
Tan0003508 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGCATTCTATGGCTACTATTCTCCTACTCATCCTTATCTCTCTCTTTCAATTTGGAGTCCTCTCCTCACACACTATCTCCGATCAAGGTAAAACCTCTCTCTTTAAAATTATTAGACGAGACCACCATTAATTTGATAAGTAGTTTTACCACGCTGCATATATGAGAGAAATTATAAAAATAATTTAAATTTAATATCCAATCATTATTAGCGATATGTAGATTTTCTATTCTATGTCTAACCAATATATTAGGTGTCTCTTTATTGTTCTTATTATTTAAACCCAATCTCTTTTCATTCATTCTTATTGTTCTGTGTTGAGTTGAAAAGATGAGGAGACCTCACAATAATCTTTATAAGATATATGAATTACTTCTGTCATTACTAATTAGTTTTAAGATAAAACCCCATATTTATCTAATATGGTGTCTAAGCCTATCAAGTCCAAATGAGTATTTGGTCCAAAATTTAAGATCCGACTCAAGAATGGTGAACTCAAAAGAGGCACCATCTTAAGAAGTGATATGTTGAGGATCCATATCAAAAAGATAAGAGACCTCGCAATCTTGATAAGATTATTTCTCTCATTATCAACTAGTTTTAAGATGAAACTCCATATGTATCTAATATTTTGAAATTTTCATTTTCAGATGTTAGCTACATGAAGCTGGTACATAATGCTAGTGACATACCAGAAAAAGAAGAATATGAGTACATAATAATAGGGGGAGGAACAGCAGGGTGCCCATTAGCTGCAACATTATCATCAAAATTCTCAGTCCTTCTTCTTGAAAGAGGGAGTGATCCCAACAAATATCCCTCTGTGTTAAATGAACAAGGTCTATTGAACGCTTTTGTTGCAGAAGACGATGGCGAAAATCCCTTCCAACGGTTCATCTCTGAGGATGGTGTAGAGAACATAAGAGGACGAGTTCTTGGCGGCGGCAGCATGGTCAATGCCGGCTTCTACTCGAGGGGCCATCGGGAGTTCTTTGAAACTGCTGGCGTTGATTGGGACATGGAATTGGTCAACAAGTCTTATCAATGGGTTGAACAAACTGTGGTGTCTCGGCCAATTTTGAATGCTTGGCAATCTGCTTTTAGAACTGCGTTATTGGAAGCTGGTGTTGTTCCTGATAATGAGTTTGATTTGAAGCACCTTGTGGGGACTAAAACTGGAGGTTCCATTTTTGATGATAAAGGAAACAGACATGGCGCTGTGGAGCTTTTGAATAAAGCTAAACCTGAAAACCTTAAAGTTGCAATTCAGGCCACAGTCCAAAAAATCATCTTCTCTGGTTAGTGCTAATAATTCTATTTTAGTTTTGGATTTTTTTTTAAAAAATATTTCACTTTTTGTCCCTCAACTTTGAGAACATTTATTTTAGTCTTTGGTCTATAAACCATTTTGATCATTTAATATCTACTTATCTAATACTTGAGTGAACCAATCTATATGTTTTCTAGTATATAACCACATCAACATGTGACTAAACCTAGCTTATTAATATATTTGTTTAAACTCTTACCGATTAAATACACATTCCTTTTTTATATATAATTTACGTACAAAATAAAATAAAAATGATGGGTTGAAAAAGTGAAATAGAGAAGGTCTAAAATTTGGACGGCTGTCTTGTTGGTCCTCAAATTTTAAAAACATCTAATTAGGTTGTGTGAAATAGGACTATGACAAATTCGAAAATTTTTAAAATTGATTGATTAAGATATAAATTTGAATAGAATATGTAATAGAACCCTAAAATTTTAATTTGATGTCTAATAGATCCATAAGTCTTAAAAAATTCGAAAGTTTAGGTCCCATTTGATAAACATTTGGTTTTTGGTTTTCAGTTTTTCAAAATCAAGCCTATAAATACTATTTCACTCATGACTTTCCATGCTTTCTTAACTATTTTTATAGTTGTGTTTTCAAAAAACTAAGTTTTGAAAACTAAAAAAAAGTAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTGGAATTTGACTAAAAATTCAAGTGTTTAGATGGAAACTATTTTAGAGAATATGAAAATCATGGTAGAAAAATGGTGTGCCACAATTTTCAATTTTCAAAAGAAAAATACTTGATTACATCCCAAGCTCCACCCAAATAATTTACAACTCAATGGAGAGTCATAAATTTTTTTTTTTTGACAAATTTTTTTTTTGTTTTTCAAAAACTAAAAATAAAAAACCAAATAGCTATCAAACGGGGTTTAGAGATTAAATTTTGTAGTTTTGAAAGTTAATAAAATATACACAAACTTAAAAGTTGAAAATGACTAAACGAGTTTCATTTTCAAGTTGGTTTCATTACATTGAAGCACTGAATTTTCAAAAGTTTTCACACTGCATTATATTCTGAACTCTATAGGTTTATCTGCAAGTGGAGTTTCATATTCTGATTCAAAAGGAAAGTTACATACAGCATTCATCCGAAAGAAAGGAGAGATTATTTTGAGTGCTGGAGCCATTGGAAGTCCTCAACTTCTTCTTCTAAGTGGGATTGGTCCAAAATCTCATCTTTCATCCTTAAAACTACCTGTCGTCCTCCACCAACCACATGTCGGCGAATCCATGTCCGACAATCCCCGTTTCGGAGCCAACATTATGCTTCCATTCCAATTGGTCGCTTCGTCTGTAAAAGTTGTTGGAACGTTAAAGAACAATATCCATTTGCAAGCTTTCGCCAGCCCTTCACCATTTTTAGTTCCTCCATCTTTTAGTCTTCTTCCTCCTCAATCCACTTCCATCATCCCGAGCTTAGCCCTTTTTGTTGGCAAATTCTCTCAAGTTCTTTCTGAGGGGTCGCTTCGGCTTAATTCCTCCAATGTGAAGAAGAGTCCAATTGTCCGATTCAATTATTATTCTCATCCTGATGATCTTGCTAAATGTGTTAGAGGAGTAAGAAAAGTGGGTGATTTGCTTCAAACCCAAACGATGGAAAAAATTAAGACCCAAGATTTGGAGGGTAATAAAGTATTTCAGTTTCTGGGGCTTCCGTGGCCGGAAAATTTGTCCGATGATAGTTCCGTTGAAGAGTACTGTCAAAAAACAGTGACCACTTATTGGCATTACCATGGAGGTTGTTTGGTCGGGAAAGTGGTCGACGGTAATTTCAAAGTCATCGGAATTGAAAATTTGCGTGTAGTCGACGGCTCCACTTTTTCTGACTCACCGGGAACTAATCCTATGGCCACTCTCATGATGCTTGGCCGGTGAGTCACTTCTTTCTTTCTTTTATTATATTATTATTATTTTACTGCTGGAAAGCATCTTAAAACTGAGAAGTATTATTGAAAAGAAAAGAGTTATTAAACATAAGGTTTGGAATTTTTTTTTTAACAATTAACAATAGCATAATCATTCCTCATTAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGTACAGTTTGTGTATTAGTTGATCTTGAGTTTTTTTTTCATTATTTTTTTATTTCCATTAACTAACAATTTGAAAATTGTTTTGCAGGTATGTTGGTCTTAAGGTACTGCAACAAAGATCAAGTTAAGAGTGTAATCTAAAAGACACCATTAACATTTTTCGTTGTCGAGTGCATTTATCTTGTTTTTATTTGCCGCATTTCATATTTTGCAGTTTCTACAAATTGTATACGAATTTTAGAAACAAAATGTCCTTTTGGTTTCTTATTCCCATGTTTCCCGTTTATCAAGAACATGTTATTTTATATCTTTTACTCATACAAGAGGGCTGGCTACAAAAATAGAACTCATTATTATTACTTTTTTTTTCTCTTAAGTTCATCAACAACCCTAAGTAGGAGTGGAGATTCAAATTTCATCCAAATTTGTTGTAAAAAAAATAGATAGAAAAATAAATCAAGGGTGAATAACATCACTAAAACCTAAGAAAAATGAAAACCATTTTAAAAACTAAACTTATAAATAATATTTCTATTCATGGTTTTCTATGTTATGCTATCTACTTTTTGGATGTGTTTTCAAAGACCCCACACAATGTTTTAAAAACTGAAAAAATGATTTCCAAGAACTTGTTTTTTGTTTTTGGGAATTTAACTAAGAATTCAAGTATTTTCTTAAGAAAAATGAGAACCGTTGTTGGAAATGGAAACTATCGCAGAGAAATGATGAGAAAACTACCATAATTTTTGAAAAACTAAAAATCAAACGATGATCAAACAGAGTAAATTATTTAAATTAAGGAGAGCAAAATAATTGGATTGGAGAAAGTAAAGAGTCTGTTTAGTACGTAATCTGAAAACATAAATTTGAAGACAAAGGATTCGAAAATCCCACGTAGAGGATACGAGGGATATTCGACAGAGGGAGGATAAAAGACCTAATTAAGGTTTTAAAGACAGTATATATACACCCTCAGTTCGGTTTGGTTTGAACTGCTTATTCAATCAACCAAACCAAATTGAATATTTTTTGTTTTCTCAGAAATCAAACTAAGATGTCCAAATCTAATGTAAAATATTCAAACCAAACCACGGGATGGATTCGATTTTTTAGTTTTCAATTTCCTATTGCACCCCTAATAAACCATTCTCATTACACAAGTATGCAAATATAATACCTCAAATTGCTACCTACTTTTATACCATGTGTTTCAAAAAATAGCTAAAACTTTTGTATTTTATGAAAATGGCTATCAATCCATAAAAACTTACTACATTTGCCAACTTGAGCTTAGGTTAGCCAATTAAAGCATACACTTTTAATAAAAGGTCAAAACTTCAAAATTTCAACCTTCAACTAAAAAAAACCGTGAAATATTACCGGATTTGAACCCTTGTACTCCTTTTTCTTTTTTTTTAAGTACCTTGTAATAATCTATATAAATTACGTTAGGCTTGAAACTTTTTGTTTTATTATATTATATTAAGATAAAGAATGAGAGTCAATTTATAAAAGGATGTTATGGTGGGTCAAATTTGGATATTGCCTTTATTATATGTTATTATTATTTTTTTATAAA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Homology
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52706 ((R)-mandelonitrile lyase 1 OS=Prunus serotina OX=23207 GN=MDL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 537.7 bits (1384), Expect = 2.9e-151 Identity = 276/537 (51.40%), Postives = 377/537 (70.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q945K2 ((R)-mandelonitrile lyase 2 OS=Prunus dulcis OX=3755 GN=MDL2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 528.9 bits (1361), Expect = 1.3e-148 Identity = 272/537 (50.65%), Postives = 373/537 (69.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52707 ((R)-mandelonitrile lyase 3 OS=Prunus serotina OX=23207 GN=MDL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 2.3e-145 Identity = 266/537 (49.53%), Postives = 365/537 (67.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SSM2 ((R)-mandelonitrile lyase-like OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g73050 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 3.2e-142 Identity = 257/535 (48.04%), Postives = 363/535 (67.85%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82784 ((R)-mandelonitrile lyase 4 OS=Prunus serotina OX=23207 GN=MDL4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 505.0 bits (1299), Expect = 2.1e-141 Identity = 261/533 (48.97%), Postives = 356/533 (66.79%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. NCBI nr
Match: KAG7029801.1 ((R)-mandelonitrile lyase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1503.0 bits (3890), Expect = 0.0e+00 Identity = 748/1029 (72.69%), Postives = 857/1029 (83.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. NCBI nr
Match: KAF4368106.1 (hypothetical protein G4B88_001010 [Cannabis sativa]) HSP 1 Score: 1044.3 bits (2699), Expect = 7.2e-301 Identity = 557/1064 (52.35%), Postives = 710/1064 (66.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. NCBI nr
Match: KAF4349168.1 (hypothetical protein F8388_026317 [Cannabis sativa]) HSP 1 Score: 1039.3 bits (2686), Expect = 2.3e-299 Identity = 565/1125 (50.22%), Postives = 724/1125 (64.36%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. NCBI nr
Match: KAF4383855.1 (hypothetical protein G4B88_016288 [Cannabis sativa]) HSP 1 Score: 1036.9 bits (2680), Expect = 1.1e-298 Identity = 559/1073 (52.10%), Postives = 733/1073 (68.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. NCBI nr
Match: KAF4383869.1 (hypothetical protein G4B88_016302, partial [Cannabis sativa]) HSP 1 Score: 1026.5 bits (2653), Expect = 1.5e-295 Identity = 548/1046 (52.39%), Postives = 704/1046 (67.30%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6FBM4 ((R)-mandelonitrile lyase OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=G4B88_001010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1044.3 bits (2699), Expect = 3.5e-301 Identity = 557/1064 (52.35%), Postives = 710/1064 (66.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6DSU4 ((R)-mandelonitrile lyase OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=F8388_026317 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1039.3 bits (2686), Expect = 1.1e-299 Identity = 565/1125 (50.22%), Postives = 724/1125 (64.36%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6GLR3 ((R)-mandelonitrile lyase OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=G4B88_016288 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1036.9 bits (2680), Expect = 5.5e-299 Identity = 559/1073 (52.10%), Postives = 733/1073 (68.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6GP35 ((R)-mandelonitrile lyase OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=G4B88_016302 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1026.5 bits (2653), Expect = 7.5e-296 Identity = 548/1046 (52.39%), Postives = 704/1046 (67.30%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6FBQ5 ((R)-mandelonitrile lyase OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=G4B88_001041 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1019.2 bits (2634), Expect = 1.2e-293 Identity = 537/1032 (52.03%), Postives = 708/1032 (68.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. TAIR 10
Match: AT1G73050.1 (Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 2.2e-143 Identity = 257/535 (48.04%), Postives = 363/535 (67.85%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. TAIR 10
Match: AT1G12570.1 (Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 417.9 bits (1073), Expect = 2.3e-116 Identity = 241/557 (43.27%), Postives = 323/557 (57.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. TAIR 10
Match: AT1G72970.1 (Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 399.4 bits (1025), Expect = 8.6e-111 Identity = 230/526 (43.73%), Postives = 306/526 (58.17%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. TAIR 10
Match: AT1G72970.2 (Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 384.4 bits (986), Expect = 2.9e-106 Identity = 225/519 (43.35%), Postives = 299/519 (57.61%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003508 vs. TAIR 10
Match: AT5G51930.1 (Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 384.4 bits (986), Expect = 2.9e-106 Identity = 228/555 (41.08%), Postives = 328/555 (59.10%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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