Tan0016231 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTGGAAGAAGAAGCTGCCAATGGCTTCAGTCCAGAAGATTGCCAGCGTCAAATCCATTGCTGAAACACCTAACTTAGCCTCCATTCCCTCCACTTACATCTTCTCCGCCGCCGCCGGTGAAGAAACTGCTCCACAAGCCATGGAAGATTCAATCCCCACCGTTGATTTCGCTCTGCTCACAGCCGGTACCCCCGATCAACGGTCCAAAGTCGTCGACGAGCTTGGCAAGGCCTGTCGAGACTGGGGCTTCTTCATGGTGCGTGTGTAGATGCAAGTTAAATTATACCAAATATCTCTTACTTGAATGAATGAAGTTCGTTTTAATTTGGTTCTTAATGTTTTAACAGTTTTGTCTCTACCATTAATTTTTTGCTTTATTCAAAAATGTTCTTTTGAATGAATATTAAGAGATTTGAGAGTTGGATGGAAACATTTAACATATTAGGAACACAATTAAAACTACCTACATATTCGAGGACATTTTTCATAATATATACTTGGTTTTATCTCTTGTCTCTAACTTATGCATTAGGTTTTAAAAAATATTCCTTATGGATTTTTTTTTTGAGAAAACCTTATGGAAGTTTGTTGAACATAAGTTGTTGTGCATATATATATATATATATATATATATAATTTAGTTTTTGCCCCCTAATCTCATCTATACATTATAAAAGTTTTAAGGCTGAAGTTCTATTTTTGACCTTGAATTTTCAAGAGTTTTTTTTTTTTTACTAGCTTCGAGCCCCCCTTAACTTAAAAAAAAAGATATTTATATTAGTATTATATAATTTGTATTATAAACAAAAATTGGCCAATGACATGAATGACTCCTGATCCTCCTCCTACTTCCACATCTTCCAAATATTTGGCACTTAAGAAAAAAAATTATTATTATTAAAATACATTTGAATTTCTAAGACAGGTTCCTTTGAATAACTCTATCTACAAATATTTACGATTTATAAAAAATAAAATAATAACAAATATATACTATTATATTTTTAGATTTAATTTATTCTTTAAATTATAGTTTGTAACATGCTTGTATTGTAGTTTCAATTTTATCACAATTTAGTTTCTAAATTTTATTGTATAAGAATTTAAGTTTAGTTTATAATTGCGGTAAATTTTAAAATAAGTGCTGTAATTGTGTGTTTTAGAAAAATGAAATGTTGGTAAGTTTTAGTTATAAACCTACCAAAAAAAAATATATATATATATTTTCAGGTGATCAATCATGGAATAGCAGAGAGGGTGAGGAAGGAGATGATGGATTGTTGTAAAGAGTTTTTTGATCTGAGGGAGGAGGAGAAGAGAGTGTACGAAACAAAGCATGTACTCGACCCCATACGATACGGCACCAGCTTCAATCCTCACATAGAGAAAGTGTTGTTATGGAGAGATTATCTCAAAATCATGGTTCATCCTAACTTTCATTCTCCAACTAAACCCCCAACTTTCAGGTCTATTTCTTTTCTTCTCTCTTTTTCTATTCTATAAGAAATATTTTTGAAGTTATTTTATACTTGATGGATTTCAAATGAGTTTCGTTCATCATCCTTTAAAATAGAATGATTTTTTTTTGAAAAGATGCCCTAACGTTTGAAGTAAGTTTCAATTTTGCTACTTTTAAACTTTTAAAATTGTTTAAAAAGTATTACATCTTATGTTAAAAAATGAAAGATAGAAATACAACGCATGTGATGATGAAATTACATATGTGGTTGTGAGTTATATATTATTTAAAGTTTCAACTATGCCCCCTTAGTTATTATTTTAAAGTTTCATTCTAACTTTAAGTTTTGAGTACAACAACACATTTAAGGGAGGGATTCGAACGTTTAGTCATGAGTCATACTTGATGCCAGTTGAACTATGTTTTTGTTGACACTCTAACTTTAAGTTATTTTAATAAGAGTATCATTTTCGTTAAATTTCTAGTTAAAATGAAGACAAAAATGAGATGGGGGCAATAAGCAATAAAAAGAACTCAAGGATATTAGTTGCATTTCAAAATAGTGATAGAATTTAGAGGGAGGAGCAAATTTAGGGTTACGAGTAAAACGTTATTTGTGATCAATAGATGGAAATTAGATTTAGGAAGAAGAGAGGAGAAACAATTGAGAAATGCAAACCCAAGAAATTAATTGAATCTAGGGGACCACTATTTGTGATCAGTACCTACCCTTTTTAATTTTATGGACCATATTTTCGCGCACAATTTTTCTCCCACAAATTTATTATGATTCCACTTTTGTTCTGACCCTACCACTCTTCAATTTTTTCAGAGGGGCAATTTTCATAACGGATGTGGATGCTTGATTTTTTAGGGTTTTGGTACGGATAACCTACTTCCACGAATTTTAATGGTTGATGACCTGCATTCTGAAATTAATGAAATATGACTCATTCTAGCGTGACAATACACGCAAAATTACTCATGAGGGTAATATAAAACGATTTTTCTTGTTCACGCTCTCGTATACGGAAACGTTCTCGCTCTCGTTCTCTCGCTCTCACTCAAATGAGTGGTCGAAAATATGGAGAGAGAAAAAATAGGTCGGCAGCATAACAGCGCTATCCAGATGAATCCAAAATTTTTACTTAACCTGTTTAAGCAAGAAACACTTCTAAGGACTTTTTCAATGCCCGACCTCCCCCCAAACTACAACAAAATAGGCCAAGCTCCAGCAGAACACACAACAGAGGCAACGAAAGCACTAAACAAAAGTTAAACGGGCATGCTGAACAAGGAAACTAAATGAATAACGTCATGCTCAACAACCCAAAGAGTTCAGAAATCCAACGAGCAATAAACAGAAGTCATAGTTCAACTCATAGATACAAAGAGCTTCCTAAGTTCCAAAATAAAGGTTCCTCTAAGACAAGAATGGTCTCATAGCCCCGTCATGTCGCCACCGTCGCTCTCTAGTGAAGGGAATTAGAATCCACACAGCAAAGAAAGATTGATTGAATCGTCATGGTATCATCATGCAACGTGTTTATTAAAGCCGATCTACCTACTAGATCTAGGCTAAACATGCTAAAAATATACAAAGAAGAAAGTTAACTTACTTGTTGTAGATCGATTCAGCAACTTCTCCTCGCAGATCACGAACTCTTCGCGCTCCTCGATCTCCACGAACGAATCCCGAACACTACCAAAATAGATCTTCTTGGTTGTTCTCTTTTGGAGAAGGAAGTTGGTGGGAACTTTTTGTTTTTGGAAGAGGTGGAGAAATGAGAGAATTGAGAGAAAGCACTTTTGGATTCTTAGGTCAAAATCCAAAAAATGACAACTTGGCTTACCAAACCCATCTTACAAAGGGTTTAAATAGTGGAATGATGAAATTCACAACTTCACATAATTACCACTTTACCACAACCATATGTTATGTAAATCTCATTCACATAATTATATAATATAAGATATCTCATATCTTATGTTGCAAATCTCATTTGCAATAATTGTGGATTTAATCAAATTGAATCACATTCAATTTATTTTCTCTCTATCAATTTCTCCAATTAGCCTTTAATTCAACAATTAGGCTAACATATAGTTTATTATGAATCTCATTCATATTAAACTATATATTATATCATCTATATGATATAATTACTCTTAAAGTGAAATTGAACACTTCAATTTCATACCAAAACTTTAACCCTTCTTTATCCTAGATTGAGCCAACCAAGGGACCTAATGGACCTACAAAGGATGAGCTCCAATGATCCGAGGTTAATCACCAAACTCTTTGACCCGGCCAACCAATATTCATTAGCTACAACACACTCCACTAAAGCCTGTAGTCTGTACTCCCATCGATGTAGAGTATTACGTGTCCACCGATATAACCAATGCTCATGAGTCGACCCTTCACAAAGTTGTTCATACACACGTCAGGTCAAATTATCGCTTTACCCTCGTGTCTCATATCTTGTTCCTTAAGTCCCCACTACTCCTCTAATGAACAACATATTGTGATGGTCCAACCATACACAACACCCTTCTCGGGCTAGTGAGAAGGTGGGCGCCCGTTGTCCAAGCCACGAGACAACACTTAAGGAACAACCCTCTAGTTTCCCTATAGGCGGGAACGCAGTGAATTCCATCTCGCGTAATTAGGTTCCCACTCTCTACTTGGTTCTGTCCCGAGAAGATAGGCATATTGGGCGAGTGGATCGGGACCACCTCACCCGTACTAATCAAAGGATGGACCCGTGATGCGAGTCCGTAATACGCTCGAGGATTCGTGTCGAGTCACTAATGGTTATCTACGAATTTATTAGTCTTTTCTTTTATGATGTTATATCGATGAAGTCTAATAATTCACGATGCAGTCTTGTACAATCTCATTGTGCAGGATGCCCCACTCGCATGTCAACCACATGAACGAGTCGAGATCACCTCGTTTGTATCTAATACAAAGTGGGCGCATCCACGATGTGTATCCGAGGATTAGGTCTCCAACCCCATCCTTATATCAGAGCCGTTCGGGTCATTAACTCGAACGTGATCCTCCTTGTGTGTCAACTACACACCGCTCAAGTTCTAGTTTTCTCATATATTCAATGACCCAGAGCTTAGTTTATTGGAAAAGTTTAAAATATTTATGAGACACAAAAAGTGAAGAAAATAATAGCTCTTATTAATTTCAAAACAATATTTTACAAACACGAGATTAGGACAAAAATCCCAACATCCAGCTCACTGTTTGTCCTTACCTGCAACCAAAGACATTAAAGTAGACGGGTGAGTATAAAAATACTCAGTAAGTAGCCCACTCACGTCCAAGCTACAAATTTCACAAGAGCACACACATAGGTAAAACAAGTTCGCAACCAAAGCATCAGGGACTCAAGACTAGACGCTCACGTGTCTACTTCACCCCGAGACTCACCGACGATCTAGAAACCTAGGCGGCCATAGACGGGGACGCACCCCAACGCGAAAGAGTAATCACTCTAACGCCCACACAGAACGCAA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MASVQKIASVKSIAETPNLASIPSTYIFSAAAGEETAPQAMEDSIPTVDFALLTAGTPDQRSKVVDELGKACRDWGFFMVINHGIAERVRKEMMDCCKEFFDLREEEKRVYETKHVLDPIRYGTSFNPHIEKVLLWRDYLKIMVHPNFHSPTKPPTFREISNEYCRRVREMARELMRGISESLGLERCNLERAVNWEKCSQILIANLYPPCPQPELAMGLSPHSDHCLITVLLQNQIDGLQILHDGKWVNVNPIPNSFLVNTADQLEILSNGKYKSVLHKAIVNNKATRMSIAMAVGPSAETVVGPVPELVHQQTNPPLFKNIKYKDYLETMQNGKLQNKSTLDRVRLL Homology
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Z244 (2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=2ODD19 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 307.0 bits (785), Expect = 2.7e-82 Identity = 155/329 (47.11%), Postives = 207/329 (62.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZSA7 (Protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DLO2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 3.5e-61 Identity = 126/329 (38.30%), Postives = 191/329 (58.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZSA8 (Protein DMR6-LIKE OXYGENASE 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DLO1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 236.1 bits (601), Expect = 6.0e-61 Identity = 130/339 (38.35%), Postives = 192/339 (56.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6YYX9 (Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase SLC1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SLC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 224.2 bits (570), Expect = 2.3e-57 Identity = 122/339 (35.99%), Postives = 190/339 (56.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W2X5 (Flavanone 3-dioxygenase 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=F3H-2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 221.1 bits (562), Expect = 2.0e-56 Identity = 131/349 (37.54%), Postives = 189/349 (54.15%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. NCBI nr
Match: XP_038886412.1 (protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 595.1 bits (1533), Expect = 3.9e-166 Identity = 287/350 (82.00%), Postives = 324/350 (92.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. NCBI nr
Match: XP_022149149.1 (protein DMR6-LIKE OXYGENASE 1-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 554.7 bits (1428), Expect = 5.8e-154 Identity = 264/344 (76.74%), Postives = 301/344 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. NCBI nr
Match: XP_022141027.1 (protein DMR6-LIKE OXYGENASE 1-like isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022159285.1 protein DMR6-LIKE OXYGENASE 1-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 7.1e-144 Identity = 253/344 (73.55%), Postives = 295/344 (85.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. NCBI nr
Match: KAG6576847.1 (2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 517.3 bits (1331), Expect = 1.0e-142 Identity = 244/350 (69.71%), Postives = 294/350 (84.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. NCBI nr
Match: XP_038904929.1 (protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 516.2 bits (1328), Expect = 2.3e-142 Identity = 247/346 (71.39%), Postives = 290/346 (83.82%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D661 (protein DMR6-LIKE OXYGENASE 1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017638 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 554.7 bits (1428), Expect = 2.8e-154 Identity = 264/344 (76.74%), Postives = 301/344 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CIQ0 (protein DMR6-LIKE OXYGENASE 1-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011533 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 3.4e-144 Identity = 253/344 (73.55%), Postives = 295/344 (85.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JCE3 (protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483195 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 508.1 bits (1307), Expect = 3.0e-140 Identity = 241/350 (68.86%), Postives = 289/350 (82.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L0R1 (Fe2OG dioxygenase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G112650 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 481.1 bits (1237), Expect = 3.9e-132 Identity = 234/348 (67.24%), Postives = 277/348 (79.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJI6 (protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501162 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 480.7 bits (1236), Expect = 5.1e-132 Identity = 233/348 (66.95%), Postives = 276/348 (79.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. TAIR 10
Match: AT2G36690.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 240.7 bits (613), Expect = 1.7e-63 Identity = 130/345 (37.68%), Postives = 202/345 (58.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. TAIR 10
Match: AT4G10490.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 2.5e-62 Identity = 126/329 (38.30%), Postives = 191/329 (58.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. TAIR 10
Match: AT4G10500.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 236.1 bits (601), Expect = 4.2e-62 Identity = 130/339 (38.35%), Postives = 192/339 (56.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. TAIR 10
Match: AT2G44800.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 3.8e-55 Identity = 113/311 (36.33%), Postives = 178/311 (57.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0016231 vs. TAIR 10
Match: AT5G24530.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 3.8e-55 Identity = 116/304 (38.16%), Postives = 179/304 (58.88%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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