Cucsat.G13184 (gene) Cucumber (B10) v3

Overview
NameCucsat.G13184
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationctg1838: 1834839 .. 1844758 (+)
RNA-Seq ExpressionCucsat.G13184
SyntenyCucsat.G13184
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATCCAGAAAAATTACAAATTAGAATAAACATGTTTAGCGGACACACTTACATAGATATTAACATTTTAAATTTGAACCATTATCACACTTAGACTACATTAACAAATGTAAGTTCCAAAAATCAATAGCAATGACTAAGGATATATATGCATCTCCTCATTCCCATTACGCACTGCCAAATTCCGGTGTTCGAAGTCGTAACCTGGTGGTGCCATTTCAAACCTTACAGCACCATAGATTATGGTATTTTCAACTGCTTCGTACTTTTCAATTCCCTGTCGTTCCATTATTCTTATGGGACAATTGATGATCTGCAAGGTTCTCAAAGTTTCTGCCGAGTTTTCAAGCCATTGGGGTAATCTTTCCACTCTTGGAAGCTCTTTGATCGTGAATCTTTGAAGCTTGAATTCCACTTCTTTTAAGTTTAGTGTAAGTTGCTTGCAACTCCAAATCATCAAATTTTGTAGTGATTTTAGATATCTCATCTCGTCTGGCAACAATTTCAAGGTAGTGCAATTATATATCATTAGGGTTTCGAGGCCTGCAAGGCAATCTGGGCGTTCAAATAGATTTTCTAGGTTATTGCACCCTCCAATGGCAAGAAACCGCAGAGAATTCATGGTTCCAACTCCGTTTTTGTCCAGACGAAGCTTGTTTGTTGTTACCCACAAGTATCTCAGGCTGATCAAATTCCTTATATCCTTGGGCAGGTCTTCAAGTGCGGAACAAGATCCAAGAATTAAGGTTTGCAAACTTTGTAGATTACATATTGAATTTGGTAGATGCTTGATTTTCGTATTGCCATGCAAGTCGAGGTATCTCAGGTACTTGAGTGTTCCTATGGAATTTGGAATTTCCTGTAGGTCTGCATTGCTTAAATACAACAATCTTAACCCTTTGTACTTCCAGATGCACTTTTCAGTTAGGGATGCATTAGGTAGCACCATATTTCTTTCTTGAAAGGCTATGGATCTTATTTCAGTGACTTCTTTGGGATGATTGTTGCCCCCCGAGCCCTCAGATTGTTCTTGTGTGATTTTGTGTGCAAGTTTTTGGATGAGAGGGTGCAATTTAATCCAGTAGCCAAGCCCATGTTCTTCAATTTCTTGAATGAAATATCTTGACCATAGCTCCATGAAGTACTTCTCACCTATATTTTCCATAGTTGAGTTCTTCTCTTCAGGTGAATGGAGGAGCCCATTTGCCATCCATAACTGAATCATATCATTTGAAGAAATTATGCGATCGTTAGGTAATTGAGAACAATGCAGAAAACAAGGCTTCAGTTGTGAGGGCATTTGATCATAGCAAACTCTGAGTACATGTAAAATACCGTTTTCCTTTTTTCTCTTGGAGCGACAACTTTTCCTCGATGTTTTTCCACTTGGCTATGCTAGTTTCTGAAGATAGCAAGCTTCCTAGACACTTTATTGCCAAAGGAACTCCCATGCATTTCTCCAAAAGTTGATCAACTATTTTAGTGAGTTCTGGATTTTCTACTTCTTGTCTGTTTCTGAAAGCATATTCTTTGAATAAACGAGATGAACTTTGCTTTGACAGTTTCTCAAGTTTGAAAATTGTTTGATATTCCGTATCATCTTGCTTTATCGGTGGGGATATCTGGATTGATCCCCAAGCCAATATTAGTATCTTCTGTAACTTGTGGAATTGGAACTTCTAGATTCTGAGCATCTTCTGTTAATGATAGGCTGTGTTCATAGATTTTGTTTGCTATAGCGTCTGCAGTTTCCTCAATTTGTGAACCTGGAACTGCTTGGTTCTGGGTATTTTTTGTTAACGACTGATTGTGTGCAGATACTCTGTCACCATTCGCCAGATTTTCCTTTGATCGTCTCTCAGTCTTGTAGCCACGGTCTTGTAAATAATTTGCAATTTCCTCAGTTTGTGTGGTCACTATGATCTTGCTGCCATGTTGTCCCATCTCCAATAATTCATTTAACACTAAAGGGGAACGATCTTTCAAGTTGGTGATTGAAAGGTCTTGAAAGACGAGCAAAAAAGTTTCCACTTTCAGAAGTCGTTTAACCTTAGAAAGCAATTGTTCTGTCGTCAAGTCCTCGCAAATTTCTTTATTGTCTGCATGACTGTAAACCTCCTTCACCAATCTATGTTTATTAAAGCCTTCCTCCACACAAACCCAGTATCTTGAAGTATACTTACCAACTACATTGTTATGATTGTACAAGAATCTGGCCACTGTGCTCTTACCTATACCGGCTTCCCCAACTATGTGGAATACATGAGTACATTCATTGAAAACATTCAAAATTCCATCATATATTTCGTCATATGTTCTGGAAGCATCTATTAAAGGGTAAAGCAATTGCCAACTTGGTTTCAGGTGTCTTATTGAAATTTCTGAAGCACTAGGGAAAGTGTGTGTTGTCTCCATACTTATGGAATCAATGTGCTTTACTTTGAGATGAAATTCATACATTCTGGTTGCAATGTTATTGAGTTCGTCGCATACTTGCTTCCTTTTACATTTCTGTTTCAATTTATTTGCAGAAATTTGATTAGAGCACGAGAAAGGGGCAAGTACCTGTTTTCCAATGTCCTTTTGTTTGAAGATTTCCCATTTGAATTCATCTATGGAGTCCTCAACTTGGTAAAAGACATTTTGAAGTTCCTTTAGCCAGTTCTGTAGACGTTGATTTTGTTCTTGCTTCTCTTCAGCATCCAAAAGAACCGCTTTAAGGCTCGACATCGCATACTCTATTCTTTTTTGGTAGGGTGGGGAATCTTTTAGCTTAGTCAAGATATTTTCAGCTTGGGTGTAGATGCAATGAGCCATATTATTTTTGGAAAATATCGCTCTCACAATTTTCTTGAGTTTGGAATGGTTAAAATGAGGGTAGTTGATATAAACACTTACTCCATGGTGATTCTTTGTGTTTTTTGTGAAGCAAGATAGCTTAAAAAACTCAACACTCTTGGGAAAGGTATCTTCTTCCTTCTACTCTCAAGAATAGAATAGGATTACTCTTAGGTTTTGTAATTATATAGACAATAATTTAAATAGGAGGAGTTTTAGAGAAGCTGAAACTAATTTATATATTTCGGTGCAATATTTTTCTTTGCTAACGGGAACATTGCTCAGTTAGTATAAAATCTGAACTATCAACTTCAACATATTTCCTACCCGGGTATAGACCAAAAAATTGATAAATTGATCTTTACAATAATGATTTTCTTTAGGACTATTTTATGTTTAAGATGACTTTTCCCCTCTTTGTCTTATATCTTATTGGAAACACGTGGCGTGTTTGTTAGAGGCTCTGAAAACAAAAATTTTAAAACAAGGAATTAAATGAAAATAAAGTTATGTTTTTGGTTTTTAGATATCTGTTTGGTAGTAAAATTCTGAAATTGTAACCATTAGAAAATAGTTACAACTATTCACCCAATATTTGTTGGCAATAAACTACATGTTTCTCTTAAAAGAAAATTGTAAAGTTTTTAATTTATAATATGATGTAATTTACAGGATAAATAAAGTTATAATTTGTCCATCTTTTCATAGCAAACCATAGAGGCAAAGGATTTTAAATCTAAATTTTAACAAACATATGTACTAACTTTTTAACTTTATCAAAATCATATAGACAAGATTTGGAATTTAACCTAATTTATTTTTTAGTTTATTTTACTGGATGTTAAAACACGAATATGTTAGTTTTATTTTATTTTTTATTCTACTAAATGCAATGTTATTTTTTTAAAATTGTTTCGTTCTGTGTAGAACAAATATTGTTTTCACAAAAAGAATTTAGATGGTCTATCAAATACGGTCTATCAAATACATATTCATTGAATTTGTGTCTTGGTTTTTCATGAAAAGACCAAAAAATGTTCGTTGAGGTATTTTCTCTTCCTTCCTTTAATGAACAAATAAACTCTATTCTTGCTTTGTTATAGCCTCTCTTCCTACCTTTGCATACACACACATATATATACAATCCAAAACTCGAGTCTTTGCATACACACATATATACACACACATGTATATTCTTTTCCCTTGTAAGGAAGAACGGTGAAGGAGTGGTGTTAGTATCCTCTAAACTAGTAGTTTTCAAGATCTAAGACATAAGTAGAGTAAAAGTGAAACTTTTCAAAATCTATAAAAAGTTTAAGAGTATTTCGTATAATTTAACAACTTTTTAATATTTAAGAAACAAACTTAAAGTGAGTGTTTGGTATAATTTAACCGGATATGAGCGAAGTTGATTAAAATAAGAATAAATTGCAACGAGTAAAAATAACGGTTAAACTTATATATCACTAATAGACTTCTACCAAACATATGATACATAGCTGATAAACTTAAAAGTTGGATCGAAATTTTTTTATACTTGAATTTTTTTTATTAGGTTTATGTTTGCAATTGTTCCTTTATCGACTAGTTTTTCACTTTTTCTTTCTCCAATATGTTTCCAATAACTTTACCAAAAAAACACCAATTAGTATTTAAATAAAATAATTTAAATTTGAAATCCTATTCAAAATAGAAATTTTGATTCAAAAATTGGTTAAACTTAAATCAAAAGATAAGCTAAATAAATTTCAAATTAAAATAAAATTGAATTTAGTTATAATCAATTATCCATCCTAAATCAACTTCCATAAATTCTATCTTAGAATCGTTAAACTAAATTTTGTAAACCCCAACATCTACCTTGTATGCAATTTGGACATCTTCAAACTTTATCCCAAATAACGATCAAACTCAAATCCAATCGGGGTGACATTCATATGCAATCTCAAATATTGAAATTTTAAAAAGAGACTCAAAGGTGCATTTTCAAGTGTGTTAATATATCAAACAAGTCATTTTGAAGAAAATTATTAGAGTACTTGATAACCATCCAAAATAGTTTTTGAATTATATTTTGAACAATTTTTACCAAAAAAAAGTTTAATTAAAAATGAGTTTTGTAAGAACATTATTTTTAAGTAAATTCTACACTACCTCTAGAGAA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Coding sequence (CDS)

ATGGCAAGAAACCGCAGAGAATTCATGGTTCCAACTCCGTTTTTGTCCAGACGAAGCTTGTTTGTTGTTACCCACAAGTATCTCAGGCTGATCAAATTCCTTATATCCTTGGGCAGGTCTTCAAGTGCGGAACAAGATCCAAGAATTAAGGTTTGCAAACTTTGTAGATTACATATTGAATTTGGTAGATGCTTGATTTTCGTATTGCCATGCAAGTCGAGGTATCTCAGGTACTTGAGTGTTCCTATGGAATTTGGAATTTCCTGTAGGTCTGCATTGCTTAAATACAACAATCTTAACCCTTTGTACTTCCAGATGCACTTTTCAGTTAGGGATGCATTAGGTAGCACCATATTTCTTTCTTGA

Protein sequence

MARNRREFMVPTPFLSRRSLFVVTHKYLRLIKFLISLGRSSSAEQDPRIKVCKLCRLHIEFGRCLIFVLPCKSRYLRYLSVPMEFGISCRSALLKYNNLNPLYFQMHFSVRDALGSTIFLS
Homology
BLAST of Cucsat.G13184 vs. NCBI nr
Match: PON92564.1 (hypothetical protein TorRG33x02_116580, partial [Trema orientale])

HSP 1 Score: 48.1 bits (113), Expect = 3.67e-04
Identity = 34/95 (35.79%), Postives = 46/95 (48.42%), Query Frame = 0

Query: 11  PTPFLSRRSLFVVTHKYLRLIKFLISLGRSSSAEQDPRIKVCKLCRLHIEFGRCLIFVLP 70
           P  F  R  L V  +K  RL  FLIS+GR ++  Q    KVCKL +LH  FG      L 
Sbjct: 1   PNCFGHRTDLDVPKYKCRRLTSFLISIGRLTA--QSSNFKVCKLNKLHSVFGNFFSCPLC 60

Query: 71  CKSRYLRYLSVPMEFGISCRSALLKYNNLNPLYFQ 105
            + RYL+ ++    FG   +   LK+  L  + F 
Sbjct: 61  DRLRYLKSINSSTSFGSFEKEQWLKFKVLRHVSFD 93

BLAST of Cucsat.G13184 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LH56 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G815405 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 246 bits (628), Expect = 1.61e-82
Identity = 121/121 (100.00%), Postives = 121/121 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 1   MARNRREFMVPTPFLSRRSLFVVTHKYLRLIKFLISLGRSSSAEQDPRIKVCKLCRLHIE 60
           MARNRREFMVPTPFLSRRSLFVVTHKYLRLIKFLISLGRSSSAEQDPRIKVCKLCRLHIE
Sbjct: 1   MARNRREFMVPTPFLSRRSLFVVTHKYLRLIKFLISLGRSSSAEQDPRIKVCKLCRLHIE 60

Query: 61  FGRCLIFVLPCKSRYLRYLSVPMEFGISCRSALLKYNNLNPLYFQMHFSVRDALGSTIFL 120
           FGRCLIFVLPCKSRYLRYLSVPMEFGISCRSALLKYNNLNPLYFQMHFSVRDALGSTIFL
Sbjct: 61  FGRCLIFVLPCKSRYLRYLSVPMEFGISCRSALLKYNNLNPLYFQMHFSVRDALGSTIFL 120

BLAST of Cucsat.G13184 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LC31 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G814395 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 122 bits (307), Expect = 2.64e-33
Identity = 67/112 (59.82%), Postives = 73/112 (65.18%), Query Frame = 0

Query: 9   MVPTPFLSRRSLFVVTHKYLRLIKFLISLGRSSSAEQDPRIKVCKLCRLHIEFGRCLIFV 68
           MVPTPFL RR LF VT +YLRL+  LISLG S SAEQD RIKVCK   L IEFG  LIF+
Sbjct: 1   MVPTPFLCRRRLFAVTQRYLRLVNCLISLGSSLSAEQDARIKVCKFFSLKIEFGSRLIFL 60

Query: 69  LPCKSRYLRYLSVPMEFGISCRSALLKYNNLNPLYFQMHFSVRDALGSTIFL 120
            PCKSRYL         GI CR AL K N+L  L   MH   R+ALG T+ L
Sbjct: 61  FPCKSRYLSCTRFSTALGIPCRFALPKCNSLKYLNLSMHAFARNALGGTLSL 112

BLAST of Cucsat.G13184 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5F445 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Trema orientale OX=63057 GN=TorRG33x02_116580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 48.1 bits (113), Expect = 1.78e-04
Identity = 34/95 (35.79%), Postives = 46/95 (48.42%), Query Frame = 0

Query: 11  PTPFLSRRSLFVVTHKYLRLIKFLISLGRSSSAEQDPRIKVCKLCRLHIEFGRCLIFVLP 70
           P  F  R  L V  +K  RL  FLIS+GR ++  Q    KVCKL +LH  FG      L 
Sbjct: 1   PNCFGHRTDLDVPKYKCRRLTSFLISIGRLTA--QSSNFKVCKLNKLHSVFGNFFSCPLC 60

Query: 71  CKSRYLRYLSVPMEFGISCRSALLKYNNLNPLYFQ 105
            + RYL+ ++    FG   +   LK+  L  + F 
Sbjct: 61  DRLRYLKSINSSTSFGSFEKEQWLKFKVLRHVSFD 93

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
PON92564.13.67e-0435.79hypothetical protein TorRG33x02_116580, partial [Trema orientale][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LH561.61e-82100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G815405 PE=4 SV=1[more]
A0A0A0LC312.64e-3359.82Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G814395 PE=4 SV=1[more]
A0A2P5F4451.78e-0435.79Uncharacterized protein (Fragment) OS=Trema orientale OX=63057 GN=TorRG33x02_116... [more]
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cucsat.G13184.T1Cucsat.G13184.T1mRNA