Cucsat.G562 (gene) Cucumber (B10) v3

Overview
NameCucsat.G562
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionBidirectional sugar transporter SWEET
Locationctg1: 10894744 .. 10895700 (-)
RNA-Seq ExpressionCucsat.G562
SyntenyCucsat.G562
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonpolypeptideCDS
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TGAAGGACCAAAAATACAACTTATTAAAGCCAACCACAATCATTTCTTCTTTCTTCAACCAACAACTATGGCGGAGCTCAGCTTCTTCGTCGGCGTAATAGGTCACCCATCTCTTCCCCTCTCTCTTTCTCTCGTTCTTTCTCTTTCTTTATTCAGCATTGGTGAACAATCTGATAATCGAGTTACTTAATTATTTTCTTTCGAACTTGAACAGGAAACATTATCTCCGTCCTCATGTTCCTTTCTCCGGCGTAAGTTTTAAGAAACTTTCTGGACTTGAATTGAGAGATTTTTCAGTTTTTTATTCATGAATCGTGTTAAACGGATTGTTGCAGGGGAACATTCCGGCGGATTATAAGGAACAAATCGACGGAAGAGTTCGAGAGCTTTCCGTATGTATGTACATGGCTGAACTCCTCTCTCTGGACTTACTATGGAATTATCAAGCCTGGCGCCTACCTTGTCGCTACTATTAATTCCTTCGGCGTCGTTGTACAGTCATTTTTCCTCGGTGTTTTCCTGATTTACGCACCTTCGTTAATGAAGGTAAGTACGTAGTTTGAATTAAACATATATAATCTGTGTGGGATTAAGAGTGTGATTGGGGAAGAACGTAATTGACCGGAGATGGATTATTTGAATGCGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGGCGAAAACAGGGATTATGGTAGGGATTTTGGATATCGGAATGTTGACGGCGGCGATTGTGGTGAGTGAATTGGTATTGGAAGGGGAAAAGCGTATTGAAGCTCTAGGGTTTGTTTGTGCGGGTTTGAATATCATGATGTACGCTTCGCCGCTCTCCGTCATGGTAATAACGTGCACTTTCACCTTCTCTCCTTTTCAAATATCGTTATCTTTCTTTCTCTCTTCTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTCCTTTTTGGGTAAGCGAAAAGACTTTTTCAAAAATAAAAGAAAATTGACAATACTTACATTCCACAAAACAAAATTCATCATTGCATAAAATAATTGTAAACAGCTAATTTTAAAATGTCAAAGAAAATAAATACTTCTAACTTTTTTTAGTTTAAAAAAACTTAAATTAATATTCTTAAATCGTCTAAAAATGATAAAATTGTAGTATTAAAATTGTACCACGAACCTTAAAATAATTATAAAACTAAGAGTCATACACACAAAAAATTAAATTTAATACACGTTTATATATGTTTGAGAGTGTAATTTTAAGTTTTAAAATTTGAAAGTCTACGTTTTTTATTTTTTTTATTGGGGAGTGAATCATCTAATAATTGAAAAGCACTGTTACATATATATATTTAATTGATGATAAAAATCCAGTGGCTCCAAATCTTTTGATATGAAATGAGATGATGAGGGAGTAGGTTTTGGTAGGACCCATTGATAGTTGGCCGTATACTATACGGTATTATTTTTCTTTCCCCTAAAATTAAAAGCTCCAAAACCCCCCATCGCCTCACGTCCACCATTTTCTTTACTATATTTTTTCTATTTTTTTAAAAAAACTCATTTATTTTATTTATTTATATTTATATTTTTTTGCAATTTTTTTCTTTTTCCCATTAAATTTCACACGCTTTTAATTCTTTTAATCATACCACAAAGTCAAATGGTTGTTAGAATTTTGAATTATAGAAAACTATATAATATACATGTATTCTTCAGGCGATGGGACTTTTATTATTTATTTTTACGACTCACGTCCAAGCACGTTTGTAAACCAAAATATTTATGCTTTATTTATTGGGTTCTTTTTTTAAATCCCATAAAATAATATATGAATACCCTTTCCACTTTCCTTTTCTAATATAAAATTCAAATATCTTTAAGGTGTTTTAATCACTGCTTTTATCTTTTTCTTTCTTCTTCATCTTTTCTTCGAAATTTAATTGTTAAGATAAAATTAAAACCAATAGCCACAGATGGTTTAGTAACACCATAACAATTTGTTTTGTCCACTCTATAATATATGTGTGTGTGAATTAGTATCAATAACTATACATTTTGTTATATATGTTGAAGATACAATTATATAAGTTAGAAAGAGATGTGAGAGAGCTAAAATTTGAATGAAAGGGACAACTGGTAAGTTAAAAAGGAAAAAAGGGTCAAACTATTCAAGATTGTCATGAATTATGATTAACCGGTAGATCAATTCATTTCCCCTCTTATCTATGTATATATTAAAAAGTTACATTTTATCTTTAAACTTTAAAATTATTTCAAAATATATACATTTTATTGATAGACAAGATAAACATATGATTGACATCACCGTTAATGCTTATAAAACTTATTCCTTTAATTTCAGCATATCATGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTTTTGTGAATTCAAATAGTAGAATAAAATCATGGTTACGATTTTGTTTAGGGAGAATTCTTGTAGAAAAAGAAATGTGAAACTATTTACAAAATATAATTAAAAAAATTCTAAAATGTAGTAAGGAGAATTTGATAACTTACTACCATTTGTGAATTGTTTTTGTTCTTTTTTTTGCCATATTTAAAAATTCTTATTTTTTTATCACCAAAAATATATTAAAGTTATCTTATATGATTGTACAATATAATTTTTAAAAAATTGTACATAACTGCGACGTCAGTCTAGAACAAAGATGCAATTGCATATGCTTTAATTTAATTTATATACACGTTAATTTCCATCTTATTTTAACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAACACCTTGAATAACATTTTTTGAACACGTTTCAAAATTGAAGAATAAAAATGGTAGTTTTCATAAGAGGATACAATTTAGATTGGGCTCAACGTAGGCCCATAAGATATTTTTGGTTATATGGTCATATGGAGCAATTTGATAAGTCAGAATAGACATGGCAGCTTGTACTTGTACATCACATCAACTAATATACAATATTGTGTTTTATTTATTTATATATATTAGAAACTTATATTTGTAGTAAAAACAATAATATTCTCATCGAACATATATAACTCAACTTATTAATATAATGTTGTTTGGATTTAATTCATTTGCAGAAAACGGTGATAAAGAGCAGGAGTGTAGAGTACATGCCTTTCATGCTATCACTTTTCTTTTCTCTAAATGGAGGAATTTGGACTTTCTATGCTTTTCTCGTCCACGATTGGTTTCTTGCGGTGAGCTCTTTAATCTAATTTTCACTAAACCTCTAAATTAAATGATTAACCATCTTCATTATTCTTAATTGTTAGGTCTATTTTTCCTCATTTTTGTTTAAATACACTCCTAGAATGGAACCCTACTCACATTTTTTCATGCGAGAAAATGTTTTTGTAATATAGAGAAGAAGAAAATAAGTCTATGATTCAAAATTAAAATTTACCCTATTTTATTTTGGTGTGGAATAATAATTGAGAAATATTGAATGCTTGCAGGTACCGAATGGAATGGGTTTAGGTTTGGGATTAATACAGCTTTTGCTATATGCAATTTACAGAAATGCCAGAAAGCCATTATTGCCATTAAACACTTCAATAATCACTTCGCAACAACAGCTCGATTCCCAAACCCAACCCCTCATTTCTTCTCCACATCCACAACCCTAATTTTGTTTCAATATATCTTATATATAAATCAATTTTATGTCTTTTTATCATCTTTTTCTTCCTTTATTATTCTTTAAATGAATTTGTGTGTGTTTTTTTAAAGGCTATAGATTTTCGTAGGACGTAGAATGATTGATCGAATGTATTTTGAGTTCTGATTTTAGAGATAATGAATTTATTTAATACTTATTTAAAAATACTTTTTGATTAAAAAAAATGCCATATTTTGTATATCATTTATGTGTACTC

Coding sequence (CDS)

GAAGGACCAAAAATACAACTTATTAAAGCCAACCACAATCATTTCTTCTTTCTTCAACCAACAACTATGGCGGAGCTCAGCTTCTTCGTCGGCGTAATAGGAAACATTATCTCCGTCCTCATGTTCCTTTCTCCGGCGGGAACATTCCGGCGGATTATAAGGAACAAATCGACGGAAGAGTTCGAGAGCTTTCCGTATGTATGTACATGGCTGAACTCCTCTCTCTGGACTTACTATGGAATTATCAAGCCTGGCGCCTACCTTGTCGCTACTATTAATTCCTTCGGCGTCGTTGTACAGTCATTTTTCCTCGGTGTTTTCCTGATTTACGCACCTTCGTTAATGAAGGCGAAAACAGGGATTATGGTAGGGATTTTGGATATCGGAATGTTGACGGCGGCGATTGTGGTGAGTGAATTGGTATTGGAAGGGGAAAAGCGTATTGAAGCTCTAGGGTTTGTTTGTGCGGGTTTGAATATCATGATGTACGCTTCGCCGCTCTCCGTCATGAAAACGGTGATAAAGAGCAGGAGTGTAGAGTACATGCCTTTCATGCTATCACTTTTCTTTTCTCTAAATGGAGGAATTTGGACTTTCTATGCTTTTCTCGTCCACGATTGGTTTCTTGCGGTACCGAATGGAATGGGTTTAGGTTTGGGATTAATACAGCTTTTGCTATATGCAATTTACAGAAATGCCAGAAAGCCATTATTGCCATTAAACACTTCAATAATCACTTCGCAACAACAGCTCGATTCCCAAACCCAACCCCTCATTTCTTCTCCACATCCACAACCCTAA

Protein sequence

EGPKIQLIKANHNHFFFLQPTTMAELSFFVGVIGNIISVLMFLSPAGTFRRIIRNKSTEEFESFPYVCTWLNSSLWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSLMKAKTGIMVGILDIGMLTAAIVVSELVLEGEKRIEALGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVHDWFLAVPNGMGLGLGLIQLLLYAIYRNARKPLLPLNTSIITSQQQLDSQTQPLISSPHPQP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cucsat.G562 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cucsat.G562 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cucsat.G562 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cucsat.G562 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR004316SWEET sugar transporterPFAMPF03083MtN3_slvcoord: 150..234
e-value: 9.3E-25
score: 86.5
coord: 29..112
e-value: 8.9E-24
score: 83.3
NoneNo IPR availableGENE3D1.20.1280.290coord: 146..235
e-value: 5.1E-20
score: 73.6
coord: 28..112
e-value: 2.0E-18
score: 68.5
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR10791:SF116BIDIRECTIONAL SUGAR TRANSPORTER SWEETcoord: 26..261
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR10791RAG1-ACTIVATING PROTEIN 1coord: 26..261

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cucsat.G562.T1Cucsat.G562.T1mRNA
Cucsat.G562.T2Cucsat.G562.T2mRNA
Cucsat.G562.T4Cucsat.G562.T4mRNA
Cucsat.G562.T3Cucsat.G562.T3mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0034219 carbohydrate transmembrane transport
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0005886 plasma membrane
molecular_function GO:0051119 sugar transmembrane transporter activity