Lag0004920.1 (mRNA) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0004920.1
TypemRNA
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6: 8507267 .. 8514299 (+)
Sequence length987
RNA-Seq ExpressionLag0004920.1
SyntenyLag0004920.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCTCTCCAGTTGGCTTTTAACTGGCGGCTGGCCCATTATCCTCCTCCCCTTGGCCATCAGCTACTTCCATCGTCGTCGCACTGCCCATGCCGCTTCCACGAAGCTGGTCTTCATGAAGCTGCGTTTGCTTTTGGCCTTTGTCGTAATTGGCGTTCTCACCAGCCTCGACAACTACCTGTACGCTGTGTGTGTGGCATTCTCACCAGGCTCGACAACTACCTGTACATTATGTGTGTGTACAAGGTTAGTCTCTAAAACTTTTATGGTTGTGTCAATTTGATCCCTGAACTTTAAAAAAATTCAAATTGGTTCTACTTCATCGAAATTTCGGCTCAACACTACAATTACCCAGACCAATAGGGGGAGAGGAAGGATCTCCCCTCTAAACAGAATCAATAGCCTCCCTATTTACATAGAAGCAAGACTTTATTTTTGGTGGTTTTATATATAGCAAAGCCAAATTTAGTGCCCTTTAAATTTAACAAACACTAGAAAATATATAATTAAGTCACCTCACAATATAATTATAACTCTATAGCTCATGCATGAGACTATATACATGACAATTATGATAAATATCATGCTAAAAAAATATAGCATCAATAATATGAACTAAAAATTGCTAAATTTCTCATAAGCCACACTCAAAATTTAACTCTCTTTCATCAGTAGAAAAAATCATCCTATATAAAACTTAATATATAGAATGACGGTATAAAAATCGATGTAAGTGGCAAGCGAGGGTTGACAACCTAGACTGTATTTGTGGAACAAACTCTCCAAATAACCAAGATTTGACCAAATTAAACGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAGAGGCCAAATGAAAAACTCGCACAAATCTAATAGATTATATTGTTAAATATACTAAAAAAAGGGTAAAAAATCACTGAACTTATCTTTGTCATGCCTTTGTCCCTCTCTCGAATTATTGCAGGGAGGAGTCTTTCTTCATCTCTCGACTTATGGACCCTTTTGCAGTCGCTAATATCAAGAGCTCCAAGAGCCCTCTTCAGAGAAACTAGCAATTCTAAAATAGAGAAAATAGAGAGATTAGAAAAGCTAAGAAAAATCTCAACCACAATGGAATGATTCCATCCATGTTAACAAAGACACATTGCTAAGATTGAACTCTCGATTCGTATTAAGGAGTTAAAAGCCCAGGTAAGTGAACCTACTATTGAACCTTTTAATTGGGCGCGAATATTTGAGTTCCTAAAATTCTCGTGTTTAGAATAATTGAATTTCTAAATATTTGTGTTTATGAGTCGTTCTTGAATTTTATTATGATTGTTAAAAGCATGAAAATTAAGCATGGCAAGTTTATTTCTTTAATTGCGTATGCGTTTATGAAGAATGTTGTAAGCAAGAAATTTATTATTTTTGCTTGTATTTGTTGATATTTAAAATAGTTGAGTTGGTGGTCTCTCAAAATCCCATTAAAGGAATTGAATTTAAATTATTTATGTCTTTAAATTCCATCAAAGGAATGAGTTTAAATTAGTGTACATGAAATTGATGTATATTTGGAGATGCCTACATAGGGCTTAGGGACATGAAATTCTAAGTCGAGGTTTGTGAAATTGACGACCTCGAGGTTTCGTGAAATTGACGGCTTCCGTAGGAGACATATGTAATTGATGTGTCTAGGATATGCATGAAATTGATGTATATCTTCTCTCTAATTTAAAGTTTAAAAATGAAGTTTAGAGTCACCAAAATTATATTTGTTGTTGATTTTAGAATGTTTTTAAAAACGTGACCCAACCTCAATAGTAGGGTCACTTACTGAGTATTTAAAATACTCATTCTTTTCAAACATATTTTTTTTTTCAGGTAAAGGTAATGGCAGATGAGAGGCGATTGATGAGAATCCGATAGACAGCCTTGAGGGGACCTGAGTTTCATATTTTTCTTCCGCTTAAGAAGTCTGCTTTACTTTATTGATTTATAAATCTGTTCGAGAAATTTTCTAGAGGCCATGAATATTCATGTTTTAGTAATTGTTTAAGAGAATTTAACATCTTTAAATTCAGGGATCTTGAAATAAAGCTTTGTTTTAAAGTTTTTGTTTAAATTAGTGTTTATGTTTTCAAATTATTATTGTTATTTTAAAAAGGCCTCCAAAGCATGTATTGTCGTAACGGTCCCTTTTAAGGCTTATTAAGAAGTCGGGTCATTACAGAAATAGTGTGTGTGTGCGAAATTCAATTCACACAATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTAACAATTTCGTTTTCCGATTGTTGGAAATAGTGTGTGTGCGAAATTCAATTCACACAATTCCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTACCATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTGTATGTAATCAAATTTAAGAAAAGAACATATATTGCTTGCCCATTTCAAAAAAATTCAATTCACACAATTTCACTTTCAGATTTTTGGAAATAGTGTGTGTGTGTCCCATTTCAAAAAAATTCAATTCACACAATTTCACTTTGAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTTGCTTTCAGATTGGAGTGTGTGTGTCCCATTTCAACAAAATTCAATTCACACAATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTTAAGATTGCTGGAAATAGTGTGTGTGTCCCATTTAAAAAAAAAATCAATTCACACAATTTCACTTTCAAATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAAGAGTGTGTGTGTGTCCCATTTCAAAAAAAATCAATTCACACAATTTCGATTTCAGATTGTTGGAATCACACAATTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTACAATTTTACTTACAATTTCGCTTTCAGATTGTGGGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTTCACATTGTGTGTGTGTGTGAATTTCGCTTTCACATTGTTGGAAATAGTACAATTTCGCTTTCGTGCGTGTGTGCAAGTGTGCATGTTTATACTGAATTTCTATAATTCACACAAAAACTTGGCACAACCATTAATGAGTGAACAAATTAAAACACTACATAAATCAAATTTAAGAAAAGAACATATATTATGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAATATATATATTGTACTGAATTTCTATAATTCACACAAAAACTTGGCACAACCGTTAATGAGTGAATAAATTAAAACACTACATAAATGTGTTTGTGTTTGCTTTCAGACTGTTGGAAATAATATATATATCTGTGTGTGTACTGAATTTCTGTAATTCACACAAAAGCTTGACACAACCGTTAATGAGTTAATAAATTAAAACACTACATAAATCAAATTTAAGAAAAGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAATGTGTGTGTGTAAAAAGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATAGTGTGTGTGTGTTGTGTGTTCGCTTTCAAATTGTTGTGTGTGTGTAAAAAGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCATGTGTGTGTAAAAAGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTGAGATTGTTGGAAATAGTGTGTGTTGTGTGTTCTCTTTCAGATTGTTGTGTGTGTAAAAAGAACATATATTGTGTTTCTCTTTCAGATTGTTGGAAATTGTGTATGTGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAAATTGTTGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGAAAACTGTATGTGTGTGTAAAAAGAACTTATATTGTGTTCGCTTTCAGATTGTTGGAAATTGTGTGTGTGTGAACATATATTGTGTGTTCGCTTTCAGATTTGTGTGTCCGGTTCTATACGGATTTGTGTTGCCGTTAATCGAATTGAGGTACAAGAAGGCGAGGTAGAGAATTACATATACATTGGTATTGGAATTTCAGTTGGTGATATCTTTGCCACCATTCTCTGCACCATTGGAATGTTGATCAATAATGATTTCCAGGTTTGATCTCTCTAACTCTAACTTCTCCCCATCATTACTTTTTCAACTATCCTACCAATAAAAGATAAAAGGTTAAAATATCATTTTCAAAATATTCTAAATTTAGTTTTTCTGTGCTTAGAATTGAACCATATTACCCTTTATTGTTTGCCAGGGAAGAGTAGTTAAGAATTGTGTGGGACCCATAGAATAAAATATTATATCATTAAATGTTCATCAAATGACGTGTCAAATGCTGAATGGAAGAAGTATGTACTACCGTAGTACTAGAAATTTTCCATACTAGTATGGGATCCTAATTGTCAACATTTTAATAGTGGTATGTAGCTCTACGTACAAACCAAGTTTTTTTCCTTAAAATTTGTCCCTACCTTTTATTTTATTTTATTTTTTTTAAAACATGTTTTAGTTTAAAATTAATTTTGATAAGTTTGGTTAAATAATAACAATAATTTCTATATATAAGACACTACTTTTACATATATTTCCAAAATTTATATAGAGATTAAAAAAAAAGTTGACAATTTTAAGCTTTATTGAAAGTAAAAAACTAAATTTGAACATTTCAAGATACATGGACTAAAATAAAACAATACCTAAAATACAGAGATCAAAATAAAATGATAGGAAATTATCAAAATTTTAAAATAAATTGCTTAATTTGAAAATACTAGAGAATTTACGGTGGGTGGAAAATAAGAATGATATAATTGTAATTATAGCACAATGTTAAAAAAATTGCAAATATAGCAAAATCTATTGGAGCATATTATTGATAGACACTATAGACTTTAGTTAATTAGAATCTATCAATCTACTGATAGACTTCGATTATCAGAGTTTATCAGTGTCTATCGCTGAAAGACTCCAATTAATCAAAATCTATCAGCAATAGACAATGATAGAATCTGACGACAACTTTTTGGTCTTGTACAATTAATTTTGTTATATATGCAATTAGTTTGCA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mRNA sequence

ATGGCTCTCCAGTTGGCTTTTAACTGGCGGCTGGCCCATTATCCTCCTCCCCTTGGCCATCAGCTACTTCCATCGTCGTCGCACTGCCCATGCCGCTTCCACGAAGCTGGTCTTCATGAAGCTGCGTTTGCTTTTGGCCTTTGTCGTAATTGGCGTTCTCACCAGCCTCGACAACTACCTGTACGCTGTGTGTGTGGCATTCTCACCAGGCTCGACAACTACCTGTACATTATGTGTGTGTACAAGATTTGTGTGTCCGGTTCTATACGGATTTGTGTTGCCGTTAATCGAATTGAGGTACAAGAAGGCGAGGTAGAGAATTACATATACATTGGTATTGGAATTTCAGTTGGTGATATCTTTGCCACCATTCTCTGCACCATTGGAATGTTGATCAATAATGATTTCCAGTTTGCAACTGTGCTATATTTGCTATTAATTTGGTTCAATTTGCCATCTATGCAACTGTCCCATCATCGGTTCGCCGGCAGCCGGTGGCGGCCGGCCACCGGAGCTGAAGAAGATGGGAGGGGGAAGGAAGAAGATGGAGGGGGAAAAAAGCCTCTCCCATTCTTCTTCTTCCTTGGTACCCGATCGGCAGCTTCCTCGTGCCCCATCTCCGACGACGTTCACCAGCGGTCTTCCGGCGAGCGTGACTCCTACGACGATCTCCATGGCGACGCAGCATCGATAGGCAGCAGCGTTTCACGTTGGTCGCGGCTGTGGCGTGTCCTTTCGGCGTTTGTGGCAGTCGTAGGCGACGATTCTGGTGTTGCTGCAGCGATCTGTGCGTGGTTTACGGCGGAACAGCAGCGTGCAGGCGCGTGGGCAGTTTGGTTGTGGAATTTGTTCTTGGCATTATCGGCGAGTTGGAGTAGTGGGTATAAGAGTTTTAGCGGTTGCGAAGAGATTGCATCTTTGGGTAAGGGCAAGGGCAGACGAATGGCGATTGATGAGAAATCGATAGATGGCCATGGGAGGACTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTCTCCAGTTGGCTTTTAACTGGCGGCTGGCCCATTATCCTCCTCCCCTTGGCCATCAGCTACTTCCATCGTCGTCGCACTGCCCATGCCGCTTCCACGAAGCTGGTCTTCATGAAGCTGCGTTTGCTTTTGGCCTTTGTCGTAATTGGCGTTCTCACCAGCCTCGACAACTACCTGTACGCTGTGTGTGTGGCATTCTCACCAGGCTCGACAACTACCTGTACATTATGTGTGTGTACAAGATTTGTGTGTCCGGTTCTATACGGATTTGTGTTGCCGTTAATCGAATTGAGGTACAAGAAGGCGAGGTAGAGAATTACATATACATTGGTATTGGAATTTCAGTTGGTGATATCTTTGCCACCATTCTCTGCACCATTGGAATGTTGATCAATAATGATTTCCAGTTTGCAACTGTGCTATATTTGCTATTAATTTGGTTCAATTTGCCATCTATGCAACTGTCCCATCATCGGTTCGCCGGCAGCCGGTGGCGGCCGGCCACCGGAGCTGAAGAAGATGGGAGGGGGAAGGAAGAAGATGGAGGGGGAAAAAAGCCTCTCCCATTCTTCTTCTTCCTTGGTACCCGATCGGCAGCTTCCTCGTGCCCCATCTCCGACGACGTTCACCAGCGGTCTTCCGGCGAGCGTGACTCCTACGACGATCTCCATGGCGACGCAGCATCGATAGGCAGCAGCGTTTCACGTTGGTCGCGGCTGTGGCGTGTCCTTTCGGCGTTTGTGGCAGTCGTAGGCGACGATTCTGGTGTTGCTGCAGCGATCTGTGCGTGGTTTACGGCGGAACAGCAGCGTGCAGGCGCGTGGGCAGTTTGGTTGTGGAATTTGTTCTTGGCATTATCGGCGAGTTGGAGTAGTGGGTATAAGAGTTTTAGCGGTTGCGAAGAGATTGCATCTTTGGGTAAGGGCAAGGGCAGACGAATGGCGATTGATGAGAAATCGATAGATGGCCATGGGAGGACTTGA

Protein sequence

MALQLAFNWRLAHYPPPLGHQLLPSSSHCPCRFHEAGLHEAAFAFGLCRNWRSHQPRQLPVRCVCGILTRLDNYLYIMCVYKICVSGSIRICVAVNRIEVQEGEVENYIYIGIGISVGDIFATILCTIGMLINNDFQFATVLYLLLIWFNLPSMQLSHHRFAGSRWRPATGAEEDGRGKEEDGGGKKPLPFFFFLGTRSAASSCPISDDVHQRSSGERDSYDDLHGDAASIGSSVSRWSRLWRVLSAFVAVVGDDSGVAAAICAWFTAEQQRAGAWAVWLWNLFLALSASWSSGYKSFSGCEEIASLGKGKGRRMAIDEKSIDGHGRT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 170..186
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 168..187

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Lag0004920Lag0004920gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lag0004920.1.exon1Lag0004920.1.exon1exon
Lag0004920.1.exon2Lag0004920.1.exon2exon
Lag0004920.1.exon3Lag0004920.1.exon3exon
Lag0004920.1.exon4Lag0004920.1.exon4exon
Lag0004920.1.exon5Lag0004920.1.exon5exon
Lag0004920.1.exon6Lag0004920.1.exon6exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
cds.Lag0004920.1cds.Lag0004920.1CDS
cds.Lag0004920.1cds.Lag0004920.1_2CDS
cds.Lag0004920.1cds.Lag0004920.1_3CDS
cds.Lag0004920.1cds.Lag0004920.1_4CDS
cds.Lag0004920.1cds.Lag0004920.1_5CDS
cds.Lag0004920.1cds.Lag0004920.1_6CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lag0004920.1Lag0004920.1-proteinpolypeptide