Homology
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q9S728 (Protodermal factor 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDF1 PE=2 SV=1)
HSP 1 Score: 195.7 bits (496), Expect = 7.4e-49
Identity = 152/297 (51.18%), Postives = 188/297 (63.30%), Query Frame = 0
Query: 7 TPSGGGYYSPPSNDPTPT-----PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTP-TPS-TPTPS 66
+P G + +PPS+ P + P P+PSTPS P SPP++ PTP TPS TPTP
Sbjct: 39 SPPSGSHGTPPSHTPPSSNCGSPPYDPSPSTPSHP------SPPSHTPTPSTPSHTPTPH 98
Query: 67 TPS-TPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSP 126
TPS TP+ ++PP +P PS PSTPS + S P++ PTPS P GG Y SP
Sbjct: 99 TPSHTPTP---HTPPCNCGSP--PSHPSTPS----HPSTPSH---PTPSHPPSGGYYSSP 158
Query: 127 PTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP---PTTSAPPFVPDPNSPF 186
P P TPPS P D P TP GG+P TP P T PF+P P P
Sbjct: 159 PPRTPVVVTPPS--------PIVD--PGTPIIGGSP--PTPIIDPGTPGTPFIPAPFPPI 218
Query: 187 TGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGS 246
TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG ++ PGF ++L QALSNTR+D +G+
Sbjct: 219 TGTCDYWRNHPTLIWGLLGWWGTVGGAFGTVSIPSSIPGFDPHMNLLQALSNTRSDPIGA 278
Query: 247 LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR 289
LYREG A++LNSMVN+++PFTT QVR+ FV+ LSSNKAA QA F++ANEGR KPR
Sbjct: 279 LYREGTASWLNSMVNHKFPFTTPQVRDHFVAGLSSNKAATKQAHTFKLANEGRLKPR 305
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q9SN46 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX5 PE=2 SV=2)
HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 2.8e-08
Identity = 83/195 (42.56%), Postives = 103/195 (52.82%), Query Frame = 0
Query: 2 TPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTP 61
+P +TPS G SPP++ TPTP PS+P+TP+ GG SPP++ TPTP PS+P
Sbjct: 457 SPPSTTPSPG---SPPTSPTTPTPGGSPPSSPTTPTPGG--SPPSSPTTPTPGGSPPSSP 516
Query: 62 STPSGGGYYSPPTYDPTP--TSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPT------PTPSTPSG-- 121
+TPS GG P+ P+P T PS PSTP+ G SP + P+ PTPSTP
Sbjct: 517 TTPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPPSTPTSPGSPPSPSSPTPSSPIPSPPTPSTPPTPI 576
Query: 122 GGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYN--------SPPTFDPTPST-PPSGGTPFYGTPPTT 178
G SPP P T PS + SPP PTPS+ PPS TP Y PP +
Sbjct: 577 SPGQNSPPIIPSPPFTGPSPPSSPSPPLPPVIPSPPIVGPTPSSPPPSTPTPVYSPPPPS 636
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
P14918 (Extensin OS=Zea mays OX=4577 GN=HRGP PE=2 SV=1)
HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 9.5e-04
Identity = 68/183 (37.16%), Postives = 89/183 (48.63%), Query Frame = 0
Query: 2 TPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTP 61
TP P+ P+ PP+ PTP TP+P P+T +PPT P+P P TP P+ P
Sbjct: 50 TPKPTPPTYTPSPKPPTPKPTPPTYTPSPKPPATKPPTPKPTPPTYTPSPKPPTPKPTPP 109
Query: 62 S-TPS-GGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPP 121
+ TPS PPT P PT P+ +P +PPTY P+P P TP +PP
Sbjct: 110 TYTPSPKPPATKPPT--PKPTPPTYTPSPKPPTPKPTPPTYTPSPKPPTPKP-----TPP 169
Query: 122 TYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP------PTTSAPPFVPDPNS 177
TY P+P PP+ +PPT+ P+P P TP TP P + P + P P
Sbjct: 170 TYTPSPK-PPTHPTPKPTPPTYTPSPKPPTPKPTPPTYTPSPKPPTPKPTPPTYTPSPKP 224
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. NCBI nr
Match:
XP_031743089.1 (protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 556 bits (1432), Expect = 4.33e-196
Identity = 285/286 (99.65%), Postives = 286/286 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 4 TPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST 63
TPSTPSGGGYYSPPS+DPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST
Sbjct: 204 TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST 263
Query: 64 PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP 123
PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP
Sbjct: 264 PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP 323
Query: 124 TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWR 183
TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWR
Sbjct: 324 TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWR 383
Query: 184 THPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS 243
THPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS
Sbjct: 384 THPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS 443
Query: 244 MVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 289
MVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 444 MVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 489
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. NCBI nr
Match:
KAE8647347.1 (hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 543 bits (1400), Expect = 2.49e-191
Identity = 285/307 (92.83%), Postives = 286/307 (93.16%), Query Frame = 0
Query: 4 TPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST 63
TPSTPSGGGYYSPPS+DPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST
Sbjct: 176 TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST 235
Query: 64 PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY-------- 123
PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY
Sbjct: 236 PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYSSPPTYDP 295
Query: 124 -------------YSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTT 183
YSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTT
Sbjct: 296 TPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTT 355
Query: 184 SAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALS 243
SAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALS
Sbjct: 356 SAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALS 415
Query: 244 NTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANE 289
NTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANE
Sbjct: 416 NTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANE 475
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. NCBI nr
Match:
XP_011657562.2 (protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 543 bits (1400), Expect = 6.60e-191
Identity = 285/307 (92.83%), Postives = 286/307 (93.16%), Query Frame = 0
Query: 4 TPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST 63
TPSTPSGGGYYSPPS+DPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST
Sbjct: 204 TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST 263
Query: 64 PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY-------- 123
PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY
Sbjct: 264 PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYSSPPTYDP 323
Query: 124 -------------YSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTT 183
YSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTT
Sbjct: 324 TPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTT 383
Query: 184 SAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALS 243
SAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALS
Sbjct: 384 SAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALS 443
Query: 244 NTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANE 289
NTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANE
Sbjct: 444 NTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANE 503
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. NCBI nr
Match:
XP_038888912.1 (protodermal factor 1-like [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 487 bits (1253), Expect = 6.06e-169
Identity = 275/323 (85.14%), Postives = 280/323 (86.69%), Query Frame = 0
Query: 2 TPTPSTPS-----GGGYYSPPSNDPTPTPSTP------TPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPT 61
TPTP TPS GGGYYSPPS DPTPTPSTP TPSTPSTPSGGGYYSPP+ DPT
Sbjct: 164 TPTPLTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPSTPSGGGYYSPPSYDPT 223
Query: 62 PTPSTPTPSTP-----STPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPT 121
PTPSTPTPSTP STPSGGGYYSPPT DPTPT PSTPSTPSGGGGY SPPTYDPTPT
Sbjct: 224 PTPSTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPT-PSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPT 283
Query: 122 PSTPS---GGGGYYSPPTYDPTPSTP---PSGGGGYNSPPTFDPTPS---TPPSGG---- 181
PSTPS GGGGYYSPPTYDPTPSTP PSGG GY+SPPTFDPTPS TPPSGG
Sbjct: 284 PSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYSSPPTFDPTPSIPTTPPSGGSGYY 343
Query: 182 ------TPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGIT 241
TPFYGTPP TSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGIT
Sbjct: 344 NPPTSGTPFYGTPPITSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGIT 403
Query: 242 NAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSS 289
NAPGFGATLS+PQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVR+SFVSALSS
Sbjct: 404 NAPGFGATLSIPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRDSFVSALSS 463
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. NCBI nr
Match:
XP_016900775.1 (PREDICTED: protodermal factor 1-like isoform X2 [Cucumis melo])
HSP 1 Score: 478 bits (1231), Expect = 4.46e-167
Identity = 255/302 (84.44%), Postives = 264/302 (87.42%), Query Frame = 0
Query: 3 PTPSTPS-----GGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPT 62
PTPSTPS GGG+++PP+ GGGYYSPP++DPTPTPSTPT
Sbjct: 107 PTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG------------------GGGYYSPPSHDPTPTPSTPT 166
Query: 63 PSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYS 122
PSTPS GGGYYSPPTYDPTP SP+TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYS
Sbjct: 167 PSTPS---GGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYS 226
Query: 123 PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG----------TPFYGTPPTTSAPPF 182
PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG TPFYGTPPTTSAPPF
Sbjct: 227 PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPF 286
Query: 183 VPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTD 242
VPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTD
Sbjct: 287 VPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTD 346
Query: 243 GLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKP 289
GLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+FKP
Sbjct: 347 GLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKP 387
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A0A0KGQ1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G423360 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 550 bits (1418), Expect = 8.30e-194
Identity = 283/286 (98.95%), Postives = 284/286 (99.30%), Query Frame = 0
Query: 4 TPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPST 63
TPSTPSGGGYYSPP+ DPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPT DPTPTPSTPTPSTPST
Sbjct: 235 TPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPST 294
Query: 64 PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP 123
PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP
Sbjct: 295 PSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP 354
Query: 124 TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWR 183
TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWR
Sbjct: 355 TPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWR 414
Query: 184 THPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS 243
THPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS
Sbjct: 415 THPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS 474
Query: 244 MVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 289
MVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 475 MVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 520
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A1S4DYH9 (protodermal factor 1-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491383 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 478 bits (1231), Expect = 2.16e-167
Identity = 255/302 (84.44%), Postives = 264/302 (87.42%), Query Frame = 0
Query: 3 PTPSTPS-----GGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPT 62
PTPSTPS GGG+++PP+ GGGYYSPP++DPTPTPSTPT
Sbjct: 107 PTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG------------------GGGYYSPPSHDPTPTPSTPT 166
Query: 63 PSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYS 122
PSTPS GGGYYSPPTYDPTP SP+TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYS
Sbjct: 167 PSTPS---GGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYS 226
Query: 123 PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG----------TPFYGTPPTTSAPPF 182
PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG TPFYGTPPTTSAPPF
Sbjct: 227 PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPF 286
Query: 183 VPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTD 242
VPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTD
Sbjct: 287 VPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTD 346
Query: 243 GLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKP 289
GLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+FKP
Sbjct: 347 GLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKP 387
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A1S4DXR0 (protodermal factor 1-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491383 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 478 bits (1231), Expect = 2.67e-167
Identity = 258/305 (84.59%), Postives = 267/305 (87.54%), Query Frame = 0
Query: 3 PTPSTPS-----GGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPT 62
PTPSTPS GGG+++PP+ GGGYYSPP++DPTPTPSTPT
Sbjct: 107 PTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG------------------GGGYYSPPSHDPTPTPSTPT 166
Query: 63 PSTP--STPSGGG-YYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGG 122
PSTP STPSGGG YYSPPTYDPTP SP+TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGG
Sbjct: 167 PSTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGG 226
Query: 123 YYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG----------TPFYGTPPTTSA 182
YYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG TPFYGTPPTTSA
Sbjct: 227 YYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSA 286
Query: 183 PPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNT 242
PPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNT
Sbjct: 287 PPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNT 346
Query: 243 RTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGR 289
RTDGLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+
Sbjct: 347 RTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGK 393
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1ES57 (protodermal factor 1-like isoform X6 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437076 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 462 bits (1189), Expect = 1.09e-159
Identity = 258/308 (83.77%), Postives = 273/308 (88.64%), Query Frame = 0
Query: 1 STPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTP-TPSTP--STPSGGG-YYSPPTNDPTPTPSTP 60
STPTPS PSGGGYYSPP+ DPTPTPSTP TPSTP S PSGGG YYSPPT DPTPTPSTP
Sbjct: 168 STPTPSAPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTP 227
Query: 61 TPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPT-PTSPSTP--STPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGG 120
+ TPSTPSGGGYYSPPT +PT P++PSTP STPS GG Y+SPPTYDPTPTPSTPSGGG
Sbjct: 228 STPTPSTPSGGGYYSPPTDNPTTPSTPSTPTPSTPSDGG-YNSPPTYDPTPTPSTPSGGG 287
Query: 121 GYYSPPTYDPTPSTP---PSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG----------TPFYGTPP 180
GYYSPPTYDPTPSTP PSGG GY+SPP++DP PSTPPSGG TPFYGTPP
Sbjct: 288 GYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYDSPPSYDPNPSTPPSGGNGFYNPPTSGTPFYGTPP 347
Query: 181 TTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQA 240
TTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQA
Sbjct: 348 TTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQA 407
Query: 241 LSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMA 288
LSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS+VNNRYPFTTN+VR+SFVSALSSN+AAAAQA+VFQMA
Sbjct: 408 LSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSLVNNRYPFTTNEVRQSFVSALSSNRAAAAQARVFQMA 467
BLAST of Cucsat.G17213.T3 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1EXH4 (protodermal factor 1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437076 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 462 bits (1189), Expect = 2.00e-159
Identity = 258/308 (83.77%), Postives = 273/308 (88.64%), Query Frame = 0
Query: 1 STPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTP-TPSTP--STPSGGG-YYSPPTNDPTPTPSTP 60
STPTPS PSGGGYYSPP+ DPTPTPSTP TPSTP S PSGGG YYSPPT DPTPTPSTP
Sbjct: 186 STPTPSAPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTP 245
Query: 61 TPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPT-PTSPSTP--STPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGG 120
+ TPSTPSGGGYYSPPT +PT P++PSTP STPS GG Y+SPPTYDPTPTPSTPSGGG
Sbjct: 246 STPTPSTPSGGGYYSPPTDNPTTPSTPSTPTPSTPSDGG-YNSPPTYDPTPTPSTPSGGG 305
Query: 121 GYYSPPTYDPTPSTP---PSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG----------TPFYGTPP 180
GYYSPPTYDPTPSTP PSGG GY+SPP++DP PSTPPSGG TPFYGTPP
Sbjct: 306 GYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYDSPPSYDPNPSTPPSGGNGFYNPPTSGTPFYGTPP 365
Query: 181 TTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQA 240
TTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQA
Sbjct: 366 TTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQA 425
Query: 241 LSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMA 288
LSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS+VNNRYPFTTN+VR+SFVSALSSN+AAAAQA+VFQMA
Sbjct: 426 LSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSLVNNRYPFTTNEVRQSFVSALSSNRAAAAQARVFQMA 485
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Q9S728 | 7.4e-49 | 51.18 | Protodermal factor 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDF1 PE=2 SV=1 | [more] |
Q9SN46 | 2.8e-08 | 42.56 | Leucine-rich repeat extensin-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L... | [more] |
P14918 | 9.5e-04 | 37.16 | Extensin OS=Zea mays OX=4577 GN=HRGP PE=2 SV=1 | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A0A0KGQ1 | 8.30e-194 | 98.95 | Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G423360 PE=4 SV=1 | [more] |
A0A1S4DYH9 | 2.16e-167 | 84.44 | protodermal factor 1-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491383 PE=... | [more] |
A0A1S4DXR0 | 2.67e-167 | 84.59 | protodermal factor 1-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491383 PE=... | [more] |
A0A6J1ES57 | 1.09e-159 | 83.77 | protodermal factor 1-like isoform X6 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114370... | [more] |
A0A6J1EXH4 | 2.00e-159 | 83.77 | protodermal factor 1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114370... | [more] |