CaUC09G178120 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC09G178120
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr09: 37319185 .. 37323778 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC09G178120
SyntenyCaUC09G178120
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTGGTGATGCTTTACGCCATTGATGTTGAAGGTTTGATTTTGGGAAGAGGGTTTTGTTTTTTGGTTGATAGACGAAATGGGTTTGTTTGAAAATGGTTGTTTGTTGGCTTACACTGCACTTAATTGGGTCGTGGGTGGTTGGATCGTATGCTTAATGGATCATTCCATTTATTGGTGCTCTGTTTTTACTTTTTGGGGGTTTCTTTTCCACATTAAAATATGTAAATCTTGTTTGTTTGTTTTTCAGGATTATTTGGCTTGGAGGCGTGGTCTTCGCTCCTTCAAAGCAAAGTATCTACATAATCCTTTGTTGGGATTTATTCGTAATTTCTCATGGAGGAGTTAATTGTTGGTGAATCAAGGAAACACAAGAAATAAGAAAAGCCCACTCTGCTTTCATGGACCCCAGTCATGGTCATGCGGTATGTAGCCTTTTTTTTTTTTTCTTTCCTGAAATTATATTTATCTTCTTCGTGTCCTTTTCTGGTGGCCAATGATGGTCTCTGGACGCTCAAAAAGCCTCCACCAAAGGCAATCGTTTCCTTTCTTTTATAACTATGGTAGGAGATTCAAACTTTCTGACTTTTTTTTTTTTTGTTGACTCTATGTTTACCATTCGAACTAGGCTCGTAAAGACAATAACTAAAGTCATATTGATGGAAGTTCTCTTATTTAGTATTTACCCAACGGAACCAATTTTTATGATGATCTAGTAGTTAAAATAAGAAATAAGTTAAAAAGTTTAAATGCTAGTTTGGTTCATGTAATTTGATTCATTTGTCTCTGTACTTCCAAATGTTCATTTTAAAATTTCTATACTTTAAATTTTGGTTCATTTCAGTTCTTGCATTTTCAATTTTAGTCTTTAAACTTTTAAAATTAAAATGAAATATCAAGGTGACCACGTTTTAAAAGTACAAGGATAAAAAAAAATATATATTTTGAAAGGATAAAGATCAAGATGAATAAAAGTTAGAAGTACAAGAATTACAATGAACACTCAAAATGTTTATAAACCAAAATGAACTAACACCAAAATTGACCATAGCAGTATTTAAACCTAGGACAAAATATATTTTTGGTCTCTGAAGTTTGGACCAGTTGTCTTTTTTATATGAGATGGGCAATTTTAGTTATTGAAGTTTGAAAAAGATTTTAAATAGTCACTATCCTCTTTGGACCGTTAGTTACTAACTCTGTGATGTTGTTGCTGTTAAGTTTGGTTGATTGTATTGCTGATTTGGCAAATAATTAATTAATTTTTTTGTTGACTAGACTCCCTTTCTTTCTTCTCCATTTTCTTTCTCTTCTTCTACGTTGTTATCGCCGGAAGTCCTTGTCGCCCCGTTGATAGGATTGCCACTGCCGGAGAAACACCATTGCCAATTATTTCTTTAAAATCTCTCTCACTAGTTTCCTATTTATGATTTATATGTTTATCTCTATCAATAATCTAAATTATCTCCATTTCCCAAATTCTCAATCTATCTCTCTTTGGTTCCAATTTCCCTCTCTATTTTTCAGATTTTGTATCTACCTTTCTTCATAACTCTATTTCTCTTTCTCTTTCCTTATTCTTCTATTTTTCTCCTTAGAACCCAATTTGAAATTAAAGAGTTCGTTTTTGTTGAAGAAAATCAATCCTTTTCTAGGAACAACTTTCTCCATCACACAGTTCGTTAATATGCATAGAGTGAGTCTTATTGTTTTTCGTTTTTTGATTTGTAATTTTAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGAATAAACCCCAAGTTCTGCATTGAGGGTTTTCTTTTTCTTTATTATTATTATTTTTTTTTCTAGACCAACTTTCTACTTACAAATTTAGAACAAGGCTCATCTTCAAATTTGCAGATGTAGAAGTCTCCAGTGCTATTAGTTATCATCGAAGCATTTCTTTTGATGGCGTTACCAAACACCTTTCTTCTGACGATAGCGACAAGCAACTTCCGACGGCAGCTACTTTAACAGAGAAGGGAAGATGAAAGGAATTCTAGTCAAAAAAAAAAAATTATTATTATTATTATTATTTGCCAAATCAGCAGTACAACCAACAAAACTTAACAGCCAAGTTTGCATTTTCAAACTTCAAAGACTAAATAAATACTTAATCCAAACCTTAGGGACCAAAAATGTAGTTTGCTCTTAAACCTAAGTTAAAACGTCAAATTTCATCTTAGATAATGAATTCAAAAGAAATATATAATAGTGTAACTTTTATCGTGCTTAATAAATTTTAAAATTTTAAAATATTAATAAGTTCTTAGATGCGATAGGTTTTCATAATCAATTAAATATATTAAACTCAAAATTGAATGTCACAATCTTATAAAACACAAAATTCAATTACTTATTCCACACTTCTAAATTTTAGAATCATCAAAATTGAAAATGAATCTCATGTAACTTCAAAAGCTCTAGAACAAAATTTGGAGTTTAACTTTAAAGACATTTTAGAAAAAAAATCAATGTTAACCATAAACTTGTTTGGTTGTATCAATTTGAACCTTAAACTTTCAATTTTATCAAGTTTGACACTTACTTTAACAAATGTTGCAAGTTTTACCCTTGGTTCAATTTTCATTAATTCAACCATTAATTAATTTTAATAGAAAACAATTTTCATAAACTTATTAATTTCAATGAAATAAAGTTTTTCACAATAATAAGGTTAACCAATCCACTAATTAACTATTGAACAATTTTGCCTAAATTCATGAATTTTCAACAAAAAGGAAAAAAAAACTTTTAATATCATTTGTCTGTAAAGCTTTGTAAATTTTATATCGTACATATGTTTTATGATTTCTTGGATATATAAGTGAACTTTTTTATTTTTTTTGTAACTATGTTTGGAGGAAGAACTTTGAGTTAAAATTGTAACAATTTTAGGTCAAAGTTAAGATTTTGAAACGCATCTAAGTTTAATGCGCAAGTGATACACGTTAGATGAAAATTGAATTTTTCCCAAAATTATTTTGATTTCAATGACTTGTTTTGAGAATTATACATCTGATTTTGGAATGGCTTTGAATTAAAGTGTACACCTGGATTAGCTTACCTTACTTTCCCCCCCTCCTCTATGCTTTCCATAAGAAAAGGAAAGTAGATTAAGTTACAGAAGAGTGTTGGAGACTTGATCGGCAATAAATTAAAATTATTATTATTATTTAGCCATCATATGAGAGAATTAGAATAGTAAATATTAGGAATGGGAACGAAAATTGACATTTCTTTGATGTCAGTTTAATCATAATGGTTTGCTATTGGAATTACGTTAATATTCCTATTGCTTATTATTTGTATTAGGAAAATTAAACAAACATATAACTACAATTATCTAAATACCCCTTAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAGCTAGGACAACTTTTTTTTAAAAGGAAGAGCAATTATGTGGGGAGGACATCATTTGATTTTAAATGTTATATTATTTAAAAATTATGGGTAGAGTAGAAGAGATAGGATGAAAATGATTTAAAATAGCTTGTGATCAGGTCCATAGAATAGGGAGAAAGAGAAAGAGATTAAAGAGAATTTTTACCCTTATTGCTCCCTGTGATTTTAATGGATTAAATTAAAGTCATCCCTACAATATTGTTCTTATACGTTGGTTTTTCTTTCTTATTTCGTGTTGGTGTGCCTCCTAACTCTTTGACGATGCACAAAGGACAATATTATATCATCTAGTGATTTAAGAACTCTCATTGAAGATGCACAAGGGACAATATGGATAGTTAACATGTTACTAGTATACTATGACAATAACAAAGACTCATTCTCCATTATTTTTTTTTTTTAAAAATAGAGCAAAGGACATTAACATTCAAAATTTAGTGGTAGGATATAAAGTATGTTTGGGCTAAGGAGTTGGTGGAATAGGAGTTTAGGAGAGTCTACTCTTTGTTTGACTCAAAGACTAAATATCATCGATTTTATAACTTATTAACTTCTTACACAGTGGGTTCTAAGAGTTGACTTTATAACTTCATTTTTTTTTTCGTCGTAGAGGTCTATTAGAGACGTGTGTTTTGAAGAAAGGTATGAGAAAGTGGGACATGGGAAGCAGAGGAATCCTAAGGAATCTAGTTTTGAGTTGAAGAATCCCCAAATTGCCAAGATTAGAAGCAACTTCCAAAGGGAATAGCCAACACACTCATCCTTTCCTTGTTATTCAAAAGATAAAAGAAACCCATTTAATATGCTTATGGAGAGGTCAGGGTTACTGGATGGCCCCATTCCATTTTATGATTTGAAATCTCAAATCTCATCCATGCACTTGTCCCTTCTTAGCTTTCTGTCCTCTTCTATTGTATCAAATCAAAAAGACAACACTGTGACCAACTTTGAAGGATGTGTTCTTATCATTTTCTGTACGTGTCTTCTTATCATTATTCCACTATTTATGATCTTATAAATGAAGGCCATAAAAGGGAATAAGAGAAGGGAAGGCTCCAATAATTCCTTTCAATTAAAAGTCTCTGTTTTGGTACTTTGTTAGATCAGCTACTTATTCTAAAGTTGAAAAACTTCAAACTTACAAACTTATTCTTTCA

mRNA sequence

ATGTTGGTGATGCTTTACGCCATTGATGTTGAAGGTTTGATTTTGGGAAGAGGGTTTTGTTTTTTGGTTGATAGACGAAATGGGATTATTTGGCTTGGAGGCGTGGTCTTCGCTCCTTCAAAGCAAAGTATCTACATAATCCTTTGTTGGGATTTATTCAGGTCTATTAGAGACGTGTGTTTTGAAGAAAGGTATGAGAAAGTGGGACATGGGAAGCAGAGGAATCCTAAGGAATCTAGTTTTGAGTTGAAGAATCCCCAAATTGCCAAGATTAGAAGCAACTTCCAAAGGGAATAGCCAACACACTCATCCTTTCCTTGTTATTCAAAAGATAAAAGAAACCCATTTAATATGCTTATGGAGAGGTCAGGGTTACTGGATGGCCCCATTCCATTTTATGATTTGAAATCTCAAATCTCATCCATGCACTTGTCCCTTCTTAGCTTTCTGTCCTCTTCTATTGTATCAAATCAAAAAGACAACACTGTGACCAACTTTGAAGGATGTGTTCTTATCATTTTCTGTACGTGTCTTCTTATCATTATTCCACTATTTATGATCTTATAAATGAAGGCCATAAAAGGGAATAAGAGAAGGGAAGGCTCCAATAATTCCTTTCAATTAAAAGTCTCTGTTTTGGTACTTTGTTAGATCAGCTACTTATTCTAAAGTTGAAAAACTTCAAACTTACAAACTTATTCTTTCA

Coding sequence (CDS)

ATGTTGGTGATGCTTTACGCCATTGATGTTGAAGGTTTGATTTTGGGAAGAGGGTTTTGTTTTTTGGTTGATAGACGAAATGGGATTATTTGGCTTGGAGGCGTGGTCTTCGCTCCTTCAAAGCAAAGTATCTACATAATCCTTTGTTGGGATTTATTCAGGTCTATTAGAGACGTGTGTTTTGAAGAAAGGTATGAGAAAGTGGGACATGGGAAGCAGAGGAATCCTAAGGAATCTAGTTTTGAGTTGAAGAATCCCCAAATTGCCAAGATTAGAAGCAACTTCCAAAGGGAATAG

Protein sequence

MLVMLYAIDVEGLILGRGFCFLVDRRNGIIWLGGVVFAPSKQSIYIILCWDLFRSIRDVCFEERYEKVGHGKQRNPKESSFELKNPQIAKIRSNFQRE
Homology
[Close]
BLAST of CaUC09G178120 vs. NCBI nr
Match: KAG7037301.1 (hypothetical protein SDJN02_00926, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 2.4e-04
Identity = 39/77 (50.65%), Postives = 42/77 (54.55%), Query Frame = 0 

Query: 1   MLVMLYAIDVEGLILGRGFCFLVDRRNGIIWLGGVVFAPSKQSIYIILCWDLFRSIRDVC 60
           MLV+LY IDVEGLI GRG           IWL GVVFAPSKQSIY      L   IR+  
Sbjct: 63  MLVVLYDIDVEGLIFGRG-----------IWLRGVVFAPSKQSIYFN---PLLGFIRNFA 122

Query: 61  FEERYEKVGHGKQRNPK 78
           +  R   V  G  RN K
Sbjct: 123 WRSRL-LVNQGSTRNKK 124

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC09G178120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7037301.12.4e-0450.65hypothetical protein SDJN02_00926, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
BLAST of CaUC09G178120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC09G178120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC09G178120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC09G178120.1CaUC09G178120.1mRNA