HG10018668 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10018668
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Unknown protein
Location	Chr04: 6633340 .. 6640841 (-)
RNA-Seq Expression	HG10018668
Synteny	HG10018668

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

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mRNA sequence

ATGTTGACAGTAATTGGTATCCAGATGCCGGAGCAACCAATCACGTACATTAGGGGTGTTCAAATAACTCGACAACCTGAACAATTAGGACTATCCAACCTAAAATGTAAGGGTTGGGTTGGCGGACGAAATGAAGGTGACAATGGCAAGAGGCAGTGCCTGAAACTAAAAGAAGAGTTTAGAGAGAGGAAGGAGAGGGAGAGAGTGAGAAACTTGCAGATGAAGGAGGTTTTAGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGACGGCTGAGAAGGGGGTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTGACAGTAATTGGTATCCAGATGCCGGAGCAACCAATCACGTACATTAGGGGTGTTCAAATAACTCGACAACCTGAACAATTAGGACTATCCAACCTAAAATGTAAGGGTTGGGTTGGCGGACGAAATGAAGGTGACAATGGCAAGAGGCAGTGCCTGAAACTAAAAGAAGAGTTTAGAGAGAGGAAGGAGAGGGAGAGAGTGAGAAACTTGCAGATGAAGGAGGTTTTAGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGACGGCTGAGAAGGGGGTTTAG

Protein sequence

MLTVIGIQMPEQPITYIRGVQITRQPEQLGLSNLKCKGWVGGRNEGDNGKRQCLKLKEEFRERKERERVRNLQMKEVLERERARETAEKGV

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10018668 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10018668 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10018668 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10018668 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 61..81

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10018668.1	HG10018668.1	mRNA