CmaCh07G011800.1 (mRNA) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh07G011800.1
TypemRNA
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr07: 6477095 .. 6482798 (+)
Sequence length627
RNA-Seq ExpressionCmaCh07G011800.1
SyntenyCmaCh07G011800.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGAAAAGGAGGTGCGGTGGGCAGGGCAGAAGCAGGGGGCGGCGGTATAACCGAGGCGTGGGGTAAAGAGCTGTCAATTGTGCGGTTCCCCAAAAAAGAAATTGAAGGCTTTGTGTTTGACCTTTTGCTTCTATTCCCCATTTTCTTTTCGCCATTTTCCTCTTGATCTTTTCTGCATGTGAATTCATTCTAATTACCCTTTTTTTTTCTTATAAAAACAATTAGCTGTTATAATTTTAAAAACAATTAATCCGTTCCAAGATCTCGCTGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGATTATAAACCCATGACCATTCCCTAAATTAACCGATGTGAGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCAGATTATAAACCCATGACCATTCCCTAAATTAACCGATGTGAGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCTCGAACAAAGCACGCCTCCCCTTACTAAATTAACCGATGTGAGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCTCGAACAAAGCACGCCTCCCCTTAATCGAGGCTTGACTCCTTTGGAGTCTTAGTCATTTTTGACTGCCTTCGTACCTTCAAGGAAGCTTGACTCCTTTTTGGAGTCCTTTGTTCGACATTTGAGGATTTGTCAATCTATTGGCACGGCTAAGTTTAGGGCATGACTCTGATACCATGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATAGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCATGGTTTTGCTTTGGGCTTCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGAGTGTATTCTTAGATTATAAACCCATGACCATTCCCTAAATTAACCGATTGTGGGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCTCGAACAAAGCACGCCTCCCCTTAATCGAGGCTTGACTCCTTTGGAGTCTTAGTCATTTTTTACTGCCTTCGTACCTTCAAGGAAGCTTGACAGATTGGCACGGCTAAGTTTAGGGCATGGCTCTGATACCATGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATGGTATGATATTGTCCAATTTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGAGTGTATTCTTAGATTATAAACTCATGACCATTCCCTAAATTAATCGATGTGGGACTTTCATCATCCAACACTCGCCTCCGTTAACGGTGTGTAAACCTCTTTAGTGGCTGCAATACGTAGCCAAAATAGACGGGCTGTTACTCATGGTATCAGAGCCTAGTCCTCACCTAACATAACACACTTAACTATAAACTTTCTATGACTGAGCTACTGACAAAGAATGTGTACCTTGTTGTTATAGATACTGAATTTCATTTCCTTTAAGCTTTTTTCCCTCATTTACTCTCGCGTAATAAGAAATATCTTGTTATTGACATTTTCGAAACCTCTTTACTCGGGTTTTCCAATCGTTCAGTAAATGTAAAGACTATTGCTTAAAACTTTCAACGTGGGTTCATTCTATATATGAAACTAAGTTCGAGATTCGGTACTTCGGGTTGGAAGATATTACGAGAACGAATGAGAAAAAGAGCTTAGAGAAGGAAACAAAGGCATAAACAATGCTTAAAAAATTCCAAAGATAAAGGCGAACGAGTTAGCAGCCAAAAACACAACGACGAGAGTGCTTCCTAACGAGGCATCCAATACCAAATCTTCACGAATTTTGATTGGCTTTGGTTGATTCATTTGTAGCTTTATTATTAAGCCATTTGGATCTCTCTCTCTGTTATTACTCCCTTTTTGGTACTCAAGAGTCTATCACTTGCCTTTTAGGGTTTTTAAAGGTTTGGATACGGGTTGGAGCCGAAGAAGAATCGACCAAATCGACCGAACGAATTTCGTTGGTTTCGTCTTTTATTTGCTAGTGCGATTCTCGATGTGCTGGAGACTGGAGAATGGGTTGAGTAAACTCGACCAGGGCTAACTAGCTTATGAGTTTTAGGGTATCGAAATGAAATTGAGTGAGTTTGTCTGGTTTGGATTAAGTTTTTCTTACGTGACTGACATTTAGAAATTTCCATGAGTGTGATAGGGACGGGGAAACTACGCCACCTTTTTCAATTCTCATCCCTGCAAAATTTCCTATTTATTTTTGCTATTTTTCGATTTCTTTTATTTTTAAAAAAAATAAATTATACAGTTCAAAGAATATTTTTAATGAATAATTTTCATTTTTTAATATAAAACACATCCTAATAAATCCAACAATATTTTATAAGCAAAAATATAATATAATATTCTACCAACATAATTTTTAAAAATTATAATGTGAATATTCTATCTCCATTCTACACCCTTATAAAAAATGTTTTGTTCCCCTCTCTGACCGACGTCCTCGCTAAGACTCGTTATTCTCTCCAATTGAGGTGGGATCTCACAATCCACTCCCCTTTGGGGTTGGGGTCCAACGTTTTGCTGGCACACTGCCCGATGTCTACCCCCTTCGAGGCTCAGCATTCTCGTTAGCACATTGTCCAGTGTTTGACTCTTTTACTATTTGTAACAGCCCAAGCCCACCGTTATTAGATATTGTTCTCTTTGGTTTTCCCCTTTCAAGCTTCCCCTCAAGGTTTTTAAAAGGCGTCTACTCGGGAGAGGTTTCCACAATGTTTCGTCCCCTCTCCAATTGATGTGAGGTCTCACACTCGTAATTTAGAATTTGAAATTCAAGTCTCGTGATTGTGGGGCTTTACAAATGGTATAAGACTATAGTGTAATTTATGACGAATCAAGCAAACGACGGTGGTAGTGTGATATTTAGAGTTAAAAATGGAAGCTTTAAATAAATTAGGGTTTAGGATATTTAATATTAAATTGTAGTTTTATATATATATATTTGATATTTTATTATAGGCAAATATATAGATATTTATCTATATTATATCTTTTAATTTATTATTATTTCTATATATTTGTAATTTATTTGATTATAAATAGAAAATTTTCAAAACATTTTTTTTTTTTTAAACTATTTTTATATATATATATTTTTTTATTTTAGCGAATTAGAATATTCATAAGAAAGCTTAAATAAAAAAAGTGAGTCTAAACAAGACGAAGGAAAATAAAACGAAAGAAAGCTCAGTGTTGTTCTGTAGTTCGCTCCATTTCCTTGGAACTGTCAATTTGCAGAAAAAGTTCATGCGCCAATGCCCTAGCCAAATCCTTTGATTTGCTTGGTTCAGTGAGCATCACTCTTTCGATTTTGCGATCCATTGAGTACAAGAAAGGAGATAAACTCGGTGGTGGAATCCAAGTCAGCCACTGGCGGCGGCGATGGAGGAACGATTTTTAACTCAAAGATGCGAGAGGAACGAATTCTTTCATAAAATTTTCTGATGTAGGGTCATGGCAGTGCTGTAGTCCGTTGATTTTGATTCTACAAGATTTCAATCGAAGGACATTTGAGCATTTAACGCCGGAGCTGCCTTCAGGTAATTGTTCTGTGGCGTTTTCCTCCGCTGTGTATGCCTTTACCTTTATTTATTGTGGTCTGTTATGTGATCAGCAATCGTTCTTAGTCGTTTCTTGTATTTTCTTTTTTAAGATGTTGATAATTTGCTATTATGATCTTGGTGCTTGTTATTGTGTTGTGTTCCTTTCGGTTTACTTGTTCAAATTTAGCGTTCTAAAGTAAATGATTCTTGGTAGTAAAATACTTGAATGGTATAGATTAGAGATTTAGCGAATGAGTTATATGGCAAGAAGGGAATGAATCTTGACATTGTAGTTGACAGTGACAAGAAAAAGGATGAGAAAGAAGAATGGTGATTTCATCGACCACTACTCATTTAGTTATAATTGTATGTGAGAAACTCCCGGTGATGTACAATCGTTGGGTTGTGTCTATTAATCTACTCATTCTTCCATTGCGGTTGGAAGCTATTTGAATTTACCCATCCTTCACATTACAAGTAGTAGGTTTTCGTTGAGTGTTATTATTGTCCTTCCAATGTGGGCTTCCACTTGATGTTCTGTATTGAGCAGCTGAAACATTGCTGAGTGTCCTAGTCTAGGTCTGACTCCTTTGAAGGGAAAAAAAATGTTTGTAAGAGATACCAAGTACGGGTCTAGTACATTACTATGAGTTAAGTGAGCTGTAAATTTTAAATAGAGGTTTGTATAGCTCAATATAGGTTTGTATACCTTAACTTCCCTTTCTTTGTGTGTAGAACATCATGTTCTAATAGACGTGTGTGTAGAACCAAAACCACTGATGATCTATCTTAAATTTTCTGTCCTCCATTTTCCTGATGGATTCAGTATACTGTTTTAACTGTGATCTTGAATTTTGTTTCTAATTAAAGAGAGACTTCCACAGACACTTTTGTTTTTGCAGATTGATCTTTCAGCCCCAGAAGAGGGGCCATACATACTGTCTCTTGTGAATTCCGATGGAGACAAACTTTTTTTCTTCTTTACTTGTGTTAGTACAATAGTTAACTCTGTTCACAACGAGACAGAAGATTTCTGACAGTGTCCATTGGGACTGCAGGGACAAAAGTTTACTGGAAATACACTCCATAAGTTTGGACATATTTTGCTGGAGAAAATTTAATATTATATTCTTCTGCCGATCCTATCTCATATCTTTGATCAAATTCATCAACTTTGAACTTTGTGTTTATTTAAAAACTTATTTGGAAACTTTTATAAGCCTCCAAAAAAGTTTTTGCATGCAAGGAGGAAGCACGGGATATTTAGCATGTCAAGATGATGGTTAGTTATATGACAGGGTATCTTTTGTAGAGAAGTGGTGTCATATTTGCTCCTTCAAGTACACTTCTTAAGATTGTATTTAATAGATGAGTGGTCTCTTGGTGGCACTGATCCTGATGGATGGGTTTTTAGATGTTCGTAGAGATGGCTTAGTTATCGAAGTCAGTGAAAACAAGACTAGTGTAGTTTATGGCCAGAGAGGAACTGGGATGGTTTAGTTGGATGTATAAATGGTGACACGGGAAGGACTGATGTATGTAAAATTACTCTCAGTCTATCTAGAGGGAAGTGTGCTGGAGTACATATAGTAATTCAGAATGTTGGTTGGGCTATTGTCAAATATACTTGACTTGAGAGAAGCTTTGAAAATGGGCTGAAAATGGAGACAAATGTTGTTGTGGGTGCTCAATTTGTTGGGCCAGTTAGATGAAACAGAGGCAATCCAATTAGTAGAGCGCCATAATATGATGTTGAAATTGGGGAGGATTTGCATTTGTAGCGGTTGTGCTAGCCCAGCCTATTTGTTAAAAGGAAGTTGGCAGCTCAAGATTTTAAATAGATTATTGAGTGCTCAATCAAGAAACCACACTTAAATACATTTCCTATCCCAATAATAGATCCACTTTTAGATGTAACAAATGGTGCTATTTTGTTTTTCGAAATTGGATCTAAAATCAAGCTATCATAAAATCAGGCCACAGCTGAAGGAAGTTGCTTAGACTTATGAAGGCCAACTGAATCTACTCTCGTGACAGCCTTTCCAATGTACTGACAAGTTTATGCTATTGGGTTTAATATTTAGTTGTCATATTAATGAAAATATGTTAGCTATAACTGCAATTTGGTTTACTAATGAATTGATGCTTGGGGGTGCCATTGTAGAAGCTGAGACGAGACCTTCTTGAAGATCGCATGAGATAA

mRNA sequence

ATGAGGAAAAGGAGGTGCGGTGGGCAGGGCAGAAGCAGGGGGCGGCGGTATAACCGAGGCGTGGGGTTTGGATACGGGTTGGAGCCGAAGAAGAATCGACCAAATCGACCGAACGAATTTCGTTGGTTTCGTCTTTTATTTGCTAGTGCGATTCTCGATGTGCTGGAGACTGGAGAATGGGTTGAAAAAAGTTCATGCGCCAATGCCCTAGCCAAATCCTTTGATTTGCTTGGTTCAGTGAGCATCACTCTTTCGATTTTGCGATCCATTGAGTACAAGAAAGGAGATAAACTCGGTGGTGGAATCCAATGCTGTAGTCCGTTGATTTTGATTCTACAAGATTTCAATCGAAGGACATTTGAGCATTTAACGCCGGAGCTGCCTTCAGCCCCAGAAGAGGGGCCATACATACTGTCTCTTGTGAATTCCGATGGAGACAAACTTTTTTTCTTCTTTACTTGTATGAGTGGTCTCTTGGTGGCACTGATCCTGATGGATGGGTTTTTAGATGTTCGTAGAGATGGCTTAGTTATCGAAGTCAGTGAAAACAAGACTAGTGTAGTTTATGGCCAGAGAGGAACTGGGATGAAGCTGAGACGAGACCTTCTTGAAGATCGCATGAGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGAAAAGGAGGTGCGGTGGGCAGGGCAGAAGCAGGGGGCGGCGGTATAACCGAGGCGTGGGGTTTGGATACGGGTTGGAGCCGAAGAAGAATCGACCAAATCGACCGAACGAATTTCGTTGGTTTCGTCTTTTATTTGCTAGTGCGATTCTCGATGTGCTGGAGACTGGAGAATGGGTTGAAAAAAGTTCATGCGCCAATGCCCTAGCCAAATCCTTTGATTTGCTTGGTTCAGTGAGCATCACTCTTTCGATTTTGCGATCCATTGAGTACAAGAAAGGAGATAAACTCGGTGGTGGAATCCAATGCTGTAGTCCGTTGATTTTGATTCTACAAGATTTCAATCGAAGGACATTTGAGCATTTAACGCCGGAGCTGCCTTCAGCCCCAGAAGAGGGGCCATACATACTGTCTCTTGTGAATTCCGATGGAGACAAACTTTTTTTCTTCTTTACTTGTATGAGTGGTCTCTTGGTGGCACTGATCCTGATGGATGGGTTTTTAGATGTTCGTAGAGATGGCTTAGTTATCGAAGTCAGTGAAAACAAGACTAGTGTAGTTTATGGCCAGAGAGGAACTGGGATGAAGCTGAGACGAGACCTTCTTGAAGATCGCATGAGATAA

Protein sequence

MRKRRCGGQGRSRGRRYNRGVGFGYGLEPKKNRPNRPNEFRWFRLLFASAILDVLETGEWVEKSSCANALAKSFDLLGSVSITLSILRSIEYKKGDKLGGGIQCCSPLILILQDFNRRTFEHLTPELPSAPEEGPYILSLVNSDGDKLFFFFTCMSGLLVALILMDGFLDVRRDGLVIEVSENKTSVVYGQRGTGMKLRRDLLEDRMR
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh07G011800.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6595519.1 (Bifunctional protein FolD 1, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 2.1e-10
Identity = 38/41 (92.68%), Postives = 39/41 (95.12%), Query Frame = 0 

Query: 63  KSSCANALAKSFDLLGSVSITLSILRSIEYKKGDKLGGGIQ 104
           KSSCANALAKSFD LGSVSITLSILRSI+YKKGDKL GGIQ
Sbjct: 14  KSSCANALAKSFDFLGSVSITLSILRSIQYKKGDKLDGGIQ 54

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh07G011800.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh07G011800.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh07G011800.1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6595519.12.1e-1092.68Bifunctional protein FolD 1, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subs... [more]
BLAST of CmaCh07G011800.1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmaCh07G011800CmaCh07G011800gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh07G011800.1:exon:1505CmaCh07G011800.1:exon:1505exon
CmaCh07G011800.1:exon:1506CmaCh07G011800.1:exon:1506exon
CmaCh07G011800.1:exon:1507CmaCh07G011800.1:exon:1507exon
CmaCh07G011800.1:exon:1508CmaCh07G011800.1:exon:1508exon
CmaCh07G011800.1:exon:1509CmaCh07G011800.1:exon:1509exon
CmaCh07G011800.1:exon:1510CmaCh07G011800.1:exon:1510exon
CmaCh07G011800.1:exon:1511CmaCh07G011800.1:exon:1511exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh07G011800.1:cdsCmaCh07G011800.1:cdsCDS
CmaCh07G011800.1:cdsCmaCh07G011800.1:cds_2CDS
CmaCh07G011800.1:cdsCmaCh07G011800.1:cds_3CDS
CmaCh07G011800.1:cdsCmaCh07G011800.1:cds_4CDS
CmaCh07G011800.1:cdsCmaCh07G011800.1:cds_5CDS
CmaCh07G011800.1:cdsCmaCh07G011800.1:cds_6CDS
CmaCh07G011800.1:cdsCmaCh07G011800.1:cds_7CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh07G011800.1CmaCh07G011800.1-proteinpolypeptide