Lsi06G006210 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AACATAATGAATTTATACCGAGAGGAAGAAAGCCCTAAAAATAGAGAGGGCGGTAAGGACAATTTACACAAGACATGTGGTCAACTATAATGAGAGAATTACAACATAAGAAATATTTAGAGAAGTCATTTGACAAATAAATCAGGAGGTGCGTGGCGTATCCTTTGAGTCCAGGCGGTGCGTTTTGGCTATCTCCTTTACAATATTGACAATTTGCCAAAAATTAAAAAGGTATAACACTCTTAAAAAAATATCAACGTATACATATTACACACTTTAATTATCGAAAATAAATTTGAACTTCTTTTATTTATCCTTCAATTATTTGTATATGTTTCTACATTTCTCTTGGAGTTACCATAACATTGACCGATAGTTTTTTTCAAAGGTACGTGGATGCAACAATATTGACCAATAGTTTTTTTTCAAAGCTACGTGGATGCAACAATTGAAATAGAAATAAATAATATTTTTTAAAAGAAAAATAGTACGTACAGAACCAAATATAAATTTTATGTTGAGTAAAATTTTTACAAATTTTGGAAAATTTCCTGCATATCTACGCCACAAAAAAAACATACAAAGTAGAGTGGAATATTTCATTGAAAAAGATTATTAACAAAAAAAAACTTACAATAAAAATTGACACTCATGTTTTCTTTGATCTTATCCTAACTAAAGCACTTGAGAAATAATTTTGTCGCATTTACCGCATCATCTTACTCCAACAAAAAAAAATGTCCTTGATCACCAATAAAATCACATATTGGTAAGGGTAAAGTAGTCCAAAATTGTTTTTCAAACATTCTCGCTTTTTATTAGATTATAGATTATAGATATACATATTATAGATTTGTATTATACAATTAAATAAAATTTTACTTTGACAATATTTCATGTGGACGTCTTTTCATATTCCATTCACTTAACCTCTATGAATGTATCAAAATTGTATTTATTATATCTACTACTTTTATTATGAAATTTATATTACATTTTATGGTTTTTGATGTTTTTTTTTTTATTTTCTTTAAAAAAACTGTTTTTTAATTATCTTGAAGGATTTTTCTTAATAAAAAGCTATTTTATTTATCGTTGTTTTTTTAATTACTTTATTTATTAAATTTTTTTTAGAAAAAATCAAACTAACTTTTCTAATGAACTTTTTAACTCAATAAAGATAGAATTAGTTTACTAACTTTGATTTCACATTATAATTAAAATTGTTCATTATAATGGAAGAAAAATTCCTTCAATCCTTTGAGAATGAAATAACAAAACTTTTTGTATTTCGATCCAACTTTTTAGTTTTTAATTTCAACATGTCATTTTTAAATTTTTTATTATTAATTAATTTAATTAACTAATTTACTATTTAATTTGTGAGACATAGGGTTACCCTGACTTTTTATTCAACAAAAGAACATTAGCTTATTATACATTACCAACAAACTTTTATCTTTCTAACAAACATTTTAAATAAAATAACAACATACTAACCATCAAATAAGAAGGAATATTTATAATCTTAAATAAATATTGTCGGTAGAAGGTTAAACATAATAGATACACAAAAAGACGTATGGTAAGAAATTAAATTCAATGTAATTGAATAGAAATGATATTTTTACTAAAGAATAAAAAAGAAGAGCATCTAATTGTAATACATATGAAATTGTTAATGGCATATTTGTAATTTATTAAAAATAAAATGGGTAAAATCGTCTAGAAAAGTTTTTTTTTTAAGATTGTTGTTTATTAATAGATTATAGATAAATGTTTTTCATCGAATAGTTCCAATAATCTAAGTCGTGTTTAGTTTTTTACTTTGTTTTTGAAAATAAGTCATTTGCATACAACTTTCCAAAACAATTTTCTTCTTCCTTCCAAAAGCATGCATGAAATATAAAAGTCTTGATATATATATATATATATATTTCCAATGATATGATAACAGACTCTCTAGCATAAATAATAATTAATTTTCACATAATAAAATATATTTTGTAAAAATGGCATATTTTCAAAACAACCATCTAAGTTAGGCATCATAGTGAGGAGGACAATTTTGGAGAGTTTGAGTGATGAGAATTAAGTATTTGAATTTATTAGCCATATTACATTAGCTAAACGAAGTTGATGACTTACAATTTCAAACCAAAGATGTTAAATGAATAAGCAAATCCATATGGGGAAAAACAAATTTTTGTTATAATACTTTTAATTGGGTAATAAGTTATTTAGGATAAGGCCAAACAATCTTTTTAAAATTTCACAAAAGCAACTCATGTAGCTAAAGTTTGGGCAATTATATTCATAAACACTATTTCTATCTTTAGAATCCATCAACAAATAGAGGACAAATATAGATTAGAAAGACCTCTCAAATTGTCACTATGTTTTCCTATATAATTAAACACGTTGTTCAAGACAAATGAATCAACCAAACATACAGTTGTAGGTTCAAAGATGTTTAACCTTCAATGGCTTGTTCTTCCCCTCATTGCAACTTTAGCTTGCTTTTCTTTTTGTACAGCAGACGATGTTTCCTATGATTCAAATGCCATAATTATCAATGGTGAACGACGTGTTATATTCTCAGGTTCAATTCATTATCCACGCAGCACCGAAACAATGTGGCCTGATCTTATTCAAAAAGCTAAAGATGGTGGACTTGATGCAATCGAGACATACATTTTTTGGGATCGCCACGAACCTCAACGACGAAAATACGATTTCTCTGGACATCTAAATTTTATCAAATTCTTCCAGCTCGTTCAAGATGCTGGGCTATATGTTGTGATGAGGATTGGTCCTTACGTGTGTGCCGAGTGGAACTACGGAGGCTTTCCACTATGGTTGCACAATATGCCGGGAATCCAACTTCGAACTGACAATCAAGTTTACAAGAATGAAATGCAAACTTTCACAACAAAGATAGTGAATATGTGTAAACAAGCCAACCTATTTGCATCACAAGGAGGGCCAATTATCCTAGCTCAAATTGAGAACGAGTATGGAAACGTGATGACACCCTATGGAAATGCAGGAAAAACATATATCAATTGGTGCGCTCAAATGGCTGAATCTCTCAATATTGGTGTTCCATGGATCATGTGCCAACAGAGTGATGCCCCACAACCTATCATTAATACATGCAACGGATTCTATTGTGATAACTTTAGTCCTAACAATCCTAAGAGCCCAAAAATGTTTACTGAAAATTGGGTGGGATGGTTCAAGAAATGGGGCGACAAAAACCCTTATAGAAGTGCAGAAGATGTAGCTTTTTCTGTGGCAAGATTTTTCCAATCTGGTGGCGTGTTTAACAATTATTACATGTATCATGGAGGCACCAACTTTGGTAGAACATCGGGAGGTCCATTCATCACTACATCTTACGACTACAACGCCCCACTTGATGAATATGGAAACTTGAATCAACCCAAATGGGGACATCTCAAACAACTCCATGCATCCATCAAAACGGGAGAAAAGATTCTCACTAACGGCACCCGCTCAGACCAAAAATTTGGTAGCTTTGTAACTTTGACGAAATTCTCCAACCCAACTACAGGGGAGAGGTTTTGCTTTTTGAGCAACACAGATAGCAGCAATGATGCTACCATAGATTTGCAAGCAGATGGAAAGTATTTTGCACCAGCTTGGTCCGTGAGCATTCTTGACGGTTGCAACAAAGAGGTTTTCAACACTGCAAAGATCAACTCTCAAACATCTATGTTTGTGAAGGTGCAGAATGAGAAGGAAAATGCACAACTCTCGTGGGTTTGGGCTCCAGAGCCCATGAGAGACACTCTACAGGGAAAGGGTACGTTTAAGGCAAACCTTCTTTTGGAACAAAAAGGAACTACTGTTGATTTCAGCGACTACTTATGGTACATGACGAATGTTGACACCAATGCAACATCTTCACTTCAAAATGTAACTCTCCAAGTGAATACAAGGGGTCATGTGCTTCATGCCTTTGTGAATAGTAGATACATTGGGTCGCAATGGGGAAGCAATGGCCAAAGTTTTGTATTTGAGAAACCAATTCTATTAAAACCAGGAACCAACACCATAACCCTTTTGAGTGCCACAGTAGGACTGAAAAATTACGATGCATTTTATGACACGGTGCCAACTGGAATTGATGGAGGTCCCATTTATCTAATTGGAGATGGAAATGTCACGACTGATTTGTCATCAAATTTATGGTCTTATAAGGTTGGATTAAATGGAGAAATGAAGCAACTTTACAACCCGGTGTTCTCACAAAGAACAAATTGGAGCACATTAAATCAAAAATCAATTGGGAGGAGAATGACATGGTACAAAGCAAGCTTTAAGACACCTTCAGGAAGTGACCCTGTAACATTGGACATGCAAGGAATGGGAAAAGGTCAGGCTTGGGTAAATGGACAAAGCATAGGCCGATTTTGGCCTTCTTTCATTGCTGGCAATGATAGTTGCAGTGCAACCTGTGACTATAGAGGTGCATATGACCCCAGCAAATGCGTTGGAAATTGTGGGAATCCTTCCCAAAGATGGTATCATATTCCAAGATCGTTTCTATCAAATGACACAAACACGTTGGTTTTGTTTGAAGAAATTGGTGGAAATCCTCAACAAGTCTTAGTTCAAACCATCACTATAGGAACTATATGTGGAGATGCTAATGAAGGAAGCACATTAGAGTTGTCTTGTCAGGGAGGGAATATCATCTCTGAAATCCAATTTGCTAGCTATGGAAATCCAAAGGGAAAATGTGGTTCGTTCAAACAAGGCTCATGGGATGTGACAAACAGTGCTCTTTTGGTGGAAAAGACTTGCATTGGCATGGAGAATTGTTCGATTGATGTATCTGCAAAGTCGTTTGGATTAGGTGATGCTAAGAATTTGTTTGCGAGATTGGCTGTTCAAGCACTATGCTCAAAGAATTGAGTGGTGTAAAATATATTCTTCATGTATAATGAATGCTAGTATTTGGTGAA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NIMNLYREEESPKNREGADDVSYDSNAIIINGERRVIFSGSIHYPRSTETMWPDLIQKAKDGGLDAIETYIFWDRHEPQRRKYDFSGHLNFIKFFQLVQDAGLYVVMRIGPYVCAEWNYGGFPLWLHNMPGIQLRTDNQVYKNEMQTFTTKIVNMCKQANLFASQGGPIILAQIENEYGNVMTPYGNAGKTYINWCAQMAESLNIGVPWIMCQQSDAPQPIINTCNGFYCDNFSPNNPKSPKMFTENWVGWFKKWGDKNPYRSAEDVAFSVARFFQSGGVFNNYYMYHGGTNFGRTSGGPFITTSYDYNAPLDEYGNLNQPKWGHLKQLHASIKTGEKILTNGTRSDQKFGSFVTLTKFSNPTTGERFCFLSNTDSSNDATIDLQADGKYFAPAWSVSILDGCNKEVFNTAKINSQTSMFVKVQNEKENAQLSWVWAPEPMRDTLQGKGTFKANLLLEQKGTTVDFSDYLWYMTNVDTNATSSLQNVTLQVNTRGHVLHAFVNSRYIGSQWGSNGQSFVFEKPILLKPGTNTITLLSATVGLKNYDAFYDTVPTGIDGGPIYLIGDGNVTTDLSSNLWSYKVGLNGEMKQLYNPVFSQRTNWSTLNQKSIGRRMTWYKASFKTPSGSDPVTLDMQGMGKGQAWVNGQSIGRFWPSFIAGNDSCSATCDYRGAYDPSKCVGNCGNPSQRWYHIPRSFLSNDTNTLVLFEEIGGNPQQVLVQTITIGTICGDANEGSTLELSCQGGNIISEIQFASYGNPKGKCGSFKQGSWDVTNSALLVEKTCIGMENCSIDVSAKSFGLGDAKNLFARLAIVWMDVGGNQ Homology
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SCV5 (Beta-galactosidase 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BGAL7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 936.0 bits (2418), Expect = 2.8e-271 Identity = 442/790 (55.95%), Postives = 578/790 (73.16%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49676 (Beta-galactosidase OS=Brassica oleracea OX=3712 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 933.3 bits (2411), Expect = 1.8e-270 Identity = 446/807 (55.27%), Postives = 578/807 (71.62%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C6W4 (Beta-galactosidase 15 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BGAL15 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 883.2 bits (2281), Expect = 2.2e-255 Identity = 436/803 (54.30%), Postives = 551/803 (68.62%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RUV9 (Beta-galactosidase 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os01g0533400 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 837.0 bits (2161), Expect = 1.8e-241 Identity = 402/800 (50.25%), Postives = 537/800 (67.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10NX8 (Beta-galactosidase 6 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os03g0255100 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 823.5 bits (2126), Expect = 2.1e-237 Identity = 407/818 (49.76%), Postives = 519/818 (63.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQ87 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492519 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1567.7 bits (4058), Expect = 0.0e+00 Identity = 735/795 (92.45%), Postives = 763/795 (95.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LXX7 (Beta-galactosidase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G643050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1553.1 bits (4020), Expect = 0.0e+00 Identity = 725/794 (91.31%), Postives = 761/794 (95.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V9Y9 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold130G00750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1552.7 bits (4019), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/795 (91.32%), Postives = 757/795 (95.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UJD2 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold231G00340 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1552.3 bits (4018), Expect = 0.0e+00 Identity = 727/796 (91.33%), Postives = 756/796 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UN87 (Beta-galactosidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold231G00310 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1552.3 bits (4018), Expect = 0.0e+00 Identity = 727/796 (91.33%), Postives = 756/796 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. NCBI nr
Match: XP_038896535.1 (beta-galactosidase 15-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1588.2 bits (4111), Expect = 0.0e+00 Identity = 746/792 (94.19%), Postives = 771/792 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. NCBI nr
Match: XP_008451143.1 (PREDICTED: beta-galactosidase 15-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1567.7 bits (4058), Expect = 0.0e+00 Identity = 735/795 (92.45%), Postives = 763/795 (95.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. NCBI nr
Match: XP_004135782.3 (beta-galactosidase 15 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1564.7 bits (4050), Expect = 0.0e+00 Identity = 736/795 (92.58%), Postives = 764/795 (96.10%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. NCBI nr
Match: XP_031741738.1 (beta-galactosidase 7-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1554.3 bits (4023), Expect = 0.0e+00 Identity = 725/795 (91.19%), Postives = 760/795 (95.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. NCBI nr
Match: KAE8653552.1 (hypothetical protein Csa_007631 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1553.1 bits (4020), Expect = 0.0e+00 Identity = 725/794 (91.31%), Postives = 761/794 (95.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. TAIR 10
Match: AT5G20710.1 (beta-galactosidase 7 ) HSP 1 Score: 936.0 bits (2418), Expect = 2.0e-272 Identity = 442/790 (55.95%), Postives = 578/790 (73.16%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. TAIR 10
Match: AT1G31740.1 (beta-galactosidase 15 ) HSP 1 Score: 857.1 bits (2213), Expect = 1.2e-248 Identity = 426/802 (53.12%), Postives = 537/802 (66.96%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. TAIR 10
Match: AT2G28470.1 (beta-galactosidase 8 ) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 1.5e-235 Identity = 412/816 (50.49%), Postives = 523/816 (64.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. TAIR 10
Match: AT2G28470.2 (beta-galactosidase 8 ) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 1.5e-235 Identity = 412/816 (50.49%), Postives = 523/816 (64.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi06G006210 vs. TAIR 10
Match: AT3G13750.1 (beta galactosidase 1 ) HSP 1 Score: 766.9 bits (1979), Expect = 1.6e-221 Identity = 394/817 (48.23%), Postives = 506/817 (61.93%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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