CsaV3_5G013340 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview


Name	CsaV3_5G013340
Type	gene
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
Description	S-protein homolog
Location	chr5: 9924563 .. 9948916 (-)
RNA-Seq Expression	CsaV3_5G013340
Synteny	CsaV3_5G013340

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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mRNA sequence

ATGTATAAAAATCATGTGTTGGCCATTGTGTCATTTCAAGGGGTTATCTCATTAAGGGTTGGATCGCTACAATGTTCAGCTTTGTCTATAGATTCAAAGTACGCACCGGCTTTAAGCAAATGGACAGTAGTAATTCTAAACAAATTAAGTTCAAATCAACAACTATTCGTTCATTGCAAATCAAAAGACGATAATCTGGGAGACCACGTAGTAGAAGCTGGACAATCCTATGAATGGAAATTTCGGGAGAACGCTTTTCAAACCACACTCTTTTGGTGCACTTTAAGAACTCCGACAAACCTTCACCAAACATTCGAAGTATATTGGAGAGAAAAAGGGGAGTGGTTGCGTTCTCGTTGCAATTTTAAAATTTGCATGTGGTATGCTCGAGACGACGGATCAATCACGATACAATGTTCAGCTTTTTCTATGGATTCAAAGTATACACCGTCTTTCAGCCATTGGACAGTAGCAATTATAAATGAATTAAGTTCAAATCAACAACTATTCGTTCATTGCAAATCAAAAGATGACAATTTGGGAGACCATACAGTAGAATCTGGGCAAACCTATCAATGGCAATTTAAGGAAAACGCTCTTGAAACCACACTCTTTTGGTGTACTTTAAGGACTCCAAAAAACCTTCACCACACATTCGAAGTGTTTTGGAGAGAGAGAGGGGAGTGGTTGCGTTCTCGTTGCAATTTTAGAGCTTGTATGTGGTATGCTCGAGATGACGGTTTCTACTTTTTTCTAAACACCTATTTCATTGCTAGTAACGCTCCCTCTAGTCGTGGCACTCTCATCTTCTTCGTCGTAGCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTATAAAAATCATGTGTTGGCCATTGTGTCATTTCAAGGGGTTATCTCATTAAGGGTTGGATCGCTACAATGTTCAGCTTTGTCTATAGATTCAAAGTACGCACCGGCTTTAAGCAAATGGACAGTAGTAATTCTAAACAAATTAAGTTCAAATCAACAACTATTCGTTCATTGCAAATCAAAAGACGATAATCTGGGAGACCACGTAGTAGAAGCTGGACAATCCTATGAATGGAAATTTCGGGAGAACGCTTTTCAAACCACACTCTTTTGGTGCACTTTAAGAACTCCGACAAACCTTCACCAAACATTCGAAGTATATTGGAGAGAAAAAGGGGAGTGGTTGCGTTCTCGTTGCAATTTTAAAATTTGCATGTGGTATGCTCGAGACGACGGATCAATCACGATACAATGTTCAGCTTTTTCTATGGATTCAAAGTATACACCGTCTTTCAGCCATTGGACAGTAGCAATTATAAATGAATTAAGTTCAAATCAACAACTATTCGTTCATTGCAAATCAAAAGATGACAATTTGGGAGACCATACAGTAGAATCTGGGCAAACCTATCAATGGCAATTTAAGGAAAACGCTCTTGAAACCACACTCTTTTGGTGTACTTTAAGGACTCCAAAAAACCTTCACCACACATTCGAAGTGTTTTGGAGAGAGAGAGGGGAGTGGTTGCGTTCTCGTTGCAATTTTAGAGCTTGTATGTGGTATGCTCGAGATGACGGTTTCTACTTTTTTCTAAACACCTATTTCATTGCTAGTAACGCTCCCTCTAGTCGTGGCACTCTCATCTTCTTCGTCGTAGCCTAA

Protein sequence

MYKNHVLAIVSFQGVISLRVGSLQCSALSIDSKYAPALSKWTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPTNLHQTFEVYWREKGEWLRSRCNFKICMWYARDDGSITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACMWYARDDGFYFFLNTYFIASNAPSSRGTLIFFVVA*

Homology

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. NCBI nr
Match: KAE8648119.1 (hypothetical protein Csa_004728 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 583.6 bits (1503), Expect = 9.1e-163
Identity = 274/274 (100.00%), Postives = 274/274 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MYKNHVLAIVSFQGVISLRVGSLQCSALSIDSKYAPALSKWTVVILNKLSSNQQLFVHCK 60
           MYKNHVLAIVSFQGVISLRVGSLQCSALSIDSKYAPALSKWTVVILNKLSSNQQLFVHCK
Sbjct: 1   MYKNHVLAIVSFQGVISLRVGSLQCSALSIDSKYAPALSKWTVVILNKLSSNQQLFVHCK 60

Query: 61  SKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPTNLHQTFEVYWREKGEWLRSRC 120
           SKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPTNLHQTFEVYWREKGEWLRSRC
Sbjct: 61  SKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPTNLHQTFEVYWREKGEWLRSRC 120

Query: 121 NFKICMWYARDDGSITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNL 180
           NFKICMWYARDDGSITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNL
Sbjct: 121 NFKICMWYARDDGSITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNL 180

Query: 181 GDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACM 240
           GDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACM
Sbjct: 181 GDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACM 240

Query: 241 WYARDDGFYFFLNTYFIASNAPSSRGTLIFFVVA 275
           WYARDDGFYFFLNTYFIASNAPSSRGTLIFFVVA
Sbjct: 241 WYARDDGFYFFLNTYFIASNAPSSRGTLIFFVVA 274

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. NCBI nr
Match: KAB2636489.1 (hypothetical protein D8674_027023 [Pyrus ussuriensis x Pyrus communis])

HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 1.1e-38
Identity = 83/244 (34.02%), Postives = 123/244 (50.41%), Query Frame = 0


Query: 49  LSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPTNLHQTFEVY 108
           + +++ L  HC+S DD+LG   +  G  + W FREN   +TL+WC +    + H +F+V+
Sbjct: 1   MGASRTLVAHCESLDDDLGIRDISDGNEFNWSFRENLSGSTLYWCDMHN-DHQHASFKVF 60

Query: 109 WREKG-EWLRSRCNFKICMWYARDDG---------------------------------- 168
           W E+   WLR RCN+K C W A+DDG                                  
Sbjct: 61  WPERNHSWLRYRCNYKECFWIAKDDGIYLRVIPESREDGGARRKQAVEDPTRHKTITHST 120

Query: 169 -------SITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVE 228
                  +++  C A   + K+      W V ++N L + + LF HC+SK+D++G+ T+ 
Sbjct: 121 AKQGQTLALSTPCLANFHEDKWELRPERWHVHVVNNLGARKTLFAHCQSKNDDIGNRTIA 180

Query: 229 SGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRE-RGEWLRSRCNFRACMWYARD 250
            G    W FK N   TTL+WC  RT    H  F+V+W E +  WLR RCN++ C W A+D
Sbjct: 181 PGAEITWSFKPNFFGTTLYWCYTRTDHE-HTAFDVYWEESKHNWLRYRCNYKECFWIAKD 240

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. NCBI nr
Match: KAE8646229.1 (hypothetical protein Csa_016318 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.8e-33
Identity = 95/252 (37.70%), Postives = 134/252 (53.17%), Query Frame = 0


Query: 41  WTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGD-HVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPT 100
           W+V I+N L S+  L VHC+SK+D+LG+ H+V+ G  Y+W F+EN + TTLFWC L   +
Sbjct: 24  WSVSIVNGL-SHLDLNVHCQSKNDDLGNHHLVKRGDIYKWNFKENFWGTTLFWCKLE-KS 83

Query: 101 NLHQTFEVYWRE--KGEWLRSRCNFK-ICMWYARDDG----------------------- 160
           + + +FE +W E     WLR RC  +  C+W A+D G                       
Sbjct: 84  DAYVSFETFWPESWSNTWLRDRCGPEGTCIWVAKDGGIYLKNNPANRDEFVHKWWIGKKM 143

Query: 161 -----------SITIQCSAFSMDSKYTPSFS--HWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNL 220
                      + T+   A  + +K         + + + N+L +NQ +  HC+SKDD+L
Sbjct: 144 MMRNVVVLWLMTATLVAEA-QISNKVVIRLPPVRYFIHVANDL-TNQDMSAHCQSKDDDL 203

Query: 221 G-DHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRER-GEWLRSRCNFR- 250
           G  H V  G  ++W FKEN  +TTLFWC L    N + +F+VFW ER   WLR RC  R 
Sbjct: 204 GIQHLVHRGDEFRWNFKENFWKTTLFWCRLE-KSNAYVSFDVFWPERKHHWLRDRCGSRG 263

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. NCBI nr
Match: KAG8486893.1 (hypothetical protein CXB51_020407 [Gossypium anomalum])

HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 4.6e-29
Identity = 83/229 (36.24%), Postives = 115/229 (50.22%), Query Frame = 0


Query: 39  SKWTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTP 98
           +KW V ++N LS+ + L VHCKSKD +LG H + AG  Y WKFR   F  TLFWC L   
Sbjct: 46  NKWQVHVVNDLSNKKTLLVHCKSKDCDLGIHNIVAGTEYNWKFRPRVFGNTLFWCHL-AY 105

Query: 99  TNLHQTFEVYWREKGEWLRSRCNFKICMWYARDDGSITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVA 158
            NLH  F+VYW  + E L  +C++  C W ARDDG                         
Sbjct: 106 DNLHAAFDVYW--ENEALYYKCDYNDCFWIARDDG------------------------I 165

Query: 159 IINELSSNQ---QLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNL 218
            + ++ +N+   Q   +CKSKDD+LG H +  G  + W+F+      TLFWC L    NL
Sbjct: 166 YLKDIRNNRVEHQRHCYCKSKDDDLGIHNLSVGAEFSWKFRPRIFGETLFWCYL-AYDNL 225

Query: 219 HHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACMWYARDDGFYFFLNTYFIASNAPSS 265
           H TFEV   + G +L+     +  + Y  +  F+ F++   I     SS
Sbjct: 226 HATFEV---DNGIFLKDISGNQDEIRYDWNITFFIFVHAIAITPLIASS 243

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. NCBI nr
Match: KAG7014486.1 (S-protein-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 134.4 bits (337), Expect = 1.5e-27
Identity = 82/280 (29.29%), Postives = 124/280 (44.29%), Query Frame = 0


Query: 36  PALSKWTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDH-VVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCT 95
           P +S + + ++N L     + VHCKSKDD+LG H +   G  Y + F+ N +Q+TLFWC 
Sbjct: 32  PRISSYNIHLVNDLQV-LGITVHCKSKDDDLGVHNLPHRGDDYHFSFKINVWQSTLFWCR 91

Query: 96  LRTPTNLHQTFEVYWRE-KGEWLRSRC---NFKICMWYARDDG----------------- 155
           +    N + +FE +W E    WLR+RC   +   C W  +DDG                 
Sbjct: 92  VE-KQNAYISFECFWTEIHHRWLRNRCEDGDVGTCTWKFKDDGIYLRHNSANRDELVPGI 151

Query: 156 --------------------SITIQCSA--------------------FSMDSKYTPSFS 215
                                +T+ C +                    F       P+F 
Sbjct: 152 IYQPKPSRYYVHVVNGLSTLPLTVHCQSKDDDLGIHHLPNRGDDFQWNFKTKGSVFPAFI 211

Query: 216 HWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRT-- 250
            W V + N L+  + + VHC+S+DD+LG HT+     + W F+ N   TTLFWC L+   
Sbjct: 212 RWHVTVTNGLNGAEAMSVHCRSQDDDLGLHTLPPTADFSWSFEANFFHTTLFWCRLQKGG 271

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JLS0 (S-protein homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH1 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 2.1e-16
Identity = 39/102 (38.24%), Postives = 59/102 (57.84%), Query Frame = 0


Query: 150 PSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTL 209
           P  S W V ++N L++ + LF+HCKSK+D+LG+  ++    + W F EN L +T FWC +
Sbjct: 36  PKISEWQVTVVNGLTTGETLFIHCKSKEDDLGEINLKFRNRFSWNFGENMLHSTFFWCYM 95

Query: 210 RTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACMWYARDDGFYFF 252
               N H    VFW +    L  RC ++ C+W A+ DG Y +
Sbjct: 96  -NKDNGHMNVNVFWDD--VILFHRCGWKNCIWTAKTDGLYLW 134

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2HQ46 (S-protein homolog 74 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH74 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 4.6e-16
Identity = 39/102 (38.24%), Postives = 63/102 (61.76%), Query Frame = 0


Query: 150 PSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTL 209
           P  S W V + N L++ + LF+HCKSK+++LGD  ++    + W F EN L +TLFWC +
Sbjct: 36  PKISEWQVTVANGLTTGETLFIHCKSKENDLGDINLKFLDRFSWNFGENMLHSTLFWCYM 95

Query: 210 RTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACMWYARDDGFYFF 252
            +  + H   +VFW +    L  RC+++ C+W A++DG Y +
Sbjct: 96  -SKDDGHMNVKVFWDD--VILFHRCDWKNCVWTAKNDGLYLW 134

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JLQ5 (S-protein homolog 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH2 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 2.2e-10
Identity = 33/95 (34.74%), Postives = 52/95 (54.74%), Query Frame = 0


Query: 39  SKWTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTP 98
           SK TV I N L +   L  HCKSKDD+LG+  ++ G+S+ + F    F  TL++C+   P
Sbjct: 46  SKRTVEINNDLGNQLTLLYHCKSKDDDLGNRTLQPGESWSFSFGRQFFGRTLYFCSFSWP 105

Query: 99  TNLHQTFEVYWREKGEWLRSRCNFKICMWYARDDG 134
              H +F++Y   +     ++C    C+W  R +G
Sbjct: 106 NESH-SFDIYKDHRDSGGDNKCESDRCVWKIRRNG 139

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DN93 (S-protein homolog 29 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH29 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 1.4e-09
Identity = 31/86 (36.05%), Postives = 51/86 (59.30%), Query Frame = 0


Query: 39  SKWTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTP 98
           +K  V + N +S    L + C+SKDD+LG+H++  GQ++ WKFR + F+TTLF C     
Sbjct: 29  AKTVVTVTNNISPQTTLTISCRSKDDDLGEHLLLHGQAFLWKFRPSWFRTTLFTCKFLWN 88

Query: 99  TNLHQTFEVYWREKGEWLRSRCNFKI 125
            N+ + F+ Y  ++ +     CN+ I
Sbjct: 89  NNV-KWFDTYRSDRDQGHCYSCNWSI 113

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23020 (S-protein homolog 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH5 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 3.2e-09
Identity = 30/89 (33.71%), Postives = 53/89 (59.55%), Query Frame = 0


Query: 36  PALSKWTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTL 95
           P   + TVV +  L     L +HCKSK D+LG HVV   Q Y +KF+ N +++TLF+C+ 
Sbjct: 23  PPFWRATVVTMTNLIGGPPLTIHCKSKQDDLGIHVVPFKQEYHFKFQPNLWKSTLFFCSF 82

Query: 96  RTPTNLHQTFEVYWREKGEWLRSRCNFKI 125
           +  +   ++F++Y  ++ + +   C ++I
Sbjct: 83  QWDSQF-KSFDIYDAQRDQGICDDCQWEI 110

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5I9W3 (S-protein homolog OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=D8674_027023 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 5.2e-39
Identity = 83/244 (34.02%), Postives = 123/244 (50.41%), Query Frame = 0


Query: 49  LSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPTNLHQTFEVY 108
           + +++ L  HC+S DD+LG   +  G  + W FREN   +TL+WC +    + H +F+V+
Sbjct: 1   MGASRTLVAHCESLDDDLGIRDISDGNEFNWSFRENLSGSTLYWCDMHN-DHQHASFKVF 60

Query: 109 WREKG-EWLRSRCNFKICMWYARDDG---------------------------------- 168
           W E+   WLR RCN+K C W A+DDG                                  
Sbjct: 61  WPERNHSWLRYRCNYKECFWIAKDDGIYLRVIPESREDGGARRKQAVEDPTRHKTITHST 120

Query: 169 -------SITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVE 228
                  +++  C A   + K+      W V ++N L + + LF HC+SK+D++G+ T+ 
Sbjct: 121 AKQGQTLALSTPCLANFHEDKWELRPERWHVHVVNNLGARKTLFAHCQSKNDDIGNRTIA 180

Query: 229 SGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRE-RGEWLRSRCNFRACMWYARD 250
            G    W FK N   TTL+WC  RT    H  F+V+W E +  WLR RCN++ C W A+D
Sbjct: 181 PGAEITWSFKPNFFGTTLYWCYTRTDHE-HTAFDVYWEESKHNWLRYRCNYKECFWIAKD 240

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5GYD4 (S-protein homolog OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=D8674_043062 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 132.9 bits (333), Expect = 2.1e-27
Identity = 69/233 (29.61%), Postives = 112/233 (48.07%), Query Frame = 0


Query: 49  LSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPTNLHQTFEVY 108
           + +++ L  HC+S DD+LG   + AG  + W FRE    +TL+WC +    + H +F+V+
Sbjct: 1   MGASRTLVAHCESLDDDLGIRDISAGNEFNWSFREKLSGSTLYWCDMHN-DHQHASFKVF 60

Query: 109 WREKG-EWLRSRCNFKICMWYARDDGSITIQCSAFSMDSKYTPSF------------SH- 168
           W E     LR RCN K C W  +D+  +   C+  S   K+ P +            SH 
Sbjct: 61  WSESNHSCLRYRCNHKECFWIVKDE--VAKHCNTMSTAFKFKPHYVVLLMFAALLALSHP 120

Query: 169 ------------------WTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQFK 228
                             +T+ ++N++ +++ L  HC+S DD+LG   +  G  + W F+
Sbjct: 121 CSGNPTNQTNDRGFPLLKYTLHVVNQMGASRTLVAHCESLDDDLGIRDISDGTEFNWSFR 180

Query: 229 ENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACMWYARDDGFY 250
           EN   +TL+WC +    + H +F+V            CN++ C W A DDG Y
Sbjct: 181 ENLSGSTLYWCDMHN-DHQHASFKV------------CNYKECFWIAIDDGIY 217

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DEX4 (S-protein homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020182 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 132.1 bits (331), Expect = 3.5e-27
Identity = 60/137 (43.80%), Postives = 89/137 (64.96%), Query Frame = 0


Query: 135 ITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQ 194
           + + CS  ++ +   P+   WTV I+NELS+ Q+LFVHCKSKDD+LG+H ++SG  Y + 
Sbjct: 17  VLLGCSTVALATWPMPT---WTVDIVNELSNGQELFVHCKSKDDDLGEHNLDSGAQYGFT 76

Query: 195 FKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRE--RGEWLRSRCNFRACMWYARDDGFYFFL 254
           FK+N  +TTLFWC LR P N H  F+V+W +  +G WL +RC+++ C+W A+ DG Y   
Sbjct: 77  FKDNVWQTTLFWCYLRKPDNSHAAFDVYWYDISKGHWLYTRCDYKNCIWIAKADGIYI-- 136

Query: 255 NTYFIASNAPSSRGTLI 270
                  N PS++  L+
Sbjct: 137 ------KNIPSNQDELV 142

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1Q3B8K9 (S-protein homolog (Fragment) OS=Cephalotus follicularis OX=3775 GN=CFOL_v3_07702 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 6.0e-27
Identity = 76/193 (39.38%), Postives = 103/193 (53.37%), Query Frame = 0


Query: 57  VHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWC--TLRTPTNLHQTFEVYWREKGE 116
           +HCKSKDD+LG HV+ +GQSYEW FR N F TTLF+C  T +    ++  F+V      +
Sbjct: 4   IHCKSKDDDLGIHVIPSGQSYEWGFRVNFFGTTLFFCGFTTKKGRGVYDIFDV------D 63

Query: 117 WLRSRCNFKICMWYARDDGSITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCK 176
               RC    C+W  RDDG +                     V I N + SN  + +HCK
Sbjct: 64  RDIRRCPGSTCIWGVRDDGPL-----------------GKARVLITNNMPSN--VTIHCK 123

Query: 177 SKDDNLGDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRC 236
           SKDD+LG H + + Q+Y+W F+ N  ETTLF+C   T K     +++F   R E    RC
Sbjct: 124 SKDDDLGIHVIPTTQSYEWGFRVNFWETTLFFCGFTTKKG-GGVYDIFNAMRDE---HRC 167

Query: 237 NFRACMWYARDDG 248
               C+W+ RDDG
Sbjct: 184 VDGTCIWHVRDDG 167

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQ33 (S-protein homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013534 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 129.0 bits (323), Expect = 3.0e-26
Identity = 57/117 (48.72%), Postives = 79/117 (67.52%), Query Frame = 0


Query: 135 ITIQCSAFSMDSKYTPSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQ 194
           + + CS  ++ S   PS+  W V I+NEL+S Q LFVHC+SKDD+LG+H +  G  Y + 
Sbjct: 17  VLLHCS--TLASSAWPSWPTWHVNIVNELNSEQTLFVHCQSKDDDLGEHNISVGTQYSFA 76

Query: 195 FKENALETTLFWCTLRTPKNLHHTFEVFWRERGE--WLRSRCNFRACMWYARDDGFY 250
           FK+N   TTLFWC LR P N H  F+V+W + G+  WL +RCN++ C+W A+DDG Y
Sbjct: 77  FKDNIWGTTLFWCYLRKPNNSHADFDVYWVDNGKGYWLYTRCNWKTCIWIAKDDGIY 131

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. TAIR 10
Match: AT4G16295.1 (S-protein homologue 1 )

HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 1.5e-17
Identity = 39/102 (38.24%), Postives = 59/102 (57.84%), Query Frame = 0


Query: 150 PSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTL 209
           P  S W V ++N L++ + LF+HCKSK+D+LG+  ++    + W F EN L +T FWC +
Sbjct: 36  PKISEWQVTVVNGLTTGETLFIHCKSKEDDLGEINLKFRNRFSWNFGENMLHSTFFWCYM 95

Query: 210 RTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACMWYARDDGFYFF 252
               N H    VFW +    L  RC ++ C+W A+ DG Y +
Sbjct: 96  -NKDNGHMNVNVFWDD--VILFHRCGWKNCIWTAKTDGLYLW 134

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. TAIR 10
Match: AT4G29035.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 3.3e-17
Identity = 39/102 (38.24%), Postives = 63/102 (61.76%), Query Frame = 0


Query: 150 PSFSHWTVAIINELSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHTVESGQTYQWQFKENALETTLFWCTL 209
           P  S W V + N L++ + LF+HCKSK+++LGD  ++    + W F EN L +TLFWC +
Sbjct: 36  PKISEWQVTVANGLTTGETLFIHCKSKENDLGDINLKFLDRFSWNFGENMLHSTLFWCYM 95

Query: 210 RTPKNLHHTFEVFWRERGEWLRSRCNFRACMWYARDDGFYFF 252
            +  + H   +VFW +    L  RC+++ C+W A++DG Y +
Sbjct: 96  -SKDDGHMNVKVFWDD--VILFHRCDWKNCVWTAKNDGLYLW 134

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. TAIR 10
Match: AT5G04350.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 2.4e-12
Identity = 37/93 (39.78%), Postives = 54/93 (58.06%), Query Frame = 0


Query: 43  VVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTPTNL- 102
           VV+ N+L  ++ L VHC+SKDD+LG+H+++ GQ YE+ F +N +QTT F C +    N  
Sbjct: 29  VVLSNQLEHSKLLKVHCRSKDDDLGEHILKIGQDYEFTFGDNIWQTTSFSCQMDQGPNFK 88

Query: 103 -HQTFEVYWREKGEWLRSRCNFKICMWYARDDG 134
            H  F  Y   +  W  S+     C W  R+DG
Sbjct: 89  HHLDFVAY---ETSW--SKALEASCKWIGREDG 116

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. TAIR 10
Match: AT4G16195.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 1.6e-11
Identity = 33/95 (34.74%), Postives = 52/95 (54.74%), Query Frame = 0


Query: 39  SKWTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENAFQTTLFWCTLRTP 98
           SK TV I N L +   L  HCKSKDD+LG+  ++ G+S+ + F    F  TL++C+   P
Sbjct: 46  SKRTVEINNDLGNQLTLLYHCKSKDDDLGNRTLQPGESWSFSFGRQFFGRTLYFCSFSWP 105

Query: 99  TNLHQTFEVYWREKGEWLRSRCNFKICMWYARDDG 134
              H +F++Y   +     ++C    C+W  R +G
Sbjct: 106 NESH-SFDIYKDHRDSGGDNKCESDRCVWKIRRNG 139

[Close]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. TAIR 10
Match: AT1G26798.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family )

HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 2.1e-11
Identity = 33/109 (30.28%), Postives = 65/109 (59.63%), Query Frame = 0


Query: 26  SALSIDSKYAPALSKWTVVILNKLSSNQQLFVHCKSKDDNLGDHVVEAGQSYEWKFRENA 85
           +++ +D  +AP      V+I+N L+ +++L VHC++K  +LG H +E  +  +++FR N 
Sbjct: 30  TSVDVDLPFAPK----HVIIINTLNPHERLVVHCRNKGKDLGVHALEPQEQIDFRFRVNL 89

Query: 86  FQTTLFWCTLRTPTNLHQTFEVYWREKGEWLRSRCNF-KICMWYARDDG 134
            +TT + CT   P N  +TF+++  ++ +  +S C   + C+WY  + G
Sbjct: 90  RRTTTYTCTFSWPGNA-KTFDIFRVDRDDNSKSTCGICRECIWYICETG 133

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAE8648119.1	9.1e-163	100.00	hypothetical protein Csa_004728 [Cucumis sativus]	[more]
KAB2636489.1	1.1e-38	34.02	hypothetical protein D8674_027023 [Pyrus ussuriensis x Pyrus communis]	[more]
KAE8646229.1	1.8e-33	37.70	hypothetical protein Csa_016318 [Cucumis sativus]	[more]
KAG8486893.1	4.6e-29	36.24	hypothetical protein CXB51_020407 [Gossypium anomalum]	[more]
KAG7014486.1	1.5e-27	29.29	S-protein-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]	[more]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
F4JLS0	2.1e-16	38.24	S-protein homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH1 PE=2 SV=1	[more]
Q2HQ46	4.6e-16	38.24	S-protein homolog 74 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH74 PE=2 SV=1	[more]
F4JLQ5	2.2e-10	34.74	S-protein homolog 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH2 PE=3 SV=1	[more]
P0DN93	1.4e-09	36.05	S-protein homolog 29 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH29 PE=3 SV=1	[more]
O23020	3.2e-09	33.71	S-protein homolog 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH5 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5N5I9W3	5.2e-39	34.02	S-protein homolog OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=D8674_0270...	[more]
A0A5N5GYD4	2.1e-27	29.61	S-protein homolog OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=D8674_0430...	[more]
A0A6J1DEX4	3.5e-27	43.80	S-protein homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020182 PE=3 SV=1	[more]
A0A1Q3B8K9	6.0e-27	39.38	S-protein homolog (Fragment) OS=Cephalotus follicularis OX=3775 GN=CFOL_v3_07702...	[more]
A0A6J1CQ33	3.0e-26	48.72	S-protein homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013534 PE=3 SV=1	[more]

BLAST of CsaV3_5G013340 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT4G16295.1	1.5e-17	38.24	S-protein homologue 1	[more]
AT4G29035.1	3.3e-17	38.24	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]
AT5G04350.1	2.4e-12	39.78	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]
AT4G16195.1	1.6e-11	34.74	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]
AT1G26798.1	2.1e-11	30.28	Plant self-incompatibility protein S1 family	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR010264	Plant self-incompatibility S1	PFAM	PF05938	Self-incomp_S1	coord: 156..253 e-value: 6.6E-27 score: 94.1 coord: 42..136 e-value: 2.9E-24 score: 85.6
IPR010264	Plant self-incompatibility S1	PANTHER	PTHR31232	FAMILY NOT NAMED	coord: 35..133 coord: 149..250
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31232:SF34	PUTATIVE-RELATED	coord: 35..133 coord: 149..250

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CsaV3_5G013340.1	CsaV3_5G013340.1	mRNA