Spg004722 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg004722
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Location	scaffold5: 21360979 .. 21373551 (-)
RNA-Seq Expression	Spg004722
Synteny	Spg004722

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGGCTCCCACAAACCCGTTTTTAAGGCTGGAGAATACTAGGGAAGATCTCGGTGGTGGTCCACGGCTTGTTCGTGCTGAGAAACATCCATGGAGTTGTAAGAATTTGAGCTTCAAAGATTGCAACCAAGTTGCGCCAACATCTTACTCTGTAAGCAACTTAGCTGTAAAGGCAAAGATCATGCCTCCCCGTGCACGAGGTCATGGAAGAGGTCGAGGAAGAGGTCGTGGTAGGGGTCGTACAACCGCTAAAGCAGTTGTGCCACCAATGGGGCATGGAGAAAATCTACCAGAAAGTCCGCAAGTGGAACAGCCGGGTACGCAGTCGGGGCATGCGGCAGAACCTGTCACATTGGATATCGACGCAATAGTTCAATCAGCAGTTGCTGGGGAAGTCCAATCTGCAGTTCAAACCGCATGCCGTTGCCGCTCTCTCCGCCGCGCCGTCGTCCGTCGTTCCGCACTCTGCCCGCTAGCGTCGCACGCCGTTCACCGCTGTGAATCGTCGCGAGCTGCCGGTGAACTCTCCCTCTCAGTTTTCTCTCCCTTGTGCGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGTCTCACTCTCTTTCTCCCTCTCTCAATCTGCAGATTGTCGCCGCCTCCTCCGTCCTCGACGCCGCGCCACCCTCACGAAGTTGCCCGCCGTCGCCTAGGACGCCGCGCCACCGTCGTGTTTTTTTTTCTCCTTCGGTCAGTCTCTCTCTCTTTCGGCCTCACTCTCACAGTCTCCCTCTTTACTGCAGCAACCACGAGCATTGACACTGCCCACCCAAAATTGTACGCTGCCGTTGTGAATCGACGTCGCCGCCATTTGGGTTTCCAACCTGTTTTTCTAAAGGACCGATTGGGCGAAGCGGAAGTTTTCCCAAAATCTCAGTTGGGTAAGAAACTCGGACCTTATGTTGCTGTATTTATATTCTTGGCAGCACTGTAG

Protein sequence

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Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg004722 vs.


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BLAST of Spg004722 vs.


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BLAST of Spg004722 vs.


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BLAST of Spg004722 vs.


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InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
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None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..21

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg004722.1	Spg004722.1	mRNA