MC11g_new0268 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview


Name	MC11g_new0268
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	Unknown protein
Location	MC11: 11222715 .. 11230185 (-)
RNA-Seq Expression	MC11g_new0268
Synteny	MC11g_new0268

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGCGCATTTGCCTTACTGCATGTCTATGCGCCTTGCACACAACGTCCACACCGCACACCCATCCACACCTGGTGCCTGCTTGCTTGCGCGCCTATGACCGCTCATCCGTCCGTGGGCCCTTGCTACCTGTCGGCCAAGCACGTCAACGCTTGCCGCTCTGCGCCCCACCATGGCCTGTTAGCCTCCAGGGTGTGCCTTCCCCTTGCCACCGCTCACATGCTTGCCGCCCCCTCCATCTCATTTATGTTCCTAAGTTTTAGTTTATTATGAAAGAATTATGCATTTCTTTTCTTTACCTTAGATTTGTAGGTTTATTTTATTTGAAAATTTAGTGTAAAGGTCATTGGCATTTTAGCCTATAACCCTTGTTGTCTTTGAGAACCAAGTTTTGAATATTGAGATATAAAACTTACGCAATGTCCATGCCGCACATCAATCCATGCCCAATGCTTGCCTACTTGCGCACCCATGACTGCTCATCTACACGTGCGCCCTTGCTGCTTGTCGGTCAAGCACATCAGAGCTTGCCACTCAGCGCCCCAACATGCCCTGTTAGCCTCTAGGGCGCACCTTCCCCTTGCCACTGCTCACATGCTTGGCACCCCGCCATCTCATTTAAGGAATAAATTTCTTTTGGATTTTCCTCAGTTTACTTTATTGTGATTGTTTTTATATTTTAAATTTAAGGAATGTATGCTCCTAAATTTTAGTTTATTAGGAAAAAATTATGCATTTCTTTTCTTTACGTTAGACTTTTAGGTTTATTTTATTTGAAAATTTAATGTAAAGGTCATTGGATTTTTAGCCTATAAATAGACGACCCCCCTTATTTTTTTGAACCAAGTTTTGAATATTGAGGTATAACATTGAGAGGTTTCTCATTCCATTGCTTTCGTGCAAACTCCCCCCGCTCGCCCCCAATAGAGTGTTATCCTTTGTGTGGTCGAACTTAGGGTACATTATTACCACAACATACTTGTTTGGTTGGTCACCAAACTCGTGGAGTGTTTCCAACCTTAGGTGTGGTGAGTATTATATCTACTCATGGTTTTGACTAAGCTAATTAATCCAATGCTCACCTTTCAGGTTGAATCAACTATATGATTGGATTCAAGTGATTAGGGGCTCGAATAGTCCATACGCTTTTCTTATCACTGTTGGACCTGTAGTGAGAGTATCTGCTAAGTTCCTCTCGGACCTTACTTACTCAAAGGAGATAACCCCACTTTTCAACAATTGTTTCACACTTTTCAACAATTGTTTCACAACTTCATGTCTCAAGTGTATATGCATTTTGTTGCTTGCCGCCCAATCCACCTAAAATAAGGAAATTATTTCCTTTCTATTTTTATTATCAAAATTATATTTAAGGAATAATTATTTTGCTTGATTAGCAGGTGCCGCAAGTTGGTACTATTCAGGAAAAAATCTTTAATTATTTGTTTAAATCTTATTTTCCTTTATTTTTAGGTTTATTTTATTTTAAAAAAATTCTTGTAAAGGGCCTCGGCCTTTGCCTATAAATAACATGTTTCCCTAATTATTAATTTAAAAAAAGTTTATTTTAAAACAGTGATTAATTAAAAACTTGGTTTTCTTTTGAAGGATAAATCTTTTATTTTCTTTCCTAAAATCTTATTTTAAAAACTTCATAATTAAAACAAATGGTTTCTTTTAAAATTCTTTTTTTTATTCACCTTAAAAAAGAAACTCTTTCTATTTTTGGAAACAAATAATATGTACCAAAATCTTTTACTCCTTTAAAAAACTTATTCTGAAAGACTTTCTTTCTTTCTTTTTATTGGACTAGGTTTCTTTTACTTTAAAAAAAACATTTTCTTTCCCTTAAAAAAAACTTTCTTCCTGAAATATTTTTTTTCCTTGTTTTGACGAAAAATTTTACTTTCGAAAACATTTTATTTTCCATCTTTAAAAAGACTTTACTTCCCAAAACATTTTATTATCCATCTTTAAAAAGACTTTACTTCCCAAAACATTTATTTTCCTTATTAGAAGTGCTCATTCCAAAAACATTTTTTCACTAACCTTTACTCACTTAAATTATTTTAATCGCTGAAACGGAGGTCGCCAGAGTGCCATTGAGGAACGTGAATCTGCTCACCAGAGTCTGTTGGGTCTTCAGGTTTACTGGAAACTGTGTTGTTCACGTCGCCACCTCCAGAATGTTGTTGCAAGTCGCCGATTTGCTCTTCATCACCAAAAAATCGTCAGTTTTCCCGAAATGTTGTTGTAGATTGCCAGTTTGCTATTCGTCGCCGAAAGTCATGGGTGCTGCCGAAATTCGTAGCAGATCGGGTCGCTGGAAGCCCTGAAGTTTGCGCTGCTGGTTTGTTATAGTGGAGATTTGTGTCGTCGGAAATTCTACTCTTCACACTGCCGCTAGTTTGCTATTACCGCTGAAGTGCTATGTTGCCGCCAAAGAGATACTTGCTCGTGGGTGTCGGAGTGGGTCACCGTAACTGCTGTCGTCCGACTGGAGTTATGTGGTGCCATCAGAGGTCTGTCACCGCTCGCGCCGTCATTGGAGGTCTGTTGCTGCCGCCGAAGTGGGTGAGGAAGATTGATAGTGGGAAGGGGGAGAAGAGAAGATGAAGAAGATGGTGGAGTTGTAGAGAGAAAGAATAGAAAGGAGAAAAGAAAAAGCTAGGGTTGTTTTAGGAGAGAGAAATGAGTTTTCCTAGGGATAACAAAACTCAATCTACTGCCTATTCATTCTTACTCTACTCTGCTGCTCCCTGTTCTAGAAGCCTTCTCTTAAATACACACAGAAGGCAATGGTAACAAAGGGAGGGTCAGATAGAGAAAATTAGAGACTGGAAGAAAAAGTAATTCTACTTTCTTTTCTTCAATAAAATCGAAGATGTACAGTACCTATTTTTATACAAGATTGTACCCTTATTAGGGTTTTTAGAAAAGGAAAATAAGGAATAAAAAGATCTATAACAAAATTAAAACACTTTTTATATTCTCATTGGATGGGAGAAATTTGTTCACGTGATTGATGTAACAAATGTGCATTGGATGAGCTGGCCGATTTAGTTGAAATTTCCTCTTCAACACATTGGGTTTTAGTGGGTTGCTTAACATCCCCAACAACTCAGGATAGTCGAGGCCTTTACTATTGGACTGAATGTTTGAAAGAAATCAACACTAGGATTCTGATGAAAACCTTTTGCAACCAACTGAGATTTATGACGCTCAATCGACTAGCCATCGGGATTACTTTTGATGCGAAAAATCCACTTGCATCCAACTACATTAAAATATGGAGATGGGGACAAGATGCCAAGTATCATTTGGAATAAGAGCAGTATACTCAAGATCTATAGCAGCTTTCCAAGCGGGCATAACGAGAGCATTTTTCACCTTTGTTGGTTTCATGAGAGACCAATCTGTGGTGGGAGAAGACAATAGCCCCTTTGGCTTAAAAATCTCAGCTTTTCCACGAGTAACCGTGGGATAAGTAGGTTGAAATCTTGAAGCACGCGAGACGGGTTCAGAGGTTACGGGAAGTGGGGCTATTTCAGGCTGGACTGTTTCGGGAGTGGATAAAGAGGAATTTTCTTGAGACAGTGATGGATTGATTTGTGGCTAGGGGTTTGGGGAATTGGATGAGAACTAATTGATGGGCAAGCATTAGGCTCACGTGTTGGGGTGGCCTAATATTGGACCGTATTTGGCTCAATAATGAGCTGGGGGTTATGGGTCTGGACTATTTGACCATGATGAGGTAGCTGGTTAGGTAAATGACCAAATCAATTGTCTAAACTGGGGAATTGATCTAAGGGCGTAGTAGATGGTTGTTGAGTCCCAAAATTAGAAGCAAAGGGAAATTCAGCTTCGTTGAACTGAACATGTCTAAAGATGAAGATCCGACCTATAGAACTAAGACATTTATGCCTTTTGTGTGCTGGACTCGGACCAAGATAAACATATTTATCAATACGAAATTGAAACTTGTGAGTATTGTAGGACCGTAAATATGGATAACAAGCACACCCAAAAATCTTAAGTTCAGAAAAATTAAGACCTAGTTTTATCAATATTTCCATAGGAGATTTACCATTGAGCACCGGTGTGGGTAACCCGTTGATGTCAAAAATTCCTCCCACAAAAAATGTAGAGGCATGGACGCTTGAGCAAGCAAGGTTAGGTCAGTTTCCACGATACGACGATGTTTTCGTTCAACTCTACCATTCTGTTAGAGGTATAAGGACATGAACATCTGGATTGTATGCTTAATTTTGAACATAATTGATGTATCTGTTTATATTTCCCTCCATTGTCAGATTGAAAAGTCTTAATATTGAATCCAAACTGATTTTGGACCATAGCCAGAAAATGATTAAATGCCGCCATACTGTCACTTTTTAATTTCAAAGGGTATATCCATACAAATCTGCTATAATCGCATTAAGAAAAGGTACATAATATTTGAAACCATCAGCTAACATAATTGGAGCGGGTCCCCACACATCAGTATGAACTAACACAAAAAGAGCATTTGCACGTGAACTAGAAATTGGAAAAGGTAATGCATGAGATTTTCCATACTTTGCAAGCTTCACAAAAATGTAAACTATCGTTAACTCTCACCGGCAGATTACAATCTCTAACAACCCTATGAAAAATTTTAGAAGATGGATGTCCAAGTCTACAATGCCAAACCTCCTTCGACACCACAACATTAACACTAATAGGTAAATTAGGTTGAACAAGTGCAGAATAAACAACTTTATTTTTAACCGACTCCAAGTTGTTAGAACTTGAAGCACTACTAGTGATTGCTCAAACTATGTTAAGGCGATAGAGTCCATCTCTAAGTTCTCCTATCAGCACCATCTTGCTCAAACGCATTTTCTTTACAAGACAATAATCAGTATGAAATTCAATGTATACATTACTATCTTTAGCCAATTTAGACACAGTCACTAAATACACATAATACATTCTCAAGCACAACCAGTCCATTTTCAAA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mRNA sequence

ATGCGCATTTGCCTTACTGCATGTCTATGCGCCTTGCACACAACGTCCACACCGCACACCCATCCACACCTGGTGCCTGCTTGCTTGCGCGCCTATGACCGCTCATCCGTCCGTGGGCCCTTGCTACCTGTCGGCCAAGCACGTCAACGCTTGCCGCTCTGCGCCCCACCATGGCCTGTTAGCCTCCAGGGTTTACTGGAAACTGTGTTGTTCACGTCGCCACCTCCAGAATGTTGTTGCAAGTCGCCGATTTGCTCTTCATCACCAAAAAATCGTCAGTTTTCCCGAAATGTTGTTGTAGATTGCCAGTTTGCTATTCGTCGCCGAAAGTCATGGGTGCTGCCGAAATTCGTAGCAGATCGGGTCGCTGGAAGCCCTGAAGTTTGCGCTGCTGTGCTATGTTGCCGCCAAAGAGATACTTGCTCGTGGGTGTCGGAGTGGGTCACCGTAACTGCTGTCGTCCGACTGGAGTTATGTGGTGCCATCAGAGGTCTGTCACCGCTCGCGCCGTCATTGGAGCGTGGAGTTGTTCCAGAATCTTCCGTAGCTAACCCTAATTCACCGTTGCAGGGTCTGGGCGACATCGTCGATCGAAGATGGAGGATTACTGGCTGGGCCGTGGGCCGAGCCCCGGGTCGGGACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCGCATTTGCCTTACTGCATGTCTATGCGCCTTGCACACAACGTCCACACCGCACACCCATCCACACCTGGTGCCTGCTTGCTTGCGCGCCTATGACCGCTCATCCGTCCGTGGGCCCTTGCTACCTGTCGGCCAAGCACGTCAACGCTTGCCGCTCTGCGCCCCACCATGGCCTGTTAGCCTCCAGGGTTTACTGGAAACTGTGTTGTTCACGTCGCCACCTCCAGAATGTTGTTGCAAGTCGCCGATTTGCTCTTCATCACCAAAAAATCGTCAGTTTTCCCGAAATGTTGTTGTAGATTGCCAGTTTGCTATTCGTCGCCGAAAGTCATGGGTGCTGCCGAAATTCGTAGCAGATCGGGTCGCTGGAAGCCCTGAAGTTTGCGCTGCTGTGCTATGTTGCCGCCAAAGAGATACTTGCTCGTGGGTGTCGGAGTGGGTCACCGTAACTGCTGTCGTCCGACTGGAGTTATGTGGTGCCATCAGAGGTCTGTCACCGCTCGCGCCGTCATTGGAGCGTGGAGTTGTTCCAGAATCTTCCGTAGCTAACCCTAATTCACCGTTGCAGGGTCTGGGCGACATCGTCGATCGAAGATGGAGGATTACTGGCTGGGCCGTGGGCCGAGCCCCGGGTCGGGACTGA

Protein sequence

MRICLTACLCALHTTSTPHTHPHLVPACLRAYDRSSVRGPLLPVGQARQRLPLCAPPWPVSLQGLLETVLFTSPPPECCCKSPICSSSPKNRQFSRNVVVDCQFAIRRRKSWVLPKFVADRVAGSPEVCAAVLCCRQRDTCSWVSEWVTVTAVVRLELCGAIRGLSPLAPSLERGVVPESSVANPNSPLQGLGDIVDRRWRITGWAVGRAPGRD

Homology

[Close]

BLAST of MC11g_new0268 vs. NCBI nr
Match: XP_022159153.1 (uncharacterized protein LOC111025577 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 5.74e-04
Identity = 27/36 (75.00%), Postives = 29/36 (80.56%), Query Frame = 0


Query: 176 VVPESSVANPNSPLQGLGDIVDRRWRITGWAVGRAP 211
           VVPE SVANPNS LQGLG+IVDRRW  T W +GR P
Sbjct: 447 VVPEPSVANPNSQLQGLGEIVDRRWE-TCW-LGRGP 480

[Close]

BLAST of MC11g_new0268 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DY12 (uncharacterized protein LOC111025577 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025577 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 2.78e-04
Identity = 27/36 (75.00%), Postives = 29/36 (80.56%), Query Frame = 0


Query: 176 VVPESSVANPNSPLQGLGDIVDRRWRITGWAVGRAP 211
           VVPE SVANPNS LQGLG+IVDRRW  T W +GR P
Sbjct: 447 VVPEPSVANPNSQLQGLGEIVDRRWE-TCW-LGRGP 480

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of MC11g_new0268 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of MC11g_new0268 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022159153.1	5.74e-04	75.00	uncharacterized protein LOC111025577 [Momordica charantia]	[more]

BLAST of MC11g_new0268 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1DY12	2.78e-04	75.00	uncharacterized protein LOC111025577 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025...	[more]

BLAST of MC11g_new0268 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
MC11g_new0268.1	MC11g_new0268.1	mRNA