Spg004712 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg004712
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115
Location	scaffold5: 20783042 .. 20794238 (+)
RNA-Seq Expression	Spg004712
Synteny	Spg004712

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGAAAGAATGATTCGTGGTATAGAAGAGTTGTCCGAACGCATGGGAAGGTTGGAGGCTCAGTACCAACCTCGTGAGAGAGTTCCACCACCACGTATTGACAATGATCGAGAGGATGACTATGAGGATGATGGTTCCGATCAACCAGATGATGACCAAGTTACCTTGGTAGCGGTTCCAAGAGGAAGACAAAGACGTGCTGGTCGTGGCATGGAAAGAGGGCGAGGTCGTGGACGAGGACATCATATTTTCCAACAACGAGTTCCTCAATATGAGGGAGTTGATCGAAATGTGGGTAACATCAAATTGAAGCTTCCAAAGTTCTATGGCAAAACCGATCCGGAGGAATACCTTGAATGGGAGAAGTCAGTGGAGTCCGTATTCAATTGCCATAATTTCAGTGATGAAAAGAAGGTAATATTATGTGTTGCTCAATTTAAACAATATGCTCAAACATGGTGGGATAAGTTGATGTCAAGTAGGAGAAGAAATCTTGAGGCACCGATCGATGATTGGTACGAGTTCAAGGAGGCCATGAGGAAGCGTTTTGTTCCAAAACATTTTCAACGGGACATGGCGCAAAAGCTTCAAGCATTGAAACAAGGAAGTAAGTCCGTGGAGGATTATTACAAGGAGATGGATACGTTGATGGATCGACTTGATATAGATGAAGACATGGAGAATCTCATGGCACGGTTTCTTAATGGGCTAAACACGGAGATTGCGGACAAGGTTGATCTACAACCTTATTTTGACATGGAAGAGATGCTGCATATTGCAATCAAAATTGAGAGGCAACTCCAACGAAAGTCACGACGGTATTCTTCTAAACACTTTTCCAACTCTAGCTCATCATGGAATAGGGATAGTAAGAGTATTGATTATAAGCCTAGAAACCGAGAGGGGTATGAGAAACCTAAAGAGAAGTTTGAAAAGGGGGAGAGTTCCAAGAAGGGGAAAGAGAAGGTAGATGAATCTAATGTGCGAAATAGGGATTTGAAGTGCTGGAAATGTCAAGGGGTAGGTCATTATAGTCGAGATTGCCCAAATAGGAGAACGATGATCCTTCGAGAGGGAGAGTTTGTGACGGAGGATGAAGAGGAAGATGAGGTCATAGAGGAAGGAAAAGTAGAGTGTGAAAGTGATGAGTTTAGTGAAGAGGATCCCGCTTATATGTCCTTAGTCACTAGGAGAGCTTTAAACACCCAAATTAAGGAGGATAGTCTAGACCAACGAGAGAACTTATTTCACACTAGGTGTCTTGTTCAATCTGTACCTTGTAGTGTGGTTATCGATAGTGGTAGTTGTACCAATGTTGTGAGTTCCATTCTGGTCAAGAGACTTAATTTAGAGACCAAACCCCATCCTAAACCATATAGGCTTCAATGGTTGAATGATTGTGGGGAGGTAAGGGTAAGTAGGCAAGCTCTTGTTTCTTTTACCATTGGGAAGTATGCTGATGATGTTTTGTGTGATGTTGTATCCATGCATGCTGGGGATTTATTGTTGGGGAGACCTTGGCAATTTGATCGTCGGGTAGTCTATGATGGGTATGCTAATCGTTACTCTTTTACTCATAATGGGAGAAAAACTACTCTTGTACCTTTGTCTCCAACAGACGTGTATATTGATCAATGTAAACTTGAAAAGAAAAGGCAAGAGGTCGATGCAAAAGCAAAAGGTTCAAAAGAAATGAAAGAAAAAGAATTGAGAGAAAAAAATGAGTTGAGTGAAAAGCAAGTGAGTAGTAATCGGCCTAGAGAGAAAAATGAGAGAAAAGCCAAAATCGTGAGCTTGTATGTTAGATCAAGTGAGGCTAGGAATGTTTTGATCTCTAACCGGACCATTCTTGTACTTTTGTACAAAGGGTCTTGTTTTCTTACTAACGAGCTTAACCCTTCTTTGCCTAGTGTTTTTGTTACACTTTTGCAGGAGTTTGAAGATTTATTTCCCGAGGAGATGCCAAGTGGTTTGCCACCACTTAGAGGAATTGAGCACAAGATTGACTTCATTCCGGGAGCGACCATTCCAAATCGTCCAGCATATAGGACTAATCCAAAGGAGGCTGAAGAAATACAAAGGCAAGTAAGTGAACTCCTTGATAAAGGGTATGTGCGTGAGAGTTTGAGTCCATGTTCTGTTCCGGTTATTCTTGTGCCTAAGAAAGATGGATCATGGCGGATGTGTGTTGATTGTAGGGCTATAAACAAGATAACTATTAAGTATAGGCATCCAATTCCTAGATTAGATGATATGCTTGATGAGTTGCATGGATGTAGTCTATTTACTAAAATTGATTTGAAATCAGGTTATCATCAAATTCGCATGCATATTGGTGATGAATGGAAAACCGCTTTCAAAACTAAGTATGGCCTTTATGAGTGGTTAGTTATGCCTTTTGGATTGACTAATGCACCTAGTACATTCATGAGGTTAATGAATCATGTCTTGCGTGAATACTTAGGGAAGTTTGTGGTTGTGTATTTTGATGACATACTTGTTTATTCTAAATCCTTAGATGAGCATGTTGAGCATGTGCGTTCTGTTTTCATTACTTTGCGAAAAGAATGCTTGTATGCAAATTTTAAAAAATGTAGCTTTTGTATGGAAAAAGTTAATTTTCTTGGATTTGTCGTTTCATCTAATGGTGTTGAGGTTGACGAGGAGAAGGTAAAGGCAATACGAGATTGGCCTACACCTAAAAGTGTAAGTGAGGTAAGAAGTTTTCATGGTCTTGCAGGATTTTATCGTAGGTTCATAAAGGATTTTAGTACTATTGCTTCACCTTTGAATGAACTTGTTAAAAAAAATGTTTCTTTTGAATGGGGAAAAGACCAAGAACTTGCTTTTAATACTTTGAAAGAAAAATTGAGTTCTGCTCCATTACTGGCATTACCTAATTTTGACTTAACTTTTGAAATTGAATGTGATGCTAGTGGTGTTGGAATAGGGGCTGTTTTAATGCAAAATCAAAGACCTTTAATGTTCTTTAGTGAAAAATTGAATGGTGCTTCTTTGAAGTATCCGACTTATGACAAAGAACTTTATGCTTTGGTTCGTGCATTACAAACTTGGCAACATTATCTTTGGCCTAAAGAGTTTGTTATTCATACTGATCATGAGAGTTTAAAACACTTGAGAGGTCAAGATAAGCTCAATCGTCGCCATGCTAAATGGGTGGAGTTCATCGAGTCATTTCCTTATGTCATTAAGTATAAACAAGGTAAAGAGAATGTTGTTGCTGATGCTTTGTCTCGAAGGTATGCTCTTTTTAACCGATTGAATGCTAAGTTTTTGGGTTTTGAGCATATAAAGTCTTTGTATCATCATGATGTGTTCTTTGCTCCTTTTGTTGAATCTTGTGAAAAAGGACTTGTTGTGGATGATTACATGTTGTTTGATGGATTTTTGTTTAGAAAAGGGAAACTTTGCATACCATTTTGTTCCATTCGTGAGTTACTTGTAAGGGAAGCTCATGGAGGTGGCTTAATGGCTCATTTTGGAGTTTCTAAAACTTATGATATGCTTGCTGAACACTTTTACTGGCCTAAAATGAGACATGATGTTAATAAAGTGTGTGCACGATGCATAACATGTAAACAAGCTAAGTCTAGGCTTCAACCACATGGTTTGTATTCACCTTTGCCCATTCCTAATGGTCCTTGGATTGATATATCAATGGATTTTGTTTTAGGCTTACCTAGAACTAGGAAAGGTAGGGATAGCATCTTTGTTGTGGTTGATAGATTTAGTAAAATGGCTCATTTTATTCCTTGTCACAAAACTGATGATGCAAAGCATATTGCTGATTTATTTTTTAGGGAGGTTGTGAGATTGCATGGTATTCCTAAAAGCATAGTAAGTGATCGTGATGTTAAATTTTTAAGTCACTTTTGGCGTGTTTTGTGGGGTAAATTGGGAACTAAGCTAGTGTATTCAACTACATGTCATCCACAAACGGATGGACAAACTGAGGTTGTTAATCGGACAATGACTACTATGCTTAGAGCTATTATCGACAAGAATCTTAAGACTTGGGAGGATTGTTTGCCATTCATAGAATTTGCATATAATAGGGCTGTACATAGCACTACTAAATGCACTCCTTTTGAAATTGTTTATGGCTTTAATCCTCTAACTCCTATTGATTTATTACCTATGCCCCCTAATGAGTTTGTGAGTTTTGATGCCAATGCAAAGGTTGACTTTGTTCATAAGCTGCACCAAAAAGTGAAAGAGAACATTGAGAAGCATAATTCCAAGGTTGCTTCAAGAATTAATAAGGGACGCAAGCTTTTAGTCTTCAAACCTGGAGATTGGGTTTGGGTGCATTTTCGAAAAGAAAGGTTTCCTACACAAAGAAGATCGAAACTTTTGCCCAGAGGAGATGGTCCTTTCCAAGTTCTTGAGCGCATCAATGACAATGCTTATAAAATTGATTTACCAGGTGAGTATGGTGTTAGTGCAACCTTTAATGTTGCTGACTTGAGTCCTTTTGATGTAGGTGATGGCTATGATTCGAGGACGAATCCTTCTGAAGAGGGAGAAGATGATGTGAACCAAGCTACATCTATTGTCATGCCTCAAGGTCCAATTACAAGGTCGAGAGCCAAGAAGATACAACAAGCATTAATCACCTATATTCAAGCTATGGTGAGCTCGACAAAGGACGTTCAAGGAGATGTTGGACTATTTCCCTACACTATTTCCAAAATTGAGATTCAAGATGGAGACACGTTAAATGCATTTTCACTTGCATTTAATGAACTATAGTTGGCTTTATGGAACTTAAGCTTAAACTACTCCAAGTGAAGCTTCAATTAATATGGGAGGTTACAAACAACTCAAAGCTGACCATTGGAGTTCAATTCTCGGATTTATGGCCCTCCATTATATAATTTTCAGTTTTTAAGTCTTTTTCATAACTTATAGGTTACATTTGAGTAGTGGCTGATTATGGGCTTTAATATTGTGGAGGTTACACTCTTAAATATGTCATTTAAGCTGAATTTAGGTTATATTTTGAAGGCTATAAAAAGCCATCTTGGATGTAACACAAACCAGAATATTTTGAGTGAAATATATTGGGTTTTCTCTTAGCTTTGTGTTGAGCTGAGTTTTTTTCAAATTGTGCAATTTCTTGTGTTTAGATCTTGCATGCTAGAGTCATTCAAGTGGTGTTGATCAAACCTCTTGTGGAGTGATTCGAATCACGAGTTTAGAAACAAGTTTTCTTTACTCTTGATATTGATCATCAAGGTAATCCGTTTCAAAACTTTTCCTTGGGTTGGTTCCATATTGTTCTTTGGGGTTTTCAGATTTGAGATCTAAAGGTCTTGTTTTTTAGCAAGGTTGTTAGATCCATTTCTTGGGAGTTTCATAACATTCACTTTATTTGGAAAACCCATTAAGGCCCATGTGGGCTAGGTTTTTTTTTTTAATTTGATTTTCTTTATTTCATAAAAACTCGTTGATAGCGAGCATAGCAAGCTATTTTTCCCTATCTATTTTAGCTAATCTTTGAAATTAAATTCGCCAAATTTATGCATTTTAATGTTCTATTCGTAAGAATCATTTATTGGAGCTAAGTTGAGAAATTGGAGTTAATTGGGTGTTTGGGACATGAAAAGAGGCCAAAGAACCGAAAAGAATCAAGTTAGAGGCATCCAAAATAGGCTCATCCAAGGGCTAGCGTCGAGACACTTCTCTCTGGGCATCTCGACGCTGGGATTTTTCCTTAACTGATTCAAGCGGCAAAGGTCATAGCGTCGCGACGCTGTGACCATAGCGTCTCGACTCTCCCAGTTTTTTCTTATACAGAATGGGCGGTAATGCGACAGCGTCGCAACGCCGCCTATAGCGTCTCGACTCTGTCGGCAGATTCTCTATAAATAGATTGCGATTAGGGCTGTCCAAGGGGACTTATTTTGATGAAATTTTAGCCCTAAATTTGACTAAGGACCTTCTGTGGAAGCTGAAACAAGTGGAGGAAGTAGGATTCAAGGCTAGGCTCGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTTTCAGCGACATTAGTGTTTAATCTCCTTTCTCTCTAACTTTAGTTGTTTTTAATGGTTGTTTTAGACTTAGTTTATATCGTAACGCTGTGTATAAGTAGCTAAGTTTATTATCTTAGGGATTGATGTAGCCCTTTGGGCATTATGGATTAATTTTGGATGTATGTTGTGATTTCATTTATGCATAGACTTTCCTTAAGGCTTTCAATTTATTGGCCATGAATTGAATGATGTTTTGTCTATATCTTGCTCGGGAGAGGGGGTTTAACTTAGATCTTGTTATGCATAACTAGGATAGTCTTAAGATCGGGAGATTTAAGATAATCTTGGAAATCGTTAAAAAGGATTAGACTTAAGATCTTGCATGTTAATGAGTTTAGATAGGGATATTGAATTCATTGCATGTGAGAGAATTATTTATGCTCGGGAGAGATAAATATGAATTGAGTTATTCCTAGATTTATGAAACATAGCATGTTAAATCATCCATTAATTAATTCATAGTCCCAATTGGTGAAATAAACTCCCTAAGAGTTTTCCATCATTTGAATTCCATATTTTAAGCTTCTTGTCTTGTTTCATTCATTCTCACTAAAGTTTGTTCCTTATATAAAATTGGACATAAGTATTTACGGTAGTTAATTTGATTAGAAACCTAATCCAGAGGACGACATTCGATCTAACAAATCACTATATTATAACTTGGCCCGTACACTTGTGGTAAGCAAATTGTGCATCAAGTTTTTGGCGTCGTTGCCGGGGATTGGCATATTTAGTCAATTAATATTGTAGAAAAATTGTCCGGTCTTAATTTAGGGTGTATTTTTATTTTTATTGTTATTTTTAGGTAGATTGCATTTTTTCCTTATTTGCTTTCTTTCCATATTTAGTTTTTCCTCGTTTGTTTAAATTTTCCATAGTTGTAGTTTTCCTTTTTAGTTCTTTCCTTATTAGATTAATTTTTCCTTATTGGTTAGTTTCCTTAATAGTTTTTACCATATTTGTTTTTGCATTCCTTATTAGATAATCTTTTCCTTTTTTTAGAATATATTTTCCTTATTTAGATTTAGTTATTTCCTTTTCTAGTTTCTTTCCTTATTTGTTTTCTTTCCTTTTCTTTTATTTTCCTTTTTAGGTTAGGTTAGACCTCGTATGCGAAAGGATAAGGATTTGGCCTTAGTACCTTTGGATCCCAAGATCGAGAGGACAATCAGTAGGATTCAAAGAGAACTTAGAGAATCTTTCCCAATGGCCGATCCAAATCCTCAGGAGGAGCCCAAGCCCATTAGAGACTACTTTCAGCCTGTTTTTCAAGGGCAACAGTCGGGGATTGTTTATGCCCCGATTAATGCCAACAATTTCGAGCTAAAAATTGGTCTCATTCAAATGGCTCAAGACTGCGCTTACAAAGGATCACCCACAGAGGATCCAAACTCTCACCTAAAATCTTTTCTGGACATCTGTGGGACGGTAAAAATCAATGGTGTTACTGAAGATGCCATTGGCTTATATTTATTTCCCTTTTCTTTGCAGGATAAACCGAGGGATTGGTTGCAGTCTATTCCACTTGGGAGCATTACCACCTGGGATGCTTTGGTTCAGGCATTCTTAAAGAAATTCTTCCCTCCTGCCAAGACGGTCAAGCTGAGGACCGAAATTGGGACGTTCCAGCAGCAATTTGACGAGCAGCTGTTCGAGGCATGTGAGTGTTACAAAGAGTTGCTAAGGAAATGCCCTCAGCATGGTTATCCTGACTGGTTACAAATTCAACTCTTTTATAACGGTCTAAATCCCAATACTAAAACCATTGTTGATGCAGCTGCATGTGGGACTCTGTTGTCCAAGACCGTAGAAAATGCACGTACACTACTAAAGGATATGGCCACCAACAACTATCAGTGGCCATCTGAGCGGTCTACACCGAAAAAGATTGCTGCTGGAGTATTCAAAATAGACAACGTAAGTGCACTCCAAGCCTAGATGTCTACCCTTGCTAATGCTTTTCTGAAGTTTTCAGGTACAGGGAGCGCTCAATCTATCAAGTCAGCAGCTGCCCTCGCATCTCAATATCAGGAGGAGACCTTAGAACAGGTTCAGTATGTTTCCAATTCTAATTTTAGGGGATATAGTAATAATTCTACACCTACACATTATCACCCTAGCAATAGAAATCATGGGAACTTCTCGTATCCTAATAATAAAAATGTCTTAAATCCTTCTGGTTTTGCCCCTCCTAAGCAAGAAAATAAACAAATTTTAGAGGATTTTGTTGGAGCCTTCATTGCAGAATCTAGTAACAGGACAAACAAGCTGGAGGAGGTCGTGATTGCAATAAACACCACAATGATTGACCATAGTGCAACAATAAATAATATTAAGACTCAGTTGGGACAACTGGTAAGTGTGGTTAATACCATGAAAAAGGATAAGGCCCCAGCTGAGCAAGAGAAATCTCAGATGGAGTACTGCAAAGCCATCACTGTCCATCATGAGGAGGAAATTCAAGAAGCCGAGGAGCAGGAGACTACTGAATTAGACGATCTCAGTGGAGAAGCTGAAGAGGGCACATCCTCAGATGAAGTTGAAAAGCTTAATCCTGAGCCCTCTATCCCTTCTCCCACTGTTTTAGTTTCAAAATTGAGGAAAAAGAAAAAGAAGAATTCAAAAGCTTAGTTTGAAAAATCTTTAGATGCTTTTATGAGTTTAAATGTTAACATTCCTTTTGCAGAAGCACTGGAGTAGAGGCCTAACTACCAAAAGTTCATGAAGGAGTGGCTTGTCAAGAAAAAGAAGGAAAAGCAGATGGAAACAGTGCACCTCACTTCCACCTGCAGCGCTCGACTACAGTAGCAAGTGTCTGACAAACTTACTGATCCAATGAGTTTTTCTGTTCCCTGTAGTTTTGGTACTTATCCTTTTCGAGCTTTATGTGATTTGGGTGCTAGCATAAATATCTTGCCTTTACCTTTATGTAAGAAATTAAACATAGGAGAAATTAAATCTACCATTGTGAAACTCCAATTGGCTCATCAGTCTGTTGTCAGTCCCTATGGAATAGTTGAAAATGTTCTTATTAAAGTAGGTAGATTCTTTCTTCCGGTTGATTTCTTTATCATGGATGTTAAGGAAAATCCTACATTCCCAGTCATATTAGGTAGACCATTCCTCGCCACTGGGTGAGTCATAATTGACATAGAGCGTAGGGAGCTGACTGTGAGGGTCCTACATGACAAGGAAGTTTTCAAAGCATTTGTAGATCCTAAGGATAATTCGAGTGCTATGGTGGTGGGTTATAGGAAAGGTGCAAGGAAGAGCACCATTGGTGGATGTCCTGACATTAGACCTCCATGATGCATATTCGGTCAACACGTCGAGCTAAAGACATTAAACAAGCGCTTATGGGAGGCAACCCAAGTAAGTTTCTTTTTTATTTGTTATTTCTTTTTGTTTTGTAGGTTGTTGATCCCGTAGCTCTTGGCTTGCAAGCATCTATGAGAAGGTCATCATCATTCCAGGGCAGTATTGTTCACCCCATCCGTTCTTTTCTTGTTCTCATGCTTGAATATGCTTTACTTTTATATACATTGAGGACAATGCATGTTTTAAGTTTGGGGGTGGAATGCTTTGCTTTGTTGAGCCCTTGAGCATCTGAGTTCGGGCTATATGTTTTTAGCTTTTTATGAATTTAGCATATGGTTGTTTTGTGGATGTTATTTTTGCATGACTATGATTTCCTAGGATAGACATTCTTGTCAATTTTCAAGCTTTTGATGAGTTGTAATCATGAGTGCCCAAAAAGGGAGACTTTTTAAACTTTTTCTAGGAGATGTCTTTCATAAGTGGAGTATTTTCCTTGGTTAGAATTAGACTTGAATGCTTAGGAGTGAATTATTAGGTTCATATGCTTGTTGTCACCTCGATAGGTGTAGGGAAGAGCTAAAGAGTTGATTTTTTTTGCAAATTAGCATGTTTAATCTTGGCTAGGAGGAAAGAAAAGAATATATGTTTATCATGCTCAAAAATAAAAATCATTCTTGTCTTTACTTTTGAAAGAAAATAATGCCATGGCTTGTGTACACAATATGCAATGTTTAATAATGTTTTAGGCAAAAAGAGCTACCCCTGTTGTGAACAGTTAGGCCAACCAAGGGTTAAACTCGGGTTATGGGTCCCTACAATAGGTGTGTGAAAGCTAGTGCCACTTTTAATTGCTTGAGTCAATTTAATTTAAAAGCACTTAGGTATGGATGAAAACAAACTAATTTGTTCCATTGGCTCATTAGGGAATCCTTAGTGCCAATGTAGAGAGAAGATGAGTTGAGAGTTTAGTAATCTAATCCCGAGCTAGTAGAGTCTAATCTAATCAATTTAGATCTCGCTAATGCAAGTTAATTTTGGAAAACTTTTGATTTGTCTCCTTCATTGGGCCTTATGTGCATGTCTCTTGATTGCTTGTTTATTGACTTGTGAGCCTTGAGAAGTGAGTCATGTTTGTTGCATCTATTCTTCAACCTATGCTTGATTTGTAGTTTGCTCGAGGACTAGCAAAAGCTTAAGTTTGGGGGTGTTTGATAGCGAGCATAACAAGCTATTTTTCCCTATCTATTTTAGTTAATCTTTGAAATTAAATTGGCCAAATTTATGCATTTTAATGTTCTATTCGTAGGAATCATTTATTGGAGGTAAATCGAGAAAATGGAGTTAATCGGGTGTTCAGGACACGAAAAGAGGCCAAAGAACCGAAAAGAATCAAGTTAGAGGCTTCCAAAATAGGCTCATTCGAGGTCCAACGTCGAGATACTGCTCTCTGGGTGTCTCGACGCTGGAATTTTTCCTTAACTGATTCAAGCGGCAAAGGTCACAACGTCGCAACACTGTGACCATAGCATCTCAACGCTCTCGATTTTTCCTTATACAGAATGGGCGGTAATGCGAAAGCGTCGCAACGCTGCCTATAACGTCTCGACGCAGTCGAGAGATTCTCTATAAATAGTTTGCGATTAGGGCTGGCCAAGGGGACTTCTTTTGATGCAATTTTAGCCCTACATTCGACTAAGGACCTTCTATGGAAGCTGAAGCAAGTGGAGGAAGCGGGATTCAAGGCTAGGCTCGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTTCCAGCGACATTAGTGTTTAA

mRNA sequence

ATGGAAAGAATGATTCGTGGTATAGAAGAGTTGTCCGAACGCATGGGAAGGTTGGAGGCTCAGTACCAACCTCGTGAGAGAGTTCCACCACCACGTATTGACAATGATCGAGAGGATGACTATGAGGATGATGGTTCCGATCAACCAGATGATGACCAAGTTACCTTGGTAGCGATCTTGCATGCTAGAGTCATTCAAGTGGTGTTGATCAAACCTCTTGTGGAATTCTCTATAAATAGATTGCGATTAGGGCTGTCCAAGGGGACTTATTTTGATGAAATTTTAGCCCTAAATTTGACTAAGGACCTTCTGTGGAAGCTGAAACAAGTGGAGGAAGTAGGATTCAAGGCTAGGCTCGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTTTCAGCGACATTAGTGTTGTTGATCCCGTAGCTCTTGGCTTGCAAGCATCTATGAGAAGGTCATCATCATTCCAGGGCAGTATTGTTCACCCCATCCGTTCTTTTCTTGTTCTCATGCTTGAATATGCTTTACTTTTATATACATTGAGGACAATGCATGTTTTAAGTTTGGGGGTGGAATGCTTTGCTTTGAATCATTTATTGGAGGTAAATCGAGAAAATGGAGTTAATCGGGTGTTCAGGACACGAAAAGAGGCCAAAGAACCGAAAAGAATCAAGTTAGAGGCTTCCAAAATAGGCTCATTCGAGGTCCAACGTCGAGATACTGCTCTCTGGGTGTCTCGACGCTGGAATTTTTCCTTAACTGATTCAAGCGGCAAAGTCGAGAGATTCTCTATAAATAGTTTGCGATTAGGGCTGGCCAAGGGGACTTCTTTTGATGCAATTTTAGCCCTACATTCGACTAAGGACCTTCTATGGAAGCTGAAGCAAGTGGAGGAAGCGGGATTCAAGGCTAGGCTCGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTTCCAGCGACATTAGTGTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAAGAATGATTCGTGGTATAGAAGAGTTGTCCGAACGCATGGGAAGGTTGGAGGCTCAGTACCAACCTCGTGAGAGAGTTCCACCACCACGTATTGACAATGATCGAGAGGATGACTATGAGGATGATGGTTCCGATCAACCAGATGATGACCAAGTTACCTTGGTAGCGATCTTGCATGCTAGAGTCATTCAAGTGGTGTTGATCAAACCTCTTGTGGAATTCTCTATAAATAGATTGCGATTAGGGCTGTCCAAGGGGACTTATTTTGATGAAATTTTAGCCCTAAATTTGACTAAGGACCTTCTGTGGAAGCTGAAACAAGTGGAGGAAGTAGGATTCAAGGCTAGGCTCGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTTTCAGCGACATTAGTGTTGTTGATCCCGTAGCTCTTGGCTTGCAAGCATCTATGAGAAGGTCATCATCATTCCAGGGCAGTATTGTTCACCCCATCCGTTCTTTTCTTGTTCTCATGCTTGAATATGCTTTACTTTTATATACATTGAGGACAATGCATGTTTTAAGTTTGGGGGTGGAATGCTTTGCTTTGAATCATTTATTGGAGGTAAATCGAGAAAATGGAGTTAATCGGGTGTTCAGGACACGAAAAGAGGCCAAAGAACCGAAAAGAATCAAGTTAGAGGCTTCCAAAATAGGCTCATTCGAGGTCCAACGTCGAGATACTGCTCTCTGGGTGTCTCGACGCTGGAATTTTTCCTTAACTGATTCAAGCGGCAAAGTCGAGAGATTCTCTATAAATAGTTTGCGATTAGGGCTGGCCAAGGGGACTTCTTTTGATGCAATTTTAGCCCTACATTCGACTAAGGACCTTCTATGGAAGCTGAAGCAAGTGGAGGAAGCGGGATTCAAGGCTAGGCTCGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTTCCAGCGACATTAGTGTTTAA

Protein sequence

MERMIRGIEELSERMGRLEAQYQPRERVPPPRIDNDREDDYEDDGSDQPDDDQVTLVAILHARVIQVVLIKPLVEFSINRLRLGLSKGTYFDEILALNLTKDLLWKLKQVEEVGFKARLVEIVTGTCGFSDISVVDPVALGLQASMRRSSSFQGSIVHPIRSFLVLMLEYALLLYTLRTMHVLSLGVECFALNHLLEVNRENGVNRVFRTRKEAKEPKRIKLEASKIGSFEVQRRDTALWVSRRWNFSLTDSSGKVERFSINSLRLGLAKGTSFDAILALHSTKDLLWKLKQVEEAGFKARLVEIVTGTCGSSDISV

Homology

[Close]

BLAST of Spg004712 vs. NCBI nr
Match: XP_022157414.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 1.0e-03
Identity = 33/59 (55.93%), Postives = 41/59 (69.49%), Query Frame = 0


Query: 1  MERMIRGIEELSERMGRLEAQYQPRERVPPPRIDNDR-EDDYEDDGSDQPDDDQVTLVA 59
          +ERMIR +E L+ER+GRLE Q Q   RVPPP       ED+YE DGSD  +DDQ T++A
Sbjct: 23 VERMIRSMEALTERIGRLETQNQAEGRVPPPPXXRVMDEDEYEGDGSDHWEDDQATVLA 81

[Close]

BLAST of Spg004712 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWE9 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024115 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 4.8e-04
Identity = 33/59 (55.93%), Postives = 41/59 (69.49%), Query Frame = 0


Query: 1  MERMIRGIEELSERMGRLEAQYQPRERVPPPRIDNDR-EDDYEDDGSDQPDDDQVTLVA 59
          +ERMIR +E L+ER+GRLE Q Q   RVPPP       ED+YE DGSD  +DDQ T++A
Sbjct: 23 VERMIRSMEALTERIGRLETQNQAEGRVPPPPXXRVMDEDEYEGDGSDHWEDDQATVLA 81

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg004712 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022157414.1	1.0e-03	55.93	LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115 [Momordica charantia]	[more]

BLAST of Spg004712 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg004712 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1DWE9	4.8e-04	55.93	LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115 OS=Momordica charantia...	[more]

BLAST of Spg004712 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 1..21
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 15..49

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg004712.1	Spg004712.1	mRNA