Cmc04g0091631 (gene) Melon (Charmono) v1.1

Overview
NameCmc04g0091631
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCMiso1.1chr04: 3504751 .. 3511668 (-)
RNA-Seq ExpressionCmc04g0091631
SyntenyCmc04g0091631
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TCAAGTATTTTGTGCTTCTCAATCAACCCCTTTTAATTTATTGCCACTTTCTCATTACTTAAACTCCCTTCCTCTCTTTCCCGCCCTTTTCTAAGAGATGAGTTTTTCTCTTTGTGGATCTCAAAGGATGGTAGGGAAGGATGAGGAGGTAGCTCAGCAGTTTCACGCCATCATGCTTATGGATTATCATCAATGGGAACGTCAAGATTCTCATCCCAAACGTGAAAGGTAAATCTTATGTAATGTCATTTAATACCGCAAGAGTCACATCGTGTTCGCAAATTTGGTCGTTCTCAACTTCTGGTTAGTTGTTCATTTTGCCTCTCTGAATTTCGAGGCAGGAATTGCAAGAAAATGTACTTTCAGTTTTTCCTAACTGGTTTCGACTGCTTTAGTATTTCTTCACTCGTTTGCTGGGGCAGAACGGTACAAATAATGGGACAATGAATCTAGAAGTTAGTGATTTAATGGAAGGGGATAGAATAAGAGAACTCGGGAATAGATTCTTGAAAATCATTAGATTACTCGATCATCTTAAATCTATTCGTGTATATAGAGGATTATTTATGAACGGAATTAGAGTATTAGGGGCTGATTTTTATGCTATTAGAGGAATTTTCATTGCCAATGGAGAAAACGTTCGGAGGATGCCGTCACTATTTTGATATTAAGAATGGTTTTAGTTCAGAGCAAGGAGATAAGCTTTGAAAAACCTCCTTGATCACAATTGAGATGCTTTAGCTGCTAATATAGAGATGCTTTAACTCTTAAACTACATAATTGTCAATTGATATGAAAACTAAACCTGGGCAAGGAGAAAAATTCACTAAAATGGAAGATTCAAGTCCCGTATCCCTATCATGTTATTATACCCCGGGTAAGTGCCACATTATCAGTGAAGTTGAAATTCATTTGTTAGTTGTTACTATGTCCATTTGCTTGTATATCTCTTCGACTCACAATCACTATTAGCCAAAAATGGGAGTCTTAGATACAGTCTTGTTTAAGATCAATTTATCACTCAGCCCCATCTGCTCTTCCACCATACTTTCTTCGTTTCTCCTGAATCCTAATGTTTCTATTCAGTGTCTTTAGCCCTCAATTTAGTTTTGATGATTTCTTTTAAAGATGAAGGGTGTTCAATCAGGTTAGACATCTAAAACACCAACTACGTTTATTCAGAAAGTACCATAGTCCAAACTGAAACAGATGACTAGAGAATTACAACTTTTGACCTTGCAATGTGTTCACTGTTTTATAAGTAATCTTATGGCTCACTACTCTCACTAGTGACGACAAATGGACTTCGGACTCGATGTTTTCCATTGGTCCAAGTGATTGAACCAAAGACTCTTTCCTTCAGTGTGGATGCAGTTGGGGTGAAAACCACTTGATAACTCTGCTTCTCATTGTTCTTTGCAAATTTCAATTTCTCTGGAATCACTTTGACCTCTACTTCCTCAGGTGCGTCTACACTGACTGTGTAAACTGTTTCACCATTGCCACCAACATTTGTAACTGTTCTGATTACTTTCTTACTTTCCTTGCCTTTCAATTCTGATACTGCTATTGTTGGGTAGTTCATGTTGGATATGTAGTCTGTAGTTGAATTCTTGGGGCAATCAAATCCATCAGGAACAGTAGTTGTGATGCTTTTAATGGTGGTTAGATTATAACCTCGGCCGCAAAGGTATAGTAAGTAGTCTGTTGTACTAGTTTCATAGACTAGTCCTGGTTGTAATGCTCCATTGGTTGATATTTCTCCTGCCCCATAATCATAAGGTGTGGCTACTGATCCCGTATCCAAAGTCATAGGCGATCCCAAGTTATTCGTTTGGATTGCTGTAAATTTTTTTGAGAAAGAATTGGTCATTAGTAAACATGTTCAGGTCAACAAGAAAAGGAAAGAAGAATTTTTTTTCTTCCATTCTAAGGTTAATATTCCTTGCCTGTTGTCATGATGGCTGATTTGATTGCTGAGGGACTCCATGTGGGGTTTTGAGATTTTACAGAGGCCACTACGCCAGAGACATGGGGGCAGGACATTGAAGTTCCTGAGATCACATTGAAGAGTGGTGACTTTGTTGCTTGTGGAGTTGAACTTGAATCATTTCCAAGCCAGGCTGCAAGAATGTTCACTCCTGGTGCTGATATGTCCGGCTGCATCACAATAACTCTCAAATTCAGGCGTGGAACAATAATTTTTCTTCATGAAGGTTAAAATTTTCAAGTTAAAATATAATAATCTTTCCCCTCGTCCTTCCTGTAGAAGCTGCCTTTTACCTTAATTATGTTTAATACTGCGGGATTAGGCCCTCTGGATGAAAAATATGTTATAGCAGGTGCTGGCTTATAGTTTATTATGGTCTCAGTGGGGAGAATTGTAGCAACTGGTTTCCTTCAGAAAATTTCAAACTCAATTAGCCATTTGAGATCGTGAAGTTCAAGCTAGTAAAGAAGATATGGAATTGAAGCTCACTTCACATCCGAGCTTTCTATCTAGATTGATTAAACAGAGGATAATTTTAACTTTTACCTGCTTGAGTTAACATAGGAGAGGATCTCAGGACCGTCCTTTTTGCTAATAACTGTCATGGGAGTAGTAAACTTCTCTGCAACTAATTTTGAGTCGTCATCAATTAAAACTACCCCAACCCCTCCAAGACTCTTCACTGTTTCCGCCTGACTTTGCCAATCCGAACCACCTCCTTCGACACTGCTTTCGCAAATAACTATCTTTCCCTTCACTTGAGCTTCATCCATGGAATCTTCAGAACAAATCCTAATTTAATTAAATTGAGAAGTAACAGTTAGCGTAAATACTTTAAATCTAAGTCTTCCTCACCAAGACTCTGAAGGCGATAAATTATTAATTCACATAGATAGCACACTTTAATATGTATTTATTAAATACATCTGACAATAACAACTGGAGAACTCATCAGAAAGCTTTGCAAGAAATCTTAATAAATTACTCAGCATGTCATTTCTTATATACCTTGCACTGTCTTCACTGGCACTCGCTTTCTTGGCTGACTTGCCTTGTATTAGAGGGTATACAGGGGACTTTTGAAGATCAGAGAAATTTATACCTTCGCCCTGCATTATAATTTTTTTTATTTGAAATAATTTATTGTGGTTTTAGCTGTTTTCATTGCAGTTGCCAAAGGATTCCGAATTACCTTGATCACTTTTTTGTTGCCCAACACAACATCAGACTCAAAATCCCTATCAATGGTGGAGGCAGCCACTGTTAGAATCCACGGCGCGTCGTTCACCACCGTTCCCGAACTGGGACCGTCGTTTCCGGCGGAGCAGACAACTGTAATGCCCTTCTCAACCGCATGAAAGGCTCCGATGGCAATAGGGTCTGCCGTCAGATCTGGTCGCAAGAAGGAGGGTGAACCGAGAGATAAGGACAATACATCGACCCCATCGGCGATGGAATCATCAAACGCCTTCAGGATCGACGACCCACGACAGCCGTCGGCCATGCAGACTCTGTACATGGCGATCCTTGAGCGGGGGGAGCCGCCCTTGGCCGTCCCGGCTGCGAGGCCATAGTAGGATGCATTAGCCACGGCGCTTCCGGCCGCCGTTGATGCCACGTGGGTGCCATGTCCAGCTCCGTCTCGAGGTGAGTGGTACCGTATGCCGTCACTCTCAGAACTTTCGTAAAATCTTGCTCCAATGATTTTTCTGGCACGACAAACATGTCAAACTCACACACAATATGGTTCGATGCTTTAATTTTAATCTCCATGCATGTGTTTTTTACGGCACACTTCTTCAATTTTTTTAATAAAGCATATATTAATTCAATTTTTTAATTTTTTATATTTAAATTATATCCTATAGTCACTGAATTACATAATAGTCAATTGCTATCTTATTGACAAAAATTTCATGAAATAATTAAGACACTTCAAAAAGAAAAGTTAAAACTGAGTTAAACTATGAATTTAGGGCCAATTGTTAATTTTAAAGGGTTTAAAAACAATTTTTTAACTGAAGAGAGTAGATTTTGAGCATTAAAAACTAAAAAATTAATTGAAAAAATAAACCATTCTTGAGCCTGAGATTAATTCTTAAACTTTTATAATTACAAGATTAGTCTTTAAACTATGATATATATTTTTTAAAAATTCATAAATGTATTGGTTTAGATTTATATTCAATAAATCAAATAATTTTCAGAACTACCGTAACAAAATAAAGTTCATAGGTTTATAATTACACAAAATTAAGTTCATAAATTAAAAAAAAAAACACACACACACACACACAAGACATAGTAAATAAAACAAAACTCACTTTCATAGAGAGTATGTTCGTAATTTAAACAATAATCATAGTTTAAAAACACCAAACTAAATATCACAATTTAAAAACACTGAACTTTAAGCTTTGTAGTAAACGAGAGTGTCAGTTGTGGTGGACACACACACTCACCTATTACAGTTGGAGGAAGTGAAGTCATCGCCTACCATGCAGGTACCTTTCCACCTCGAAGGTATTGGACCCATACCCTTGTCATTAAAACTCTCCGATTCCGGCCAGATACCTGATTTTACCGGTGACTGTTAGAACTAACTTCTTATATATTGTTATTAGTGCAGACTGCAGAGCAAAGAATAATTAATGTTTAATATATATAATTACCAGTATCCAAGATTCCTATAATGGTATCGTACGGTTGAGAGGAAGAGGTTGGGGAATCTGATTTGGGATTGGCGTCGACTTTGACGCTTGTCTGACTGACCAAGAAATCCCATGAATGAGTTGTGTGTAACTTCAATATTGGATCAGGAAAAACCGAAACAACTCCAGGGCTTTGTCTCATGGCTTGGGCTTCATGTTCTGATAGACGAGCTGCAAATCCTGTGAACCCATGTTTATATGTGTGCACCAGTACGTTCCTACGTTCAACAAAATAATATGTGAGTTTTTAATTTCTCTCGGCCTTTTCAATCTCTATAGTCTTACATAGGTTTTCATTTTCACACGTCCAGATAATTTTACAAGTATCTAAGCTGGAGAGATGCGGGTTAGATCATATATTCTTTTATTGTAAATTGATTTTGAAATGAAATTATTATTATTTAATATTTATATAGATTTTATTGTGTGTCTAGTAAATTTATAATTTTTTATTAAGAAATTCTTAGATAATTGATAATCTAATAACTTATTATGTAGTTAATTATAATTTTAAGGCTCTGTTTTATAACTATATAGGCTCATAAGTGAAATCTTAAGAATTAGTAAGGCAAGGTTTGATAACCATGTAGGCTCACGATCGAGAATTTAACAACTTATTGTTAGAAATTAACAAGTTAGATACATTATCTATATAAAGAGTTCATTTCTTTTATATGTAAGCAAGTAAGAAAAAAATCAAATCAATGAAAGCAAATTGAAGTTTATTAAGAAAGTGAATTTCAAGAGAACAATATTCATATTCTCTCTCGTGTGTTCTTAAGTTTTGTAAGAAAACAAGTTTCTTCTCTTTCAACACTTGTTATGCAATTGTAATTAAGATTTTGTTTAGTAACTATTTGGGCTTTCTTTAATGATTATGTTTTTTAAAATTAACCCTACAAATTTCACCTCCATTCATTATTGGTTTCTAAGTTTTGTAGGCTACATTTTAAGATTAAGTCAAATTTTAATTAAAAAATTAGTATTTATCATTATTTTGTTTTTAAATTCAACTAACAACTCTTTTAAATATGCAAATTATGGTAAGAAAGAATGAGAAAATAATTGTAATTTTCAATAGCCAAAAACACCGAAATAGTTACAAAATATAATTGTATTAGTTTTATAAAATTAAGCCTGTAAACATCATTTTCACCTTTAAACTCCTTATTTTGTTATCTACTCTGTGCAAACCTCTAAAAAAAAGTAAATAAAGTTTTTTTTAAAGAAAATTGAACTTAGAATTCAATCTTTTACTTTAGAAAAAAAGATGAAAATTAATGAATTAAATTGAGAGGAAATATGCCCATTAGCGTAAGAAATTGAGATATATTATAATGCTACCGTCTGTTGACAGAGTTAAGAAGGCGAAGGAAGTCAATCCTGGAGCCAGAAGCGGATCCCATGTAAACGATATAAACACCATTTTTTGCATCTTCTGCAGCATCAGCTACTTCAACATTTTCAGAAACAAGACAAAAGGTGACACAAACCAAAGCTAAAAAAACACAAAAAGAAATGCTTTGCATGGCTTATTGGCTTGGCGTAATTGGCTTCTGTATTGATCTAATTGAGCAAGTTCCCTTCGACTTCAAGCGCTAATTTATATGTTTTTACAGATGAAAACTGGTGGTGAAGAAAGAATGTGGAAAAATTCAATGAGAGATTATCAGTTGGTGGGTTTCATGATCAGAGCACGCGCACTGCCAAAATGTCAAGCTTTTCCCTTATCCACATGTAGTGCGCCATGGTAATTCAAATGGTGGCTTACTGAACAACAGTGGCCATGGTGGAGATTTTGGAGATCATCACATAACTGGTAAGATTGTCCCTTTTTATATATAGATATGCATATAAGATTCAATCAACCCCATACCTAGCTAGCTGATTGATATGGTTGTTTTTATTTGGTAACAACCCACATGACATTTTCATGGGTGATGGGTGGGTTTAATTAATTTCTCTTATTCTTCTTCATCAATCCTATCAAGTTTAGTTCACTGTTAGCTGTGTTAAGAATTTTATTTGCTTGTTTTATGGATTCATGCTGGGTTTATGTTCTTAAATAATGGAGATTTAGAATGTGGGAAATGGGATATACGTCAAGTTTTCTCATTTTTAGAATGTTACGTCCTTAACTAGCTGAGGTCGAAGCTCTATTAATTATTTTCAAATTAGCCACAATAGATAAGCTTAGAGTGTGTATTTTAATTCAAC

mRNA sequence

TCAAGTATTTTGTGCTTCTCAATCAACCCCTTTTAATTTATTGCCACTTTCTCATTACTTAAACTCCCTTCCTCTCTTTCCCGCCCTTTTCTAAGAGATGAGTTTTTCTCTTTGTGGATCTCAAAGGATGGTAGGGAAGGATGAGGAGGTAGCTCAGCAGTTTCACGCCATCATGCTTATGGATTATCATCAATGGGAACGTCAAGATTCTCATCCCAAACGTGAAAGTTGCCAAAGGATTCCGAATTACCTTGATCACTTTTTTGTTGCCCAACACAACATCAGACTCAAAATCCCTATCAATGGTGGAGGCAGCCACTGTTAGAATCCACGGCGCGTCGTTCACCACCGTTCCCGAACTGGGACCGTCGTTTCCGGCGGAGCAGACAACTGTAATGCCCTTCTCAACCGCATGAAAGGCTCCGATGGCAATAGGGTCTGCCGTCAGATCTGGTCGCAAGAAGGAGGGTGAACCGAGAGATAAGGACAATACATCGACCCCATCGGCGATGGAATCATCAAACGCCTTCAGGATCGACGACCCACGACAGCCGTCGGCCATGCAGACTCTGTACATGGCGATCCTTGAGCGGGGGGAGCCGCCCTTGGCCGTCCCGGCTGCGAGGCCATAGTAGGATGCATTAGCCACGGCGCTTCCGGCCGCCGTTGATGCCACGTGGGTGCCATGTCCAGCTCCGTCTCGAGTAAACGAGAGTGTCAGTTGTGGTGGACACACACACTCACCTATTACAGTTGGAGGAAGTGAAGTCATCGCCTACCATGCAGGTACCTTTCCACCTCGAAGGTATTGGACCCATACCCTTGTCATTAAAACTCTCCGATTCCGGCCAGATACCTGATTTTACCGGTGACTGTTAGAACTAACTTCTTATATATTGTTATTAGTGCAGACTGCAGAGCAAAGAATAATTAATGTTTAATATATATAATTACCAGTATCCAAGATTCCTATAATGGTATCGTACGGTTGAGAGGAAGAGGTTGGGGAATCTGATTTGGGATTGGCGTCGACTTTGACGCTTGTCTGACTGACCAAGAAATCCCATGAATGAGTTGTGTGTAACTTCAATATTGGATCAGGAAAAACCGAAACAACTCCAGGGCTTTGTCTCATGGCTTGGGCTTCATGTTCTGATAGACGAGCTGCAAATCCTGTGAACCCATGTTTATATGTGTGCACCAGTACGTTCCTACGTTCAACAAAATAATATAGTTAAGAAGGCGAAGGAAGTCAATCCTGGAGCCAGAAGCGGATCCCATGTAAACGATATAAACACCATTTTTTGCATCTTCTGCAGCATCAGCTACTTCAACATTTTCAGAAACAAGACAAAAGATGAAAACTGGTGGTGAAGAAAGAATGTGGAAAAATTCAATGAGAGATTATCAGTTGGTGGGTTTCATGATCAGAGCACGCGCACTGCCAAAATGTCAAGCTTTTCCCTTATCCACATGTAGTGCGCCATGGTAATTCAAATGGTGGCTTACTGAACAACAGTGGCCATGGTGGAGATTTTGGAGATCATCACATAACTGGTAAGATTGTCCCTTTTTATATATAGATATGCATATAAGATTCAATCAACCCCATACCTAGCTAGCTGATTGATATGGTTGTTTTTATTTGGTAACAACCCACATGACATTTTCATGGGTGATGGGTGGGTTTAATTAATTTCTCTTATTCTTCTTCATCAATCCTATCAAGTTTAGTTCACTGTTAGCTGTGTTAAGAATTTTATTTGCTTGTTTTATGGATTCATGCTGGGTTTATGTTCTTAAATAATGGAGATTTAGAATGTGGGAAATGGGATATACGTCAAGTTTTCTCATTTTTAGAATGTTACGTCCTTAACTAGCTGAGGTCGAAGCTCTATTAATTATTTTCAAATTAGCCACAATAGATAAGCTTAGAGTGTGTATTTTAATTCAAC

Coding sequence (CDS)

ATGAGTTTTTCTCTTTGTGGATCTCAAAGGATGGTAGGGAAGGATGAGGAGGTAGCTCAGCAGTTTCACGCCATCATGCTTATGGATTATCATCAATGGGAACGTCAAGATTCTCATCCCAAACGTGAAAGTTGCCAAAGGATTCCGAATTACCTTGATCACTTTTTTGTTGCCCAACACAACATCAGACTCAAAATCCCTATCAATGGTGGAGGCAGCCACTGTTAG

Protein sequence

MSFSLCGSQRMVGKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRESCQRIPNYLDHFFVAQHNIRLKIPINGGGSHC
Homology
[Close]
BLAST of Cmc04g0091631 vs. NCBI nr
Match: KAA0063304.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold205G001270 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 2.9e-10
Identity = 34/39 (87.18%), Postives = 38/39 (97.44%), Query Frame = 0 

Query: 11 MVGKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRE-SCQRI 49
          MVGKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRE +C+++
Sbjct: 1  MVGKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRERNCKKM 39

[Close]
BLAST of Cmc04g0091631 vs. NCBI nr
Match: KAE8651348.1 (hypothetical protein Csa_002480 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 6.0e-08
Identity = 28/33 (84.85%), Postives = 30/33 (90.91%), Query Frame = 0 

Query: 13 GKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRESC 46
          G+D+EVAQQFH I LMDYHQWE QDSHPKRESC
Sbjct: 56 GRDQEVAQQFHVIKLMDYHQWEPQDSHPKRESC 88

[Close]
BLAST of Cmc04g0091631 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V7W6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold205G001270 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 1.4e-10
Identity = 34/39 (87.18%), Postives = 38/39 (97.44%), Query Frame = 0 

Query: 11 MVGKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRE-SCQRI 49
          MVGKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRE +C+++
Sbjct: 1  MVGKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRERNCKKM 39

[Close]
BLAST of Cmc04g0091631 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LDL6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G873790 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.2e-06
Identity = 26/31 (83.87%), Postives = 28/31 (90.32%), Query Frame = 0 

Query: 13 GKDEEVAQQFHAIMLMDYHQWERQDSHPKRE 44
          G+D+EVAQQFH I LMDYHQWE QDSHPKRE
Sbjct: 56 GRDQEVAQQFHVIKLMDYHQWEPQDSHPKRE 86

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cmc04g0091631 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0063304.12.9e-1087.18hypothetical protein E6C27_scaffold205G001270 [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAE8651348.16.0e-0884.85hypothetical protein Csa_002480 [Cucumis sativus][more]
BLAST of Cmc04g0091631 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc04g0091631 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7V7W61.4e-1087.18Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold... [more]
A0A0A0LDL61.2e-0683.87Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G873790 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Cmc04g0091631 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cmc04g0091631.1Cmc04g0091631.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016020 membrane