CmaCh09G009070 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh09G009070
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr09: 4512923 .. 4520930 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh09G009070
SyntenyCmaCh09G009070
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATTCTTCTTTTCAATTAACCTTATCGTATGGGAATTCTCCGGAGATTTACTCTCAGCGGCTGCCGGCGATGATGAGAACGTCGGAATCAAAGCACCATGCGTCCATGTCTATAGAGGTTCAGTCCTACTTATTTCTCTCAAATTTGAAACTGAACTTCCTGATCTCCGATCCAGGGAGCATCATTTTGGGGCGCGAAGTGCAAGGTCTAGTTTGTGGATGATCCTTTTGGAATAATGGCGGCAGTCTCAGTTAAGCAATCGACTGCGGACAGTAATTGTTAGTCATTACTTCACCTGCTTGTTGTTGTTAAATTATCAAGAGTGACAATGAGTTATTGCTTCAGCTTTTAATTCATTTTGAATTGTACTTCTCAAAGTAATTATAGGCTAATTTATGCATTTGCTTTACCTGTCTTTTTATCAAGCTCAGGTTCTTAATGATTTTACTTGTCGTTCCTCAGAATTGAGTGCTTGCTCTGTTGTTTCTTTAAATTAGTCTGTTTGTGTCACATTTTTCTTCATATAGTCAATTAGTTCTAGGGATTTCGATGTCTTTGCTGTGATGGTGATGTTATACCATCGTTTTAGAATTTTTGAACTGATATGTTTAGAGGTAAGAAATTGTTCACTTATTGTTTTAAATAAAAGAAAGATACTGTCGTTGATTGTATGAAAAATACTATTGTAAAAGAAGCCACTGCGATTGGCAGAATCAGAATGGTGTTGTGATTAGGGGGAGGATAGCAAAAAGAGCGCAAACATTTTATCATTTTCGTTAATTTCCACCTGCTATTTCCTCAAAAGCTTCTTTCTTCCGTCTCCAACCAAACCTTAGTGCTTAATCACGCATAACCACAACACCTGTAGTTTCTCCTTGAAATGAATGCCATAAAAGAAGCCAGGGAATCTGTGCCATATACCTTAGTGAACAAATCTAGGCATAATTGAGAACTAATTGGTGGTGTGAAGTCCCGAATCTCTAAAACCCCAACAAACTGAATCTTCTCCAGAGCAAAAGTGGTGGCAGATATTCGATGTGAAGCTTCCATGGATTAAATTTTTGCTGCTTTCTTGAAGTGTTTGTTGCTCCTTATAGGATAGACTTCTGATCTTTGGATTTTCCCCTCACATTCATGTTCGTGAAGCCAGGTAGATCCCCTCTCTTAAAACAATTCTAGTTTAGAAAGAACTAAAATCTAATTGTTTTGACTAGTCTATGTATTCTAGTAAGTCATAATGCAAGCATATGTAGCCTCATTTATCCTATTTGAATGAAAGGATAGACATGAAAAGCTGGTAAACCTGTCGAGGTAAAAAAAGTTGGTGCTTTGTGTTAAATGTGGATTATGCTGTGTTAAACTCTCAAAATGGACTCTGATCAAAGTGTGAACTTCAAACCCAAAAGTTCTTATTTTCTATGTTTAGTAACCAGAAGAGAAATCATTTAGGCATTTCTTTTCCTCTATTTTCTGGATCAATGATGCATGCCACTGTTTTCTCACCGATCTAGTAGGTTGCTACTTCTGTGCACATAGTTTCTCAAGATTAATTATCTATCTGGAAGTTTCAGTGTTGATATAGCACTCAGTTATCTTATAGAAAGGGGTAATACTTATATTGCTGCCTTTGGTAATTGATACTGACATTTCTCATATCATAATTGGACTTTGGTAATTTATAATATACAAGTTATAGAATTGGAACAGCAATCAACAGTAGAACGAGAGAAGATGGTATTTCTTTTTTTGTAATAATAAACAGGAAGAAGTCTATACAGTTTCTTTCTTATTTATAGCTACCATTTAAATTTAATTATAATTATAAAACAACGTATGCATATCTATAATTGCATTTAATCCAAGTCCTAAATTCTATTAGAACAAGCCCAATGTGATCGCACTAGGTCCATTGAGTGCTGCTATGAGATTGAGGAAATTTTATTGAGCTTTCTTAATGGAAGAAACCAAGGTGACTGTAAATTCTCAGTTGATCGTGTCAACTCTCAAAGGAACTTCTGTAATGAATTTATGTTTTCTATGGGGTTGAGAAAACTGTGGACATGTTTATGTGTATTTGAAATTTCAGGCTGGTCACTTCAATTCCTTAGTGTTTTTCGCATGCTCAAGCAATTTACAATACGCCAAACTATTTACCATACTTATGCTGCTATTGTTATGTTTTTGGAATTCACAACTTGAGGATTGCTATTGTTATGATTTTGGTATTCACAACTTAAGGATACAGTTTTACATCCTATAAAACAGATCCTGTTCAAGTAAGGTCATTATTATATTTTTGGTATTGTAAAGCGATGAAAGGACTTTTAAGACATGTTGGCAATTTGAGATTTATTATCTTGGAGTAGAAATGGTAAAGCTGTAGATGTTGTTTTCTTGAATTGCTAGTTTGTCTAGAAGATTAAGGTTCTTCCTTGCAACTGTTTTCTTGTTCCTTCAAGTATATTTTATTCCCTTTTTTATCCTCTTGCATCTCAATTTTTAGTTATTGGTCAATATATTCGTGTTTTGTTTTATATTTTTTAATAAGACTATTGAGCAATTTTATTTAATCAAACTTTTTAAAGAGTTGAAATTGTGTTATTTCTTTTGAGTTTATCAATGCTATCCTATCCCTTTCCCCAGAAAACTAGTAGTAAGTCCTTTCAATGTCATTATCATCTGTCTAAAAGTGTGCTGTCCATTTCATTTTCTTTTCATGTTTTTCATTTCATCTGATGTAAATCCTAATCTGTGTGCTTTTTGGACTTCTTGAAAGCTATTGCATAGAAAAATGGAAGAAGTTTCTCCAAACTCCATTATCTTGAATTTCATATTAGTTTCCCATCAGATCAAGATTGATGTTTATATTTTTGGTCATATCACTTGTAATTCTCAGTAAGATAGAGATATTTCTCTTGTTCCTGTTTAGTAGTTTGACTTCAAATTCCCGTTCAACAAGTTTATAATAGGCACGTTTGTGCAAAGGAAATTGCTTGGAAAATTGCACATATTGCTGCTATGTCTTATCAATTGCTCACCTGCATATAGTACATTTGTCCCTTTACATAAACATATTCTTTGGTAGTAATCAGGTAACAGTGTGACTTTTTTTCTTTTATCTTTTATGTACATAGAATAGAATAGCATTTAATATATATATATATATTGAATTCTTGATGCATTTGCACAGACCTATCATTTACTTCGGTCTAGTAGAATTTAGATTGCAACCTTTCCAACTCTTCTGTCAAGCTAGATTTTTTCAAGGGCATGAAAGAAATGTGAACTTAGAGTCTCAGCTCGAAGTTCGACATCAGCATGGATGCAAAAAGCTTATCTGCAGTTCATCAGATGGTTCAAGTTGACCGCAAGCCTGCAATGCTTAGCTTCTTTGGACAGCCAAGTCATATAAACGAGCTTTAATAGACCATCTTTTTGATCTGGCCTAACATGATCCCTCCGTGCAGCAGAATGGAGATGTTGCAGGGATCGAGTAATACAACTTGAATTTTATTGTTCATCTGTGATAGTCTTTTCCTAGAGATAGAAATATGAAGTTTAAATTCTATCTTTTAACATTGGTTGCGCATGGCATGGAAATCGGGACAGACATTCATCTACAAGAAATTGTGTAAGTTTAGTTATTCGCTTTTGCGTTTCTTTTGTTTCTTTGTTTTCTTTTTTCACCTTCAGATTTTTTTCTATATGTAGAAGTGTATTACTATTAGGCAGGAGCTTCCCATGGAAGGTTTCTGGAAGTTTCTTCATTGCATTGTTTTCCATTCTTACTGGTTTTTATTCTATATTGGGCTCCTATAAGGCCCATTCCTGAATAGAGTAGCAATTAAACTCCTGGTCTTGCTCTTCTGTTCAATAATTATTTCTAAGAATGACATAACATTTTTGGATGCAATGTTTTGAAATCGTTCAGCATAATCATTCTCTCGGCAATTATTGTCTTTTGAGGATTAAAGAATCTATTTCTTTTCAATCTCTCATTTTCTGTTCTCCTCCGGTTTGGTTTGAGTCACAGAGTAAGATTGCATATTTCTAATTGTTTACGAGTAAGAATCTAATAGTGACAATATTTGCTGCCTATAATTATAGTTTCTGTCGCAGGGTGCAAGTGTTGGAACTACAAAGACATGCAACAGTTAAAATTGTCAACCATTCTTCTTAGCATAGAGTATCCCTCTCATTTATTAGTTGTGAAATTGATTTTTACTTCTCTTGAAGAAACTTGGCCATCTATAATCTAAATTAAATTTGCATATTCAATTTATTTTTACCATTGAGAATTTTGGGGGTTTTAGGAATATTTGGCCTTATTGTCTTGAATTGAATATCAATTCTTACTGCCTTAGATTACTTCAAATTTTAGTGAAATTCACCCCAGACCAAGTGCGTGAGACAATCCATGCAGGACAGTAGGAAAATATAAGTTTCCTGTACATTTATCTTCTGCTTTTATTGAGTTAATTTAATTTAGATGATGTAGCCTGTGAAAGGATTCAACATTGAGAGCCATCATCAGTTTTTTGACAAACTAGTAGTGGTTGGCGCACACATTTAGAGTTCTTGTCTAGGTACTTCTAATCCTTACCTTCCATCAGATGAACGCGGATGAACGGCTCACTTCACCGAAGAAAGAGCTGTGTGGGGGCATTTTCAAGTTGTGCTAAGGTACATCCACTTCTTCATGAGATGAAATTAGGAACGGTGGGAGTGGGGGGGCCGGAATTAGTATGCTTAAGAAGACATAATTATGCAACCCTTTTTCATTCTTTCATGGGGGTTGACAGTAGAGACATGACACACCACTTTCCTCTCTTTTTACAGATGCATTTGAAATGGGGCCAACATTCTCTCTCATACCCCATGTCTCTTCGCACCACCTCACCAACCGGGCACAGTTTCAAATATCTATTGGTCAAACACAGTGCGATGGAAAGGAAAAACATCCTTATATCTATATGTTCTGTAACACTGCCAGACAGACTG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mRNA sequence

ATTCTTCTTTTCAATTAACCTTATCGTATGGGAATTCTCCGGAGATTTACTCTCAGCGGCTGCCGGCGATGATGAGAACGTCGGAATCAAAGCACCATGCGTCCATGTCTATAGAGGTTCAGTCCTACTTATTTCTCTCAAATTTGAAACTGAACTTCCTGATCTCCGATCCAGGGAGCATCATTTTGGGGCGCGAAGTGCAAGGTCTAGTTTGTGGATGATCCTTTTGGAATAATGGCGGCAGTCTCAGTTAAGCAATCGACTGCGGACAGTAATTACCTATCATTTACTTCGGTCTAGTAGAATTTAGATTGCAACCTTTCCAACTCTTCTGTCAAGCTAGATTTTTTCAAGGGCATGAAAGAAATGTGAACTTAGAGTCTCAGCTCGAAGTTCGACATCAGCATGGATGCAAAAAGCTTATCTGCAGTTCATCAGATGGTTCAAGTTGACCGCAAGCCTGCAATGCTTAGCTTCTTTGGACAGCCAAGTCATATAAACGAGCTTTAATAGACCATCTTTTTGATCTGGCCTAACATGATCCCTCCGTGCAGCAGAATGGAGATGTTGCAGGGATCGAGTAATACAACTTGAATTTTATTGTTCATCTGTGATAGTCTTTTCCTAGAGATAGAAATATGAAGTTTAAATTCTATCTTTTAACATTGGTTGCGCATGGCATGGAAATCGGGACAGACATTCATCTACAAGAAATTGTGGTGCAAGTGTTGGAACTACAAAGACATGCAACAGTTAAAATTGTCAACCATTCTTCTTAGCATAGAATGAACGCGGATGAACGGCTCACTTCACCGAAGAAAGAGCTGTGTGGGGGCATTTTCAAGTTGTGCTAAGATGCATTTGAAATGGGGCCAACATTCTCTCTCATACCCCATGTCTCTTCGCACCACCTCACCAACCGGGCACAGTTTCAAATATCTATTGACAGACTGGTGTTCGTGCTGTAAGGACCCACTGACTATCCTATCAAGCGACAAGAAGCGATGGGCTGAAAGGAACCAGAAACAAATATTATATGAATTACAAGCACTTAGCTTAGCGATGGAAAATCGTTGCTTTGGAATCACAAAACACTTTCTTGTCATCTTCATGATTTTTAAATCTCCTTTTGGTCCATCATGTCAGTTCCACAGCATAAACACGGACTGTGCACTCAAGCACACAGTGAAGAATAAAAGTGTAATTGGCAAGGGGAGACAGGCCATCATTTGTAATAATGCTGATGATGATCCTGTTGTCGAGGAAAACATGCATGGAATGAACTACGTGTCGATATGAGGCAAATTAGCTTCAAGGGAATGGAGAGAGACTGGAAAGCATCGCAGAAATTAATCAAACATTGCTTTGTTCCCTAGTAGAGACTGTTTTTACCTCATCATTTACACAGAAGACAATGGTATTTTTACATGTGAACCTTGGCATGTAAAGGAGGAACACCTGGAGGTTAAAGCTGAGAGACCATCAAATCTGCCATGAATTGAAAGCTACGTGTCAATTTTTGGTTAGTTCTATTTTAATTCTTATTGATCTTTCAATAAAGCTTAGATTTAGTCACTATGACAGTTTTTCTTTGTTCATTTAAAAAAAAAAAAACAACTATTGGTTATCTTAATAAATTATTTTATTA

Coding sequence (CDS)

ATGAACGGCTCACTTCACCGAAGAAAGAGCTGTGTGGGGGCATTTTCAAGTTGTGCTAAGATGCATTTGAAATGGGGCCAACATTCTCTCTCATACCCCATGTCTCTTCGCACCACCTCACCAACCGGGCACAGTTTCAAATATCTATTGACAGACTGGTGTTCGTGCTGTAAGGACCCACTGACTATCCTATCAAGCGACAAGAAGCGATGGGCTGAAAGGAACCAGAAACAAATATTATATGAATTACAAGCACTTAGCTTAGCGATGGAAAATCGTTGCTTTGGAATCACAAAACACTTTCTTGTCATCTTCATGATTTTTAAATCTCCTTTTGGTCCATCATGTCAGTTCCACAGCATAAACACGGACTGTGCACTCAAGCACACAGTGAAGAATAAAAGTGTAATTGGCAAGGGGAGACAGGCCATCATTTGTAATAATGCTGATGATGATCCTGTTGTCGAGGAAAACATGCATGGAATGAACTACGTGTCGATATGA

Protein sequence

MNGSLHRRKSCVGAFSSCAKMHLKWGQHSLSYPMSLRTTSPTGHSFKYLLTDWCSCCKDPLTILSSDKKRWAERNQKQILYELQALSLAMENRCFGITKHFLVIFMIFKSPFGPSCQFHSINTDCALKHTVKNKSVIGKGRQAIICNNADDDPVVEENMHGMNYVSI
Homology
BLAST of CmaCh09G009070 vs. NCBI nr
Match: KAG6592004.1 (hypothetical protein SDJN03_14350, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 223.8 bits (569), Expect = 1.1e-54
Identity = 117/167 (70.06%), Postives = 118/167 (70.66%), Query Frame = 0

Query: 1   MNGSLHRRKSCVGAFSSCAKMHLKWGQHSLSYPMSLRTTSPTGHSFKYLLTDWCSCCKDP 60
           MNG+LHRRKSCVGAFSSCAK                              TDWCSCCKDP
Sbjct: 1   MNGTLHRRKSCVGAFSSCAK------------------------------TDWCSCCKDP 60

Query: 61  LTILSSDKKRWAERNQKQILYELQALSLAMENRCFGITKHFLVIFMIFKSPFGPSCQFHS 120
           LTILSSDKKRWAERNQKQILYE QALSLAMENRCFGITKHFLVIFMIFKSPFGPSCQ   
Sbjct: 61  LTILSSDKKRWAERNQKQILYEFQALSLAMENRCFGITKHFLVIFMIFKSPFGPSCQ--- 119

Query: 121 INTDCALKHTVKNKSVIGKGRQAIICNNADDDPVVEENMHGMNYVSI 168
                          VIGKGRQAIICNNADDDPVVEENMHGMNYVSI
Sbjct: 121 ---------------VIGKGRQAIICNNADDDPVVEENMHGMNYVSI 119

BLAST of CmaCh09G009070 vs. NCBI nr
Match: KAG7024879.1 (hypothetical protein SDJN02_13698, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 3.6e-45
Identity = 97/119 (81.51%), Postives = 98/119 (82.35%), Query Frame = 0

Query: 49  LLTDWCSCCKDPLTILSSDKKRWAERNQKQILYELQALSLAMENRCFGITKHFLVIFMIF 108
           LL+  CSCCKDPLTILSSDKKRWAERNQKQILYE QALSLAMENRCFGITKHFLVIFMIF
Sbjct: 18  LLSIECSCCKDPLTILSSDKKRWAERNQKQILYEFQALSLAMENRCFGITKHFLVIFMIF 77

Query: 109 KSPFGPSCQFHSINTDCALKHTVKNKSVIGKGRQAIICNNADDDPVVEENMHGMNYVSI 168
           KSPFGPSCQ                  VIGKGRQAIICNNADDDPVVEENMHGMNYVSI
Sbjct: 78  KSPFGPSCQ------------------VIGKGRQAIICNNADDDPVVEENMHGMNYVSI 118

BLAST of CmaCh09G009070 vs. NCBI nr
Match: XP_038896213.1 (uncharacterized protein LOC120084489 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 1.2e-24
Identity = 59/64 (92.19%), Postives = 59/64 (92.19%), Query Frame = 0

Query: 54  CSCCKDPLTILSSDKKRWAERNQKQILYELQALSLAMENRCFGITKHFLVIFMIFKSPFG 113
           CSCCKDPL ILSSDKKRWAERNQK ILYE QALSLAMENRCFGITK FLVIFMIFKS FG
Sbjct: 14  CSCCKDPLAILSSDKKRWAERNQKLILYEFQALSLAMENRCFGITKPFLVIFMIFKSLFG 73

Query: 114 PSCQ 118
           PSCQ
Sbjct: 74  PSCQ 77

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6592004.11.1e-5470.06hypothetical protein SDJN03_14350, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
KAG7024879.13.6e-4581.51hypothetical protein SDJN02_13698, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
XP_038896213.11.2e-2492.19uncharacterized protein LOC120084489 [Benincasa hispida][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh09G009070.1CmaCh09G009070.1mRNA