Clc08G16690 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc08G16690
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr08: 27132158 .. 27136998 (-)
RNA-Seq ExpressionClc08G16690
SyntenyClc08G16690
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGCCTCGTCGGCTCCACCAAACAGTTGCAACAAAAACCGGATTGACCAAGAAAGGCGTTGACCAGCTATGTTAGTTCAATTGGAGTTCATACACTAAACACCAATTCTCCATTAAAATCCAAATTCATCGATTTTACCTAACCATTGTTATTGCTTATGCCAAATCAGTCAAGGGTTATTGCAATTTGCAATCGCATAGCTGTTCCTCGATCTTTGATCCTACTTCCCAACTTCACAATCTGTTCATCAACTATCTCAATTCTCAAAATGGTTAGTTCTTATAATCTCATCTTATGCTGTTTCGTTCTGTTTCCATGTAATAGAGCCACAAGGGGCATTGACTGAATCCTTCTGTACTTCACAAAGTGACAAGCCTATTACATTTGTTCTTATCTTCTACATCTTCCCCCTTGTATTGACTAATATAATTCTTTTTCATTCTTGTTTATCTCATGTTCTCGAATGTATTAAAATAGGAATCCCGAAGAGTCATTTATGTTGGTGTCTCTTCCGCAGGACTGTGTCGTTGCCGAATTATTGGGCATGAGAAATTTTGTTGGCTGCTTGTGATATCTTATTTGAATCAAATTTATACATTAAGCATCTGATTTGACTCGAAAAACTCTCCTACACGAGCCGTTCAATGGTCATCCTTTATAATATTCATCCGGGTCCCACGTACATTGACAGAACATTTTGAAATATGATACGTTGGGTTTTGTTTGTTTATTTATTTTTATTTTTATAATGGGTATCCAGCTTCCTTACTAGATTGTCTTATAATTGTGTTTCTGGATGCTTTTCCAGACGTGGTCTTATGTACTTCATCGAGTTTCCCCAGATAAACTTTTGTTTGGTCAAAGCAATTGATCAGGAAACGTTGTACCATACACTTTTTAGTCTTTTGGCATTGCTCTATTCTATCTTGTAAGATTGTTATAGATGCTTCTGGCGTGTTAACGGTTGTGATTTTGTTAAAAACATAAGTTGAGAACAAAAAATCTGCACAAAATGCAGTAGATAAGTTAATGGAATGCTGATCAATAACTAACAAATCTGGACGTGGATACTTCCTTGTAGAGGCAGGACAGGTCGGTAGATGTTTCTCTGTTGCACATTTTTCCGGGATGTGCAAAAATCACAGTGCTGTAGAAGGTTATGTAAGGTCGAAGTGTTTCGGTTTTGTTAACCTAGAAGATGCATATGATTTTGTGAAAGCAACAAATGGACTTGAATGATAAAGAGTTTGATTAAAACGAGTGATAGGTTGAAAAGCTATGAAATTTTTTGAGAGTTAAGAGTTCTGGAGCTGATCGAGCATAGTGCGGATGATTTACTTGGTTGATAGCATCTACAATGATAAATTTACCATAGTGTTTTAGGAATTGCCACAATTTCCTCGTGCTATGTTTATTATTTTCTTTTAATGATAAAACCGTGCAGTTCCAATTTCATCCTTCTCAGAGTAGTAATTGTCATGTTTTCCCTCTAAACTCTTAAATTTACAGCATATGTCGAAATGTGCCTTTATATATATGCTCTCTACTCTATTTCAATGTCTTGGAGTTGTGAGCCCCATGGTTCTAATCATGGACTTTTGTATGCAAAAGTTCGTTTCATAGTCAAGGATTAGGAATGTAACTCTTATTCATTGATTGGATCTGCTAGCTCTCATTGTTCTCTCTTTTTGAGTGCCAAGTATATTTCGGGGAGATTATTCACTTGGCAAGCCAAAAACTTGTAAAGGAAACTGGCCATCTCCTTGAATTACTTTATTAATGATAAATATAGTTCTCCATCTCCCGTAGTTTTCCTCTTTATGCAGAGCCATTGATAATTGGATTTTTGCCTAAAAATTTGGAGCAAGAATACAACTTCCAGTCTGCTGGCTCGACGGTTGCTTTTGTCACTTTCCTGTGTACGTTCTTGATGTTCTCTATATATATTCGAAAATTTCTGGTAAAAGTTCTCTTCCATTCATCATGCGAGTGTTACGAATAAACTCTTGAATATGTATCAATTTTTTAGTAGAACTATGTGTACGATGACTGAGTTCTTTTACAATGTCTTCTCACAAGTCTGAAAATCAATATTTATATTGTCATTCTGTGTGCTTTCATAGTCTGTGAAACTGAAGACTGGAGTCTTCTGGTTAAATATTTGCAATACAACCTGCTGGTTTATATGGAATGAGAGAAATATAGACCTTTCTTAGATGCTTGTGACCAGGGAATGATTATTGTTGTAGCTTAAAAATGCAGCTCTCTTGATAACGATTTCAGTAATGATTCTTCCTACCATTTTTGCCCATTAGTAACCTTTTTCTTAACTCATGGCTTAGATTTGGATGGTGGCTTATCTCCCACTTTAGATTTGGACGATCTCTTTTTGTACTTTACTGTAAGAAACAAAAGATAAAATCCTCTCTTAACTTGCTCGTAAATTTTTCTCATTACTGTGTGGATATGATGACTGATATTTATAAAATTTTGGCAATGGTGGTAAAAGGGTCAACCTCAAATGCTTTGAGGGTTAGGGAGACTCAAATCATGGTGCCCGAGATGATCAAATATCATAGTGCGTTTTGTAAATTTCCCTGTTGGAATCTAGATCGTCTCCACCATATTCTTTTCCTTTATGATAGATTGTGGCGTGATTTCTCCGGCATGTATTTGATGATCTTCTGGTGCTCCCTCCCTGGGTTAAAGATTGATCTTTTTTACTTTTTTATTTGTTGGGTTGATAATGGTTTCTGCTGTAATTCTGAGCATTAACATGGAGTGTATTTAAAAAAAATGACCAGTTCTAAATGGTCGAAAAATTGGTAGTAGAAGATGCGATGCAGAGATAACAAGTCAGAAAAGAAAGTTGTAAGTTCTTTGCGTCCATTCTTCTTTCTATTAAAGAGAAGATCTAACATGGCTCTGCTTTATGTAGATTGAATTTGGTTATGAGCAGCTAACTTCCTGACGATGGGGTCTGATAAGGCTTTTGCCTTGGACTTCTGCGCTCTTGGTTAAAACTTTTCCCTATGCAGTGGCTTCTTTGCTAAATAGTTGCTTCCAGGATGGGCCAAATTGAAGTTTCGCACATACTGTGTCACCTGAGATTTTGCAGACAAGTTTCGGAGTGGTCGCATGAAGGTTATGTGGCTGCTTGGAAAGTTCAACGTTCACTGGTCTTGTATTTTGGAGACAGCTAGATTTGTCATCTTGGCGTAGAAGCGCAAGACACTTTGGAATATAAATCCTACAGTGTTCTTTTTCATATTGACCCAATGCATTTCATTAGTTTGCCTTTAACATTAAACCTCAAATTCTAGTACATATTTCTTTGTCCTGTAATTTCCAATGTCCAGCCGACACCTAGGAAACATCATTTACCTTCTAACACGTGGACTGTGATGAAAGTGGACGCAATTCACATAAAGAAAACTGTTTGATGTTTATCTTATCAGACCCACGTCTTGAAATTGCATCTGTTTTCCTTGGCTTTTCCACAATTTCCATCCTAATTATTTGATTACCTTCTTCTCTACAATGAGTTGGGTGCTGGTGGCTTCCCACGTGTGAGGCTTAAGCAGCGAGCAAATACTTTTCTTATGGACGAGGACTTGAATAGGTATCAAAACCAACTTATGGATCAAGTTTCCTGGTAATTTTTTTTAAGACAACTCAAAAAAGTTAATTAATGGCCTCAAAATCTTGAGCTCTGTTATAAGATTCACCCGTTTTTACCATTCTTTGGCTTTGATGTGAAGAGTTACTGACTGAATTTTTTTAATTTTTAATTTTTATTTTTTTCCTTTATGAGGGTAGAAGTGTGGATAGTATAGGATAGGAACTCTAAATGTAGACTGAATCAATTGGATTTTGTTAGTTGGCAGTAAATTAATATCAAACCTACCTGTTTTATATTTTCAATCTGCAGGTTAAGACCAGGATGAGCCTATTTATTTTATTAATGAGCTAATGGAAGAGTGACATTTTAAATTGCATCGGATGCCTGGCATGCTTGCTTGCTGTGCCATCCTTCCCTTGATGGTGAAGTTAGTTAATATTTTTGGCTTCTCCCCATTATCTATTTTGCAGATCACGGGAACTTCTTAGGCAGTTTACTTTCAAAATTTCCAACTTTATATGCAAAGTTCAATGAAACTTAATGATGAAAAAGGCCTTTTTTTTCATTTTTTTCCCTGTTTATTGCTGTGAGTCTGATTTTTAAACTGGTAGTTGAAACAACCCAATGTGATATTATTGTTTTGCAGTTATGGGTGAATGACGGTTCCACCAAGTACTGACCTTTGCATCATTTTCACCCTTCTTGCTTAATCTATTTAATTAAACTCCCTACATTTTTTTACTAGAGGGTTTGGTAAGTATATTTACTGCAGTGTTTGCAGGTGAAAGGGATTGGCAATATCATCATCAGTGATTATTGCAGCAGGCTTCTTTTCATTTGCTGTACCAATTTCATTCCTTTTATTTTTTTCCTTTATAATAATATATTATCTAAAAGTCTTAGCTGATAGGTGGGATTGATTAGCACATTTTTTCTGCTGTTTGATTATTGACAAAAGTTGCATCCAGTTTTCTTCTTTCTTTGACACATTCATTTTGATTCAATTTCAATCTTCTTTCTACTCATTTTGAGAAGAAAAATGGCAACTGACAAAGATGCCCACTTATAATGGTGGGTTAGGAGAAAGGCAATCTTGGTTCCCTCATGGTTTAGCTTGATAATTATATCTACCGCCGTGGGTGAAAAAAAAGTGACCCATCTCAATTGCCTGGTTAATTTCAATCTCCTCAACGCTTTATGCCTAAGCACAGTAGATTAG

mRNA sequence

ATGCCTCGTCGGCTCCACCAAACAGTTGCAACAAAAACCGGATTGACCAAGAAAGGCGTTGACCAGCTATATGCTTCTGGCGTGTTAACGTTCTCCATCTCCCGTAGTTTTCCTCTTTATGCAGAGCCATTGATAATTGGATTTTTGCCTAAAAATTTGGAGCAAGAATACAACTTCCAGTCTGCTGGCTCGACGGTTGCTTTTGTCACTTTCCTACAAGTTTCGGAGTGGTCGCATGAAGGTTATGTGGCTGCTTGGAAAGTTCAACGTTCACTGCCGACACCTAGGAAACATCATTTACCTTCTAACACGTGGACTGTGATGAAAGTGGACGCAATTCACATAAAGAAAACTTTATGGGTGAATGACGGTTCCACCAAGAGAAAGGCAATCTTGGTTCCCTCATGGTTTAGCTTGATAATTATATCTACCGCCGTGGGTGAAAAAAAAGTGACCCATCTCAATTGCCTGGTTAATTTCAATCTCCTCAACGCTTTATGCCTAAGCACAGTAGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCCTCGTCGGCTCCACCAAACAGTTGCAACAAAAACCGGATTGACCAAGAAAGGCGTTGACCAGCTATATGCTTCTGGCGTGTTAACGTTCTCCATCTCCCGTAGTTTTCCTCTTTATGCAGAGCCATTGATAATTGGATTTTTGCCTAAAAATTTGGAGCAAGAATACAACTTCCAGTCTGCTGGCTCGACGGTTGCTTTTGTCACTTTCCTACAAGTTTCGGAGTGGTCGCATGAAGGTTATGTGGCTGCTTGGAAAGTTCAACGTTCACTGCCGACACCTAGGAAACATCATTTACCTTCTAACACGTGGACTGTGATGAAAGTGGACGCAATTCACATAAAGAAAACTTTATGGGTGAATGACGGTTCCACCAAGAGAAAGGCAATCTTGGTTCCCTCATGGTTTAGCTTGATAATTATATCTACCGCCGTGGGTGAAAAAAAAGTGACCCATCTCAATTGCCTGGTTAATTTCAATCTCCTCAACGCTTTATGCCTAAGCACAGTAGATTAG

Protein sequence

MPRRLHQTVATKTGLTKKGVDQLYASGVLTFSISRSFPLYAEPLIIGFLPKNLEQEYNFQSAGSTVAFVTFLQVSEWSHEGYVAAWKVQRSLPTPRKHHLPSNTWTVMKVDAIHIKKTLWVNDGSTKRKAILVPSWFSLIIISTAVGEKKVTHLNCLVNFNLLNALCLSTVD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc08G16690.2Clc08G16690.2mRNA