CmaCh07G011800 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh07G011800
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr07: 6477095 .. 6482798 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh07G011800
SyntenyCmaCh07G011800
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGAAAAGGAGGTGCGGTGGGCAGGGCAGAAGCAGGGGGCGGCGGTATAACCGAGGCGTGGGGTAAAGAGCTGTCAATTGTGCGGTTCCCCAAAAAAGAAATTGAAGGCTTTGTGTTTGACCTTTTGCTTCTATTCCCCATTTTCTTTTCGCCATTTTCCTCTTGATCTTTTCTGCATGTGAATTCATTCTAATTACCCTTTTTTTTTCTTATAAAAACAATTAGCTGTTATAATTTTAAAAACAATTAATCCGTTCCAAGATCTCGCTGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGATTATAAACCCATGACCATTCCCTAAATTAACCGATGTGAGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCAGATTATAAACCCATGACCATTCCCTAAATTAACCGATGTGAGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCTCGAACAAAGCACGCCTCCCCTTACTAAATTAACCGATGTGAGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCTCGAACAAAGCACGCCTCCCCTTAATCGAGGCTTGACTCCTTTGGAGTCTTAGTCATTTTTGACTGCCTTCGTACCTTCAAGGAAGCTTGACTCCTTTTTGGAGTCCTTTGTTCGACATTTGAGGATTTGTCAATCTATTGGCACGGCTAAGTTTAGGGCATGACTCTGATACCATGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATAGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCATGGTTTTGCTTTGGGCTTCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGAGTGTATTCTTAGATTATAAACCCATGACCATTCCCTAAATTAACCGATTGTGGGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCTCGAACAAAGCACGCCTCCCCTTAATCGAGGCTTGACTCCTTTGGAGTCTTAGTCATTTTTTACTGCCTTCGTACCTTCAAGGAAGCTTGACAGATTGGCACGGCTAAGTTTAGGGCATGGCTCTGATACCATGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATGGTATGATATTGTCCAATTTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGAGTGTATTCTTAGATTATAAACTCATGACCATTCCCTAAATTAATCGATGTGGGACTTTCATCATCCAACACTCGCCTCCGTTAACGGTGTGTAAACCTCTTTAGTGGCTGCAATACGTAGCCAAAATAGACGGGCTGTTACTCATGGTATCAGAGCCTAGTCCTCACCTAACATAACACACTTAACTATAAACTTTCTATGACTGAGCTACTGACAAAGAATGTGTACCTTGTTGTTATAGATACTGAATTTCATTTCCTTTAAGCTTTTTTCCCTCATTTACTCTCGCGTAATAAGAAATATCTTGTTATTGACATTTTCGAAACCTCTTTACTCGGGTTTTCCAATCGTTCAGTAAATGTAAAGACTATTGCTTAAAACTTTCAACGTGGGTTCATTCTATATATGAAACTAAGTTCGAGATTCGGTACTTCGGGTTGGAAGATATTACGAGAACGAATGAGAAAAAGAGCTTAGAGAAGGAAACAAAGGCATAAACAATGCTTAAAAAATTCCAAAGATAAAGGCGAACGAGTTAGCAGCCAAAAACACAACGACGAGAGTGCTTCCTAACGAGGCATCCAATACCAAATCTTCACGAATTTTGATTGGCTTTGGTTGATTCATTTGTAGCTTTATTATTAAGCCATTTGGATCTCTCTCTCTGTTATTACTCCCTTTTTGGTACTCAAGAGTCTATCACTTGCCTTTTAGGGTTTTTAAAGGTTTGGATACGGGTTGGAGCCGAAGAAGAATCGACCAAATCGACCGAACGAATTTCGTTGGTTTCGTCTTTTATTTGCTAGTGCGATTCTCGATGTGCTGGAGACTGGAGAATGGGTTGAGTAAACTCGACCAGGGCTAACTAGCTTATGAGTTTTAGGGTATCGAAATGAAATTGAGTGAGTTTGTCTGGTTTGGATTAAGTTTTTCTTACGTGACTGACATTTAGAAATTTCCATGAGTGTGATAGGGACGGGGAAACTACGCCACCTTTTTCAATTCTCATCCCTGCAAAATTTCCTATTTATTTTTGCTATTTTTCGATTTCTTTTATTTTTAAAAAAAATAAATTATACAGTTCAAAGAATATTTTTAATGAATAATTTTCATTTTTTAATATAAAACACATCCTAATAAATCCAACAATATTTTATAAGCAAAAATATAATATAATATTCTACCAACATAATTTTTAAAAATTATAATGTGAATATTCTATCTCCATTCTACACCCTTATAAAAAATGTTTTGTTCCCCTCTCTGACCGACGTCCTCGCTAAGACTCGTTATTCTCTCCAATTGAGGTGGGATCTCACAATCCACTCCCCTTTGGGGTTGGGGTCCAACGTTTTGCTGGCACACTGCCCGATGTCTACCCCCTTCGAGGCTCAGCATTCTCGTTAGCACATTGTCCAGTGTTTGACTCTTTTACTATTTGTAACAGCCCAAGCCCACCGTTATTAGATATTGTTCTCTTTGGTTTTCCCCTTTCAAGCTTCCCCTCAAGGTTTTTAAAAGGCGTCTACTCGGGAGAGGTTTCCACAATGTTTCGTCCCCTCTCCAATTGATGTGAGGTCTCACACTCGTAATTTAGAATTTGAAATTCAAGTCTCGTGATTGTGGGGCTTTACAAATGGTATAAGACTATAGTGTAATTTATGACGAATCAAGCAAACGACGGTGGTAGTGTGATATTTAGAGTTAAAAATGGAAGCTTTAAATAAATTAGGGTTTAGGATATTTAATATTAAATTGTAGTTTTATATATATATATTTGATATTTTATTATAGGCAAATATATAGATATTTATCTATATTATATCTTTTAATTTATTATTATTTCTATATATTTGTAATTTATTTGATTATAAATAGAAAATTTTCAAAACATTTTTTTTTTTTTAAACTATTTTTATATATATATATTTTTTTATTTTAGCGAATTAGAATATTCATAAGAAAGCTTAAATAAAAAAAGTGAGTCTAAACAAGACGAAGGAAAATAAAACGAAAGAAAGCTCAGTGTTGTTCTGTAGTTCGCTCCATTTCCTTGGAACTGTCAATTTGCAGAAAAAGTTCATGCGCCAATGCCCTAGCCAAATCCTTTGATTTGCTTGGTTCAGTGAGCATCACTCTTTCGATTTTGCGATCCATTGAGTACAAGAAAGGAGATAAACTCGGTGGTGGAATCCAAGTCAGCCACTGGCGGCGGCGATGGAGGAACGATTTTTAACTCAAAGATGCGAGAGGAACGAATTCTTTCATAAAATTTTCTGATGTAGGGTCATGGCAGTGCTGTAGTCCGTTGATTTTGATTCTACAAGATTTCAATCGAAGGACATTTGAGCATTTAACGCCGGAGCTGCCTTCAGGTAATTGTTCTGTGGCGTTTTCCTCCGCTGTGTATGCCTTTACCTTTATTTATTGTGGTCTGTTATGTGATCAGCAATCGTTCTTAGTCGTTTCTTGTATTTTCTTTTTTAAGATGTTGATAATTTGCTATTATGATCTTGGTGCTTGTTATTGTGTTGTGTTCCTTTCGGTTTACTTGTTCAAATTTAGCGTTCTAAAGTAAATGATTCTTGGTAGTAAAATACTTGAATGGTATAGATTAGAGATTTAGCGAATGAGTTATATGGCAAGAAGGGAATGAATCTTGACATTGTAGTTGACAGTGACAAGAAAAAGGATGAGAAAGAAGAATGGTGATTTCATCGACCACTACTCATTTAGTTATAATTGTATGTGAGAAACTCCCGGTGATGTACAATCGTTGGGTTGTGTCTATTAATCTACTCATTCTTCCATTGCGGTTGGAAGCTATTTGAATTTACCCATCCTTCACATTACAAGTAGTAGGTTTTCGTTGAGTGTTATTATTGTCCTTCCAATGTGGGCTTCCACTTGATGTTCTGTATTGAGCAGCTGAAACATTGCTGAGTGTCCTAGTCTAGGTCTGACTCCTTTGAAGGGAAAAAAAATGTTTGTAAGAGATACCAAGTACGGGTCTAGTACATTACTATGAGTTAAGTGAGCTGTAAATTTTAAATAGAGGTTTGTATAGCTCAATATAGGTTTGTATACCTTAACTTCCCTTTCTTTGTGTGTAGAACATCATGTTCTAATAGACGTGTGTGTAGAACCAAAACCACTGATGATCTATCTTAAATTTTCTGTCCTCCATTTTCCTGATGGATTCAGTATACTGTTTTAACTGTGATCTTGAATTTTGTTTCTAATTAAAGAGAGACTTCCACAGACACTTTTGTTTTTGCAGATTGATCTTTCAGCCCCAGAAGAGGGGCCATACATACTGTCTCTTGTGAATTCCGATGGAGACAAACTTTTTTTCTTCTTTACTTGTGTTAGTACAATAGTTAACTCTGTTCACAACGAGACAGAAGATTTCTGACAGTGTCCATTGGGACTGCAGGGACAAAAGTTTACTGGAAATACACTCCATAAGTTTGGACATATTTTGCTGGAGAAAATTTAATATTATATTCTTCTGCCGATCCTATCTCATATCTTTGATCAAATTCATCAACTTTGAACTTTGTGTTTATTTAAAAACTTATTTGGAAACTTTTATAAGCCTCCAAAAAAGTTTTTGCATGCAAGGAGGAAGCACGGGATATTTAGCATGTCAAGATGATGGTTAGTTATATGACAGGGTATCTTTTGTAGAGAAGTGGTGTCATATTTGCTCCTTCAAGTACACTTCTTAAGATTGTATTTAATAGATGAGTGGTCTCTTGGTGGCACTGATCCTGATGGATGGGTTTTTAGATGTTCGTAGAGATGGCTTAGTTATCGAAGTCAGTGAAAACAAGACTAGTGTAGTTTATGGCCAGAGAGGAACTGGGATGGTTTAGTTGGATGTATAAATGGTGACACGGGAAGGACTGATGTATGTAAAATTACTCTCAGTCTATCTAGAGGGAAGTGTGCTGGAGTACATATAGTAATTCAGAATGTTGGTTGGGCTATTGTCAAATATACTTGACTTGAGAGAAGCTTTGAAAATGGGCTGAAAATGGAGACAAATGTTGTTGTGGGTGCTCAATTTGTTGGGCCAGTTAGATGAAACAGAGGCAATCCAATTAGTAGAGCGCCATAATATGATGTTGAAATTGGGGAGGATTTGCATTTGTAGCGGTTGTGCTAGCCCAGCCTATTTGTTAAAAGGAAGTTGGCAGCTCAAGATTTTAAATAGATTATTGAGTGCTCAATCAAGAAACCACACTTAAATACATTTCCTATCCCAATAATAGATCCACTTTTAGATGTAACAAATGGTGCTATTTTGTTTTTCGAAATTGGATCTAAAATCAAGCTATCATAAAATCAGGCCACAGCTGAAGGAAGTTGCTTAGACTTATGAAGGCCAACTGAATCTACTCTCGTGACAGCCTTTCCAATGTACTGACAAGTTTATGCTATTGGGTTTAATATTTAGTTGTCATATTAATGAAAATATGTTAGCTATAACTGCAATTTGGTTTACTAATGAATTGATGCTTGGGGGTGCCATTGTAGAAGCTGAGACGAGACCTTCTTGAAGATCGCATGAGATAA

mRNA sequence

ATGAGGAAAAGGAGGTGCGGTGGGCAGGGCAGAAGCAGGGGGCGGCGGTATAACCGAGGCGTGGGGTTTGGATACGGGTTGGAGCCGAAGAAGAATCGACCAAATCGACCGAACGAATTTCGTTGGTTTCGTCTTTTATTTGCTAGTGCGATTCTCGATGTGCTGGAGACTGGAGAATGGGTTGAAAAAAGTTCATGCGCCAATGCCCTAGCCAAATCCTTTGATTTGCTTGGTTCAGTGAGCATCACTCTTTCGATTTTGCGATCCATTGAGTACAAGAAAGGAGATAAACTCGGTGGTGGAATCCAATGCTGTAGTCCGTTGATTTTGATTCTACAAGATTTCAATCGAAGGACATTTGAGCATTTAACGCCGGAGCTGCCTTCAGCCCCAGAAGAGGGGCCATACATACTGTCTCTTGTGAATTCCGATGGAGACAAACTTTTTTTCTTCTTTACTTGTATGAGTGGTCTCTTGGTGGCACTGATCCTGATGGATGGGTTTTTAGATGTTCGTAGAGATGGCTTAGTTATCGAAGTCAGTGAAAACAAGACTAGTGTAGTTTATGGCCAGAGAGGAACTGGGATGAAGCTGAGACGAGACCTTCTTGAAGATCGCATGAGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGAAAAGGAGGTGCGGTGGGCAGGGCAGAAGCAGGGGGCGGCGGTATAACCGAGGCGTGGGGTTTGGATACGGGTTGGAGCCGAAGAAGAATCGACCAAATCGACCGAACGAATTTCGTTGGTTTCGTCTTTTATTTGCTAGTGCGATTCTCGATGTGCTGGAGACTGGAGAATGGGTTGAAAAAAGTTCATGCGCCAATGCCCTAGCCAAATCCTTTGATTTGCTTGGTTCAGTGAGCATCACTCTTTCGATTTTGCGATCCATTGAGTACAAGAAAGGAGATAAACTCGGTGGTGGAATCCAATGCTGTAGTCCGTTGATTTTGATTCTACAAGATTTCAATCGAAGGACATTTGAGCATTTAACGCCGGAGCTGCCTTCAGCCCCAGAAGAGGGGCCATACATACTGTCTCTTGTGAATTCCGATGGAGACAAACTTTTTTTCTTCTTTACTTGTATGAGTGGTCTCTTGGTGGCACTGATCCTGATGGATGGGTTTTTAGATGTTCGTAGAGATGGCTTAGTTATCGAAGTCAGTGAAAACAAGACTAGTGTAGTTTATGGCCAGAGAGGAACTGGGATGAAGCTGAGACGAGACCTTCTTGAAGATCGCATGAGATAA

Protein sequence

MRKRRCGGQGRSRGRRYNRGVGFGYGLEPKKNRPNRPNEFRWFRLLFASAILDVLETGEWVEKSSCANALAKSFDLLGSVSITLSILRSIEYKKGDKLGGGIQCCSPLILILQDFNRRTFEHLTPELPSAPEEGPYILSLVNSDGDKLFFFFTCMSGLLVALILMDGFLDVRRDGLVIEVSENKTSVVYGQRGTGMKLRRDLLEDRMR
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh07G011800 vs. NCBI nr
Match: KAG6595519.1 (Bifunctional protein FolD 1, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 2.1e-10
Identity = 38/41 (92.68%), Postives = 39/41 (95.12%), Query Frame = 0 

Query: 63  KSSCANALAKSFDLLGSVSITLSILRSIEYKKGDKLGGGIQ 104
           KSSCANALAKSFD LGSVSITLSILRSI+YKKGDKL GGIQ
Sbjct: 14  KSSCANALAKSFDFLGSVSITLSILRSIQYKKGDKLDGGIQ 54

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh07G011800 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh07G011800 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh07G011800 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6595519.12.1e-1092.68Bifunctional protein FolD 1, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subs... [more]
BLAST of CmaCh07G011800 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh07G011800.1CmaCh07G011800.1mRNA