Spg014922.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg014922.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold3: 35277508 .. 35287219 (-)
Sequence length201
RNA-Seq ExpressionSpg014922.1
SyntenySpg014922.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCTCGAGTTTTCCCCAGGATGACTGCTCTGATACCACTTTGTTAGGTTCCTGTGTTAACCTCACTCTTAAACACGATCCCTAATGAATCTTAGCAGTAACAAACAACAAGTCTCAATACACAAGTCCCTCAAGACGATTTCATTCAACCTTCAGTGTTCCAAAAGGAGAGTACAAAAGCACACGAACTTACCACCTTTCGAGAGGGTGGCGCTCTCCCTTACTCTATCACACAGGACAGAGAAACCAAAATCACATAAAGCATAAAACATAATGGAAACTAACAGCAGCTTAAATGTTGTATTAACTTACAACAGAACACTGATTAACTTAAGGGGAGGGAGAATTTACGTTTCTACCCCTCCTAGGGGGGCCTAACAATGTCTTACATAAAAAATGCTGGTAATGGTTAGTGTGAATCATTATCCTGTTGGAATTGAAACTGATTTCTCTTTTTCTTTTGCCTCTTTTTTTTGTACCAGCCAGTGGTTCTGTGCCTGGTGGACCTTCAAATGTTTCAGGTATGCACTTCTGTCTAATGCCAACTGCTACATGTTTTTTTGTACTTCTTGAGGAGGGATAGTGTTAAAAATAAAAATCATGTTTATATCAAATCAGAAACCTATTTTGAGCTTCTCTCATTAGAATATTCCTTTTCTTTGGCAGCTGAATCACATAAACCTAATTTCAAGCACATCCCTAAGGTATGCTATTATGTCATTGGGGATTATGATTGTATAATTCATCTCTTTTTTCCATTAGGGTTCATCAGTTGTTTGGTTTTTAAGTATTACTTTGGATACCCCCAACATCTTTGTTTGAGAAATTATGCCTCATTTTGAAAATAGAAAAGCTGGGGATTACAAGAGTAGGTATAAGTTCTTAGTGGGTGCTTCCGGAGTAACCCTCATCTATTAGATAGTGATTTATCTTTATATTAATAACTTATTAAATCCGCAAGTTAATTGTATATCGTGTTGTTGGTTATATTACTTATATCTTTAAAGCAGTTTTGCTTTAGGGAGGAAATGTAACTTCAATTGTCTAGCTTGTTTTAGTTGATGTTTTTATTCTCTCCATCTAAAATATTTGGATACTGCTTTCTTCATATGTCTCATATTTACTTTCTTAGTTCACATGGAATTGGTAAGTAATTTTCATGCCAATAGATATTTTTCTTGAGGGAATGTACATACAATTGTCTAGCTTGTTTTATTTCTATATTATTCTTTTTTGTAGGTTCCAACATATGCTTCAAAATGCCAAGAATTGTCAACCACACCATCATATTCAATACAACTTGATTGTTTTGATGGCTAGTTTTGTTTGGAGATTAAATTAGGATCACAACTTATTAGCACATGAAGGTATCCTACCCTCTCATTTGTTCATTTACTCTCACGTCTGTAATGAGAGAGTTCAGAGAGTAGAGTTCGGGATCCGGTGTATATACCTATTTCCTTCTTTAGGGTTTCTAGGCGTTTGGAGACGATTCGGGGTTGAATCAAGTCGAATCTAGCTGACCTAGGACACCAGGGACCGAGCGAAGGGGAGAGGACTCGACCCACCGAAGTGGGCCGAGGCTGACCAGGTCGAAGCCAAGCCCAATGGTATTAGGCCTTGACCCAATTCCTTTTGCCCTACCTCTCCTCCGGGGTCCGCTTTCTAGTCGTGTCCTTGGGTTGGTACTGCGCTGTCCTACTTAGTCCTTTAATTCCAGAATGGTCCAGAATTACCTATAACAATAGTGTTTGGCAACCATTAAAAATGACTCATTAGAAAATGAGATTGAGAAATAAACCATTTTGAGAGAAACACTTGAAACCAACGTTTTAAAAAAGAGTTTTTAAGTATGCAATAACTCGTGTATAAAAACACTTATAAGGAAATGTAACCAAACATATGAGTGTTTAAATTTTAAACAATTTTTATACAAAATGTTTTTTTAAAAAGTACATTCTTGAAAAACATTTATATTAAAATGTATTCCAAATGAACCCTAATCAACCAGCCCCATTATTTCTTCTCTTTCTCTTCCCGCATATTAGGGGTTAGCATATTGGTTAATTATTTAATTGATTCTTTTATACCAATAATAAAATGTTTTTTTTTCTTCTCTTCTACCGAACACAAAAGGGACCGAGAGGAAATTGCAAAGAAATGTGAGATTCAATCAAAAGCATGCACTTTACTTTTTAGGGATGAGGGTGGGTCGTCAAATAGGAGAGATTGAGGTGACTGGAGACAATATGTAATGTAACTCATTAATGTCAATCTAGATGTCGTAGGGATCAACACAAAGAATGATAATAGTTTGTATCTACTTGTTTTTTGGAACAATCTTAATGTAATTTTATTAAATTGAATTAAAGTAGTGCGGAGTTGTTTGTCTAATGTGCGCTAATATTATGGGTCATCATTAGACACTATTTTAAAAAATATCTGGCTAACCTCCTTTAACTCCATGTCAGAATCGAAGTGCTCTGCTACCGAATTGATGTGAACTAGAATAGAACCACTATGTATTACGATATAAAATGTAAAGGACTACACGATAAACCAAGTATTCGAGGTAATTGGACCCTCCTCTCTTGAGAACATCCCAGAGTAACTCACTGACTCAATTCCCTATCTTTCCATTTCTCACTCCCTCTATTTATAACTCCATACTCTAACCAACTCCCCTACCTAACTGCTAATATACCTTTACCAATATTCCTAATTACACCTTAGGTACATTCCTATCAGATTGCCAATTTGCTTACTCCTGCTAGAGTCGGTGCTTTAGTTTGTTCAAGGTTGTTGTGGTGCGTAATATGGACTGTTGGTCTTTGTTTGAGGAGATCATAGCGAACTTGTCATTTCAAAGAGGTTTGAGAGGGGTGAGATTCAATGCCTCTCTTTAGGCGTCCCTTTGTCAGACTTTTTGTAACTATCAGCTTAGTATTGTTCTTTTGGATTGGAGCTCATTTTTCTAGGTAGTTGATGGTTTATTTTTTGGACTTGTTTTTTTGTATGCTCTTTTTTATTCTTTTATTTTTCTGAATGAAAGCTCAAATTCTTAAAAGGAAAAAATTATTGGGTTGTGGTTTTATGTTTATAGAAAATTCTGTCAAAAGAAATCTGTTGGAGGTGGAATTTCAAGAGTTTAAAGGTCTAAAATAACTCATCTGTTGCAAGAGTTTAATGGTCTAAAATAACTTCATGAGGGATTCGTTTCAGGTTTGAGGATGAATCGGGAAATTGGATTTTATGTAGTTTCTATAATTGTGTAAATATTATTTGTTAATATTTAGTCATTATTGTCTTTATTCTTTCCTTTTATTGTAATGGGTCTTTCTCCTATATGAGAAGGCCTAGAATGTTCATATTTGAATAAGAGACTATTATTCTCCTAAAACTAAGATGGTATCAGAGCAGGTTAAACCCTAGTCGTATCTAAAACCCTAAATACCATACTTTTCGAAATCCTAGCCGCCGCCGCCGTCGGAACCCTAGCCACCATTCTTGATTGGTGCATCCTACTTCTGCCGTCGGTGGTCTCGTATTTTTGCTTTGACCCATACATTTTCCTATAATCCTAAAAATACCCAAACCTAACCCTAGCTCCCAGCCTTTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTCCACCTCAGACGTTGCCGCCGCCCCCGCCGGCCACCTCAGACGTTGCCGCCGCTTACCGCAGACCCAACCGTTGGGTATTTCGTGAATCGTGACCCAGAGCCTTGTGAGATAACGACCCGTGACCCACGAATTCGCGACCTGCAAGTCACCGCCGTCGATATTCAGCGCCGTCGTCTTCTCACGATCTTTCTCCTCGTCGATTCTCAGTCTGCCGCCGTCGCCGCTGCCAGTAACCTTAGACGCCGCCGTCGATTGCATCAGATGCCCATGCGAACATGACCTGCGTCTTCACCAGCTCGCAAATTTGTCTCACCTTGAGCTTCTGAATCTGTGGAGTTGTATTTCCGATAAACAAGATTGCTCGCCATCACGATCTGAATCGTTCACTACCGATCGGAACTCTTGTCGCCGACTTCAAACGGCGCAATCTACTTCCATCGGCGTCTTAGTACTCAGATCCGTTGTGATTCACAGTTGATTCAAGATCTAGGGTTACCTTCACTGGTTTGGTTCTTATCCGGTTCGGTTTATATCAGTTCATTGGTTTGGTTTGATTCATTGGTTCAGCTTTGGTTTGTTTGGTTTGGTGTACATTTTATTATTTCCCATTTACTCATTTTTTTGATAACATGTCCAAGGAGCAAGTTCATCAAATCCTAAAATTGCTACCAACCAATTTATCATCTAATAATTCTTGTGTTTCATTGGCACAAACAGGGAATTATCCTCAAGCCTTCTCTTGTGGCACTTTTTCTCCGTGGATTATCGATTTCGGAGCTTCTGACCATATGACTAGTACCTCTCAATTTTTTTCTTCATACTCTCCTTCCTATTCTAATGAAAAAATTCGAATTGTAGATGGCAGTTTTTCTTCCGTTGCAGGAAAAAGAACTATTAAATTGACTGAAAAAATTTCTTTACAATCTGTCTTACATGTTCCAAAATTAGCCTGTAATCTTTTATCTGTCAGCAAACTTTCTCGAGATTCTAATTTTCGTGTTATATTCTTCGAGTCTCACTGTATTTTTCAGGATCAGGAATCGGAGACGATGATTGGGAGTGCTAGGATGCTTGATGGTCTTTACTACTTTGATGAAGGTTCTTTTAGTAATAAAATAACTCAGGGTTTCAGTAGTATTAGTTCTCTTTCTGGTAAAGAACAAATTATGCTTTGGCATCTTAGGTTAGGACATCCTAGTTTTCCTTATCTCAAGCATTTATTTCCAAATTTATTTAAGGGATTTGATTGCTCCTCATTTGATTGTGAAAGTTGCATTTTAGCAAAAAATCATCGTTCCACCTATTTACCTAAACCTTACAAATCTTCCAAACCTTTTTGTTTAATACATAGTGATGTTTGGGGGGCTTCTAAAATTAGGACTCATAGTGGGAAAAGATGGTTTGTTACTTTTATTGACGACCATACTCGTCTATCTTGGGTGTACTTAATGGAAAAGAAATCTGAGGTGAAAGACATTTTTAGAAATTTTTATAATATGATCGAAACTCAATTTCAAACCAAAATTTTCATTTTACACTCTGACAATGGAACTGAATATTTTAATGAATGTTTTGGTGAGTTTTTAAAAGATAAAGGTATAGTTCACCAGTCTACTTGTCGAGATACTCCTCAACAGAATGGTGTTGCTGAAAGAAAAAATAGGCATTTACTTGAGGTAGCTCGTGCTATAATGTTTTCCATGCATGTTCCAAAATATTTATGGGGCGAAGCAATTCTCACAGCTACCTATCTAATAAATAGAATGCGTAGTAAGATCTTGAATTTTAAAACTCCCATTGATTGCTTTAAAAATGATTTTCCAAAATCTCGCTTATATTATGATTTACCTCTCAAAGTTATTGGGTGTACTACTTATGTTCACATCCCTAGTCACTTTCGGTCAAAACTTGATCATAGAGCAGTTAAATGCATTTTTTTGGGTTATTCTTCAAATCAAAAAGGCTATAAATGTTTTGATCCTCAGACAAAAAAATGTTTTGTAAGCATGGATGTGTCTTTTTTAGAAAATCAACCATATTTTACCCAACGTTCTCTTCAGGGGGAGAAACCAAATTTGGAAGATAACTTTTGGGATGTTTCTACTCCTCTTCCTAACCTTATTTGTCCTGATGATATTAGTCCTTTGGTGCCAAGTATAGAAACTTCTCAATCAGGGGGAGAAATACTACATAATGATCCTACTGATCAAGCTCCTGAGTTTAAGTTTTATACTAGAAGAAAATTCAATCAGAGGAAACAAGACCAAATAGTTGATCCTTCACAGAACCAATCTGAGACTCCGACGATTGAAACTGGAAAATCTAGTAATTCTTCTTCCATTCCTACCTCAACTATTCAAAATACTTTGTCAGTTGTATCTGATTTTGATATGCCCATAGCCATTAGAAAAGGTACTCGAAGTTGTACCAAATATCCTATTGCAAACTACATGTCATATCAAAATTTGTGAAATAGTCATAAAGCCTTCACCTCTTGGATAAATGATTTGTTTGTTCCAAAGAATATACATGAGGCTTTAGAGGATCCAAATTGGAAAGTAGCAGTTATGGAGGAGATGAATGCTCTAAAACAAAATGGGACTTGGGAAATAGTAGAGTTGCCAAAGGATAAGAAACCAGTGGGTTGTAAATGGGTGTTTACCATAAAATGCAATGCAGATGGTAGTATTGAGAGATATAAGGCCCGATTAGTAGCTAAAGGCTTCACCCAAACATATGGGATTGATTATCAAGAAACGTTTGCCCCAGTTGCTAAAATTAACTCTATTCGAGTATTGTTGTCTCTTGCAGCTAATTCAGAGTGGCCTTTCTACCAACTTGATGTGAAAAATGCTTTTCTCAATGGCGACCTTGAGGAAGAAGTTTTTATGCATTTGCCACCAGGTTTTGAAAAGGAACTTGGAAGTAATAGAATTTGCAGGTTAAAGAAATCTCTATATGGCCTTAAACAGTCTCCAAGAGCTTGGTTCGAACGGTTTGGAAAAGTTGTGTCTGGTTATGGGTTTCTTCAAAGTCAAGCTGACCATACTATATTTTATAAACACTCTGAGAATAATAAAATCTCTATCTTGATTGTCTATGTTGATGATATTATTCTCACAGGTGATGATGAAGTAGGTCTAACTGATCTCAAGAAAAACCTTGCAACTGTGTTTCAAATCAAAGACTTGGGAATGTTAAAATATTTCCTTGGGGTGGAATTTGCAAGATCAAGGAAAGACATCTTTGTAAATCAAAGAAAATATGTCCTTGACTTACTTGAAGAAACAGGATTACTTGGATGCAGAGTTGCTGAAACTCCTATTGAGCCTAATTGGAAATTAGAAGCAGCAAAAGAAGAAGAAATAAAGGATAAGGAGAGATACCAAAGACTTGTAAATCAAAGAAAATATGTCCTTGACTTACTTGAAGAAACAGGATTACTTGGATGCAGAGTTGCTGAAACTCCTATTGAGCCTAATTGGAAATTAGAAGCAGCAAAAGAAGAAGAAATAAAGGATAAGGAGAGATACCAAAGACTTGTGGGGAGACTAATTTATTTGTCTCATACTCGTCTAGACATTGCTTTTGTTGTAAGCATGGTAAGTCAGTTTATGCATGCACCCGGACCAACTCATTTCGAAGCTGCCTATAGGATTTTACGTTATTTAAAAGGAGCTTCTGGAAAAGGTATTTTATTCAAAAAGAATAATCACTTCCAAGTAGAGGTCTATACAGATGCAGACTGGGCTGGAAGTACTACTGATAGAAGATCTACCTCAGGTTATTGTTCCTTTGTCGGAGGAAATCTAGTCACATGGCGAAGCAAAAAGCAAAATGTAGTGGCCAGGAGTAGCGCTGAAGCAGAGTTTAGAGCCTTAGCCCATGGAATCTGTGAAGGCATATGGATCAAAAGAATACTTGAAGAATTCAAGTTCCCTCAGATTAAGCCTATTCGAATTTATTGTGACAATAAGGCTGCCATATCTATAGCTCACAATCCAGTTCTACATGATAGAACAAAACATATTGAGGTTGACAAACACTTTATTAAAGAAAAGATCGATACTGGTGCAATATGTATCCCTTATCTTCCGACTCCAGAGCAAATTGCTGATGTTCTAACTAAGGGACTTTCAAAGAAGCAATTCGATAAACTAATTGACAAGCTGGCTATGGAAGACATCTTTAAACCAGCTTGAGGGGGAGTGTTGGAATTTCTAGTTTCTATAATTTTGTAAATATTATTTGTTAATATTTAGTCATTATTGTCTTTATTCTTTCCTTTTATTGTAATGGGTCTTTCTCCTATATAAGAAGGCCTAGAATGTTCATATTTGAATAAGAGACTATTATTCTCCTAAAACTAAGAGGGTGTGAATTCATGGTCAGGTTGTTGGTAAGATCAAAATTTCATCATCTTAAGAGTGGATAAGACTTGGCCAAAGGCATCCTCTGGAAGACAGAATGTCCTAAAAAGGGCAATATCCTTGATTGGGCAGATAGATGCTTCTAGGCTTATCTATAATAATGTCTGTATGGAGTTTATTCTGTAGCTCTGCCTCCCAGTGATTCTCAGTATTAATTTAGCGACTTATATATCTTTGTTTTACTTCTTCATCCATCATGATACCTTTATTGTTACGTTGACTGTCGATCTTGTATTTCTTAAGTTCTCTCTAATTCACTTGTGTGTTAGGAAGAGGGTTGGTGGTTTGAAACTGGAAGAATTACCAGCGATGGAGGCTTTACAAACTCCAGGTCTGACAGCATTCCATTTTAATAAGATACCAAGATGTTATCCGCTTCTCTACGCTTTCTCTTTTTTTCCCTTCCCATGAATCTTTGTTGCAGAGTGGATGGTGAGGGTTTTCTAGTTGCAAATGTGGAAATAGTTGAGTCATTTTCTGCATGAGAGTTGTTAGTTTCATGAAGTATACAATAGTGTTATGAATTTTTGTACAAGTTAGAAAATGTTGGTGGCTTTCTTCATTCTAATTCTAAACATTTTAATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTATTTTAATCTTCTGGTTAATATATAGTTGAAAATGTAGAACTAAATATTTTCCCCTAAACCCTAGACCCTCTGAGGTAACTTGGTGTTCAATGGCATTGGTGGAATTTCTTATATATCCTAATCATCTTGACATCAGGAACCAGCAATGGACAGACAAAAGTTATCAGAGAGGGAGATAATGGTGTTGCTTATTCATGGAACTCAAAAGATTACAAATTGGATAAGGTAAATTTAGTTATAGATATGTCTCTTTATGAACAATGTACATTCGTTTCCTTTTCAAATCTATTCATGTCTTTCGGCAAATTATTTGATTTGTGTTGTCTTATGATGGAGCCATGGAGGAGGTTCTTTCTGTTATGGAATATTTGGCTTGAGAGTAATGAGAGAATTTTTATAGAGTTTGAGAATTCTTGGGAGGAGGTGTCGGCTCAGGCCAAGTCTAACACCTTTCTTTGAGCTTCTATTTCCAAAGACTTCTGTAATTATCCTTTTGGTCTCTCTCTCTTTTTGGGTGAAAGCCGGTTGTTAGAACTTTATTTGTTCTTTTGGTTCCCTTCTTGGCTGTATCTTTGTAAGTTCTTTTTTTATTCTCTTTGAATTCCAAATTGAAAGCCTGGTTCTTTATCTTTCTTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTTTCTTGGCTTGTGCTCTTGTTTACATGATATTTCTTTGCAACCTCATTTTGGTATTAATTATATATTTTTTTCTTGTTATTTCATTTACCCTGTATTTGGTATTGGGTGATTACGATGGTCATAGGGTTTAGGTGTTGAATCTCTGAACAGATCGAGGAAAATAGCATTTTGTAATGATTGATTTACTTCGAATAATTGCCTACCCTTTTCGCATGCCCGGTAATTATTATTATATCAGTAAGAACCAAGTCCTATGTTTGAAATTGATGCACATGGGCTTTTCTGCCATCTGAATTATTTTATGAAAATTGGAGCATCCTTTACATATATATATTCTTTAATTTGTAGATTGGTGAAGTTGTTGATGGGC

mRNA sequence

ATGGCTCGAGTTTTCCCCAGGATGACTGCTCTGATACCACTTTCCAGTGGTTCTGTGCCTGGTGGACCTTCAAATGTTTCAGCTGAATCACATAAACCTAATTTCAAGCACATCCCTAAGGTTCCAACATATGCTTCAAAATGCCAAGAATTGTCAACCACACCATCATATTCAATACAACTTGATTGTTTTGATGGCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCTCGAGTTTTCCCCAGGATGACTGCTCTGATACCACTTTCCAGTGGTTCTGTGCCTGGTGGACCTTCAAATGTTTCAGCTGAATCACATAAACCTAATTTCAAGCACATCCCTAAGGTTCCAACATATGCTTCAAAATGCCAAGAATTGTCAACCACACCATCATATTCAATACAACTTGATTGTTTTGATGGCTAG

Protein sequence

MARVFPRMTALIPLSSGSVPGGPSNVSAESHKPNFKHIPKVPTYASKCQELSTTPSYSIQLDCFDG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spg014922Spg014922gene


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg014922.1-three_prime_utrSpg014922.1-three_prime_utr-scaffold3:35277508..35278402three_prime_UTR
Spg014922.1-three_prime_utrSpg014922.1-three_prime_utr-scaffold3:35278818..35278879three_prime_UTR
Spg014922.1-three_prime_utrSpg014922.1-three_prime_utr-scaffold3:35285852..35285898three_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg014922.1-cdsSpg014922.1-cds-scaffold3:35285899..35285979CDS
Spg014922.1-cdsSpg014922.1-cds-scaffold3:35286515..35286552CDS
Spg014922.1-cdsSpg014922.1-cds-scaffold3:35286698..35286736CDS
Spg014922.1-cdsSpg014922.1-cds-scaffold3:35287177..35287219CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg014922.1Spg014922.1-proteinpolypeptide