HG10012272 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10012272
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr01: 19648553 .. 19654005 (-)
RNA-Seq ExpressionHG10012272
SyntenyHG10012272
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGATGATCGGTCCAGCCTCGGTAAGACGTCAAATCATGTTGGGCTGGCCCAGATAGAGTAATGGAAGATGAACCGAATCTTTAGGATAAAGGCTTCAATCAGGGGTTTAGATTTGTCTGGGGTTTGTTTGGATTGTTGTTACTTTTAAATTATCAGATTATAGATATAATAACTAAATTGACCTAATATTATTTTTTTGAATAAAATTTATAATTATTAAATAATGGTTTAAAAGAGATATATAAAATAAATCTTAATTTTGAAGGGTAAAATTAAAAATTAAAAAATTATTAAAAATTGCATCTGTAAATAACTGATTTTAAAAAGGTGTGAAATGAACAAAATAATAATAATAATAATAATCTTTTATAATGACTTCTATCACTACCAAGATTAACTTTCAAACGCACTTGAATCACTTTAGAATTTATGGAAAATATGCATTCTTAGTTTTATGGTCGATGATATGCTTATTTTTACCTAAACTTTTTATTTCATCAATTTGAACTATAATTTAAATACGTATTACATTTTTATTTATTATTTAGTTTCTTCAAAAACTTACTAATTTAGTCCTGATTAAGTTCTGCACAAATTTAAGTTTGATTCATATACAAGATAGACCATTAAATAACTCGATTAAAACTTTCAATTCTAACTCCCCAAAAAAAAACCAGCTCCAATAGCCAGTTTTTTTAGTCCAAAATTCTATGAAACATTGTTTGATAAGAATATTTTCAATGTTTTTCCAACCAAATATAAGATAAAAATTATAACATTTATCCGGATTTGATAAAATTAAAAGTTAATGTGATTTGTATTTAACTTTGTGGAATATTTGAGAATTATTAAACCCAATACACATCCTGAGAGAAATTCCAAAACTAGTGTAATTCTATATACTCCTAGAATTAACAAATCATATACAATATATGACATTCCAATCATAAGTTACATAAACCACTTCAATTTCTATGGTCGAGCTCACACCCACAACATTTTTTTTCCCCTTTAACATAGTACATTTTTCTTTATCAAAGTAAATAAATAAATGGACACCAATGCAAAGCCAAACACAACAATATGGTTGAAAATCAACCACATGTGTCGATTGTGCAATCTTTTTCTCTACTCTTTTCCTTTAACAATCTCGTACCATAGATAGGCATGTTGCTTTTTTTTCAACCCATTAATTCTTGTGGTAATATCGACAAAATTTCATCAATTCCATCCTATTCAAACTCACATAATGAATTTGTGTATTAAATTCATAATGTTATGATTGGTAGGTATATATTCAAATTATCGGAGAGACACTTGCTAAACTTTTTTTTTTAATCTAGACACAAAATTGAAAGTTTAAGATTCTATTATACATAAAATTTAAATTTATATCTAATAAATTAGTTAATTTTTAAATTACTTAAATTTCTCATAGACTTATTAAACACAAAATTGAAAGTTTAAATCTATATCTATCCTATCTAAAAGGGGCTAAGAGGGATAAACTTTTGATTTTCCTTTCTACTCCTTCTAGTTGATAGTCAAAGAAATATCTTAGTATTTTCACATTCAAATCATTAAATAATTTTTTTCCTATTTGTTTCAAGTTAAATGAGTAGATATTTTTTTTAAAAAAATCTATCTAAATTTTTTGATTTTTTTCACGCTAAATGAACAGATTTTTTTTTTAAAAAAAAACTAAAACTATCTAATTTTTTTTCCAATTTGCTTCACGTTAAAGGAGTAGATATTCAAACAAAAAAAATTGTCTGTTTTTTTTTCTTATTTGTTTCACGTTACATGAGGAAATATTAAAAAAAAGTTATATAAAATTTTCTTAACATATAAGGTTCACGTCAAATGAGTAGATATTGAAAAAAAAAAAAATCTATCTAAATTGATGTTAAAAAAAATCTCTCTATCTATATAATTCACATTAAAATAAAAATAAAACAAATCACATTCTATCCATTTACAGGAGTTAAATAATAGTTATAAATATATTATAGAAGTAGGTTTTTTATTTCAAATAAGAGTGATTAACTTTTTTTTCTTATTATAAATGTAAATATTATTTAGTTTATTTGTAATTTTAATTTGAAAACTTAAGAAAAAAGTTTTAAAAAAACATATAAATTCAAATTCAGTTTGATTTAGATATCTTTCTTTAAAAAATATATATATATATAAAGAAATAAAATGATTATAAGTATAAGTCTTTTATTTTAACTTATATAAATACATTTCATTTTGCAACGTTACGAAATACGTGTAATGCACATAATTCTAACTAATAGTTCTAAAAGTTCATATACTAAATAAAGTAAACTTCAAAATTTAGCGATTAAACTTATAGTAAATTAAGTTTATTATTAAAACTAATTATATTAGAAAAATTCAACATTTTTTAAAAGAAATTATGAGAAAAAAAAATCCTTTTTAACTTTTATATAGTACTTGTGGATAGGCTTGGTTGTCGATTGATCATAATTATTATAGGAGAATTTTGTAAAGTGAAAATATAGTTATAAAAGAAGACAAAAGACCAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGTTCACGTGCCATAGCAACACAAGAGTAACCCGTGAGTGAATATTTTGGCACTGATTCAATCAGGGAGGCTTCACCATCAAACAAAACAAAACAATTCTTTTTCCTCTTATTTTTATATCTGCAAATCAAAATTGCTAAAGCACCCGTGACATGTTATTATTTGAAGGATTTAAAAACGTCACTTATTTTATATTATTTTCACAAAGAGTGGATGTAGAAATTTAAATTTTTAACTTATGCAAAATGTTATTAATTACATGTGTATTGGCATGCGTGTTTTGGATGTTTTACTGGTCCACTCCTTTAGTCCAACCTCTTCGTCGAAATTGACTTATATGAGAGTACTCACGTCGAAGTATTTAGTCAACTAAGTAAGAGAAGGGTTTAGAGTTTCTCTTTTAGAATTTACTTATTCCCTCTAGGATTGTCGAATGAGTCTATTTATAAGGTTGTTCCTCTGACATCTCCCTGAAGTTACGTGTAATGTCGGTAGTATTAGAACTAATGTTGTCCTTGAAGTTGTAGAGAGCTAGTACTATAGTCCGCTTAAATTACTTTTCGATTGGTATAAGTCCATCGGTTCGGTTAGTTGACTCAAAACTCGAAAGTGACTTTTTTCTTTTGAGATGTGCAGTTTCCCATGCTATCTCTCAATTTTTCTTGAACTTGGGCCTGCTCATAGGCTTTGGATCTTGCTTGGAATAACTTTTAACAACATTTTGAATTAATCATTCAATGTTTTTCTTAATAGTTAACAATTATAAGAGTGGACGATTTCTTTAGGATGATAATTGATGTCTTATCCACTAAATAATATTCGGATTAAGCAAATTCACAACTATCTGGTTATGTATTAATAATTCATTAGATAATTTTTTTACATAAATTACTAATGTTCAAATTAGAAAGAAAAAAATTGACATTCAATTTTTTAAAAAAATACAAACAAACATGCCCATATCCACTCCAAAATTTTGGCCAAGTCTCACAACATTATTTTATTGAAGATATCATGGAAGAAAATATTAGCCCCATATCTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTCCTTTTTAATTGAATTTGGTGTTTTCATATAAATATAAGATTAAAAAAAATTGTAGCTCAAGGAAAATTTAAATCCTATAATAAGAAAGTATTATAGAAAGTCTGCATGTGGGGTCTTTTGGACATTTTGGGCCATTTGGCCGAATGATTGAAGTCTCACCTTCACATCAAAGGGCTCCCTAGTCTTTACATCTCTCTCTCCAATGTTATTATCATAGTTTTATTCTTTGTAAAGGCCAAACAAGAATCATAAAATAATTGACAAAATCAAAACAAGAAAGATGCTTACTAATTTGCTTTTAACTTATCATTCACTTATTTTATCCTTCAATAATGATTAATGAATTATTTGATATTTCATCAATATTTTATCGACATTTATTGAAATGATGGATTGGAATGTCGATAATGTGTTTTTTGGAGCTATTTTTTAAAACAAATTTTAAAAAACAAATATTTAACGTTTTTTAAACAGTTAACATATATTTTTGAATTTTTTTTAAGGAGTAGGATGTTTATTATTAATATTATATACATTTTTTTTTGTTTTTCTTTATGTTTCATTAATTTTTTTACAATATAATACAAATATCAATTCATTTCATCCCTCACCGGTGTTTAATGGCATGTTAGAAAGAGTGATAGATGGATTAAAAGTTCAAAAACATACTTGTAATTCACAAGTAGTCTTTGCAATTTATTCCAAAAAAAAAAAAACAAAGAAAAAAGAATGGTTAATTTACCATTTCCATCACTATATACTTTAAAGTTTTTTAATTGTTAGTCTTTATACTTTCAATTGTTCAATTCTAGTTTCTCTATTTTCAATAAATCTTAAATTTAGTCTCTCAAAGTTAATTTTTATCAATAATAATAATTTTCATGCAAGAATATACAATATGTGAATATTTTTTTAAAAAAAGTTGTATAGTAAAAATGCTAGTAAATAATTAGAAAAAAAATAAACTATAAAGAATCAATTGAAATTAAATTTAAAATTTATCGAAATAAATTAAACTTCAAATTAGAGGGAACAAAATCGTATTCTCTATAATTTATTTTTTAAAATACAAATCTCTGACATATGCAAATAATAACAGAGGGAGCATAATAATAATAACAATAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTCTTAGACGTAGAAACCCTTCTAATCAAAACAAGCAAACAAAGAAGTCGATAGAACACAAAAAAGGCGATCAAAGCATAAACATTTGTCCACCGTTGATTCTCGTGAAGGCCTCTCTTAACCAACACATCTCCACCCGTAACCAAACACTCCCTTTCATTCTCTTCAAACCAAATGAAGCATCTAGAAACCAAGCACGAATA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mRNA sequence

ATGGATGATCGGTCCAGCCTCGTTCATAAACACCCAAAACTTAGGCAAGCTTTCTTGGGAGATGAAGTAGCCGGAGAAAAGGAAAAACGCGGCGAGGAGAACGGTCACCAGCGAGGTGCCGGCGATGAAATTGGGGGCGAGGGAGCTCAAGAAAAGGACGAAGGAATTGGCCATGAGAATGATGACCCAAATGACGAGCACGAAGTAGGCGAAAGCTTGCCACGTGGCGCAGAGGCCGACGAGGAAATAGACGGAGGCGGAGTAGATGACGGCGACGGCGAGGAGGTAAGGGAGGAAAACGAGGGTGTTGGCGATTATGTAGGAGGAGAGACGGTAGACGCCGGCGGAGGTTTCACGGAGGAGAATGGGGCGTTCGTTGAGGAAAATGGGGAGGGATTCGGTTGTGGAAGAGAGGAGGAATGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGATGATCGGTCCAGCCTCGTTCATAAACACCCAAAACTTAGGCAAGCTTTCTTGGGAGATGAAGTAGCCGGAGAAAAGGAAAAACGCGGCGAGGAGAACGGTCACCAGCGAGGTGCCGGCGATGAAATTGGGGGCGAGGGAGCTCAAGAAAAGGACGAAGGAATTGGCCATGAGAATGATGACCCAAATGACGAGCACGAAGTAGGCGAAAGCTTGCCACGTGGCGCAGAGGCCGACGAGGAAATAGACGGAGGCGGAGTAGATGACGGCGACGGCGAGGAGGTAAGGGAGGAAAACGAGGGTGTTGGCGATTATGTAGGAGGAGAGACGGTAGACGCCGGCGGAGGTTTCACGGAGGAGAATGGGGCGTTCGTTGAGGAAAATGGGGAGGGATTCGGTTGTGGAAGAGAGGAGGAATGTTAG

Protein sequence

MDDRSSLVHKHPKLRQAFLGDEVAGEKEKRGEENGHQRGAGDEIGGEGAQEKDEGIGHENDDPNDEHEVGESLPRGAEADEEIDGGGVDDGDGEEVREENEGVGDYVGGETVDAGGGFTEENGAFVEENGEGFGCGREEEC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 83..99
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..82
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..141

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10012272.1HG10012272.1mRNA