Lag0004920 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0004920
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6: 8507267 .. 8514299 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0004920
SyntenyLag0004920
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCTCTCCAGTTGGCTTTTAACTGGCGGCTGGCCCATTATCCTCCTCCCCTTGGCCATCAGCTACTTCCATCGTCGTCGCACTGCCCATGCCGCTTCCACGAAGCTGGTCTTCATGAAGCTGCGTTTGCTTTTGGCCTTTGTCGTAATTGGCGTTCTCACCAGCCTCGACAACTACCTGTACGCTGTGTGTGTGGCATTCTCACCAGGCTCGACAACTACCTGTACATTATGTGTGTGTACAAGGTTAGTCTCTAAAACTTTTATGGTTGTGTCAATTTGATCCCTGAACTTTAAAAAAATTCAAATTGGTTCTACTTCATCGAAATTTCGGCTCAACACTACAATTACCCAGACCAATAGGGGGAGAGGAAGGATCTCCCCTCTAAACAGAATCAATAGCCTCCCTATTTACATAGAAGCAAGACTTTATTTTTGGTGGTTTTATATATAGCAAAGCCAAATTTAGTGCCCTTTAAATTTAACAAACACTAGAAAATATATAATTAAGTCACCTCACAATATAATTATAACTCTATAGCTCATGCATGAGACTATATACATGACAATTATGATAAATATCATGCTAAAAAAATATAGCATCAATAATATGAACTAAAAATTGCTAAATTTCTCATAAGCCACACTCAAAATTTAACTCTCTTTCATCAGTAGAAAAAATCATCCTATATAAAACTTAATATATAGAATGACGGTATAAAAATCGATGTAAGTGGCAAGCGAGGGTTGACAACCTAGACTGTATTTGTGGAACAAACTCTCCAAATAACCAAGATTTGACCAAATTAAACGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAGAGGCCAAATGAAAAACTCGCACAAATCTAATAGATTATATTGTTAAATATACTAAAAAAAGGGTAAAAAATCACTGAACTTATCTTTGTCATGCCTTTGTCCCTCTCTCGAATTATTGCAGGGAGGAGTCTTTCTTCATCTCTCGACTTATGGACCCTTTTGCAGTCGCTAATATCAAGAGCTCCAAGAGCCCTCTTCAGAGAAACTAGCAATTCTAAAATAGAGAAAATAGAGAGATTAGAAAAGCTAAGAAAAATCTCAACCACAATGGAATGATTCCATCCATGTTAACAAAGACACATTGCTAAGATTGAACTCTCGATTCGTATTAAGGAGTTAAAAGCCCAGGTAAGTGAACCTACTATTGAACCTTTTAATTGGGCGCGAATATTTGAGTTCCTAAAATTCTCGTGTTTAGAATAATTGAATTTCTAAATATTTGTGTTTATGAGTCGTTCTTGAATTTTATTATGATTGTTAAAAGCATGAAAATTAAGCATGGCAAGTTTATTTCTTTAATTGCGTATGCGTTTATGAAGAATGTTGTAAGCAAGAAATTTATTATTTTTGCTTGTATTTGTTGATATTTAAAATAGTTGAGTTGGTGGTCTCTCAAAATCCCATTAAAGGAATTGAATTTAAATTATTTATGTCTTTAAATTCCATCAAAGGAATGAGTTTAAATTAGTGTACATGAAATTGATGTATATTTGGAGATGCCTACATAGGGCTTAGGGACATGAAATTCTAAGTCGAGGTTTGTGAAATTGACGACCTCGAGGTTTCGTGAAATTGACGGCTTCCGTAGGAGACATATGTAATTGATGTGTCTAGGATATGCATGAAATTGATGTATATCTTCTCTCTAATTTAAAGTTTAAAAATGAAGTTTAGAGTCACCAAAATTATATTTGTTGTTGATTTTAGAATGTTTTTAAAAACGTGACCCAACCTCAATAGTAGGGTCACTTACTGAGTATTTAAAATACTCATTCTTTTCAAACATATTTTTTTTTTCAGGTAAAGGTAATGGCAGATGAGAGGCGATTGATGAGAATCCGATAGACAGCCTTGAGGGGACCTGAGTTTCATATTTTTCTTCCGCTTAAGAAGTCTGCTTTACTTTATTGATTTATAAATCTGTTCGAGAAATTTTCTAGAGGCCATGAATATTCATGTTTTAGTAATTGTTTAAGAGAATTTAACATCTTTAAATTCAGGGATCTTGAAATAAAGCTTTGTTTTAAAGTTTTTGTTTAAATTAGTGTTTATGTTTTCAAATTATTATTGTTATTTTAAAAAGGCCTCCAAAGCATGTATTGTCGTAACGGTCCCTTTTAAGGCTTATTAAGAAGTCGGGTCATTACAGAAATAGTGTGTGTGTGCGAAATTCAATTCACACAATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTAACAATTTCGTTTTCCGATTGTTGGAAATAGTGTGTGTGCGAAATTCAATTCACACAATTCCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTACCATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTGTATGTAATCAAATTTAAGAAAAGAACATATATTGCTTGCCCATTTCAAAAAAATTCAATTCACACAATTTCACTTTCAGATTTTTGGAAATAGTGTGTGTGTGTCCCATTTCAAAAAAATTCAATTCACACAATTTCACTTTGAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTTGCTTTCAGATTGGAGTGTGTGTGTCCCATTTCAACAAAATTCAATTCACACAATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTTAAGATTGCTGGAAATAGTGTGTGTGTCCCATTTAAAAAAAAAATCAATTCACACAATTTCACTTTCAAATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAAGAGTGTGTGTGTGTCCCATTTCAAAAAAAATCAATTCACACAATTTCGATTTCAGATTGTTGGAATCACACAATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTTACTTACAATTTCGCTTTCAGATTGTGGGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTTCACATTGTGTGTGTGTGTGAATTTCGCTTTCACATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTTCGTGCGTGTGTGCAAGTGTGCATGTTTATACTGAATTTCTATAATTCACACAAAAACTTGGCACAACCATTAATGAGTGAACAAATTAAAACACTACATAAATCAAATTTAAGAAAAGAACATATATTATGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAATATATATATTGTACTGAATTTCTATAATTCACACAAAAACTTGGCACAACCGTTAATGAGTGAATAAATTAAAACACTACATAAATGTGTTTGTGTTTGCTTTCAGACTGTTGGAAATAATATATATATCTGTGTGTGTACTGAATTTCTGTAATTCACACAAAAGCTTGACACAACCGTTAATGAGTTAATAAATTAAAACACTACATAAATCAAATTTAAGAAAAGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAATGTGTGTGTGTAAAAAGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTGTGTGTGTGTTGTGTGTTCGCTTTCAAATTGTTGTGTGTGTGTAAAAAGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCATGTGTGTGTAAAAAGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTGAGATTGTTGGAAATAGTGTGTGTTGTGTGTTCTCTTTCAGATTGTTGTGTGTGTAAAAAGAACATATATTGTGTTTCTCTTTCAGATTGTTGGAAATTGTGTATGTGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAAATTGTTGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGAAAACTGTATGTGTGTGTAAAAAGAACTTATATTGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATTGTGTGTGTGTGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAGATTTGTGTGTCCGGTTCTATACGGATTTGTGTTGCCGTTAATCGAATTGAGGTACAAGAAGGCGAGGTAGAGAATTACATATACATTGGTATTGGAATTTCAGTTGGTGATATCTTTGCCACCATTCTCTGCACCATTGGAATGTTGATCAATAATGATTTCCAGGTTTGATCTCTCTAACTCTAACTTCTCCCCATCATTACTTTTTCAACTATCCTACCAATAAAAGATAAAAGGTTAAAATATCATTTTCAAAATATTCTAAATTTAGTTTTTCTGTGCTTAGAATTGAACCATATTACCCTTTATTGTTTGCCAGGGAAGAGTAGTTAAGAATTGTGTGGGACCCATAGAATAAAATATTATATCATTAAATGTTCATCAAATGACGTGTCAAATGCTGAATGGAAGAAGTATGTACTACCGTAGTACTAGAAATTTTCCATACTAGTATGGGATCCTAATTGTCAACATTTTAATAGTGGTATGTAGCTCTACGTACAAACCAAGTTTTTTTCCTTAAAATTTGTCCCTACCTTTTATTTTATTTTATTTTTTTTAAAACATGTTTTAGTTTAAAATTAATTTTGATAAGTTTGGTTAAATAATAACAATAATTTCTATATATAAGACACTACTTTTACATATATTTCCAAAATTTATATAGAGATTAAAAAAAAAGTTGACAATTTTAAGCTTTATTGAAAGTAAAAAACTAAATTTGAACATTTCAAGATACATGGACTAAAATAAAACAATACCTAAAATACAGAGATCAAAATAAAATGATAGGAAATTATCAAAATTTTAAAATAAATTGCTTAATTTGAAAATACTAGAGAATTTACGGTGGGTGGAAAATAAGAATGATATAATTGTAATTATAGCACAATGTTAAAAAAATTGCAAATATAGCAAAATCTATTGGAGCATATTATTGATAGACACTATAGACTTTAGTTAATTAGAATCTATCAATCTACTGATAGACTTCGATTATCAGAGTTTATCAGTGTCTATCGCTGAAAGACTCCAATTAATCAAAATCTATCAGCAATAGACAATGATAGAATCTGACGACAACTTTTTGGTCTTGTACAATTAATTTTGTTATATATGCAATTAGTTTGCAACTGTGCTATATTTGCTATTAATTTGGTTCAATTTGCCATCTATGCAACTGTCCCATCATCGGTTCGCCGGCAGCCGGTGGCGGCCGGCCACCGGAGCTGAAGAAGATGGGAGGGGGAAGGAAGAAGATGGAGGGGGAAAAAAGGTGGAGAAGAAAGAAGATGGAGAAGATAGAGAGATAATTTTAAAAATAATAATAAAATAATAATATATTTAATATTTTTATAATTTTTATTTAAAAAAATTAAAAACTAATTTTTTTAATTAAAATAATAGTGCCACGTCAGCTTACCGTTAGGGTTTAACAGAAAAATTGACGGCAGGGACCAAACTGCTCATTATCTCAAACCTCGGGGGTATTTTTGTTGAGTTTGAAAACTCGGGGACCAAAGTGTCACTTAACCCAAACCTCAGGGACCAAAAGTGTATTTTTCCCTAAAAGATTTGAAGATTGGTGAAAATTTAAAATTTGGGCTGGAGTGGCAATTTCGTAAATATTGAGATAGTTAAGTAAGCAAACCCTAAGCCATCCCCTTTTATTTTAGTCGCACGCAGCCCTAGGAGCAAGCCACTCCTCATATTCTTCTCTCTCCCCTTACCAAATCGTTTAGCCTCTCCCATTCTTCTTCTTCCTTGGTACCCGATCGGCAGCTTCCTCGTGCCCCATCTCCGACGACGTTCACCAGCGGTCTTCCGGCGAGCGTGACTCCTACGACGATCTCCATGGCGACGCAGCATCGATAGGCAGCAGCGTTTCACGTTGGTCGCGGCTGTGGCGTGTCCTTTCGGCGTTTGTGGCAGTCGTAGGCGACGATTCTGGTGTTGCTGCAGCGATCTGTGCGTGGTTTACGGCGGAACAGCAGCGTGCAGGCGCGTGGGCAGTTTGGTTGTGGAATTTGGTGAGTTTCAGCACCTGATCGCGCGGACAGCGGTGATGGGTGGTCGTTTCCTCTGTTTTCCGGCGTTTCGTAGTGGGTAAGTGTTTAGAAGTTGTTTCTTGGTTGAATAATAAGTTTTAATGAATACCCACTGATTTTTGAAACCCATTCAGCAAGTTCTTGGCATTATCGGCGAGTTGGAGTAGTGGGTATAAGAGTTTTAGCGGTTGCGAAGAGATTGCATCTTTGGGTAAGTTTTGAGTGCTAAACCTTCCTTAAATCGGTTAGTACCTAGAAGAGCAATGAGTTTTAGTCCTATTTAGTTTAAAGGAATCTTCCTTCTAATTTGTAGCTGGCCAAGGTCTTTGAATCAAGAAGTTCGAAGAGGATTGATTTGACGATACTTAAGCCGAGGTAAGTGAACTTATTATTGAACCCTTTTTAATTGGGTGCACATATACTTGATTTTCTAAAATATTCGTTTTTATGAGTTGTTCTTGAAATTTATTATTATTTATTAAAAGCATGAAAGTTGAGCATATTTTAATTATGCATGAGTTTATGATAAGTCATTGAAAGCATGAAAATTATTATTATTGTTCGTATTTGTAAATGTTTAAAATAGTTGAGTTGGTGGTCTCTTGAAATTCCATTAAAGGAATTAGTTTAAATTATTTATAAGTGTAATTCAGCGTACATGAAATTGATGTACGTTCAGAGATGCCTACGCAGGGCTTAGGGACATGAAATTGATGTACCTATACCTAAGTCGAGGGTTGTGAAATTGACGCCCTCGAGGTTTCGTGAAATTGACGGCCTCTGTAGGAGACATATGAAATTGATGTGTCTAGAATATGTATGAAAGTGATGCATATTCTCTCTCATTAGAAGTACACATGAAATTGATGTGTTTTAGGATATGCATGAAATTGATGTATATCCTAATTAAGTTTACAAATAAAGTTTAGAGCCACCAAAATTGTATTTGGTGTTATTTTTAAAATGTTTTTAAAGCGTGATCCAACCTCAATAGTAGGGTCACTTATTGAGTATTTAAAATACTCATTCTTTTCAAAAATATTTTTTTTCAGGTAAGGGCAAGGGCAGACGAATGGCGATTGATGAGAAATCGATAGATGGCCATGGGAGGACTTGA

mRNA sequence

ATGGCTCTCCAGTTGGCTTTTAACTGGCGGCTGGCCCATTATCCTCCTCCCCTTGGCCATCAGCTACTTCCATCGTCGTCGCACTGCCCATGCCGCTTCCACGAAGCTGGTCTTCATGAAGCTGCGTTTGCTTTTGGCCTTTGTCGTAATTGGCGTTCTCACCAGCCTCGACAACTACCTGTACGCTGTGTGTGTGGCATTCTCACCAGGCTCGACAACTACCTGTACATTATGTGTGTGTACAAGATTTGTGTGTCCGGTTCTATACGGATTTGTGTTGCCGTTAATCGAATTGAGGTACAAGAAGGCGAGGTAGAGAATTACATATACATTGGTATTGGAATTTCAGTTGGTGATATCTTTGCCACCATTCTCTGCACCATTGGAATGTTGATCAATAATGATTTCCAGTTTGCAACTGTGCTATATTTGCTATTAATTTGGTTCAATTTGCCATCTATGCAACTGTCCCATCATCGGTTCGCCGGCAGCCGGTGGCGGCCGGCCACCGGAGCTGAAGAAGATGGGAGGGGGAAGGAAGAAGATGGAGGGGGAAAAAAGCCTCTCCCATTCTTCTTCTTCCTTGGTACCCGATCGGCAGCTTCCTCGTGCCCCATCTCCGACGACGTTCACCAGCGGTCTTCCGGCGAGCGTGACTCCTACGACGATCTCCATGGCGACGCAGCATCGATAGGCAGCAGCGTTTCACGTTGGTCGCGGCTGTGGCGTGTCCTTTCGGCGTTTGTGGCAGTCGTAGGCGACGATTCTGGTGTTGCTGCAGCGATCTGTGCGTGGTTTACGGCGGAACAGCAGCGTGCAGGCGCGTGGGCAGTTTGGTTGTGGAATTTGTTCTTGGCATTATCGGCGAGTTGGAGTAGTGGGTATAAGAGTTTTAGCGGTTGCGAAGAGATTGCATCTTTGGGTAAGGGCAAGGGCAGACGAATGGCGATTGATGAGAAATCGATAGATGGCCATGGGAGGACTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTCTCCAGTTGGCTTTTAACTGGCGGCTGGCCCATTATCCTCCTCCCCTTGGCCATCAGCTACTTCCATCGTCGTCGCACTGCCCATGCCGCTTCCACGAAGCTGGTCTTCATGAAGCTGCGTTTGCTTTTGGCCTTTGTCGTAATTGGCGTTCTCACCAGCCTCGACAACTACCTGTACGCTGTGTGTGTGGCATTCTCACCAGGCTCGACAACTACCTGTACATTATGTGTGTGTACAAGATTTGTGTGTCCGGTTCTATACGGATTTGTGTTGCCGTTAATCGAATTGAGGTACAAGAAGGCGAGGTAGAGAATTACATATACATTGGTATTGGAATTTCAGTTGGTGATATCTTTGCCACCATTCTCTGCACCATTGGAATGTTGATCAATAATGATTTCCAGTTTGCAACTGTGCTATATTTGCTATTAATTTGGTTCAATTTGCCATCTATGCAACTGTCCCATCATCGGTTCGCCGGCAGCCGGTGGCGGCCGGCCACCGGAGCTGAAGAAGATGGGAGGGGGAAGGAAGAAGATGGAGGGGGAAAAAAGCCTCTCCCATTCTTCTTCTTCCTTGGTACCCGATCGGCAGCTTCCTCGTGCCCCATCTCCGACGACGTTCACCAGCGGTCTTCCGGCGAGCGTGACTCCTACGACGATCTCCATGGCGACGCAGCATCGATAGGCAGCAGCGTTTCACGTTGGTCGCGGCTGTGGCGTGTCCTTTCGGCGTTTGTGGCAGTCGTAGGCGACGATTCTGGTGTTGCTGCAGCGATCTGTGCGTGGTTTACGGCGGAACAGCAGCGTGCAGGCGCGTGGGCAGTTTGGTTGTGGAATTTGTTCTTGGCATTATCGGCGAGTTGGAGTAGTGGGTATAAGAGTTTTAGCGGTTGCGAAGAGATTGCATCTTTGGGTAAGGGCAAGGGCAGACGAATGGCGATTGATGAGAAATCGATAGATGGCCATGGGAGGACTTGA

Protein sequence

MALQLAFNWRLAHYPPPLGHQLLPSSSHCPCRFHEAGLHEAAFAFGLCRNWRSHQPRQLPVRCVCGILTRLDNYLYIMCVYKICVSGSIRICVAVNRIEVQEGEVENYIYIGIGISVGDIFATILCTIGMLINNDFQFATVLYLLLIWFNLPSMQLSHHRFAGSRWRPATGAEEDGRGKEEDGGGKKPLPFFFFLGTRSAASSCPISDDVHQRSSGERDSYDDLHGDAASIGSSVSRWSRLWRVLSAFVAVVGDDSGVAAAICAWFTAEQQRAGAWAVWLWNLFLALSASWSSGYKSFSGCEEIASLGKGKGRRMAIDEKSIDGHGRT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 170..186
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 168..187

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0004920.1Lag0004920.1mRNA