Cp4.1LG15g01040 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview
NameCp4.1LG15g01040
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG15: 777945 .. 783105 (-)
RNA-Seq ExpressionCp4.1LG15g01040
SyntenyCp4.1LG15g01040
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GAAGAACGGAGGAACAGAGAGGTTTGCGCGCGAAAGTTTGGCGTTCTTGGAGTTGCTCTGACGAGGAGAAGGTTGATATTAGGGTTCGGAATTATCGGTGCCTCACTATGTTGTTTGCAAACGCAGGTATGTTTCAATGTTAGATTGATCTCATCAATGGTATTTACTTTTGGATTTTGATCGGTTAATCTTTTTCTAAACTGATGAACGTGAATGCTCTTCGCACAAATCGTAATTGCTTTAAGATTTCTGTTAGTCGAAATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTAAACTAGTGATCTTGATTGCTCAGTCTCATAAATCCTAATTACTGGTTTAATTAGTCGACGAGGAGCAAGCCGTTTGCTATAAACTAATGATCGCGATTATTCAGTCTCAAAATCCTAACTATCAACGACAAAAAAAAGAGTATATATTATGTTCATCAATCTTATTACATTAGGCCTTTTAGTCAATCATTTTGATTCGTTTATTTATATTTTTTTCCTATTTTACACACGATCCGACGATTAACTGAATCTCTATCGCTTATTCTTAATTCAGACTTTGAATGAGTTGCTGCAGTACATGTTTGAAGAAGGTCTTGTGTCAGCGTTGCTACCTGAACAGTATTTTTAGGTAAGTATTTTGACGATTTTTCCTCCGTTATACTTCTATTTCTAACCATCTGGCATACATATGCTTCTCTGAATATCGTGCTTCCTAAATTCTTTCGTTTTCGTGCATTATAATGAATTGTATACTTTGGAGTTAGTGAATTTCTTGTGAAAGATATATTTCTTATCATAAAGTCTTATACATTCAATAATCGAATCGTGTCTGCCTAAGATCATTACAGATTGTTACGTGCATTTAGGGATGCACTGGTGGTAATATTCTCTAAAATCTCTTATTCACAATAGTTTCCTAAAAATCTCATAAAAGAAAAAAGAAAAGTTTACAAAATCCTGTTTCTTATATGCATGCCGTTTTCTTATTTTTGTCAAATTTTAGAGACGTTGTTTTCATTAATTCATATCTTACTGTTTCTTAGTAGTCTAGTTTCTTGGAAGCCTAAGTTATTCTTCAATGTTTTTCCATCATTTGTAGGTTACTATTAACTGAATCTGAATGTGCCTATGTAGTTTATATGTTATATCTTTGGGCAAATAAGATTTGTTGTAAGCCTTATAATGAACAGTTGTGCTGTTCAACTTACTTGGTTAGCTTTTTCTGTAAGTAAACTTTGATTGGATGAAACAAAATACGAAAGGCTTATAAGAAATCGAACTTAAAGCCATGTATGTCTCCCAGAAAGGAAAAAAAAAAAAACTTCCAAATATTTCAGATAATTATTCAATGAGGTCGGTGGTGTAAAGGATAGAAATTGTTAGGAAGTCTTAAAAGCTGTTGTGATATCAACCCCTGCGTAAGCTATACTCCATATTCACAGGAAACAATGCGTTGGAAAACTTTTGGAAAATCTAAAGGTAACTTCCTTGACACGGAAGAAAATACAAAATGGATGACATTTTAAGATAATTCACGTACTGTCGACCATTTAGGTTAATTCTTGATTGAGATTTGATAGTGTATATAGTAACCTTTAGCAAGAAGAATTTCGTCAAACACGTTCAGATAAAATGAACAGACTAAGATAGCAAGGTATTTTGTTTTTTTTTTCATATGTTAGGACATGGATGTTAAAGTAAAATAGAACACTTATCCTTCTAGAAAGCTTCTGAAGGTTCTACGCATGTCTCCAATATATTTTGCATTAGGTCTCCATACATATCTTGAAGATTTGATGTTTATGTTTCCTTAGGTCCGTAGGGAATCTCCTTTAGACAAGGTTAGATTTTCAAAGAAGTATTTAGGATATTTTGTATTCATGAAGGGTATAGTGAAAAATCTCTTTGCTTGGACCCAAAGTATCTCAAGAAGCAAGCTAGCAAAGCCATAGAAAGGTTTAAAAGTGAGCGAGCGAGCGAGAATTATAGCGTGATTTAATCTTTTCTCAAAAGTGTCTATCTTTATACCTTTTTAAACAGAAGTTCATTCTTTCACTTATTTTTCTCTTCCCTTTCGTGCTAATTTCTTCAACAATGAACATCAATGTTTACATTCGTAGAGGTCATAAACGTTAGCTAAGAAATGAAAATTTAGTTAAGTTACTTGAAACTTTGTCAAGTGATCTTTTAACTAATTACTCTTATAGTTACAAACTTAGGTTAGCTTATTAGAATATTAATTTTAGATATAAAGAGGTTTTATTGTATTGTTTAGTTCCCAAGATTTATTTTTAAAACCGGTCATTATGATATTGATGAGTATTAGAGTTACCGTCTTTTAATTGACATTGGATACTCCAAGGTTTTAATCATTCATGATGTTGTTTTAGTATAATGATTTTGGAGCTTAAAATGAAAGTTGCATATGATGTTTGTAAGCCATGGACTCCTTGAGTTTTCTTCCCTCTTAATCTTGATCATAAAGATAATCCGTTCCTATAGATTTTCTTGGAGATTCTAACGATTTTGGAATTTTTGAATAATTTAAACTTAAAGATCTTGTTTTTCAATATGATCAAATTCTCAAAATTAAATCATAAAATATTTGGTTTAGGAAGGTTTAGATTATTTGGGTAGTTCATCAAAAAAAAAATTGTTTGAAAATTGATGAAAAAAAGTTAAATATTTGAATTATTGCTCTTATTATACTTAAGAAATAAAATAATTTACGAAAAATTGTTGATGAGTAAAAAAAAAATATAATTAAATGTATGCATTATGCACTTAGTACAAGACTTGGTAAACGAAACTGCTCGCAACAAATTATGGATTGGAACTTATTTTTGCCTTTCTGATATTTTCCTATCTATTTTTATTTTATAGTAAATAATATGTAGGAGCGAATTCTCAGGTGGACTCATAAGTGACTTTGACTTTACGCTAATTGGTGTCAACTAATACATTTGTACGCAAAAAGCATGGAATCGAGGCAATGCTGTGCCACTGGTTTGTTTCTACCTATACCTCTTCTCTCTATATCCATTCAATTCACGTCCTTCCATTCCTTGCTGATCTCTGCTCAATTTTACTCTGCATAAAATCAAAACCCAAGGTTATACAATGGAAATGGAACCTAACAAATGAGGTAACAATCAATTAGATACATGCCCTTTTTAACTTTTATAAGTTTAGTTTTTGAACAATTTAGTCATTTAAATTTCAAAAGTTTTTTATTTTAATTGTGATATGTTTAAGCATGGTCTAAAATCGATATATTAATTATTTTTATCTATTAGATATTTTTAAAGTTTAGAGATCTTAAGCACAATTGAAATTTAAAGACTAATTAGTTACTTTTTAAAATTTAAGAAGACTTTAGCATTTTGGAAAGCTTGTAATTTAAATTTCAAATGTCATTTCCAAAATCAAAATAATTAAAGTTCGCTTTCCACCTTAAACTGTAAAATTATACTTTTATTATCAAAATTCTATGAATCTCTTATATCTCCTATGTATATTAAAAAAAAACAATAATTTTATTTATTTATTATCATTTTTAAATAAAAAAACTATTATCAAACATTAGGGGTGTACATGGGTCGGGTTGGAATGGGTTAAGAATTTTATGGACTAACCCATAAGATCAGACTGGTTGGATTGGTAATCTAACCAAATCCAAAAAATTTCAGAAGGTTGCCCAAAATTTTTCAGAACCAACTTTCTATTTTTTATAAAAAAAATTATTTATCCGCATAATTTTCAAACAAATTTTTAAACTACAATTATAACCATGTACTGTACATTTATTGTTAAGTAAATTGCAACAGAAATAATAATAAACTACAAATATAACAATGTACTGAACATTTATTGTTAAGTAAATTGCAACAGAAATATTAAATAAATTAGAATTTTGAATTAACTCTCTTGGTTTTGGAAATTTCAAATATTTTGCACAATTTTTTATAGAACTTATATTTAAAATCATTTACTTTTCACCTCGCCCAATAAAACATGAAAGTAAAAAGAAATTAAATATTAAGTCACTCAAACACAATATAATATTGTTTCATAATCATTTACTTTTCACCTCGCCCAATAAATTGAGTATTTTTTATTTTAGAAAATTAATCTCCCAACCTAATTCAATTCAATCCAACCCAGGGTTGGATTGGATTGTTGGATTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTCAGACTCCATTTTGAAAAGAAAAAAAAAAAACTTTTAGTAATTAACAATTAAAAGTAATCATGTCTATTTTTATATATTGTTCAACAAAAAGGGCAGAGAATAGCAAACAAAAAGAAAACATTATAAAAAAATTGTATGTAAATGAAATAAATGAACAGTAAGATAGAAATGAACCTGGATGGAAAACCAGTAAACGGCTCAGATTGAACTTAGCATGAGGCTGGCACGCGGTTTTGGTTCCTTATCCTTCAAGTTGGTCCATTTCTGAATCATAGTGCTGATGCAGCCCACGAATTCAGTTATGGGGACAAGATACATGGCAGGAAATAAAAGATTCTAGATTACATTCAAAGTTTAGAGAAATTTTGGTCTCAAAAGGTTGATGTTATATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTGTTTCTCAAACATTATATGACCTTTCAAAGTTCAATTCTATTTCAATAACCTTATTGTGATTTACACTATTTAAGTGTCAATATGAAAATAAAGATTGAAAATAAGATGATAAGAATGTCAATGGACAGGCCAAAAAAACAAAATGATTAAATGTGGGAAATGAGTATTGTATACCAAATTTGTATAATTTAAGTGAGATATAATTCTATACTATGGTTGTGAAACAAGGCTCATTTACGGATTACTGGTAACTGAAGTTTTTATTGGCTTTGACCAAAGGAGGAGTTGACAGACCAGACCCACTTTGAAAGAGAGGTGTTAATGTAGGCTTCGAAAATTAAGGACAGAGAATTAGTTCTTTCGGAGGAAAATATTGGGATTGCAAGAACAAAGAGTGTTGAGAAAGTTCGAGGGATGGAGAATTTTGGAAGGTCAGAGAAAGACTCGAGTTTTAGCCTGAAGGGAACAAATGGGGTATCTATCTCTCTCAA

mRNA sequence

GAAGAACGGAGGAACAGAGAGGTTTGCGCGCGAAAGTTTGGCGTTCTTGGAGTTGCTCTGACGAGGAGAAGGTTGATATTAGGGTTCGGAATTATCGGTGCCTCACTATGTTGTTTGCAAACGCAGACTTTGAATGAGTTGCTGCAGTACATGTTTGAAGAAGGTCTTGTGTCAGCGTTGCTACCTGAACAGTATTTTTAGTAAATAATATGTAGGAGCGAATTCTCAGGTGGACTCATAAGTGACTTTGACTTTACGCTAATTGGTGTCAACTAATACATTTGTACGCAAAAAGCATGGAATCGAGGCAATGCTGTGCCACTGGAGGAGTTGACAGACCAGACCCACTTTGAAAGAGAGGTGTTAATGTAGGCTTCGAAAATTAAGGACAGAGAATTAGTTCTTTCGGAGGAAAATATTGGGATTGCAAGAACAAAGAGTGTTGAGAAAGTTCGAGGGATGGAGAATTTTGGAAGGTCAGAGAAAGACTCGAGTTTTAGCCTGAAGGGAACAAATGGGGTATCTATCTCTCTCAA

Coding sequence (CDS)

GAAGAACGGAGGAACAGAGAGGTTTGCGCGCGAAAGTTTGGCGTTCTTGGAGTTGCTCTGACGAGGAGAAGGTTGATATTAGGGTTCGGAATTATCGGTGCCTCACTATGTTGTTTGCAAACGCAGACTTTGAATGAGTTGCTGCAGTACATGTTTGAAGAAGGTCTTGTGTCAGCGTTGCTACCTGAACAGTATTTTTAG

Protein sequence

EERRNREVCARKFGVLGVALTRRRLILGFGIIGASLCCLQTQTLNELLQYMFEEGLVSALLPEQYF
Homology
[Close]
BLAST of Cp4.1LG15g01040 vs. NCBI nr
Match: KAG7011295.1 (hypothetical protein SDJN02_26199, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 4.63e-20
Identity = 47/58 (81.03%), Postives = 48/58 (82.76%), Query Frame = 0 

Query: 5  NREVCARKFGVLGVALTRRRLILGFGIIGASLCCLQTQTLNELLQYMFEEGLVSALLP 62
          +REVCARKFGV  VALTRRRLILGFGIIGASLCCLQTQTLNELL YM      S LLP
Sbjct: 4  HREVCARKFGVPKVALTRRRLILGFGIIGASLCCLQTQTLNELLHYMLFTS--SNLLP 59

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cp4.1LG15g01040 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cp4.1LG15g01040 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7011295.14.63e-2081.03hypothetical protein SDJN02_26199, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
BLAST of Cp4.1LG15g01040 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cp4.1LG15g01040 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG15g01040.1Cp4.1LG15g01040.1mRNA