Sequences
The following sequences are available for this feature:
Gene sequence (with intron) Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. ACGCAGAGGCTCAATACATCCCTGAAAAAGAAGAAGCAAGCAGAGACTGAAAATTGAAAAGAGAAGTGAAAAATGAAAAAAAATGGGGAATTGAAGATGATAGAAACCTGCGTTGTTGTGAGGATTATGAATTGAATGAGGAATCTAGGGAAAGAAGTGGGGTTGTAAAGAAGAGTCAGAGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGGGTGGCGATGTGCTCCAATTGGTATCGCCAATTCAGAGAAATGGAGTTGGAAATTTTGGGTAACAGAAAAGTAAATTGTTAGATGGCGGTGTTGCTCCCGCTACGGTGCGTTCAATCCACGTCACTTCCG mRNA sequence ACGCAGAGGCTCAATACATCCCTGAAAAAGAAGAAGCAAGCAGAGACTGAAAATTGAAAAGAGAAGTGAAAAATGAAAAAAAATGGGGAATTGAAGATGATAGAAACCTGCGTTGTTAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGGGTGGCGATGTGCTCCAATTGGTATCGCCAATTCAGAGAAATGGAGTTGGAAATTTTGGGTAACAGAAAAGTAAATTGTTAGATGGCGGTGTTGCTCCCGCTACGGTGCGTTCAATCCACGTCACTTCCG Coding sequence (CDS) ATGAAAAAAAATGGGGAATTGAAGATGATAGAAACCTGCGTTGTTAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGGGTGGCGATGTGCTCCAATTGGTATCGCCAATTCAGAGAAATGGAGTTGGAAATTTTGGGTAACAGAAAAGTAAATTGTTAG Protein sequence MKKNGELKMIETCVVKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKWVAMCSNWYRQFREMELEILGNRKVNC*
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (PI 183967) v1
Date Performed: 2021-10-25
| IPR Term | IPR Description | Source | Source Term | Source Description | Alignment |
|---|
| None | No IPR available | COILS | Coil | Coil | coord: 15..183 |
| None | No IPR available | MOBIDB_LITE | mobidb-lite | disorder_prediction | coord: 1..186 |
| None | No IPR available | MOBIDB_LITE | mobidb-lite | disorder_prediction | coord: 14..186 |
| IPR005819 | Linker histone H1/H5 | PRINTS | PR00624 | HISTONEH5 | coord: 68..87
score: 39.44
coord: 16..30
score: 37.78
coord: 46..63
score: 41.98 |
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
| Category |
Term Accession |
Term Name |
| biological_process |
GO:0006334 |
nucleosome assembly |
| cellular_component |
GO:0000786 |
nucleosome |
| molecular_function |
GO:0003677 |
DNA binding |
|
