|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Gene sequence (with intron) Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. ATGAACACTCTCGTCGCCGAGATTTTCGTCGTCTTCTTGTCTGGTGCTTCTCTTCTCTTCTTCCTGAGGACACAACTTTCATCTGCTTCCCATGTTCATGGATTGTCTGCATTTTACAAGGTCTGTGTTAAGTTATTCTTGTCTGCTTATTGTGTCTTTAACTTGGTTAACCTGCACTTCATTTTCTAGATTTAGAAATTCTTGTGACAATGGGAATAAATGATCTCTCCTTTATTATCATCTCTCTCTTTCTCTCCATTCTTTTGTTTCCTTTATTGGTCTTAGTTTTGATAAAATTAATAGAATTGAGCAGCTGGTGACATGAACTTGACTTTTGAGTCTCCGAGGCTATAATGGTAGAAAAGTGTTTCTTAGGCAAAGGAACTTGCAGAGTGAAGTTGGGTATCACTTAGAATGGTTCCGAGCATATTTCCACTAAGAAAATAAGAGAGTGCTTTACCGAGTGGGAATGCAGAGTACTCAATGTGCAATTTCACAAGGTCGGTCCTCCCATATGGTTGTATCTCATCAAAGAATGATAAGAAGCTGCTTGTTGACATTAGGAAAAAGCGCTATCAGTCTCAATAGAGTCAACCCGTACTAATTAGGTTGTGGTTGGATTGGCTGCAAGCGGAACATAGGCGCTTTAGGTGTGAAATTAGTAATTGTAGTTTCATAAAAGTAGAATTAACAATAATTGGGCAAACAAAAAGGATTTTCGACAAAATGCTCCTACCCCACCATGCCTGTCCCTAAGTGGTACGTGTGTAAGTCTCTTCTAAGTTTTTTAATGTTATTAAAAAAAAAAACATTATAATCTTTACAAAGGTTTAATAAGTTCATTATTTTTTTAGTTTTTTTTAAGTGTATTAAGCCTTCAAATTTAAAAATTAAATTCAAATGCTTCACAAACGTATATTTTAAATAATAATTATTATGAAATAGTTTTAACAATAATTATTATGAATTAGTTTTTAAAGGAATTTATTCCTTCAAATAAATTATGAGTAGAAATTTTGCTGAATGACAGAGATTCTCTGCCTTCGGAAAAGTGGAAGGATGCATTGATTCCTTCGTTGAAATGTTTCCTTCCATCATCTGTCACTTAATCATTATAATATTAATAATAATAATTATTATTATTATATTTTGTAAAATTAAATTCACTGAAATAAATTGAATAAATTAAACAATAATATCATATGCAAAATACAAAATACAAAAGGGATGTAATTATATTTATCAAGTCCTAGAAAAACCAACCATATTTTAAAATTTTAAGGATTATAAAAGTTATTATTTAATTTAACTATCATCCGTATTTTAGTATGATAAATATATTTTACGTACAAACATATTTTAGTATTATTATAGCAAGATATTTGTGAATGTCGCTAATAAATTAATTTGAGTTGACTTTAGCTACCACATAATACTGTTCATTAAATCGTTTTAGGAAGGTATTTATGGGTCCCACAAATCAATTTATGCAGAAAAATAATTATTATTTTAAAGGGTTTTGAAGGCCAACTACTTTGGTTTTTGGGGGACACATAGACTTTTTAATTTTCAGTGTCCTATCTTATCCAAACTACATGGGACACATTTCCAACAATATCATATAAATCAAATCATATTTATTTGCTTATATATATATATATAAATAAATAAAACTATTTAATGTATAAATTATAGCAGTACAAAATCTTATACTCATTATATATTTAAGTATTTAATTAATTTGGATCTTATACTCATTATATATTTATGTATTTAATTAATTTGGTTAGTATAGAAAAATATCTAGTTTGGACGTTTTAATTAAATCTATTTTTTTAAAAAAATTAAACAAATGAAATAGCACCTATTTTATTTGACAACATAAAAATATCTGTCATTACTTTATTGTGAAAGACCTTTTTAATTCAATAATTATAGAGATGAAGATTAAATTATGGATATTTAAAACAATTAGTAATTTATCCACCACCGTGCTAGAACTAGCCAGTTTTCCAGTTCCCAATGAACCAAAAAGAATTTATATTTGTTAATTTAATTTAAAATTTTGGGATTGTGTACAAAAATTTGAATTTTCTGGGATGAGACAAGAGGGGTCTGGCCAATGGCAGGTTCAAACAATAAAGGCGGCCGGTGCAGTGTCTTTTGTTCTTAAATTACGTGTCAACCTTGAACCAAAGCAGCACATAGTTTCCGGTGATCTGTAGGGTCAAGTTATCAAATCTTCAAAACCAATATGAATAATAAAAGGCCAAAAGATGGAAAGCTTTGAAGATTCCCTTGGGGTCAAGACTAACGGAGGCATTGACTGACGGAATCGCACCGTTTGCTAATGCAGTTAGTTTGTTTGCTTGCCGTATGCATCAGGTGAGCGTTAAATCCCCCACCGTCATCCTCTCGGTTTTCGTTAGCTCACGTGTTTGTTCCCAAACCCGACACTTAACGCGCCGTGGTAGTTAGTTATACCCTATTTTCAATTTGGCCCTTCCGTGGTTGCTTCTATCTTACTCCACATCCCCATTATCATCCTACACCAATAAATAAATAAATAAATAAAAAAGAATTATTAAGCCCAAAAAAGAAATAAATAAAAAGAAATATTCTATCGAAATCTGTTTCTATGTCTAGGCTTCCTGTTGCAATAAAAAAGAATATATATTATATAATAAAGTGATCGAGAGATAAAATAATGACTTGAAAATTATTAAAATATTTAATTTAAAAAATTTTATATCAGAATTGTAAGGACGTAACATATTAAACATGCATGATGATCTTCGTGCAAGCAAAAGAAACTATGTACAGCTCCTGATAAGGTACTGAGACATAAGAAGGTGAGAATGGGCAAGAAGAAAATAAGTAATCACCTGATCAAAGAGCTCTGCAAATATATAAAACCCACCATCTTTTTGTTTGGTTTTTCCTTTCAATTCTCCCCTTACAGAGATAAAGGGAGTGAAGGGTTGAAGGAAGATAAGGATTTCTTGGCTTTCCGGTGAGTAGTAACAACTCAGATCTGGCCGACACTGACTCAGTCCTCCGGTAACTATTCGCCTGAAAGTATGGTGATTTTTCAGTTTAATTAATTTAGTAATGGAAGGGAAAGGGAAAATTATTGTGGTTTGTTGGGATTTCTTTTTTTCCTTTCGTCTTGCCCTTCAATTCCAATGATCATTGAAGCTGTGAACTGGACCTTTCTCTCTCTCACTCTTCTTTTTCTCTCTCTACTTTCATTTTCTTTCCCCCATTTTTGAAAGCTGGGTGTTTGCTGCCATGAAAGAGCAGAAGTTTTGTAGAAGGGAGATCTTTAATTCAGATGGGCTCTTAATCGTTAAGTCTAATTTTGTACTGTATTTCAGCTACGATCTGTTTGAGCTGGAACATAAAACTGGCTTTTTGGGTTTCTCGGTGCTAAGAGACACCATGAAATTTCTAAACTTATCGCGTTTTCTCACAGTGAACGAAGAATTACGTTAA mRNA sequence ATGAACACTCTCGTCGCCGAGATTTTCGTCGTCTTCTTGTCTGGTGCTTCTCTTCTCTTCTTCCTGAGGACACAACTTTCATCTGCTTCCCATGTTCATGGATTGTCTGCATTTTACAAGGCCAAAAGATGGAAAGCTTTGAAGATTCCCTTGGGGTCAAGACTAACGGAGGCATTGACTGACGGAATCGCACCGTTTGCTAATGCAGTTAGTTTGTTTGCTTGCCGTATGCATCAGATCTGGCCGACACTGACTCAGTCCTCCGTGAACGAAGAATTACGTTAA Coding sequence (CDS) ATGAACACTCTCGTCGCCGAGATTTTCGTCGTCTTCTTGTCTGGTGCTTCTCTTCTCTTCTTCCTGAGGACACAACTTTCATCTGCTTCCCATGTTCATGGATTGTCTGCATTTTACAAGGCCAAAAGATGGAAAGCTTTGAAGATTCCCTTGGGGTCAAGACTAACGGAGGCATTGACTGACGGAATCGCACCGTTTGCTAATGCAGTTAGTTTGTTTGCTTGCCGTATGCATCAGATCTGGCCGACACTGACTCAGTCCTCCGTGAACGAAGAATTACGTTAA Protein sequence MNTLVAEIFVVFLSGASLLFFLRTQLSSASHVHGLSAFYKAKRWKALKIPLGSRLTEALTDGIAPFANAVSLFACRMHQIWPTLTQSSVNEELR
Homology
BLAST of Csor.00g292480 vs. NCBI nr
Match: KAG6596539.1 (hypothetical protein SDJN03_09719, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 183 bits (465), Expect = 3.38e-58 Identity = 94/94 (100.00%), Postives = 94/94 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MNTLVAEIFVVFLSGASLLFFLRTQLSSASHVHGLSAFYKAKRWKALKIPLGSRLTEALT 60
MNTLVAEIFVVFLSGASLLFFLRTQLSSASHVHGLSAFYKAKRWKALKIPLGSRLTEALT
Sbjct: 1 MNTLVAEIFVVFLSGASLLFFLRTQLSSASHVHGLSAFYKAKRWKALKIPLGSRLTEALT 60
Query: 61 DGIAPFANAVSLFACRMHQIWPTLTQSSVNEELR 94
DGIAPFANAVSLFACRMHQIWPTLTQSSVNEELR
Sbjct: 61 DGIAPFANAVSLFACRMHQIWPTLTQSSVNEELR 94
BLAST of Csor.00g292480 vs. NCBI nr
Match: KAG7028072.1 (hypothetical protein SDJN02_09252, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 8.27e-16 Identity = 40/40 (100.00%), Postives = 40/40 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MNTLVAEIFVVFLSGASLLFFLRTQLSSASHVHGLSAFYK 40
MNTLVAEIFVVFLSGASLLFFLRTQLSSASHVHGLSAFYK
Sbjct: 1 MNTLVAEIFVVFLSGASLLFFLRTQLSSASHVHGLSAFYK 40
The following BLAST results are available for this feature:
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| KAG6596539.1 | 3.38e-58 | 100.00 | hypothetical protein SDJN03_09719, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... | [more] |
| KAG7028072.1 | 8.27e-16 | 100.00 | hypothetical protein SDJN02_09252, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... | [more] |
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
|
