CmaCh09G008120 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview


Name	CmaCh09G008120
Type	gene
Organism	Cucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	Unknown protein
Location	Cma_Chr09: 3969110 .. 3976507 (+)
RNA-Seq Expression	CmaCh09G008120
Synteny	CmaCh09G008120

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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ATGGGTGTAGCAAACGCTTTGATCAGGCCCAGAACTTGGATGTCGACGTCGAGGGAGGCGGGGCGGGGCAGGGCAGGGCAGGGCAGGGCGGTTTGATACAAAATCTGAGTCAATGGGCTGTGGCTCAATTCTCCGGCCCCTTCCCTTTCAAAATGCTCTTTTTTCCATGTGGGTATTGGCTTTTTCAGGTTTTGGACGCCATGGAAAGCAGAGAAAGGTGCAGAAAAGATGGCGTAGGTGAGACCCAATTCCCATCCCGTTTCTTGTTTCTTGCCCACTTCGTTTACTTGTCCTTTCCTTCCTTCTTTGGATCTTTCCTTCTCTCACTGTTCTTGTACTGTATGGACTGTAAATTTTTAATCAAATTCTTTCCTCTCTCTCTCCTCCTCTGAATTAAATTTTAAATGAGAACTGAGGAGAGAGAAGAAAGAACTAAGCTGCTTTTTAAGCATTGGTTTAAGCTATGAATGAGAAACAAAGTGGTGGTATGGAAAGTGCGGATTTTGAATATAAGCTATCAACTAATTCGGGTACTGGGTGGTGTGTCAGCAGAATGTTGGCCCCCGAAGAAGTGAATTGTAAGATCCCACATTGGTTAGAACGAAATAAAAATCTTTCCTTGGCAAAAACGTTTTAAAACCTTAAGAAAAAATCTCGAGATTACCATATTTACTAAGTGGTGGACTTAGACTGTCACAAATTTTTTTAAATAAAATATTACAAAAAATGATTATGGATTTATAAAATATTCTACAAAATCTTTATATTTTAAATCAAATTTCATAATTCTATCTGATCAAAGAAACATTATTATTATTTTAAGATAATAAATAATGAGATAAAAGAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAACAGGGATTAGATAAGATTGACGAAAGGGTAATCACGTTATTCCGGAGAAATTGGAAGGGTAATTATGTCATTTCGATTTCGGAAGGAAAAAAAATTGGGAGTCGAGCTAGTACGGAAGTGAAAGAGGTAGTCTAGGGTGCGGCCGCTCACAGAGTTTCATTTTTGGGTTGTGCTTGGTGGGGCCACGTGGCATTAATCGAAAAGTATGATATACTAATGCAAGGGTTTCAATAATTAATGATGGAGAGAAAGGGTATTTTACATTATTTTCAATTAATAGCTTTATTTATTATTTTTTTATTGATTTATTTATTTACACCTTCCTCTATAATTGCTAAATTATTTAATTTATTTGGATGCCTCCCAATTTGTTTGTCTTAAATATTAAATTATTATTATTATTATTGAAAAAAAGAAAAGAAAATGATATCCCATCTTAATTAAAAAAGAAAATCTGTGGCCCTTAGAATTTCTATACTTGGTTTTCTTTATGATGGGATGGACAAATTAATAATAATAATACAATAATATAGGCATATTTTTATTTAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGGTAATTGTTTGGGTTAGCTTGGTTAGCAAGCATGATTACAATTAATGAGATGATGACAAAAAAATGTGTCTTCCCTTTCAAGTTTACACATTTTCATGCCTAATATTTCAAATAATTCTTTAATATTTATTTACATTACTCGTCCCGATATGATCCTCTCTCGCCTTTCTCTTTCAAGCTTTTCCTCAAAGTTCTTAAAACGCGTTTGTTAGAGAAAAGTTTCCACTAATGTGGGATCTCATAATCTATCCTTGTCTGGGCTCAATATGTTTTCCCTCAAAGTTTTTAAAATTCGTTTCCTAGGGAGAAATTCCCACTTATGTGGCACCTCATAATCCATCATGTCTGGAGCTCAGCGTGCTTCTCTCAAAGTTTTTAAAACACGTCTGCTAGGGAGAGGTTTTCACTGATTTGGGATCTCTCATAATCCACCCTGTCTAGAGCCCAACGTGCTTTCCCTCAAATTTTTTAAAATGAGTCTGTTAAGGAGAGGTTTTCACTGATGCGAGATCAAATAATCCACCATTGTCCAAAGCCTAGCGTCCTCGTTGATATTTGTTCTCATCTCCAATTGATGTGTAATCTTACCATCTACCCCCGTTTAGGGCCCAGCGTTCTCGTTGATACTTGTTTCCCTCTCCAACTAATGAGTGATCTCATAATTCACTCTTCTTTGGGGCCCAACATTCTCACTGACACATTGCTCAATGTCAGACTTGATACCATTTGTAACAGTCCAAGCTCACAGTTAGCAGATATTGTCTTTTTTAGATTTTCTCTTTCGTGCTTTCCCTCAAGGTTTTTAAAACGCGTGTCAAAAGTTTCCACACCCTTATACCTATACAGAAATAGGATATTTTTTTTTATTAAATAAATGTTTATGTGCACCTCCTATGTTTTAGAACATGAAAAAAATTGGCGTAGAATTAGTCTCACATTCATTAATTAAAGAAAAAATTATAAATTTATATAATTATGACGTCAATTTTCATAATTTATTTTTAAGAAAAAATATATTTTTGAGAAGCAATGAAGCGACCAAAGGGAAGCAGCCTGATAATGCCGTTTGCCACACTCAATGCTCTGCCCAACTCAGCGCCATCATGTCTTTGTTTTTTACTCAAATTAATACATTTATTTTTAAATTATAATAATAACCAATTTCTAATATTATTCATTTTGAATTCATATAAACACTTTCCAAAAATTTAAAATTAATTAAATTATGAAAAGAAAAAAAAAAACAGCTTAAAATAAAACACGTCTTAAGTTAACGTAAATCTAAAGATTTAGAATTATAATTATTGTCTTATTTATTTGAATTAATTTGAACCGACATGTCGTCCACAAACTACCTCTGCTCGCATCACTATGTCGGCTCTCCCGCATGCCCACACCCCGTGTATGTTGAGATCATTCGCCGTCCATAATCAATATATAAGAAATATTATTAAATTTCAATAATTATTTTTTATTTTAAAATAATAATAAAAAAATTAATTTGTGGGAAAGCAAAAGGGATTAATTGCGGCGGACATATGTCGGGGGAGAAGGTGCTTTCATGCCCTACACGAGGGTTGGCTGTTTTGGGGACATTTTCTTTCGTATTTATTAATTACCCATTTTTTTCCATTATTATTATTCATACTAATAATTAATAAAATCTTCTAATATATATTTAAGCACGTAGTTTAATAAGTGTGACATCCCACCGTCCCATATTTGTTAGGGAGGAAAACAAAACACTGGTGTGTAAACCTTTTCTTAAGAAACGAGTTTTAAAGCATTGAGGGGAAGCTCGAAAAGAGAAAGTCCAAATAGAGCTTGAGTCGTTACAAATGGTATTAGAGTCAGACACCGAGCGATGTGCCTAGCAAGGAGGCTGAGCCCCGAAGGGGGGTAGACACGAGGCAATGTGTCATCTAGGACGTTGGGCCCTAAACGAGAGTAGACACGAGGTGGTGTGCTAGTAAGGATGCTGGGCCTCGAAGGGGGGTGGATTTCGTGGTGGTCCCACATTGATTGGAGAAAGAAACTAGTGTCAGCGAGGACGCTAGACCTCGAAGGGGGTGGATTGCGAAATCCCACAATCCCATATTGGTTGGGGAGGAGAATGAAAGCAAAGGGAAAGTCTGAAAAGGAAAAGTTCACAATATCTGCTAGCAGTAGGTTACAATAAGTTTCTCGTTATTTGACGTTTTTCATAGTTCAGTTAACGACCATTTCTTTCTCTCTTATCGTTATCGTTGTTATTATTGTTCAAGGATTTTACCCATAAAATTCTGTATTTCTTTAAGATTACAACTTTTGAAATGTCTCGGGTAAGGTTAAGGATTTCCATTTTGAAGCTATATAAGATCATGTATGTTGTCTTTACATGCAAGAAGACTTGAAAAATGTAGTAAAATGAACATTTGTGCTCTACTTTAGCCAAGAGCTAAGTTTCTTTGCAATTTTATATAGTTTAGAATCATTCAAGCTAGACATGATCGATCTTACTTGTGGAGTGATTCGAATTTCAAAAAAATGTTCTTACCTTGAGATGTTCGATCAACGAGATAATCTGAATCTTACTTTCCTTTAGTGATTCTTTATCACTTCCCATCCTAAATTTCGAAGTCGACTTGACCATACTGCAATGCCTTGTTAGCTAGGACGTCTAAATTTAACAACAAAAGTTTTCAACCCTTAATTAAGGGCATTCCAGCCACCCGACAACTATGTTGGACTAATGAACATAGCATTAATGATTTTGTCTGATTTCAGCTACAATTGATATCCAATAAGCTTATTTATTTAGCTACAACACATTTACCCAAAAGGGTTGGCCTCAAAGTTGCATTATTATAAATTGCTTTAATTTCCTGTTATTATTGTTTTCTTGAGACACCCAAAATGAATCCATTTGAAACTTCCTTTTTATGGTTCATTGTGTTGGTTTGAGAACATCATAACCATTGGTTGACATTTGTACTCAAATCATGTTTTATGAGATTATGGGTAAAAAAAGATCGGGACGTGTGGATATCGTTCATAGAAAGGAGAGAAAGTTAGTCGTGGGTGTACACGGTTCGATTATACAAATCTTTTAGACCAATTCAAGATTTTGAGTTGGTTGGATTGGTAACTCGAACAACCCGAACAGAGTTCACATTCCAACCCTACTCACCCTTCTATTTTTCGGGTGGGATTGTCGGGTTGTTCTTCTTTTTTTAATTATTTAAAACAATCATATTTATCCACCGTACATGTTACATTAATACTTAAATCACATAAAGTTATAACTCATCACTAACATCAGTGACAAATGTCAAATATTCTTAATATTCATAATAATCTTAAAAACAGAATAGAGTTGGATTGGGTTGACCCAACAAAAAAAATGTCAACGGGCAAACCAATTCAAATTTTATGTTTTTTCAAAAATTCAACCCAACCCAGTTTTTATAGTTTGGTTAGATGATCTGGGTTGGTCGGGATTCCAAAAGTTCATCCCAACCCTAAATAGTACATATTCATTTCGTTCTTAAATTCTTCTTTTACGACAAATCGTTAATGCAGGT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mRNA sequence

ATGGGTGTAGCAAACGCTTTGATCAGGCCCAGAACTTGGATGTCGACGTCGAGGGAGGCGGGGCGGGGCAGGGCAGGGCAGGGCAGGGCGGTTTTGGACGCCATGGAAAGCAGAGAAAGGTGCAGAAAAGATGGCGTAGAAGCTACTGCAGATGACGACGATGATGATGATGATGCGCAGGGAAATCGCTGCTCCGATTCTCCCTTCGACTTCCCTCAAATCGGTGCCATACCCATTTCCATTTTGAAATCTCTTAACCCTAATTCGATTCTTGATTCCATTTGCATGTTGATGCTGTATGCATTTTTGATTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGTGTAGCAAACGCTTTGATCAGGCCCAGAACTTGGATGTCGACGTCGAGGGAGGCGGGGCGGGGCAGGGCAGGGCAGGGCAGGGCGGTTTTGGACGCCATGGAAAGCAGAGAAAGGTGCAGAAAAGATGGCGTAGAAGCTACTGCAGATGACGACGATGATGATGATGATGCGCAGGGAAATCGCTGCTCCGATTCTCCCTTCGACTTCCCTCAAATCGGTGCCATACCCATTTCCATTTTGAAATCTCTTAACCCTAATTCGATTCTTGATTCCATTTGCATGTTGATGCTGTATGCATTTTTGATTTAG

Protein sequence

MGVANALIRPRTWMSTSREAGRGRAGQGRAVLDAMESRERCRKDGVEATADDDDDDDDAQGNRCSDSPFDFPQIGAIPISILKSLNPNSILDSICMLMLYAFLI

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmaCh09G008120 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh09G008120 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh09G008120 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh09G008120 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 16..69
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 33..48

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh09G008120.1	CmaCh09G008120.1	mRNA