Tan0020158.1 (mRNA) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTGATGGAATTCGAAAACCAGTAGACATAAAATATGAAAATAGAAATAATTTCGGAGATAAAACAAGAAATGGAAGGTAGACTTTCTACGAAATGTGTAGCTGAATTGACTAATTAAAATGCTAAAATCATGAGAAAAAGTTGTTAAACGAAAAAATATGTAAATTAGGAAACTTAATAGCTAAAATTGTGGGATTTGGAATCAAATATTAAATAGATATTAGATAATATTTCAAATAAATATTTATACTTATTAAGGAGAGAGAAATTTAAAAAGGGCATGTTGGTCCAAAATTACACCAAAAATCCTATGTTTTAAAATGTTTAAATATTTTGTACATTTATGTAAATATGTATGAGAAATATTGGCATCCTTGTAAAAATTCCATTAAAAATTTGAGCACCAATTTAACATCTTTAAAGTTGAGGGAGTTACTAGACACAAAATTGAGAATTTTGTAACTTATTAGATATTTTAAAGTTACTAAACTTAAAATTTAACCTAAATGATAACCTAAATGGTAAGAAACAAAAACTAATATTTTAAAAAGAAAAAACCAGTATATTACCGCTAAAATTTAAAACTGCATTGCCCTCAATTATCCTTCATCCATTGCACCCTCGATTTCCTCTCTTTTGAATCTCATTGTCGTCTTCTTCCTTCAATTTTTCTACCGACTATAAGAGCTCAGTCTCTCTCTACAGTTATTTCCACCGTTATTTCAACCTTGGTCTCTTCCGCCTCCTCCCTCGTCGGTCCACCCAAATCCACCGCCCCTGAGTTCTTCGAGCTCCCGGACTCGGTCGGCGTCAAAGCCTTGGAGCTTTGCATTGGCTCAGGGGAAACCTCCGTCGACGGAGACCAGGTGACTTGATTTCGAATCGATTTGGAATATCAATTTATCTATGTGGACTAGAATTTTTCTTACAATTTATTAGCTTTTTTTTTCATCAATACATTTTAGGATTTACGTTCCTTTCATTAAGGTTTGTTGGTTCTCTGAGATTATGTTCTGAATGACTTTACGAAATCTTTACATATGTATTTTTGGAATGATTTTGTAGACAATGGGCACCAAGCTTTTGAGCTAGCAATGGATTTTTAAGTGTATTGGGGACAAGAATTTTGTACGTTTCTCAGATGCATTTGTTGTTGTTAAGGATGTACCATTCTTAAAAGACTCTTAAAACGCCTTGATGATTGGGTTCCCAGTGTTCTTTTAAAGTAATTCTCTGAAATGTCCATCAGGATTGAGCGATTAATCATTCCCCCCAAAAAATAGACAACGACTTCAATCTCTTCTTGAAAAGGTCTTTCCAACCACAACCTATTGGTCTCATTGATAGGGTTCCATCTAAATCAATAATCAACTATCTGCTACCTATTTCTTTACCGTAAAGCTTTCCGAAACCCGTTGATCTTTTCTTCCATCTCTTCGTCTCAAACTAGAAGTCGACCCGTCTAAGGTTATTATATAGTGGATTATGCATGTATTCCTTCTCCTATAGGACATAATTTTATGGAGAAATCTGTGTTTTCATCATCACCTTTGTTAAGAATCCTTCTTGGCTTTTTAAGTCTACATCTAACCACTCTGGCATTCAAGTCCAAATTATGCAATTTAAGGTTTTTTCTTTGGTCTTTCTTTTCCTCAGTGATTTTTTATTATGGAAGTGGTAGAATTCTTTTGACTTTTACTGTCCCTAAAAGTGCTTATGTTCCAACTTTTAAGATTGGATTTCATCTTCTTAAGCTTCTAACAGAGCAAATTATCATCCTTCCCACGAAGGCTACTCCTCCATCAATGACCTAAAATGCATATCTACTTCCTATTCCATTATCAGATATTAGGATAAGCTCAAAGAATTTAATGAAGGTACAATCTTGGAGAGAATTCTAAAGTTTCTAAGATTCAACAAAGTACCTTGCAATGAGAAAAATCTTTGCTCACTTTATTAGTTATCACTGGAGAATAATACAGTCGAAAAGAATAATCTCCAATATGAGAAAGGTGATGTATTTATAAAGCTTACATCGATGAAAAATCTCCTAACACTTTTAACTGTTTATATCAAACTGATTTAACAAAATAAAACAAATACATAACCGTAGCAGCTAATCCTTTATTGGGCTTGGCCTTCAATGGGCTTCCTTCCAAACAAAGTTGGCTCTAGCCCCACATTTATAACCTTTGGAAAAGGAGGCTAGGAATAGTAGCTAATTTAAGGGAATGAGAATCCCCGCACAGTGGAAGACGATCGAATCGTCGAGATATCGTTACGCTACTCGAGTTTCATTAAAATCAATTATCAAATAATCTAGGCTAAACATGCTCAAAGGAAAGAAAAACAGCAAGTAAAGTAAACTTACTTGTTGAAGACAATCTTATAGAATTCCTTTCTAGCGGATCACGAACTCTTCGTGCGAACTTGATCTCTACGAATACTTCTCTCGAATAAAACCCGAACACAACCAATGGCTTCTCGATTGTTCTTCCTTTGGAAGAAGGAAAGTAGTGGGACTTTTAGTTTTGGAGAAGGGAGGAGAGTTGAGAGAGTAGAGAGAAAATGGTTCTCTTCTTTTTTGTGAGATCCAAAAAAATGAGAGATGAGCCTAAGAAACCCTTCTTGCAAAGGGTTTAAATAGTGAAATTGATGGAGTTAAAATCTCCACATTATTACCACTTTACCACAACTATAGGTTAATGCAAATCATATTTGCATAACCATATATTATCAGATATCTCATATCTCATATTACAATCACATTTGCAATAATGTGGATTTATTAAATTGAATCACATTCAATTTAATTTCTCTCCATTAATTTCTCTAATTAGCCCTAATTCAACAATTAGGCTAACCTATAGTTTATTATGAATCTCATTCACATTAAACTATATATTATATCATTCATATCTCATATAAATGACATAAATGCCCTTTAAGTGAAATTGAACACTTCAATTCACACCAAAACATTAACCCTTCTTTTAACACAGATTGAGCCAACTGAGTGACCTAATGCACCTACAAAGTGATTTGTGCTCTCAATGATACGAGATTAACCTATCAAACTCTTTGACCCTGTTAATCAACCTTCATTAGCTACTGGTAACACTCTACTAAAGCCCGTGAGTCGCACTCCCAATGCAGAGAATATTACGTGTCCACTGATATAACCAATAACCATGAGTCGACCCTTCACAGGTTGTTCGGAGACACGGGTGGGTCAAATTACCGCTTTACCCCGTGTGTCTACTTCTTGTTCCTTAAGTCCCCACTACTCCTCTAATGAACAACATATTGTGATGGTCCAACCATACACAACACCCTTCTCGGCCAAAGGAGAAGGTGGGCGCCGTTGTCCAAGCCCCGGAGACAACACTTAAGGGAACAACCTCTCTAGTTTCCCTAAAGGCGCGAACGAGTGAATTCCATCTCGCGTAGTTAAGTTCCCAGCTCCTACTTGGTCCTCGTCCCCTTAGAAGATAGGCATATTGGGCGAGTAATCGTGACCACCTCTCACCTGTATTTCTAGTCAAGGACGACGACACTGCGTGACAGAGAGTCCGTAACACGCTCGTGATTCGGTCGTGTCACAAATGGTCATCTACGAAGTATTAGTCCTGACTGTCAACGGTGTTACATCAGTAGGTCTAACAATTCACGGTCCAGTCTTGTACAATCTCATTGCACAGGATGCCCCCACTCGCATGTCAACCACATGAACGAGTCAGATCACCTCGTTTGTATCTTAATACAAAGCGGGCCGCATCAACAGCGTATCCAGGATTAGGTCTCCAACCCTATCCATATATTGTAGATCGTTCGGGTCATTAACTCGATCGTGATCCTCACTGTATGTCCACCACACACCGTTCAAGTTCTAGTTCTCTCATAAATTCAATGACCCTGGAGCTTAGTTTATTGGAAAAGTTTGTAAAATTTGCGAGACAAAAAGTAATGAAATGAATAACATTTTATTAATTTCAAACAGTAATTTACAAACACGAGATTAGGACAAAAATCCCAACACTAATTAATTAAGCCATTTTGATTTGAGCCTCACAGTAGACTCGACTGACAAGACACCAGTGTGAATTGAACTGTTCAACTTCTTTTTTGTCTTGTACAATATAGACAATCGTCACCCCTTTTCAGCTATTTCTCATGTTGAGTGAGAAAGCTGATTTATAGACTCAAAAATTCCTCAATCGTGCACTTGACTAATGATGAGTAATGTAAACCACTGGGCTCGAACCACACACTTCATGCCTTCTTCGCCACTCCTGCGAGAATTTCTCGCGAACTGCTCCACTAACGTTACAGCATTGCAACGTCGTGGCCAACATTGCAACGCTGCAACGTCAAGCATCAAGGCCTGCGTTCTCAACGAAAACGGCGTTGCAACGCAACCCCTTGCGTTGCAACGCTGCATTGCAACAACTTCTTCATCCGCGTGGGCGGCGTTGAGACGCCGAAAACCAGCGTCTCAACGCCATCGACAGAACAACAAACTCCTTTACTATTATTCGTCATTTTTCGTTCGTTTTTGCTCTGATTTCTTCACAACAACTCTTGCCACGATCGACACGGACTTACAGACTCGATTTACTTTCTAAAATGCCCCAAAACACTAGGCCTTAACATTGATCAAATCAATAGAAAAGTAAATCTAAAATTAAGTGCCAAACACCGAAACATCCAATATGCAAAACCGAAATTCATCTCATGAAATTAAGGCAAACCCACCTAATTTTAAGAAAAACAAAATTCACAACGAAAAAGCCAACGATTGCCTCTGATACCAATTGAAGGGAATGAAACTCCCACATCGAAAATGACTTTGAACGTTGTGGTGTTCGTTGTGAAAAATGTTTGTTAAAAATGAACTAAAATAGTTTAATTCTAGGCTAAATATGCAATTAGAAGAAGGAAAAACAGTAAAGTAAAATACTTACTTGTTGAAGAACACTTCTTCGCCGATT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Match: XP_022927313.1 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP17-1, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 122.1 bits (305), Expect = 4.3e-24 Identity = 84/161 (52.17%), Postives = 91/161 (56.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. NCBI nr
Match: XP_023001602.1 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP17-1, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 120.9 bits (302), Expect = 9.5e-24 Identity = 83/158 (52.53%), Postives = 90/158 (56.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6583798.1 (Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP17-1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 118.2 bits (295), Expect = 6.2e-23 Identity = 82/161 (50.93%), Postives = 89/161 (55.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038894068.1 (LOW QUALITY PROTEIN: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP17-1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 115.9 bits (289), Expect = 3.1e-22 Identity = 88/184 (47.83%), Postives = 99/184 (53.80%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EKN1 (Peptidylprolyl isomerase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 122.1 bits (305), Expect = 2.1e-24 Identity = 84/161 (52.17%), Postives = 91/161 (56.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KH10 (Peptidylprolyl isomerase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495682 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 120.9 bits (302), Expect = 4.6e-24 Identity = 83/158 (52.53%), Postives = 90/158 (56.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M0X0 (Peptidylprolyl isomerase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G707640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 2.1e-21 Identity = 84/184 (45.65%), Postives = 97/184 (52.72%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C9V7 (Peptidylprolyl isomerase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498282 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 111.7 bits (278), Expect = 2.8e-21 Identity = 76/154 (49.35%), Postives = 81/154 (52.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C9B3 (Peptidylprolyl isomerase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498282 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 111.3 bits (277), Expect = 3.7e-21 Identity = 85/184 (46.20%), Postives = 97/184 (52.72%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020158.1 vs. TAIR 10
Match: AT4G19830.1 (FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein ) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 3.3e-14 Identity = 56/162 (34.57%), Postives = 80/162 (49.38%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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