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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Gene sequence (with intron) Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. GAAGAACGGAGGAACAGAGAGGTTTGCGCGCGAAAGTTTGGCGTTCTTGGAGTTGCTCTGACGAGGAGAAGGTTGATATTAGGGTTCGGAATTATCGGTGCCTCACTATGTTGTTTGCAAACGCAGGTATGTTTCAATGTTAGATTGATCTCATCAATGGTATTTACTTTTGGATTTTGATCGGTTAATCTTTTTCTAAACTGATGAACGTGAATGCTCTTCGCACAAATCGTAATTGCTTTAAGATTTCTGTTAGTCGAAATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTAAACTAGTGATCTTGATTGCTCAGTCTCATAAATCCTAATTACTGGTTTAATTAGTCGACGAGGAGCAAGCCGTTTGCTATAAACTAATGATCGCGATTATTCAGTCTCAAAATCCTAACTATCAACGACAAAAAAAAGAGTATATATTATGTTCATCAATCTTATTACATTAGGCCTTTTAGTCAATCATTTTGATTCGTTTATTTATATTTTTTTCCTATTTTACACACGATCCGACGATTAACTGAATCTCTATCGCTTATTCTTAATTCAGACTTTGAATGAGTTGCTGCAGTACATGTTTGAAGAAGGTCTTGTGTCAGCGTTGCTACCTGAACAGTATTTTTAGGTAAGTATTTTGACGATTTTTCCTCCGTTATACTTCTATTTCTAACCATCTGGCATACATATGCTTCTCTGAATATCGTGCTTCCTAAATTCTTTCGTTTTCGTGCATTATAATGAATTGTATACTTTGGAGTTAGTGAATTTCTTGTGAAAGATATATTTCTTATCATAAAGTCTTATACATTCAATAATCGAATCGTGTCTGCCTAAGATCATTACAGATTGTTACGTGCATTTAGGGATGCACTGGTGGTAATATTCTCTAAAATCTCTTATTCACAATAGTTTCCTAAAAATCTCATAAAAGAAAAAAGAAAAGTTTACAAAATCCTGTTTCTTATATGCATGCCGTTTTCTTATTTTTGTCAAATTTTAGAGACGTTGTTTTCATTAATTCATATCTTACTGTTTCTTAGTAGTCTAGTTTCTTGGAAGCCTAAGTTATTCTTCAATGTTTTTCCATCATTTGTAGGTTACTATTAACTGAATCTGAATGTGCCTATGTAGTTTATATGTTATATCTTTGGGCAAATAAGATTTGTTGTAAGCCTTATAATGAACAGTTGTGCTGTTCAACTTACTTGGTTAGCTTTTTCTGTAAGTAAACTTTGATTGGATGAAACAAAATACGAAAGGCTTATAAGAAATCGAACTTAAAGCCATGTATGTCTCCCAGAAAGGAAAAAAAAAAAAACTTCCAAATATTTCAGATAATTATTCAATGAGGTCGGTGGTGTAAAGGATAGAAATTGTTAGGAAGTCTTAAAAGCTGTTGTGATATCAACCCCTGCGTAAGCTATACTCCATATTCACAGGAAACAATGCGTTGGAAAACTTTTGGAAAATCTAAAGGTAACTTCCTTGACACGGAAGAAAATACAAAATGGATGACATTTTAAGATAATTCACGTACTGTCGACCATTTAGGTTAATTCTTGATTGAGATTTGATAGTGTATATAGTAACCTTTAGCAAGAAGAATTTCGTCAAACACGTTCAGATAAAATGAACAGACTAAGATAGCAAGGTATTTTGTTTTTTTTTTCATATGTTAGGACATGGATGTTAAAGTAAAATAGAACACTTATCCTTCTAGAAAGCTTCTGAAGGTTCTACGCATGTCTCCAATATATTTTGCATTAGGTCTCCATACATATCTTGAAGATTTGATGTTTATGTTTCCTTAGGTCCGTAGGGAATCTCCTTTAGACAAGGTTAGATTTTCAAAGAAGTATTTAGGATATTTTGTATTCATGAAGGGTATAGTGAAAAATCTCTTTGCTTGGACCCAAAGTATCTCAAGAAGCAAGCTAGCAAAGCCATAGAAAGGTTTAAAAGTGAGCGAGCGAGCGAGAATTATAGCGTGATTTAATCTTTTCTCAAAAGTGTCTATCTTTATACCTTTTTAAACAGAAGTTCATTCTTTCACTTATTTTTCTCTTCCCTTTCGTGCTAATTTCTTCAACAATGAACATCAATGTTTACATTCGTAGAGGTCATAAACGTTAGCTAAGAAATGAAAATTTAGTTAAGTTACTTGAAACTTTGTCAAGTGATCTTTTAACTAATTACTCTTATAGTTACAAACTTAGGTTAGCTTATTAGAATATTAATTTTAGATATAAAGAGGTTTTATTGTATTGTTTAGTTCCCAAGATTTATTTTTAAAACCGGTCATTATGATATTGATGAGTATTAGAGTTACCGTCTTTTAATTGACATTGGATACTCCAAGGTTTTAATCATTCATGATGTTGTTTTAGTATAATGATTTTGGAGCTTAAAATGAAAGTTGCATATGATGTTTGTAAGCCATGGACTCCTTGAGTTTTCTTCCCTCTTAATCTTGATCATAAAGATAATCCGTTCCTATAGATTTTCTTGGAGATTCTAACGATTTTGGAATTTTTGAATAATTTAAACTTAAAGATCTTGTTTTTCAATATGATCAAATTCTCAAAATTAAATCATAAAATATTTGGTTTAGGAAGGTTTAGATTATTTGGGTAGTTCATCAAAAAAAAAATTGTTTGAAAATTGATGAAAAAAAGTTAAATATTTGAATTATTGCTCTTATTATACTTAAGAAATAAAATAATTTACGAAAAATTGTTGATGAGTAAAAAAAAAATATAATTAAATGTATGCATTATGCACTTAGTACAAGACTTGGTAAACGAAACTGCTCGCAACAAATTATGGATTGGAACTTATTTTTGCCTTTCTGATATTTTCCTATCTATTTTTATTTTATAGTAAATAATATGTAGGAGCGAATTCTCAGGTGGACTCATAAGTGACTTTGACTTTACGCTAATTGGTGTCAACTAATACATTTGTACGCAAAAAGCATGGAATCGAGGCAATGCTGTGCCACTGGTTTGTTTCTACCTATACCTCTTCTCTCTATATCCATTCAATTCACGTCCTTCCATTCCTTGCTGATCTCTGCTCAATTTTACTCTGCATAAAATCAAAACCCAAGGTTATACAATGGAAATGGAACCTAACAAATGAGGTAACAATCAATTAGATACATGCCCTTTTTAACTTTTATAAGTTTAGTTTTTGAACAATTTAGTCATTTAAATTTCAAAAGTTTTTTATTTTAATTGTGATATGTTTAAGCATGGTCTAAAATCGATATATTAATTATTTTTATCTATTAGATATTTTTAAAGTTTAGAGATCTTAAGCACAATTGAAATTTAAAGACTAATTAGTTACTTTTTAAAATTTAAGAAGACTTTAGCATTTTGGAAAGCTTGTAATTTAAATTTCAAATGTCATTTCCAAAATCAAAATAATTAAAGTTCGCTTTCCACCTTAAACTGTAAAATTATACTTTTATTATCAAAATTCTATGAATCTCTTATATCTCCTATGTATATTAAAAAAAAACAATAATTTTATTTATTTATTATCATTTTTAAATAAAAAAACTATTATCAAACATTAGGGGTGTACATGGGTCGGGTTGGAATGGGTTAAGAATTTTATGGACTAACCCATAAGATCAGACTGGTTGGATTGGTAATCTAACCAAATCCAAAAAATTTCAGAAGGTTGCCCAAAATTTTTCAGAACCAACTTTCTATTTTTTATAAAAAAAATTATTTATCCGCATAATTTTCAAACAAATTTTTAAACTACAATTATAACCATGTACTGTACATTTATTGTTAAGTAAATTGCAACAGAAATAATAATAAACTACAAATATAACAATGTACTGAACATTTATTGTTAAGTAAATTGCAACAGAAATATTAAATAAATTAGAATTTTGAATTAACTCTCTTGGTTTTGGAAATTTCAAATATTTTGCACAATTTTTTATAGAACTTATATTTAAAATCATTTACTTTTCACCTCGCCCAATAAAACATGAAAGTAAAAAGAAATTAAATATTAAGTCACTCAAACACAATATAATATTGTTTCATAATCATTTACTTTTCACCTCGCCCAATAAATTGAGTATTTTTTATTTTAGAAAATTAATCTCCCAACCTAATTCAATTCAATCCAACCCAGGGTTGGATTGGATTGTTGGATTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTCAGACTCCATTTTGAAAAGAAAAAAAAAAAACTTTTAGTAATTAACAATTAAAAGTAATCATGTCTATTTTTATATATTGTTCAACAAAAAGGGCAGAGAATAGCAAACAAAAAGAAAACATTATAAAAAAATTGTATGTAAATGAAATAAATGAACAGTAAGATAGAAATGAACCTGGATGGAAAACCAGTAAACGGCTCAGATTGAACTTAGCATGAGGCTGGCACGCGGTTTTGGTTCCTTATCCTTCAAGTTGGTCCATTTCTGAATCATAGTGCTGATGCAGCCCACGAATTCAGTTATGGGGACAAGATACATGGCAGGAAATAAAAGATTCTAGATTACATTCAAAGTTTAGAGAAATTTTGGTCTCAAAAGGTTGATGTTATATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTGTTTCTCAAACATTATATGACCTTTCAAAGTTCAATTCTATTTCAATAACCTTATTGTGATTTACACTATTTAAGTGTCAATATGAAAATAAAGATTGAAAATAAGATGATAAGAATGTCAATGGACAGGCCAAAAAAACAAAATGATTAAATGTGGGAAATGAGTATTGTATACCAAATTTGTATAATTTAAGTGAGATATAATTCTATACTATGGTTGTGAAACAAGGCTCATTTACGGATTACTGGTAACTGAAGTTTTTATTGGCTTTGACCAAAGGAGGAGTTGACAGACCAGACCCACTTTGAAAGAGAGGTGTTAATGTAGGCTTCGAAAATTAAGGACAGAGAATTAGTTCTTTCGGAGGAAAATATTGGGATTGCAAGAACAAAGAGTGTTGAGAAAGTTCGAGGGATGGAGAATTTTGGAAGGTCAGAGAAAGACTCGAGTTTTAGCCTGAAGGGAACAAATGGGGTATCTATCTCTCTCAA mRNA sequence GAAGAACGGAGGAACAGAGAGGTTTGCGCGCGAAAGTTTGGCGTTCTTGGAGTTGCTCTGACGAGGAGAAGGTTGATATTAGGGTTCGGAATTATCGGTGCCTCACTATGTTGTTTGCAAACGCAGACTTTGAATGAGTTGCTGCAGTACATGTTTGAAGAAGGTCTTGTGTCAGCGTTGCTACCTGAACAGTATTTTTAGTAAATAATATGTAGGAGCGAATTCTCAGGTGGACTCATAAGTGACTTTGACTTTACGCTAATTGGTGTCAACTAATACATTTGTACGCAAAAAGCATGGAATCGAGGCAATGCTGTGCCACTGGAGGAGTTGACAGACCAGACCCACTTTGAAAGAGAGGTGTTAATGTAGGCTTCGAAAATTAAGGACAGAGAATTAGTTCTTTCGGAGGAAAATATTGGGATTGCAAGAACAAAGAGTGTTGAGAAAGTTCGAGGGATGGAGAATTTTGGAAGGTCAGAGAAAGACTCGAGTTTTAGCCTGAAGGGAACAAATGGGGTATCTATCTCTCTCAA Coding sequence (CDS) GAAGAACGGAGGAACAGAGAGGTTTGCGCGCGAAAGTTTGGCGTTCTTGGAGTTGCTCTGACGAGGAGAAGGTTGATATTAGGGTTCGGAATTATCGGTGCCTCACTATGTTGTTTGCAAACGCAGACTTTGAATGAGTTGCTGCAGTACATGTTTGAAGAAGGTCTTGTGTCAGCGTTGCTACCTGAACAGTATTTTTAG Protein sequence EERRNREVCARKFGVLGVALTRRRLILGFGIIGASLCCLQTQTLNELLQYMFEEGLVSALLPEQYF
Homology
BLAST of Cp4.1LG15g01040 vs. NCBI nr
Match: KAG7011295.1 (hypothetical protein SDJN02_26199, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 4.63e-20 Identity = 47/58 (81.03%), Postives = 48/58 (82.76%), Query Frame = 0 Query: 5 NREVCARKFGVLGVALTRRRLILGFGIIGASLCCLQTQTLNELLQYMFEEGLVSALLP 62 +REVCARKFGV VALTRRRLILGFGIIGASLCCLQTQTLNELL YM S LLP Sbjct: 4 HREVCARKFGVPKVALTRRRLILGFGIIGASLCCLQTQTLNELLHYMLFTS--SNLLP 59
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
KAG7011295.1 | 4.63e-20 | 81.03 | hypothetical protein SDJN02_26199, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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