MELO3C029330 (gene) Melon (DHL92) v4

Overview
NameMELO3C029330
Typegene
OrganismCucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionTranslation machinery-associated protein 22
Locationchr02: 2081786 .. 2086218 (-)
RNA-Seq ExpressionMELO3C029330
SyntenyMELO3C029330
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTTGATAAGGGGTCTAACACTTTTTTTCTTTTTTGCGCTTTGTGCTTAGGCCCCAGGAGACTATTGAACTTTATTGCACCTTGAGTGAGCGAGTTTATGTATGATTAATTGATCCTAAAATATATTTTTTTGAAGTTAGTCAAATTTCTTTCATCTCAAAGACACTGCTGCAAGTAATCCCATAGAACGTTTTCCCCTTTTGCCAATTGGTTCTCTTTCATACCCCTCTTTTCAATTTAGCTATTGATTTGGTTGTCTCATGTTTGACATTGTCTGATTATGGTATTTTAACTGATGTTTGCTTCTTCTGTCCTTGTTTAATAATAATTTTATATTTGTTTGGTCTCAACCTATGACTTATTGCTCTAGTCATTCTTTTCTCTTTTGGTGGTAAACTACAGGACCTAAGCAAGAGGAAGTGAAACGTCTTCCCGGTGGCAAGATAAAGAAAAAAGTAATTTAGCCATTAAATTCAATCTTGTTGTCACTAATAAATAAAAGATTCATACGATGGAACTAATTTATTGGATGTACATATAGGATAAGCAAGAAGTTGTTATTGAGAAGGTTACACGAAATAAGAGAAAGTGTATTACAACTGTAAAAGGATTAGACCTTTTTGGTGAGCAATACTTTGTTTCCTACGCCTACTTGACATTTCTTCATTGTTACATTTATTTCCAATAACAGCGTCTCTTAACTGGATTTAGGAGTTAAGCTAAGTGATGCTTCAAAGAAACTTGGGAAAAAGTTTGCTACTGGTGCCTCTGTGGTTAAGGTTGTTAACTTCTTGTGTCATGACTTAGATATCTGTCTACTGTAGATGCCTCTTGATTTCTTATCATCTGTTTGATACTTGGTTTTAGGGGCCAACCGAGAAAGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGACATAGCCTATGACATCGTGGATTTCATTACGGAGACTTGGCCTGATGTAAGATACTCATTCATTATTTTATTTATTTATTTATTATTATTATTTTTGGATAGCCATGAGTTAGAGCTAGGATCCCCTGTACAATCTGGGATAAAAGCATATACCAGCCTCCCATTGCCTCTGAACTCCTTGCAGCATTGTACTTGAATTTTTTGCTTATACTGTACCTTATATTTTTTAATTTGGTTTGGTTATCAGTGGATGTGGTTAGTTTTAAAAAACGTCAACACTTTCAACTTCTAATGATAAAAATATGATTGGATGCTTTTTGGTTTTTGCTGAAAGTACAATGTAAAAGGTCTATATGGTCAAATATATTTCTCCATTATCTAGTCATTCTATAATTGTATCAATTTTGTGGCATATTATTTAACCAAAATAATAACAATAATAAACGAAAGAAACAACTTTATCGAAGTTTAGCTTTGAAGACATAATTGGATTTGCCATCCTGAATTCTTAGCATTTGTCTGTGTTAAGAACCAAGGTAGTATGGGATGCCTCTGTCCCACATTGGTTAGAATGCAATGACCAATGTGGTACTTAAGTAGCTTGGCTCTCACACCCCCATGGTTGGCTTTTGGGGTGTGGTTCTCCAAGGTGCTTAAGTATCTAGCAATGGTGTTAGAGCTGGTTGTGAATGTTTCAAAGTGAAACCGCCAGAGAGTTTCGACCGGGTGTGGCCGAGTGAAGTGCCATTGGGACTTCGACTTTCCAGGGTTGGGGTATTGTTAAGAACCAAGGTTTTATTGTTAAGAATGTCTTTGTCTCACATTGGTTAGAATTGGAGAACCGGTGTGGTACTTAAGTAGCTTGGCTCTCCCACCCCAATGGATGCTTGGAGTGTGGTTCTCCAAGGTGCTTAAGTACCTAACAATTTGTCACCACACTTTAATGAATTTAAACTATTGTTGTATGTATAAGCCTAGGCTAGCTTACACGCACCTCTACTAGTCTCACTGTCCTAAGACAACTTTAATGATCATATATAATGATATGAATAAAAATGGTAAATGCAATCACAGAGCCAATAGGGTACAATTCAATCAATAGTGCTGCATCATACCGTCACCTTCCTAACCACAAACAAACAGGGAGATCTTGGTTTTGCTATTAGAAATTAATTCTGGTCATTATTCCCCCTATTGATTCCAATATAGGGAAGGGCTCATAGTATCAATTGGAAGGTTACGTTTTTCGTTTGGAAGATCACTGGGAAAGAGTTAACTCTTTGGATCGATTTTCTATAAAGATATCTACTTTGATAGGACTGTTTTGTTGCATTCTTTGTCGGAGGGTAGAAGAAGATCTTGATCATATTTATTGGAGTGGTGACTTTGCTTGGATTGTTTAAAGTTATTATTTTTGTCGCATGTTGGGGTTGGGGTCTGTTGGAGGAGAGGAGTAATAGGACCTTTAGAGGGGTTGAGAAGGGCCCTTGTAATTTTAGGTTCTATGTTCCTCCTTAGGTGTTATTGACAAAGTCTTTTTTGTAGTTGCTCTTTAGGTTTCATCGTACTTGATTGAAGTTCCTTTCTATATTACGGCTTAGTTTTTTGGATTCCCATTTATTATTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTTCTTTTTATCTTTTTTTATTATTGTTTTCAATGAAAGTTCGGTTCTTTTGCTGAAAATAATATCTGGTGTTTGTGTTATAGTCAATCTTGTAGTCATTATCATACACTTGTTTGGCCTTCCAAACCAAATCAGATCTAGAATCTAAGATTATGAGCCTTCAGCTTCTCAACCTCCAACGTGCAGTTTGGGGAAGAGAGTTTTTTGGGTTTGAATATCCAGCCATCAAGATTGTCCTTTTGAACATAGTTACTCTGATCTTTCCTTTAGTGCAGTGGGATTCAGGTATTCTCATCCAATGCTGCACGGTTCCTTTGGTCCCTGTACAGAAGTGAGGTGCAGGTGTTGCCCCTCCTCTCATGTGCTACCTCAAAAGAACCTAGCCCACAAAAAAAGACAACACTGGACACCTTAAGTTGGTGATGTCGACAAATCTCTATCACAAACAATTGCTTCATTTTGTCCTTCACATTTACATTCTTGTTCAATAGCTGATATCGTCCTACATGGTCATCTTGCACTGAATTGAACTCCCTTCCATCTCTCCTGGCATCAAATTGACTTCAACCAAATCATTTGCCAATGATTTATTTTCACTCAAAGACGTCATATTTAGTTTGGGAGTGATTTTGAAAGGATTTAATCACTTTTGTCATGTTTAAGATCAACTCGAAACGTACTTTTAGTCCTTCAAAACCAATTTAATGTTTGGTTTTTACGCTTTTAAATGTGATTTTTACCATAAAAATTGATTTTGAATGATTATAAACATGTTTAATAGTGATTTTGAACATGACAATCAATCCCAAACATGTGCACGGTTGTTTGGAGAAGAATAATACAAGAAATCCAGAAGTCATCTTCTATGTTACTTTCAACTAATTTTAGATGTTCAATTGTGCACATTGTTTTGTGGTGTTTGGGGAGAAGCTAGAAAGAAAATAGAGAGGGATGGAGAGAGTCTTTTGGTATTTGGTCCTGTTAGGAGTTCTTGTATTCAAACCCGTGCATATTATTTTCTTCCTAATTAATATTAATTTCCACTTGGTTTTTGTACAAATTTTAGGCCCACAAGTGAAACAGAGTGTTGGTATAATACTAAATTTACCTTTAAGTCCCTTCTTGGATTGTGTCTCTCTTTAGGCATCGGTGATGAGTTTCTTTTGTAATCTTGGTTTGATTATAAGAAGCATGGATATGGACATAGGCATGACACGATTTGTCGATACACCAATTTAAAGAAAACTAGGACACAGACATGCTGGGGATGTACTTTTTTAAAAAAAAACTTTTTAAAAGGATATATATATATAAATCTAACATAAAATACTGGTTGTATTCATCAAAAAAAGCATAAAATTTTAAGTTAAACAACAATTGTAGGAGATGAAACAGTTAATTGTTTATGTTTCTTACTTCAGTTTTTTCTGTTTGGTTAAAAAAATGGGCTTTCCTTTGGTTTTTCAATCTTTTTTAACATATAATTGATCTGAGTTTTAGATTTGGGTCAAACATAAAAGGTTCTGTGGCGTGTCACAACCTTGTCCATGTGTTGGAAATTAAAAATAAATAAAAAAAATAGGATATGGAAATTTGTATATCAAACATGTATTCAGAGCGTGTTTGGACGTGTTCGATACTTGCACACCCTTAAATGGTGCGTCCATGCTTGAAAAGTCTTATTTTGCTTGATTGTTGACCCTTTCTTTAGCAATCTCTATTGTGGGAGACTTTTTTTTTACAATCTTGTATTCTTTTATTTTTTCTCAATGAAAGTTGGTATTTTATATATAAAAGAAAAACTAATTTCAGATTTGTGCCCCTCTATTCTATTCTCCCATTCCTTCGTTCTACGAATTCTCAGATGTTTGA

mRNA sequence

ATGTTTGATAAGGGGCCCCAGGAGACTATTGAACTTTATTGCACCTTGAGTGAGCGAGTTTATTTAGTCAAATTTCTTTCATCTCAAAGACACTGCTGCAAGACCTAAGCAAGAGGAAGTGAAACGTCTTCCCGGTGGCAAGATAAAGAAAAAAGATAAGCAAGAAGTTGTTATTGAGAAGGTTACACGAAATAAGAGAAAGTGTATTACAACTGTAAAAGGATTAGACCTTTTTGGAGTTAAGCTAAGTGATGCTTCAAAGAAACTTGGGAAAAAGTTTGCTACTGGTGCCTCTGTGGTTAAGGGGCCAACCGAGAAAGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGACATAGCCTATGACATCGTGGATTTCATTACGGAGACTTGGCCTGATTCATTATCATACACTTGTTTGGCCTTCCAAACCAAATCAGATCTAGAATCTAAGATTATGAGCCTTCAGCTTCTCAACCTCCAACGTGCAGTTTGGGGAAGAGAGTTTTTTGGGTTTGAATATCCAGCCATCAAGATTGTCCTTTTGAACATAGTTACTCTGATCTTTCCTTTAGTGCAGTGGGATTCAGATGTTCAATTGTGCACATTGTTTTGTGGTGTTTGGGGAGAAGCTAGAAAGAAAATAGAGAGGGATGGAGAGAGTCTTTTGATTTGTGCCCCTCTATTCTATTCTCCCATTCCTTCGTTCTACGAATTCTCAGATGTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGCCTTCAGCTTCTCAACCTCCAACGTGCAGTTTGGGGAAGAGAGTTTTTTGGGTTTGAATATCCAGCCATCAAGATTGTCCTTTTGAACATAGTTACTCTGATCTTTCCTTTAGTGCAGTGGGATTCAGATGTTCAATTGTGCACATTGTTTTGTGGTGTTTGGGGAGAAGCTAGAAAGAAAATAGAGAGGGATGGAGAGAGTCTTTTGATTTGTGCCCCTCTATTCTATTCTCCCATTCCTTCGTTCTACGAATTCTCAGATGTTTGA

Protein sequence

MSLQLLNLQRAVWGREFFGFEYPAIKIVLLNIVTLIFPLVQWDSDVQLCTLFCGVWGEARKKIERDGESLLICAPLFYSPIPSFYEFSDV
Homology
[Close]
BLAST of MELO3C029330 vs. NCBI nr
Match: KAA0055826.1 (translation machinery-associated protein 22 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 2.5e-16
Identity = 47/53 (88.68%), Postives = 49/53 (92.45%), Query Frame = 0 

Query: 1   MSLQLLNLQRAVWGREFFGFEYPAIKIVLLNIVTLIFPLVQWDSD--VQLCTL 52
           MSLQLLNLQRAVWGREFFGFEYPAIKIVLLNIVTLIFPLVQWDS   +Q CT+
Sbjct: 261 MSLQLLNLQRAVWGREFFGFEYPAIKIVLLNIVTLIFPLVQWDSGILIQCCTV 313

[Close]
BLAST of MELO3C029330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UNG3 (Translation machinery-associated protein 22 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold181G002210 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 1.2e-16
Identity = 47/53 (88.68%), Postives = 49/53 (92.45%), Query Frame = 0 

Query: 1   MSLQLLNLQRAVWGREFFGFEYPAIKIVLLNIVTLIFPLVQWDSD--VQLCTL 52
           MSLQLLNLQRAVWGREFFGFEYPAIKIVLLNIVTLIFPLVQWDS   +Q CT+
Sbjct: 261 MSLQLLNLQRAVWGREFFGFEYPAIKIVLLNIVTLIFPLVQWDSGILIQCCTV 313

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C029330 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0055826.12.5e-1688.68translation machinery-associated protein 22 [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of MELO3C029330 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C029330 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7UNG31.2e-1688.68Translation machinery-associated protein 22 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=11946... [more]
BLAST of MELO3C029330 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C029330.1MELO3C029330.1mRNA