CmUC01G012940.1 (mRNA) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC01G012940.1
TypemRNA
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmU531Chr01: 25316300 .. 25323730 (-)
Sequence length351
RNA-Seq ExpressionCmUC01G012940.1
SyntenyCmUC01G012940.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTGACAACCCACCAGCAGCGGCGTTCAGGTGATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCGAGCAGGTGTGCGACGGCTGCAGCTCTGAGCAGGTCTGCAACAGCTGCAGCAACGAACAGGTGTGCGACGACGGTAGCGAACGTCCCTAGAGGTGGTAGCGTCCGGTGCGGCAATGGTGAGGAAAAAAATTAGGGGGAGGTTGAAAGGAGAAGAGAAAACAAAAAAATAGGGGGAGTGTTTTAGAGGGAAATTAAAAAGATGGGGGAAATAAAATAAAAAATGTGAGAAAAATAAAGTGGGGGGAGGATTTTAAGGATGTGAGATTTAAGTAATTTTTATCCACAAATTTTAACTTCCCTCATTTTCTCAAAATTTGAAATTTTAAAAAATATTAATGACTATTAAAATTTGTCACTTTTTAATGACTATGAATTGTAGTCATAAATTGGTGACAAAAAAAATGTCAAAATAGTAAAAAAAAAAAATCCGAAAATTCACTTCTTTTCTCGCCAAAACTATATTTTTCATTTTCTTACATTTAATGACTGTTTTTTTCGGTCATTAATTAATGACACAAAAAAACAGTCATCAATTCCGACAAATCTGAAAAACTTCGTTTTTTCCGGCAAAAAACGCGTGAATTTGGCTTTAATGACTGTTTTTTTTCTCTCTCATCTATTTCTGCTACTGTACAAAGAGTCATGGAAGGTGAAAATTGTTGTAGTGTTCATGACTTTCCTAAATTTATTTGATGCGAAACAACTGCACTTCTAATGTTTTGCCAAAAATCCAATAATATTTTACTATATTTGTAAATAAATTGACTTATTTTGCAATATTTGAAACGACTCTTTAACCTTTTTAGTATTAAACTCGAGTTATGTACTTTAATCTAGATGATCAATCTAGACTAAAAATGGAAATAAACTCAATAAAAGCAAATCATGCTATGGAAATGAGCAAAATAACTTTTTGTGCATGAAATACTTATTCTCTTCCTCTTCGGTATTTACATACTTAAATCCCACGTAATAATTTAGACCATGACGAAATAAGAAAGCAGTAGTCGAAAAGGATGCATATATCGAAAGAAAGACTTGAAAAATGAAAATATCAATAATGGACTTGTGTTAACTAATGGAAAAAATGTACACAAGTTAAAATCAAATGAAACTTGTAACTAAAAAATTGTAAGATAGATGAAGAGAAAAATACAAAACAAGAGACTAAAATAAATGTTGGATAATTTAAGTCCATAAACGGTAGAATTATAAGAAGAACGACGAACTCAACCCAAGAGATCGCTACCACTTCCTTCAGTCAACTCAACTTTCTTTTTCAAAGATAGTTGGAGTGTTGATGCCTTGAACCTTTTGATAAGGGTGGACTGAAAAAATGGTAGCAAGAATTCGAGGAGATAAAAAAATAAAACTAAAACAAAATGCTAAAGGTAACAAGGAATTTTTGTTTTGAGAATGGTGTGTATTGAGTCCTTTACATACAAAGATTATCTTCAAGATTTTTGCAGGATAAATCTCATAAAATCAGCTTATAAATCATTGGATAATTCCTTCCAGAGCTACTGTGATTCTAATATTATTTCTTTTTCTAGAGATCCGCCCAGTTGTCAGGTAATGTAATTGCATTAGGAAACTGCAATTCTGAAATTTGCACCAATTTCCTTCCATAAACACAAAATTTATAAGGATGTATTTCAAAAATTAAGAATCAAGGATTTTGAATGAACTCATGCAAAATATTTTTATTTTCTTACCATTCCTTACTACTTAGGTTAAAAATACATTAAAACTAGTTAGTAATTGAAGTTTTCAGAGCTAAATAAGTCCCATAAAAAAAGACTTATAAAAAATATTAAAAATTCAAAAATGTTGATGCAAATTTAGATGATAGCATGCAAATAATGTATTATCTTTAAGCTTTAAGGTTTAGTTTATACTAATTTTGAAGGATATTTTGATGGTTTAATGTTCATATTTGGTTATTTTATAAAATTGGAGCATTTGGAGTAAAATCAGAGACTTTTGGTAAAATAATGAGCATATTATGCCATTGAGACTAGAATTGAAGAGTAAGTGAAAGTAATGTTGAAGTAAAACAAAAAAGAAGAAAAACAGACAAAGTTGGGTTATTGAAGCAGCTCCAAGTCATACATCCCTACCCTAGACCGCAACGTCCAGAAACTACGTGTTTCGAAGGCATTTTGATCATTTTGAGCTATAAATTCCTCTCTTTTTCATCCCATTTTAGGGCATCTTTTAGAGGGGAAAATGCAATTTGGTATCTACTCAATTTTAGAGAGCATTCTTGAAAATAAGGAATTTAAGGTTCGAGATCGTGATCGTAGTAGATCTCATTCATGTGTCAATCGTAATGAGCCGAAATCGTAAAGAAAAATAGATTTTTTTTTAGCCCGTTTACATAAATAGTTAATTTTCAATTGTAATTTGATTGTCATTGAAGCCATTTATATTAACATTTGTAATTGGAATGGATGTTGTTGTCATTACTATAATAAACATATTACCAAGCATCTGATTATATTTGGAATGGATGTTGTTGTTCTTTATTTGTTTGGTATTTTGTTTAGTATTTGGGTTTCTGATTATATGATCAATTGTTCCTTTCCTTTCCTTCATTGTTATCTTGCTTTGTGGTTCAATTATTGTGCGGTATTGTTACATTGTTTAGATTTGATCTCATATACGTTATCGATATTCGAACGATACAGGTAGCAATATCAATACCGATATCAATAATCGAAATCAATATTAATACCGATCGACATCTCGGCACTTCATGATTAAAAATAACATAAAGTGTCTCGATATATATACTGGTATTTAGATCAAATATCGATACTGATACAAAAATATAACCGTTTATATATATAGATATCGATACCAATTTTAAACGCAACAAAAACCATATGGATGGTAATTGAATTGGATGGAAGATGTATGAGGGCAAAATCTAAAAAATGCTTAAAGGTTCACACAAAAAGAGGAATGAGTCCCACGTAATTATTAAAAGTAATCAAATTGATCACCGTTTCATCTACAATTAGATTATGGATTGGGATACAATTTTTGTTGTGGGGTCCAATTTTCATTATGATTACAAAATGTTGGTAAACACCAAAAATTATAATTAACTACGCTACACTTTTCATATTACATTAATTGATTACGTTTACAAATAAGTAAGTAGATGCGGCGTTAGTGTTTTAGGGTTTGAATGATTTAGTTGGAATTTGTAATGTCTATATTGGCAGACTATTTTTATGTTGCCACTTAAGATTAATGTGTTTTGTGATTATTTGTTTAATTCTTTAGCCCTGAGTTAAATCTGTTTGATCTAAATTATAGCTTAGAAATGTAAAATTTAGATATATAAACTTGGATGCATGGTTTTTATAATAACTTGTACAACAGTGAAGTTATTTCTAATAGAGGTCAGTTAATACCCTTATTTGTTTAATAGAAAATAGATAAAGATGTTGATTCTATGAATAACCTAAGTAGAAGACTTAATTGAGATAAGGAGAGAGTAGTTAATAAAATTAGTGTCGTCCGGCCTTTATTAATCACTTCTACTTTTGCGGTTTGGAGTGCTTCGATTCCTCCGATTGTTCTAAGTAAATAGTTAGATTAGTTTAGATTGATTAACTCACTTTCTCTTTTAGGTTCTCTAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATTATATAAAGTGTTAGTGCTTAGTCAAACAAGAAATCTAATCCTAAAAACGACACTCAATTTACTATACTAAAACTTGTCATTATCCTAAATTTGTAGGTTTTGAATGGTGTAAAAATCATGTAGCATCGGACCGATGTTAAATTTGTTTTCTAGTGTGGAAACTAAATGAATATTCATTGTAGATAAAAGACTAGGGTTTTTCTATGCATACCTAGCATCTATGTATTGTATTCTCTCATTATTTATTGAGAGGTTTTGTGGAATTATGAGACTTGATGGCATCTTGCCGAAAAGCTAGATAGATTTTTGGGATGTTTTTGATAAAAATAAAAAAAATGGTAAAGAAGTTGAGAATCGAGCATTTTTCTCGACGGTTTATGAAGCGCGGGAAAAAGTAGTTATCCCAACGTCATTTCTTATTTTTGTCAGAAAATGTATGCCTATCCCGACGAAATTTAGTTGGCGATGGTAAAAAACCTTCTGTAGAGACTTTCCTACGTTTTTTTTCTTTATATACTTTTTTTGAAAATTTTAACCCTTACAAAAATGACAAATTTCTTATAGCAATTGCTATAGATTTGTTAACCCTCTTTAATATTTTATGATAATGGAAGGTTTTATCAACTTTACTACGTAAAGAAAGTAGGTATTACTGCGATTGTTGTTTGATTCATCCCATGGAGAAAACGACTCCGTTTTGTGTATAGGCCAACAACATGTGTGACAATTGGTCGAGTAGTCAACTTCTGTTTGAAATGAAAATGATGTCATTTCATGTATAATAGCTATCATCTCTTTGCTTGAAAAAAAAATAATAATAAATAAAAAACTACCTATCATCTCTTCTCCCAAACATATTTCAACTTCTTTTAGGAAACAAATCCACATCTATTCTACATTTTGACAACACCCCACTCTCTTTAAAGATGACAAAATATAAGTAGCAACTGAAAATAAATCATAAAACACATTCCAATTAGTGTTGGTCATGATTATACCTAAGTATTGGTTACTTTGATTATTTTAGTCAGTAAGATAAGTTTTCTTTCTTTCTTTTTTATTCTTGATGATTTTATATGAAGAAATAGAAAGGTTCATTCACCGTTAATATTGGACCCATAAAAATTTAAAAATATTAATGACTAAGTTAACATGTCTATGAAAATTGAGTATTTTAATGATTACATCCAATAATTTTATAAAGTTTGGTTTTGAAGTTTCCAAATTGTGTAATAAATTCCTA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mRNA sequence

ATGGTGACAACCCACCAGCAGCGGCGTTCAGGTGATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCGAGCAGGTGTGCGACGGCTGCAGCTCTGAGCAGGTCTGCAACAGCTGCAGCAACGAACAGGTGTGCGACGACGGTAGCGAACGTCCCTAGAGGTGGTAGCGTCCGGTGCGGCAATGAAGGAGAAGAAGCGAGTGTTACCCATGCTCGACATACATGCAACCTGAAGCTTCGTGACATTCTACTAGAGTCAATTCGCCGTCATCCCCCTTTGAGGACCGGTCGGAGCATTCTGAGAGGGTTTCACGAAGACCTAGCTACGAGAGAGTGTTTGGCTGTCACTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGACAACCCACCAGCAGCGGCGTTCAGGTGATGGAGGCAGACAGCGTGCGACATCGGCGGCGGCGAGCAGGTGTGCGACGGCTGCAGCTCTGAGCAGGTCTGCAACAGCTGCAGCAACGAACAGGTGTGCGACGACGGTAGCGAACGTCCCTAGAGGTGGTAGCGTCCGGTGCGGCAATGAAGGAGAAGAAGCGAGTGTTACCCATGCTCGACATACATGCAACCTGAAGCTTCGTGACATTCTACTAGAGTCAATTCGCCGTCATCCCCCTTTGAGGACCGGTCGGAGCATTCTGAGAGGGTTTCACGAAGACCTAGCTACGAGAGAGTGTTTGGCTGTCACTTGA

Protein sequence

MVTTHQQRRSGDGGRQRATSAAASRCATAAALSRSATAAATNRCATTVANVPRGGSVRCGNEGEEASVTHARHTCNLKLRDILLESIRRHPPLRTGRSILRGFHEDLATRECLAVT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..21

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmUC01G012940CmUC01G012940gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC01G012940.1-exonCmUC01G012940.1-exon-CmU531Chr01:25316300..25316466exon
CmUC01G012940.1-exonCmUC01G012940.1-exon-CmU531Chr01:25323547..25323730exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC01G012940.1-cdsCmUC01G012940.1-cds-CmU531Chr01:25316300..25316466CDS
CmUC01G012940.1-cdsCmUC01G012940.1-cds-CmU531Chr01:25323547..25323730CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmUC01G012940.1CmUC01G012940.1-proteinpolypeptide