CmUC01G012940.1 (mRNA) Watermelon (USVL531) v1

Overview


Name	CmUC01G012940.1
Type	mRNA
Organism	Citrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
Description	Unknown protein
Location	CmU531Chr01: 25316300 .. 25323730 (-)
Sequence length	351
RNA-Seq Expression	CmUC01G012940.1
Synteny	CmUC01G012940.1

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGTGACAACCCACCAGCAGCGGCGTTCAGGTGATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCGAGCAGGTGTGCGACGGCTGCAGCTCTGAGCAGGTCTGCAACAGCTGCAGCAACGAACAGGTGTGCGACGACGGTAGCGAACGTCCCTAGAGGTGGTAGCGTCCGGTGCGGCAATGGTGAGGAAAAAAATTAGGGGGAGGTTGAAAGGAGAAGAGAAAACAAAAAAATAGGGGGAGTGTTTTAGAGGGAAATTAAAAAGATGGGGGAAATAAAATAAAAAATGTGAGAAAAATAAAGTGGGGGGAGGATTTTAAGGATGTGAGATTTAAGTAATTTTTATCCACAAATTTTAACTTCCCTCATTTTCTCAAAATTTGAAATTTTAAAAAATATTAATGACTATTAAAATTTGTCACTTTTTAATGACTATGAATTGTAGTCATAAATTGGTGACAAAAAAAATGTCAAAATAGTAAAAAAAAAAAATCCGAAAATTCACTTCTTTTCTCGCCAAAACTATATTTTTCATTTTCTTACATTTAATGACTGTTTTTTTCGGTCATTAATTAATGACACAAAAAAACAGTCATCAATTCCGACAAATCTGAAAAACTTCGTTTTTTCCGGCAAAAAACGCGTGAATTTGGCTTTAATGACTGTTTTTTTTCTCTCTCATCTATTTCTGCTACTGTACAAAGAGTCATGGAAGGTGAAAATTGTTGTAGTGTTCATGACTTTCCTAAATTTATTTGATGCGAAACAACTGCACTTCTAATGTTTTGCCAAAAATCCAATAATATTTTACTATATTTGTAAATAAATTGACTTATTTTGCAATATTTGAAACGACTCTTTAACCTTTTTAGTATTAAACTCGAGTTATGTACTTTAATCTAGATGATCAATCTAGACTAAAAATGGAAATAAACTCAATAAAAGCAAATCATGCTATGGAAATGAGCAAAATAACTTTTTGTGCATGAAATACTTATTCTCTTCCTCTTCGGTATTTACATACTTAAATCCCACGTAATAATTTAGACCATGACGAAATAAGAAAGCAGTAGTCGAAAAGGATGCATATATCGAAAGAAAGACTTGAAAAATGAAAATATCAATAATGGACTTGTGTTAACTAATGGAAAAAATGTACACAAGTTAAAATCAAATGAAACTTGTAACTAAAAAATTGTAAGATAGATGAAGAGAAAAATACAAAACAAGAGACTAAAATAAATGTTGGATAATTTAAGTCCATAAACGGTAGAATTATAAGAAGAACGACGAACTCAACCCAAGAGATCGCTACCACTTCCTTCAGTCAACTCAACTTTCTTTTTCAAAGATAGTTGGAGTGTTGATGCCTTGAACCTTTTGATAAGGGTGGACTGAAAAAATGGTAGCAAGAATTCGAGGAGATAAAAAAATAAAACTAAAACAAAATGCTAAAGGTAACAAGGAATTTTTGTTTTGAGAATGGTGTGTATTGAGTCCTTTACATACAAAGATTATCTTCAAGATTTTTGCAGGATAAATCTCATAAAATCAGCTTATAAATCATTGGATAATTCCTTCCAGAGCTACTGTGATTCTAATATTATTTCTTTTTCTAGAGATCCGCCCAGTTGTCAGGTAATGTAATTGCATTAGGAAACTGCAATTCTGAAATTTGCACCAATTTCCTTCCATAAACACAAAATTTATAAGGATGTATTTCAAAAATTAAGAATCAAGGATTTTGAATGAACTCATGCAAAATATTTTTATTTTCTTACCATTCCTTACTACTTAGGTTAAAAATACATTAAAACTAGTTAGTAATTGAAGTTTTCAGAGCTAAATAAGTCCCATAAAAAAAGACTTATAAAAAATATTAAAAATTCAAAAATGTTGATGCAAATTTAGATGATAGCATGCAAATAATGTATTATCTTTAAGCTTTAAGGTTTAGTTTATACTAATTTTGAAGGATATTTTGATGGTTTAATGTTCATATTTGGTTATTTTATAAAATTGGAGCATTTGGAGTAAAATCAGAGACTTTTGGTAAAATAATGAGCATATTATGCCATTGAGACTAGAATTGAAGAGTAAGTGAAAGTAATGTTGAAGTAAAACAAAAAAGAAGAAAAACAGACAAAGTTGGGTTATTGAAGCAGCTCCAAGTCATACATCCCTACCCTAGACCGCAACGTCCAGAAACTACGTGTTTCGAAGGCATTTTGATCATTTTGAGCTATAAATTCCTCTCTTTTTCATCCCATTTTAGGGCATCTTTTAGAGGGGAAAATGCAATTTGGTATCTACTCAATTTTAGAGAGCATTCTTGAAAATAAGGAATTTAAGGTTCGAGATCGTGATCGTAGTAGATCTCATTCATGTGTCAATCGTAATGAGCCGAAATCGTAAAGAAAAATAGATTTTTTTTTAGCCCGTTTACATAAATAGTTAATTTTCAATTGTAATTTGATTGTCATTGAAGCCATTTATATTAACATTTGTAATTGGAATGGATGTTGTTGTCATTACTATAATAAACATATTACCAAGCATCTGATTATATTTGGAATGGATGTTGTTGTTCTTTATTTGTTTGGTATTTTGTTTAGTATTTGGGTTTCTGATTATATGATCAATTGTTCCTTTCCTTTCCTTCATTGTTATCTTGCTTTGTGGTTCAATTATTGTGCGGTATTGTTACATTGTTTAGATTTGATCTCATATACGTTATCGATATTCGAACGATACAGGTAGCAATATCAATACCGATATCAATAATCGAAATCAATATTAATACCGATCGACATCTCGGCACTTCATGATTAAAAATAACATAAAGTGTCTCGATATATATACTGGTATTTAGATCAAATATCGATACTGATACAAAAATATAACCGTTTATATATATAGATATCGATACCAATTTTAAACGCAACAAAAACCATATGGATGGTAATTGAATTGGATGGAAGATGTATGAGGGCAAAATCTAAAAAATGCTTAAAGGTTCACACAAAAAGAGGAATGAGTCCCACGTAATTATTAAAAGTAATCAAATTGATCACCGTTTCATCTACAATTAGATTATGGATTGGGATACAATTTTTGTTGTGGGGTCCAATTTTCATTATGATTACAAAATGTTGGTAAACACCAAAAATTATAATTAACTACGCTACACTTTTCATATTACATTAATTGATTACGTTTACAAATAAGTAAGTAGATGCGGCGTTAGTGTTTTAGGGTTTGAATGATTTAGTTGGAATTTGTAATGTCTATATTGGCAGACTATTTTTATGTTGCCACTTAAGATTAATGTGTTTTGTGATTATTTGTTTAATTCTTTAGCCCTGAGTTAAATCTGTTTGATCTAAATTATAGCTTAGAAATGTAAAATTTAGATATATAAACTTGGATGCATGGTTTTTATAATAACTTGTACAACAGTGAAGTTATTTCTAATAGAGGTCAGTTAATACCCTTATTTGTTTAATAGAAAATAGATAAAGATGTTGATTCTATGAATAACCTAAGTAGAAGACTTAATTGAGATAAGGAGAGAGTAGTTAATAAAATTAGTGTCGTCCGGCCTTTATTAATCACTTCTACTTTTGCGGTTTGGAGTGCTTCGATTCCTCCGATTGTTCTAAGTAAATAGTTAGATTAGTTTAGATTGATTAACTCACTTTCTCTTTTAGGTTCTCTAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATTATATAAAGTGTTAGTGCTTAGTCAAACAAGAAATCTAATCCTAAAAACGACACTCAATTTACTATACTAAAACTTGTCATTATCCTAAATTTGTAGGTTTTGAATGGTGTAAAAATCATGTAGCATCGGACCGATGTTAAATTTGTTTTCTAGTGTGGAAACTAAATGAATATTCATTGTAGATAAAAGACTAGGGTTTTTCTATGCATACCTAGCATCTATGTATTGTATTCTCTCATTATTTATTGAGAGGTTTTGTGGAATTATGAGACTTGATGGCATCTTGCCGAAAAGCTAGATAGATTTTTGGGATGTTTTTGATAAAAATAAAAAAAATGGTAAAGAAGTTGAGAATCGAGCATTTTTCTCGACGGTTTATGAAGCGCGGGAAAAAGTAGTTATCCCAACGTCATTTCTTATTTTTGTCAGAAAATGTATGCCTATCCCGACGAAATTTAGTTGGCGATGGTAAAAAACCTTCTGTAGAGACTTTCCTACGTTTTTTTTCTTTATATACTTTTTTTGAAAATTTTAACCCTTACAAAAATGACAAATTTCTTATAGCAATTGCTATAGATTTGTTAACCCTCTTTAATATTTTATGATAATGGAAGGTTTTATCAACTTTACTACGTAAAGAAAGTAGGTATTACTGCGATTGTTGTTTGATTCATCCCATGGAGAAAACGACTCCGTTTTGTGTATAGGCCAACAACATGTGTGACAATTGGTCGAGTAGTCAACTTCTGTTTGAAATGAAAATGATGTCATTTCATGTATAATAGCTATCATCTCTTTGCTTGAAAAAAAAATAATAATAAATAAAAAACTACCTATCATCTCTTCTCCCAAACATATTTCAACTTCTTTTAGGAAACAAATCCACATCTATTCTACATTTTGACAACACCCCACTCTCTTTAAAGATGACAAAATATAAGTAGCAACTGAAAATAAATCATAAAACACATTCCAATTAGTGTTGGTCATGATTATACCTAAGTATTGGTTACTTTGATTATTTTAGTCAGTAAGATAAGTTTTCTTTCTTTCTTTTTTATTCTTGATGATTTTATATGAAGAAATAGAAAGGTTCATTCACCGTTAATATTGGACCCATAAAAATTTAAAAATATTAATGACTAAGTTAACATGTCTATGAAAATTGAGTATTTTAATGATTACATCCAATAATTTTATAAAGTTTGGTTTTGAAGTTTCCAAATTGTGTAATAAATTCCTA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mRNA sequence

ATGGTGACAACCCACCAGCAGCGGCGTTCAGGTGATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCGAGCAGGTGTGCGACGGCTGCAGCTCTGAGCAGGTCTGCAACAGCTGCAGCAACGAACAGGTGTGCGACGACGGTAGCGAACGTCCCTAGAGGTGGTAGCGTCCGGTGCGGCAATGAAGGAGAAGAAGCGAGTGTTACCCATGCTCGACATACATGCAACCTGAAGCTTCGTGACATTCTACTAGAGTCAATTCGCCGTCATCCCCCTTTGAGGACCGGTCGGAGCATTCTGAGAGGGTTTCACGAAGACCTAGCTACGAGAGAGTGTTTGGCTGTCACTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGACAACCCACCAGCAGCGGCGTTCAGGTGATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCGAGCAGGTGTGCGACGGCTGCAGCTCTGAGCAGGTCTGCAACAGCTGCAGCAACGAACAGGTGTGCGACGACGGTAGCGAACGTCCCTAGAGGTGGTAGCGTCCGGTGCGGCAATGAAGGAGAAGAAGCGAGTGTTACCCATGCTCGACATACATGCAACCTGAAGCTTCGTGACATTCTACTAGAGTCAATTCGCCGTCATCCCCCTTTGAGGACCGGTCGGAGCATTCTGAGAGGGTTTCACGAAGACCTAGCTACGAGAGAGTGTTTGGCTGTCACTTGA

Protein sequence

MVTTHQQRRSGDGGRQRATSAAASRCATAAALSRSATAAATNRCATTVANVPRGGSVRCGNEGEEASVTHARHTCNLKLRDILLESIRRHPPLRTGRSILRGFHEDLATRECLAVT

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmUC01G012940.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmUC01G012940.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmUC01G012940.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmUC01G012940.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..21

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
CmUC01G012940	CmUC01G012940	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmUC01G012940.1-exon	CmUC01G012940.1-exon-CmU531Chr01:25316300..25316466	exon
CmUC01G012940.1-exon	CmUC01G012940.1-exon-CmU531Chr01:25323547..25323730	exon

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmUC01G012940.1-cds	CmUC01G012940.1-cds-CmU531Chr01:25316300..25316466	CDS
CmUC01G012940.1-cds	CmUC01G012940.1-cds-CmU531Chr01:25323547..25323730	CDS

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmUC01G012940.1	CmUC01G012940.1-protein	polypeptide