CmaCh09G008120.1 (mRNA) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview


Name	CmaCh09G008120.1
Type	mRNA
Organism	Cucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	Unknown protein
Location	Cma_Chr09: 3969110 .. 3976507 (+)
Sequence length	315
RNA-Seq Expression	CmaCh09G008120.1
Synteny	CmaCh09G008120.1

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGTGTAGCAAACGCTTTGATCAGGCCCAGAACTTGGATGTCGACGTCGAGGGAGGCGGGGCGGGGCAGGGCAGGGCAGGGCAGGGCGGTTTGATACAAAATCTGAGTCAATGGGCTGTGGCTCAATTCTCCGGCCCCTTCCCTTTCAAAATGCTCTTTTTTCCATGTGGGTATTGGCTTTTTCAGGTTTTGGACGCCATGGAAAGCAGAGAAAGGTGCAGAAAAGATGGCGTAGGTGAGACCCAATTCCCATCCCGTTTCTTGTTTCTTGCCCACTTCGTTTACTTGTCCTTTCCTTCCTTCTTTGGATCTTTCCTTCTCTCACTGTTCTTGTACTGTATGGACTGTAAATTTTTAATCAAATTCTTTCCTCTCTCTCTCCTCCTCTGAATTAAATTTTAAATGAGAACTGAGGAGAGAGAAGAAAGAACTAAGCTGCTTTTTAAGCATTGGTTTAAGCTATGAATGAGAAACAAAGTGGTGGTATGGAAAGTGCGGATTTTGAATATAAGCTATCAACTAATTCGGGTACTGGGTGGTGTGTCAGCAGAATGTTGGCCCCCGAAGAAGTGAATTGTAAGATCCCACATTGGTTAGAACGAAATAAAAATCTTTCCTTGGCAAAAACGTTTTAAAACCTTAAGAAAAAATCTCGAGATTACCATATTTACTAAGTGGTGGACTTAGACTGTCACAAATTTTTTTAAATAAAATATTACAAAAAATGATTATGGATTTATAAAATATTCTACAAAATCTTTATATTTTAAATCAAATTTCATAATTCTATCTGATCAAAGAAACATTATTATTATTTTAAGATAATAAATAATGAGATAAAAGAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAACAGGGATTAGATAAGATTGACGAAAGGGTAATCACGTTATTCCGGAGAAATTGGAAGGGTAATTATGTCATTTCGATTTCGGAAGGAAAAAAAATTGGGAGTCGAGCTAGTACGGAAGTGAAAGAGGTAGTCTAGGGTGCGGCCGCTCACAGAGTTTCATTTTTGGGTTGTGCTTGGTGGGGCCACGTGGCATTAATCGAAAAGTATGATATACTAATGCAAGGGTTTCAATAATTAATGATGGAGAGAAAGGGTATTTTACATTATTTTCAATTAATAGCTTTATTTATTATTTTTTTATTGATTTATTTATTTACACCTTCCTCTATAATTGCTAAATTATTTAATTTATTTGGATGCCTCCCAATTTGTTTGTCTTAAATATTAAATTATTATTATTATTATTGAAAAAAAGAAAAGAAAATGATATCCCATCTTAATTAAAAAAGAAAATCTGTGGCCCTTAGAATTTCTATACTTGGTTTTCTTTATGATGGGATGGACAAATTAATAATAATAATACAATAATATAGGCATATTTTTATTTAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGGTAATTGTTTGGGTTAGCTTGGTTAGCAAGCATGATTACAATTAATGAGATGATGACAAAAAAATGTGTCTTCCCTTTCAAGTTTACACATTTTCATGCCTAATATTTCAAATAATTCTTTAATATTTATTTACATTACTCGTCCCGATATGATCCTCTCTCGCCTTTCTCTTTCAAGCTTTTCCTCAAAGTTCTTAAAACGCGTTTGTTAGAGAAAAGTTTCCACTAATGTGGGATCTCATAATCTATCCTTGTCTGGGCTCAATATGTTTTCCCTCAAAGTTTTTAAAATTCGTTTCCTAGGGAGAAATTCCCACTTATGTGGCACCTCATAATCCATCATGTCTGGAGCTCAGCGTGCTTCTCTCAAAGTTTTTAAAACACGTCTGCTAGGGAGAGGTTTTCACTGATTTGGGATCTCTCATAATCCACCCTGTCTAGAGCCCAACGTGCTTTCCCTCAAATTTTTTAAAATGAGTCTGTTAAGGAGAGGTTTTCACTGATGCGAGATCAAATAATCCACCATTGTCCAAAGCCTAGCGTCCTCGTTGATATTTGTTCTCATCTCCAATTGATGTGTAATCTTACCATCTACCCCCGTTTAGGGCCCAGCGTTCTCGTTGATACTTGTTTCCCTCTCCAACTAATGAGTGATCTCATAATTCACTCTTCTTTGGGGCCCAACATTCTCACTGACACATTGCTCAATGTCAGACTTGATACCATTTGTAACAGTCCAAGCTCACAGTTAGCAGATATTGTCTTTTTTAGATTTTCTCTTTCGTGCTTTCCCTCAAGGTTTTTAAAACGCGTGTCAAAAGTTTCCACACCCTTATACCTATACAGAAATAGGATATTTTTTTTTATTAAATAAATGTTTATGTGCACCTCCTATGTTTTAGAACATGAAAAAAATTGGCGTAGAATTAGTCTCACATTCATTAATTAAAGAAAAAATTATAAATTTATATAATTATGACGTCAATTTTCATAATTTATTTTTAAGAAAAAATATATTTTTGAGAAGCAATGAAGCGACCAAAGGGAAGCAGCCTGATAATGCCGTTTGCCACACTCAATGCTCTGCCCAACTCAGCGCCATCATGTCTTTGTTTTTTACTCAAATTAATACATTTATTTTTAAATTATAATAATAACCAATTTCTAATATTATTCATTTTGAATTCATATAAACACTTTCCAAAAATTTAAAATTAATTAAATTATGAAAAGAAAAAAAAAAACAGCTTAAAATAAAACACGTCTTAAGTTAACGTAAATCTAAAGATTTAGAATTATAATTATTGTCTTATTTATTTGAATTAATTTGAACCGACATGTCGTCCACAAACTACCTCTGCTCGCATCACTATGTCGGCTCTCCCGCATGCCCACACCCCGTGTATGTTGAGATCATTCGCCGTCCATAATCAATATATAAGAAATATTATTAAATTTCAATAATTATTTTTTATTTTAAAATAATAATAAAAAAATTAATTTGTGGGAAAGCAAAAGGGATTAATTGCGGCGGACATATGTCGGGGGAGAAGGTGCTTTCATGCCCTACACGAGGGTTGGCTGTTTTGGGGACATTTTCTTTCGTATTTATTAATTACCCATTTTTTTCCATTATTATTATTCATACTAATAATTAATAAAATCTTCTAATATATATTTAAGCACGTAGTTTAATAAGTGTGACATCCCACCGTCCCATATTTGTTAGGGAGGAAAACAAAACACTGGTGTGTAAACCTTTTCTTAAGAAACGAGTTTTAAAGCATTGAGGGGAAGCTCGAAAAGAGAAAGTCCAAATAGAGCTTGAGTCGTTACAAATGGTATTAGAGTCAGACACCGAGCGATGTGCCTAGCAAGGAGGCTGAGCCCCGAAGGGGGGTAGACACGAGGCAATGTGTCATCTAGGACGTTGGGCCCTAAACGAGAGTAGACACGAGGTGGTGTGCTAGTAAGGATGCTGGGCCTCGAAGGGGGGTGGATTTCGTGGTGGTCCCACATTGATTGGAGAAAGAAACTAGTGTCAGCGAGGACGCTAGACCTCGAAGGGGGTGGATTGCGAAATCCCACAATCCCATATTGGTTGGGGAGGAGAATGAAAGCAAAGGGAAAGTCTGAAAAGGAAAAGTTCACAATATCTGCTAGCAGTAGGTTACAATAAGTTTCTCGTTATTTGACGTTTTTCATAGTTCAGTTAACGACCATTTCTTTCTCTCTTATCGTTATCGTTGTTATTATTGTTCAAGGATTTTACCCATAAAATTCTGTATTTCTTTAAGATTACAACTTTTGAAATGTCTCGGGTAAGGTTAAGGATTTCCATTTTGAAGCTATATAAGATCATGTATGTTGTCTTTACATGCAAGAAGACTTGAAAAATGTAGTAAAATGAACATTTGTGCTCTACTTTAGCCAAGAGCTAAGTTTCTTTGCAATTTTATATAGTTTAGAATCATTCAAGCTAGACATGATCGATCTTACTTGTGGAGTGATTCGAATTTCAAAAAAATGTTCTTACCTTGAGATGTTCGATCAACGAGATAATCTGAATCTTACTTTCCTTTAGTGATTCTTTATCACTTCCCATCCTAAATTTCGAAGTCGACTTGACCATACTGCAATGCCTTGTTAGCTAGGACGTCTAAATTTAACAACAAAAGTTTTCAACCCTTAATTAAGGGCATTCCAGCCACCCGACAACTATGTTGGACTAATGAACATAGCATTAATGATTTTGTCTGATTTCAGCTACAATTGATATCCAATAAGCTTATTTATTTAGCTACAACACATTTACCCAAAAGGGTTGGCCTCAAAGTTGCATTATTATAAATTGCTTTAATTTCCTGTTATTATTGTTTTCTTGAGACACCCAAAATGAATCCATTTGAAACTTCCTTTTTATGGTTCATTGTGTTGGTTTGAGAACATCATAACCATTGGTTGACATTTGTACTCAAATCATGTTTTATGAGATTATGGGTAAAAAAAGATCGGGACGTGTGGATATCGTTCATAGAAAGGAGAGAAAGTTAGTCGTGGGTGTACACGGTTCGATTATACAAATCTTTTAGACCAATTCAAGATTTTGAGTTGGTTGGATTGGTAACTCGAACAACCCGAACAGAGTTCACATTCCAACCCTACTCACCCTTCTATTTTTCGGGTGGGATTGTCGGGTTGTTCTTCTTTTTTTAATTATTTAAAACAATCATATTTATCCACCGTACATGTTACATTAATACTTAAATCACATAAAGTTATAACTCATCACTAACATCAGTGACAAATGTCAAATATTCTTAATATTCATAATAATCTTAAAAACAGAATAGAGTTGGATTGGGTTGACCCAACAAAAAAAATGTCAACGGGCAAACCAATTCAAATTTTATGTTTTTTCAAAAATTCAACCCAACCCAGTTTTTATAGTTTGGTTAGATGATCTGGGTTGGTCGGGATTCCAAAAGTTCATCCCAACCCTAAATAGTACATATTCATTTCGTTCTTAAATTCTTCTTTTACGACAAATCGTTAATGCAGGTAGTATAGAAGAGTTCTGATACTACCGTAGCACTAGAAATTTTATCCATTACAAGCAACGAACGATAATGGGCTTTATTTGGGCCTATATCATTCTCGAACCAATTGTATAGGTCAAAACCCAATTGACGAGAGAAGACGAGGGAGCCCCAGAACACGAAGAAAACATTTGTGGTCGAAGAATTTGTATCGAAAACGTGCAAATGAATAGAAGAAATAGAGAGATGGAGAGTAACTCTAATTTTGTGTCATCACTATGTATGGTTGTAATGAAAGTGAGAGGCTTTCATTTGCTTGTGGACTAACATTTTTCAATACATTATTGTTTTTTTAACTTATCCAAATGAATGATTAATGGGATTGAATTTTTTTTAATAATTGTTCATTTTTTAAATATAAATATAAATAAATAAAATTATATAATTTATTTTCATTTTTTTCTATTGTAATAATTTATAAATATAATCTTCTAAAATAAATATTATTAACCATATAAGTATCTCATTTTAAAATAAGTTTAGTTCTATCAAATTAATATAAGTTTCATAACAATAAAATATTAATATTAAATTAGTAAAGTTATTCAAACCGTTAGCCCAACAAACTTTACAAATTGGGCCGGACTTGAATTAGTTGCATCAGGCCCAAAAGGTATTGGGCCCAATGTCCAATAAAGGGTACGAGGATGACGTTCGTGCCATCTGAACTGTGCAAGGCTTCGGCCCACGGCTCCTTCACTTCTGAGTGAACCCGCCATGAGCTAAACCCCGACGCCGATCCTTTTCTCTGTATGGCGCCCTCCGCATCACGGTTACGTATCGCAGTAAGCTTAGGATTTTAAAAAATGTCTACTAGGGAGAGGTTTCCATACCCTTATAAGAAATGATTCGTTCTCCTCTCCAACCAATGTGGGATCTCACCATTTGTGTTCTTGGTGGTAAGCTGCCTATGTCTGCTTATGATACAATTTGTAACAACCCAAACTCACTGTTAGCAAATATATATGTTTTAGCCCTATTGTCTACAACCTCACGATTTTAAAACGCGTCTTTTAGGGAGAAATTTCCACACACTTATTAATGTTTGATCTCATAATCGACCATTTTGGGAGCCCAACATTCTTGCTAGCACACCACTAGTATCTAGCTCTGATACAATGCAAATATTTGCTAAAACCATCCCACTTGGTGGTAAAAATTCTTCATTTATAATCATTTACGTAACTAAATAAATTACAAACAAAATGAAAAGAGCAATAAATATCTTTTCTACCGTGAAAAAAATTCTAATTTATTCATTATTTTTAGTTCATACATAGAAAGTAAAGTACATGGCTCACTTAAATGATAATAAATATCTTATTTGGCCGATTATTTTTAAATTGACGTTGATTAACAGTAGTTTTGTCCTTATTTGCTTTTAGCAGCATCAAATGATTGAAAAACAGGTACAATATTGTTTATATTTCCAACACGAGTGAATATTTGAATATTTAACGGCTAAAAATGTAACCAATTTATTTACTAATAATGTTACGTTTCAAGCTGATTCAAAATATTAACACGATTACAGTTCAACGGCTATGAAAAAAAAAAACAGCTGGTTTTCGATCTGATACTCATGCCAATAGTATGGATCACACCCCTCTTACTTTAGGTGTTGTAAAAAAGCTTCAAAATTTGAGTAATATAAAGTGCTGTGATATTATTTTAACATCAATAACGAAGAACTTTTACCATCTCTCGAAAAGAATCAGCCCTTTTTCTCTTCCTTTTCCAATAATTAGAGACAATTTTGAAGAAGAAACATTCAACCTTGAAAATCAAGCATTTTGGTGGAAATGAAATAATTGAATCCAATTATCTCCAATAGTTTTGATAAACTCCCGATTGGATATAATAATCATAATCAAAAACCCAAAAAGGAACCCCGAAATCATTCGATCAAACCCAAAATCATTACAATTTCACAATATAAAGAGGTGGGTTTTGTCAATCCAATGAGTTTCAGTGCGAATGAAGATGAAATCAAAAGCTTTGGGGTTTATAAAATAATCCCCAAAAATGGGGGGAAAACACGAGTGGCGGAAGAGAGATAAAAAGGGGCGAGAAGAAACGGTCTTGGTGAGAGAAAAGGGATGGGATTTGCCATTTGTTGTACTTGGGGGAACTGTTCCCTTTCTCAAACCTTTCTTGCTTTCATGGCTCGGTGACCAACCCTGAAGAAGCTACTGCAGATGACGACGATGATGATGATGATGCGCAGGGAAATCGCTGCTCCGATTCTCCCTTCGACTTCCCTCAAATCGGTGCCATACCCATTTCCATTTTGAAATCTCTTAACCCTAATTCGATTCTTGATTCCATTTGCATGTTGATGCTGTATGCATTTTTGATTTAG

mRNA sequence

ATGGGTGTAGCAAACGCTTTGATCAGGCCCAGAACTTGGATGTCGACGTCGAGGGAGGCGGGGCGGGGCAGGGCAGGGCAGGGCAGGGCGGTTTTGGACGCCATGGAAAGCAGAGAAAGGTGCAGAAAAGATGGCGTAGAAGCTACTGCAGATGACGACGATGATGATGATGATGCGCAGGGAAATCGCTGCTCCGATTCTCCCTTCGACTTCCCTCAAATCGGTGCCATACCCATTTCCATTTTGAAATCTCTTAACCCTAATTCGATTCTTGATTCCATTTGCATGTTGATGCTGTATGCATTTTTGATTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGTGTAGCAAACGCTTTGATCAGGCCCAGAACTTGGATGTCGACGTCGAGGGAGGCGGGGCGGGGCAGGGCAGGGCAGGGCAGGGCGGTTTTGGACGCCATGGAAAGCAGAGAAAGGTGCAGAAAAGATGGCGTAGAAGCTACTGCAGATGACGACGATGATGATGATGATGCGCAGGGAAATCGCTGCTCCGATTCTCCCTTCGACTTCCCTCAAATCGGTGCCATACCCATTTCCATTTTGAAATCTCTTAACCCTAATTCGATTCTTGATTCCATTTGCATGTTGATGCTGTATGCATTTTTGATTTAG

Protein sequence

MGVANALIRPRTWMSTSREAGRGRAGQGRAVLDAMESRERCRKDGVEATADDDDDDDDAQGNRCSDSPFDFPQIGAIPISILKSLNPNSILDSICMLMLYAFLI

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmaCh09G008120.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh09G008120.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh09G008120.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmaCh09G008120.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 16..69
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 33..48

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh09G008120	CmaCh09G008120	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh09G008120.1:exon:1955	CmaCh09G008120.1:exon:1955	exon
CmaCh09G008120.1:exon:1954	CmaCh09G008120.1:exon:1954	exon
CmaCh09G008120.1:exon:1953	CmaCh09G008120.1:exon:1953	exon

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh09G008120.1:cds	CmaCh09G008120.1:cds	CDS
CmaCh09G008120.1:cds	CmaCh09G008120.1:cds_2	CDS
CmaCh09G008120.1:cds	CmaCh09G008120.1:cds_3	CDS

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmaCh09G008120.1	CmaCh09G008120.1-protein	polypeptide