Tan0003346 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTTGGTCCTCTCCTACCAAATATCAATATCACGGAAAAATCAAAAGCTCTTATTGAATGCATTGCATGATCGGGTGGGTTCTTAGCTCCCTCGGCAAGTCTCTACACGGATCATGAAGTTGAACGATAGTTGAATTGCGAATTTGCAGAAGTGCAAGCGTCGAACCAGATTCGGATCATGGAGGACAAGGGAAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATCTCACAGAGATGGCCTCCAATCTAGAATCACTTCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGTCTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGATCAAGCAAGGACGATCAAGGTTACTAGACTCACTCTTGCTTCTTTTTTTTCTTCTTCTTCTGTAGTGGGGTATTTTTAATCTGATATCTGGTTTGGAATTTTGATTTTGCTATTTGAAATTTGGGGGAGTGAGGGATTGATGGGATTTCTAGAGGGTGGTTGTCGAATTGCCCTCGTATTACCGATTTAAATGTTAATTTTCATGCTATGTAGAGGATCAGAGTGATATACATGGATCAAGGTTGTTAAGATATCTGATATATGGTTTGGAATCTCAATTTGGCTATGGAATGTGGGGGAGTGAGAGAGTGAGGGATTGTCCAAAGACATTGCAGCTTTGGCAGATTCAGCGAGGAAGAATCTGGAGGCGGTTACACTGGAAGTTATTCTCTTAAAAAGATTCTGTCAAGAGGCTATTTTGAATGTGGGATTTTTGAAAACGAGGAGGTACATACACCTGATCTTCGAAGACCTTCTTGGAGAAATGGAGGCACTGTGTAGAGTAGTGAACTTCAGCCAAATGAGTGGCTGGAGATGGCAATGATGGAGGGATATTAAGAAAAATATATACTAATGTACTCACTGGGTTGGGAAAATTCAGGGGCGAGTTAAAGGATTCAGTTTCTTCTTTACAAACGATATAGGAAGGCTTCTTGAGCATTGATAAAGTTGAAGCACTACAACTCCATTTATGATTATTATATTCTGTATTTGGAGACTTCAATCTAAGACCTCGTGTGGTGTCTCTAAACATCACAAGTCCCTTGCCACCAGGACTTCCTTGAGTGTCGTATAGGGTTAATACCTTGGATGCAACCCAAGCCAAAAGGATGGAACATGAATCAGCTATTGCAATTAAAAATGAGTTGGTATGGAGCCTCTTCATGCAATAGAGAACCAGAAGATGCATGTGGTTGTGCTTTATTACTCAAATAGTAGGTCAAATGAGCCTCATCCATGGGAGATGACTCTCTCAGATGCCACTCTGTAACTTATGTCACAGCCCAAGAGTGAAGAGTGTGTATGAATGATCAAGGACATGCTATCCACCTGGAGTCTAGGGAGGGGCCTCGTGAGTCTCTTTAATCATCTTCCAATAGAAGGGATTTGGGGATAGCTGTACATCTCTTCCTTTGTTGTCCGTTCACGTCTAGGCTTTGGACCCAGATTTTTGACACCTTCTAATCTCTGCTTCCATTCTCCAAGTCAATCTGTTAGCAACTAGTTGTGTTATATTGTTATCCTAAGTTCAACAGGCAAAAGGAATGCTGGATAAATGCTTGTGGAACTTTTTCTTTAGCAAGTTTGGCTGGAATGTAGTATAAGAAAATTTTATTCCAAAGACCAATAGACAAAAAATATCTTGGACTTCATTGGGCTTTCAGCTTCCTCTTGGTGTATTAAGTTAGATTTTTTTAATAAATTTTGTAGGATGATTTTAAATAGGAAAATTCATTTACTTATCTCTTGTGTTCTATCTTCGAATACAACTATTTTCTTATTGGCTTTTGAACCTGATCAATTTTTCTTTTACTGATCTTCTTACTACTGTTTAGATTATAGTGATCTGGTAAATCAATTTTTTTAACGTCACACCCCACCATATAAAAATCAAAGACCATATTACATGAGCTTAAGTGATGCTCTTTGTTGAAATGGCGCGCCCTTTGCTTTTGTTTATTACCGACGTGTGACGCAATTTTTTGCCCACTGGTTATGATAATGAAATAATCTCTTGCTAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAACTACATGTGCAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACTACAAGTATGGAATATCTTACTCTTTTCCAGCTTCTTTGTAAGGTACACATATAGAAGTTCTATGCCTAACAATAATAACAAGTATAATAACACGAAAAATAGGGAATGAGGACCCAACTCCTTCGTGTTCGAGAGTTCTTCGACACTAAGGAGGGTTATTTCATTAAGAGGGTAGAAGGACAAGAGCCAAAACAAACACACTCCAATACTTCTTAATGATCGGGGCCTAACAATACCCCTGTTCACCAGAAGTCAATCGAAAGACCTTGTCCTCGAGGTGGAAATCGAGATATTGAGTCATAATGTCTCATACATACTTCCCATGTGGCGTCTGTGGTGTTACGTTTGTCCCATCTCGATGAGGCATTCCCAGTGTTGTTTATCATCACTCCATCGAACGCCCAACACATCTCGCTGGTGTCTGCCCACTCATAAGCTTTCTTGCGGAGAAAGAAGGGTGAAGGATTGGACCACCACATGTGAGCCCACGGCTTTTTTCAATCGAAAGAAATGTGGAAAACGGGTGAATGGAGGTCGTTGGTGGTAAGTGTAGTCGATAAACAACTTTGGCCGATCCGCTCAAGTATCTCGTCTTTTGTCCCATAAAACTTGGGAGAGAGTTTTTCACAAGCGTTTCTTTGCTAAAGAGCGTTATCCAGTATGGTCGAGTTTTAAGTACACCCAATCACTCGGCTGAAATTCCAACTCTCGTCTCCATGAGAATCTGGCTTGTTTCTTCATTCTTTCTCGCGCCAAGCGCAACCCGATCCTTCCAGTGGTCGCAATGTTTGTGTCTCTTTCCATGAGTTGTTGTTCGGTATGTTATTAGATGTCTTCTTTTACGCCATAGGATACTAGCGGGGAGGTGCTCGACCATAAACTACATTGAATGGTGTTGTGTTGATTGAAACATGGAAGTTCGTGTTGTACCAGTGTTCGACCCACTTTATCCATTTTTCCCATTTCGTGGTTGCTCATTGCGAAACAACATAAGAAGGTTTCAAGACATCCGGTTCACCCGCTTTCGGTTTGGCCATCCGTCTGTGGATGGAAGGAAGTACTCTTCTTTAGTTGTGTACCCTGTGACCACGAAAAGTTCCATAAAAATTGCTCATAAAATCACATCTCTCGCTGAAATGATCGATTTCGGGAACCCATGGAGACGTCATAATCTCTCTAATGAATAATTACTTGCCACTTCCTTTGCGGAATACGGGGTGCTTGAGAGTCAAGAAATGAGCGTGCTTACTCGGTCTATCCACTACGACCGGAATCGAGTCTACTCCATGTGATCGTGGTAATCCTCAATGAAATCAAGGCCGATGTCCTCCCGTATTCGTTCCGGATGGGTAAGGGTTGAGTAGACCGCAGCGGGAGCTAAAGCCTCGATCTTGTTCCGTTGACAAACGCACATTCCTCTACGTATTTTTGAACTTGACTTTTCAGTGTTCTATCTTCGAATACAACTATTTTCTTATTGGCTTTTGAACCTGATCAATTTTTCTTTTACTGATCTTCTTACTACTGTTTAGATTATAGTGATCTGGTAAATCAATTTTTTTAACGTCACACCCCACCATATAAAAATCAAAGACCATATTACATGAGCTTAAGTGATGCTCTTTGTTGAAATGGCGCGCCCTTTTTCCCTTCCCATACTGCGCTTTTGTTTATTACCGACGTGTGACGCAATTTTTGCCCACTGGTTATGATAATGAAATAATCTCTTGCTAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGATCTCATGCTGTGTTTCGCTCAGAAAACCCTTCACTTCACCGGTTTCGTCTTTTCCGCTTGACCCTTCTGGCTAACATCGCTGAGGCAGCACAATATTTCTTTTTCTGGTCTTTGAGCTTTCCTCCATGCTTGAACTACATGTGTTCAGGAGGTCACTCCTTCGTGTTCGAGAGAGGAGGGGTTATTTCATTAAGAGAACACTCCCACAAAAACATTCTGTATGGAATATCTTACTCTTTTTCAGCTTCTTCTTCTAATTTTCTTGACTTTTATACCATTTTTAATTTCTAAAAAAAATGTCAGATTTTCCTTGCCATCATACTCAAACTTTCCCAACTTGGGAAAGATTTTGATATTAGTCTCCCAGTGCTTAACTACAACATTTGATTAGCATTGTTTCTCCAATGCATTGAGACATTTGGGTGAACATAGTTCATCTTGTGAATTATGAATATACTTTCTTCTGTTTTCAATGAACTTCTATTTAAGGTAGGAGACAACAGGTTTTTCCTGGGAATATACAATAAGAAAGATATATTTAAAAAATCTACGTTGGGAGGATACCTTTTTCTTTGGCTCTCAATTCTTCAACATTTTTGTGCACCAGTATCTTCATATAGGAGTGCAATTATGATGTTAGTTGATTACTCAATTACTGGTTAGAAGGTGATAACTAGCATCCTGAAACTGCTGGATACTCCTCTAAATTTTTCATAGCGTTTTATTCAACTTAAAATCAGCAGCTTTATCTGTTGAGCAACAATCTGTCTATTTGGCCTTCAATATGTGGGGGTCTGGTTGTGTTGTGTCGGAGTCTTGTGGTTGACATGACATTGTGATATATATATATATATATACACACACACACACACACACACACACACATGTTATCAATTATGGATTTCATAAACGTCTTTCGAGTCCATATGCGGGGTTAAGCCCACAGACTGTTTGCTTCTACGAGGTTTGG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ATTTGGTCCTCTCCTACCAAATATCAATATCACGGAAAAATCAAAAGCTCTTATTGAATGCATTGCATGATCGGGTGGGTTCTTAGCTCCCTCGGCAAGTCTCTACACGGATCATGAAGTTGAACGATAGTTGAATTGCGAATTTGCAGAAGTGCAAGCGTCGAACCAGATTCGGATCATGGAGGACAAGGGAAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATCTCACAGAGATGGCCTCCAATCTAGAATCACTTCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGTCTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGATCAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAACTACATGTGCAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACTACAAAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGCGCGAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAGGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAGACTCTTGGTGGGAAAGAATGACGTTCTGCAAATGTGTGAGGATTTGATTTTGATAATTAGAGCCGCCTTGGTACTTTTCTTTTTTCTTCTTTTCTCTCTCTCGTTTGTTTGTGTAGCATTAGTGTAAAATTTGTATGGATAATATGATCGAGTCTAATTAGGAATATGGTGTATAATATATTGTTTTGAATTTGTAGAGAAATATCTAGTTTATAAAATATGGATAAATAAAATTCAAATTATATTTGATTGGATAACAATTGAGAAGTTATTTGCTCGCAATGTC ATGGAGGACAAGGGAAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATCTCACAGAGATGGCCTCCAATCTAGAATCACTTCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGTCTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGATCAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAACTACATGTGCAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACTACAAAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGCGCGAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAGGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAGACTCTTGGTGGGAAAGAATGA MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE Homology
BLAST of Tan0003346 vs. NCBI nr
Match: XP_022963475.1 (uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_023511737.1 uncharacterized protein LOC111776508 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 266.9 bits (681), Expect = 1.0e-67 Identity = 143/148 (96.62%), Postives = 148/148 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. NCBI nr
Match: XP_038886855.1 (uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 264.2 bits (674), Expect = 6.6e-67 Identity = 143/148 (96.62%), Postives = 146/148 (98.65%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. NCBI nr
Match: XP_022967634.1 (uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 1.9e-66 Identity = 141/148 (95.27%), Postives = 147/148 (99.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. NCBI nr
Match: XP_004136872.1 (uncharacterized protein LOC101218756 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031744796.1 uncharacterized protein LOC101218756 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031744797.1 uncharacterized protein LOC101218756 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN43713.1 hypothetical protein Csa_017358 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 261.2 bits (666), Expect = 5.6e-66 Identity = 139/148 (93.92%), Postives = 147/148 (99.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. NCBI nr
Match: XP_022963476.1 (uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2 [Cucurbita moschata] >XP_023511738.1 uncharacterized protein LOC111776508 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >KAG7011406.1 hypothetical protein SDJN02_26311 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 7.3e-66 Identity = 140/145 (96.55%), Postives = 145/145 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HI40 (uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 266.9 bits (681), Expect = 4.9e-68 Identity = 143/148 (96.62%), Postives = 148/148 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HXA5 (uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467076 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 9.3e-67 Identity = 141/148 (95.27%), Postives = 147/148 (99.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K2J2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G062790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 261.2 bits (666), Expect = 2.7e-66 Identity = 139/148 (93.92%), Postives = 147/148 (99.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JEJ3 (uncharacterized protein LOC111486188 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486188 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 3.5e-66 Identity = 141/148 (95.27%), Postives = 145/148 (97.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HG82 (uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 3.5e-66 Identity = 140/145 (96.55%), Postives = 145/145 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003346 vs. TAIR 10
Match: AT5G64180.1 (unknown protein; Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 210.7 bits (535), Expect = 8.1e-55 Identity = 114/149 (76.51%), Postives = 137/149 (91.95%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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