAAACTTTTCTCGACTATTATGGTTTTGGTAGGTACTCTATTTACCCAAATCAGTCAATCTCCTAGATTCATTCAACTGCTTGCAACTCAAGAGCATGCTACATACATACAAATTTTGGTAGGCGTCGCTTTTGCACACTAATTGATACTAACAATAAGGACTGTAGTAAGTATAATTCATAGTTTAGATAATTGCATCAGTTCAAATAGTGGACCAGTACGGATTTAGGGAGAGTGGACAAGTATGGCCTTATTTTTCTTCATTCTTTTCTCAATGAAAGTTGTTTCAATAAAAAATCAGGCATAGAGATTAATTAAAGTTCCATCCTATATATCCACTCACTAAACATCACTAACTTTCATACATTGTTTTATTCCAAAGAGTGTTGATCGATTCAAATAAGCTTGCCTCAAGGTTTCCTGTTTTTTTTCCTAAGCCTTTTGTTGATTTTTCATAACGAGATACGCGTCTAATTGAAATGCACTAATTTACCTTTTGTAATTTTAATTTATGTATTAGCACTTTTTATTGTTTTTTTGTTTTTACTTCCTTGTGGAGTTTGCATCCTTTGAGTGTTAGCCTTTTTCCAATACATCCATGAAAATTTCCATTTATTGTTAAAGAAAAGAGTTGATGCTTGAAGGGTGGCTCTAGGTCATGAAGCAGCCTTATGCATTGTCTTTGTAGCATCGACGGATGTAGTATAGGTCTGGGGTTCAACCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAACTTTATGCTCTTTATAATATATATATAAAACTGAAGTAATACCAATATCCGAAGCCAGCCTAGTGGTGAAATTGTCTCTCAGCCTTCTTAGACCTAGGGCATGCACAGAATACAAGGGATGAGGACCAGAGGTCTTTGCGCCATGTGTGCAACTAGGTTGAGTAATTTCAATTAAGCACTTGCCCTGCTGTGCCTTTGATTGCCTCCGCCAAGGTGTGTGCGTTATTAAATAACCCTTAATAGTTTTTTAAATAAATATGCTTATAACGTTATAACCCACCGTCTAAAGCCACGAAAAAGGCCCATCAAAGCCACACAACCTAAACATTTGTTTCTTTAGTCTATTGTGATCATGCAAATCAAACTAACTACGTGGAAAAGTTTCAATGTGAAAAATATTAGGTGCACTATGAGAGTTAAATAAGAAGTCAAATTTATCTAATGTCATGTTCAAAGCATAAATGGAGAAGTCTTTTGCAATGCCTTTGGATATAGCGTATAGGGGGAAAGGTGACAAGCTCTTTGATCACAATCGATCAAATTCTTTCAGAGCCAAATTAAAGGTTTCGATGCGGGGGAATGAAGATCCTCATATTTGTCCCATGTTGATGACTGTATTCTGATTTCTTCCCATCAGAAAAATGATGTTGAGAATCTATTTAAGTATATTCAACTTATGGAGGAAGCATCTAGATTAAATATTGACTGATACAAGTCTGAAATTGGGTATTAATTGTGACAACAACTGAGTATCTCACTTAGCAAATCACTTTAGATGCAAGGGGAGCTCAAGGGCTGCAATCTGCTTGGGTTTTCTCATAAACAATAACCCATCCTCCTTATATTTTTTGCAACTTATTATGGAAAAGACAGACAAAAATCTTCAATCATGGCAAAGCAACTTCTATCCAAGGGAGGTAGCTTACCTTTGACAAATGCCACCCTAACCAATCTTCCTGCCTACATTTCCCCCTTCATTTGCCTTCCAAAGTGGTTGCTCTCATTCAACTCTTGCAATTTCGTATAGTGTAGGAATAGGAGCATGAAGCTCTTATATCTTCTGAAGTGGAACAAGTTAAAAAAAGAAACTGGAAAGGGGGACTTGACATTATTGATTTGAAGCTTCAGAACAACGCTGTCATCTGGAATATGTGTTCCACTTGAGCTATGTGTTCAATTGGAGTGTCTTTAATTCTTATTCAGAATTTAGTCTTTCTGATGTAATTTGATTCTAGCCTTGTATTGGCAAGTTTGATATTTTTATTTTGTTTCCTTTCATGTAATTTGAGCTTTAGACTCTTTCATTATATCAATGAATGATCTTGTTTCTGTTTAAAAAAAACATTTAGAACAAAGCTCTCTTAACCAAATGGATTTGGAGCTTCTCATGTGAAAAAATGCTTTATGGAGAAAAGTGTCCATTGCTAAATTTAGCACCACCTCTTTCAATTTAAAATTGGGAAACCTTTTTAGGGTATTCCCCAAAAGTTCATGGAAGTTTATCCATAGGCATTGAGATCTTGTTTAGAAAAGCGTTGTGATCTTTAAAGCCTTTACATGTTATTGTTTGCTTTTGGGAAGATAATTGGGTAGGAGACAACCCTTTAGGTGTTTGTTTTCTAGAATAATATGTAGTCTCCTTAAAGAAAAAATCAGCTGTTGTAGATTGTTGGGACAATGTTAATCAGACATGAAATTTAGGCCTTGGAAGAGGGATATTTGATTGGGAACTTTAGCATCAAGTGAGTTTATTAGAAGAATTGGTTTCTTTAGAACGAGAGATGGAGCAAATGAAATCAAATGGAACCTAAACCTGTTCGCTCTAGCAAATTTACTTTCCTCCACACTTTGAAAACAAAGTATAAATAACAGCCCCTTGACCAATTTTATTAGGAATTAGAGCTCCCAAGGACCATTTGCTTTGGACATTTTCCCAATATTGGCCTCTCTTCACCTAGGTGTGCATCTTAGTTTAAGGACCTAAGAGTCCCTTGACCAATCATTTTTGTAACTATACTCTTAGTCTTCTTTTACTTGATTGAAATTTGAAGCTCTTTTACTGGTTCCTTTTTGTAATCTCGTGTATTCTTTCATTTTTCTCTCAATGAAAGTGTGAATTTTTTTTATTACAATTATTTTAATATCAACATATGTACACACACATCTCCTCGGTGATGTTCAAACCCGAATATATTCTTTTGTAATTATAGCCTTTACATAATAAATGAGTGGTTGGTTGTTGAAGCTCGAATTTGTTGAGGCTGGTCGAGGCTATTGATTGTATGGATTGAAACCTCCTTGAAGAAGTGCTTTGGTTTAAAGGCTTTCATTGGCAATGGATTCGATGGATTATGGGTTGAATTTGAAGCTTTAAATATTTAGTTTTTATTAATGGGCATCCTTGTGGAGAAACCTTGGCTACATGGTGGTTGAGGCAAGTTGATCCACTTCATTCATTTCTTTTTCTAATTGAAAGTGAGGTTTTTGGTTTTTTACTGGATATTGTTTATTTCAAAAGGGCTGATAAACAATTTAGCTTTGGAAAAGAAAAAATATGTTTCTGTCCTTCAATTATCTGATGGTACATTGGCCGAAGGAGTTTATTGTCAAAGAAGTTGAAATGGAGAAGGGAGATTGGGTTTGCCCGCAATGTACACTCATGAACTTTGCAAGTAACAAGAAATGTTTGCACTGTAGAGAACTTCGTCCAAAGAGAGAATTGAATCAAGGAGAATGAATGGGAATGCCCTCGTGTGCTTTTGAATTTCAGAGGAGACATGAGCTGGTGCAAGTGCAATGTTGAACGTCCTAAACAAGAAA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MILFIFDIKLALSKWCISHRKKAKQIVETWDKLFNSSQKEQRVSFLYLANDILQNSRRKGSEFVNEFWKVLPGALKYVYDHGDESGKKAVARLVNIWEERKVFGSRGQSLKDEMLGKNPPPTPLPSSNGKSSNPIKIVKRDAHSVRIKLAVGGVPEKILTAFQSVLDEHLNEDAALINCSSATHHLNQIEEDLNVSLAQGTQPRSALLDDLQDQETVIQECIRQLEGVEATRASLVSLLVEALQDQESKLELVRNQLQVARSQIELASNVRKRFTSTTVPGPSATTVDLLTEMTHATDSKLSSVQQNIISSQSPLIQAMGSFPGPKTSEEENKRAAAAAVAAKLAASTSSAQMLTSVLSSLVAEEAASMNGGLKSSGFSSLSLFSPEKRQKLEKPMPISDVSSSDGAGASFVAPMQQQMTSMPLAQSANGQPVSQANPSQASFAPPPPPVPPSLSSTPPVNQYAQSGGLMGVLPYNFGAYSLPPPPPLPPHIAMGLSRPTSQPPPQQLQQPQQSQPASSGFYRPPGIGFYGQGQQSTPPPVPRQ Homology
BLAST of Cucsat.G13186 vs. NCBI nr
Match: XP_004136608.1 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B [Cucumis sativus] >XP_031739391.1 regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B [Cucumis sativus] >KAE8651160.1 hypothetical protein Csa_001803 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 461 bits (1187), Expect = 1.73e-158 Identity = 252/252 (100.00%), Postives = 252/252 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. NCBI nr
Match: KAA0053932.1 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK25472.1 regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 442 bits (1136), Expect = 2.57e-152 Identity = 242/252 (96.03%), Postives = 245/252 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. NCBI nr
Match: XP_008443180.1 (PREDICTED: regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 442 bits (1136), Expect = 8.66e-151 Identity = 242/252 (96.03%), Postives = 245/252 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. NCBI nr
Match: XP_038904543.1 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 428 bits (1101), Expect = 1.90e-145 Identity = 234/253 (92.49%), Postives = 240/253 (94.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. NCBI nr
Match: XP_022152017.1 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Momordica charantia] >XP_022152018.1 regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 382 bits (982), Expect = 1.67e-127 Identity = 212/252 (84.13%), Postives = 223/252 (88.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LH72 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G815990 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 461 bits (1187), Expect = 1.12e-160 Identity = 252/252 (100.00%), Postives = 252/252 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DPK3 (Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G006180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 442 bits (1136), Expect = 1.24e-152 Identity = 242/252 (96.03%), Postives = 245/252 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7H0 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486842 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 442 bits (1136), Expect = 4.19e-151 Identity = 242/252 (96.03%), Postives = 245/252 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DF20 (regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019832 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 382 bits (982), Expect = 8.07e-128 Identity = 212/252 (84.13%), Postives = 223/252 (88.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G13186 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F7Z5 (actin cytoskeleton-regulatory complex protein pan-1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441698 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 374 bits (961), Expect = 5.20e-126 Identity = 212/254 (83.46%), Postives = 224/254 (88.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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