Pay0018110.1 (mRNA) Melon (Payzawat) v1

Overview


Name	Pay0018110.1
Type	mRNA
Organism	Cucumis melo L. var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Unknown protein
Location	chr06: 30489667 .. 30498205 (+)
Sequence length	249
RNA-Seq Expression	Pay0018110.1
Synteny	Pay0018110.1

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexonpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGACAGCAATAGTGGTGCAATGCAATTACGCGGAGTTGGTAAATGCTACGTTATGCATTGAAAAGAGTTCAGGTGGAAAAAGATTAAGTTTAGAGTTAGATGATGAAGAAGAAGATGAGGAAAAAGAAAGTGTAAGAAACTTAAGTCTATATTTAGCTAGGGATCACGTTGGAGTAGCGCTCAGAAAAAAATGTACACTACAAGAAATCGAAGGGTTCTCGATGCACAAAACAACATCCACAGAAGGAATGTTGAGATAGACGCATATTTCCAACATCGTTTTGCATAGTCGGGACATGACAAAAACATTATATTAATATTACATTGTTCCAACGTTGCAAGAAGAAGCCATTCTCGACGTGTTATTTTAGGGCATCGGGAATCGTTCACAATTAAAAAATATATATATATATATAACGTGCCATGTATCATGTCTAGAATAGTCACACTTGTTCCCCACGGTTCTTGACCAACATTAGAAATGGGTAATCTATTTTTTTACGGCTTGCATTGGGCATCGGGACAAACTCAAACATTAATTTTGTCAGAGTAGGATTCTTGATGGCCCATGCAAGGCATCGAAAATGGTTATACATCTTCCCAACACCATTAGTGATTCGTTAGGATTGTTTTAGACTATTTTCGACGATTCATTAATGGCATAGGGTACTGGATGAAACTCTTGACATCTTCGTGGTGCATTATGAGTTCCCCCTATATATTTCATTTTAGTTCTGTGAAAGACAGAATTGAAAGAAGAGAAGAGAAACGAGAGAGGAGAAGGAGAAGAAGAAGTAGAAATGTGTCGTCTGCCTGACCCCTTGCCATCGTCTACCTCGCCACTACCGTCTCCCTAGCCGCTACACTGATTTCTTCCATTTTCGACAAGCGTCAAACCATTCTTTTGTTACTTTTGAAGTTAGGTTAGGTTAGAAATTAGTTTAGGTTAGGTAGTTTATAGTTTTGTTTTTTGAAGTTAGTTTAAGATTGAATATTGAATTAGTTTTAGGATATTAAAGTATTTTTGGAATGTGGGTTGGAAATTTATGGGGGGTTATTTAAGAAATTGGGTTGGGGGATTTAAAATTCGAGTTAAAAATTTAAGGGTGGGAGAGGGTTTAGAATTAATTGAATGGAATAGAATGAGTTAAGAATTAGAGAAATGGAGGGTTCAATTGGAATTTTGAAAGGGGGATTGATACATTGAACTTTCAAGGGGGTGGGGTAAGTTTAATTGAATATTCGAAGGGGATGGGTTGAAAATTTAAGGGGGGGGGGGAGGGAGGCGAAAGTTATTACTCTTTTTAAAATTTTGTAATTTCTGTTAAGATTCGTTTTAGCTATCCTATAGTTATGGTAGCCTTTAGTTCAATTCTAATTGTTTATTTCTTAGTAGTTTTAAATAAATTTAATGTTGATTTGGGACGACTATTCTGCAGTTATGGTAGCCTTTTTTATTTTGAATTTGTTTGTATTTCAGAGGGTTTGAAGAGAGATGGTAGTAGGGTAGCTTGTAAGGTAGCGTTGTTGGAAGGGGTGGGTAGGTTGCGAAGATTGAAGTTGTTTGTGGTTAATTAGGTTGTGATAGCTATCCTGCAGTTATGCTAGCGTCTGTAGTTTGAAGTTCGTTTTAGTGAAAATTTTAGAAGATTGTATATTAAACGGAGTATGTTTACGATGTGAGAGGAGAGGAATATGCATCAAATCAAACCTATTTATGTTTTAGGGACTTAAACGATGAAAAATTGTTGGATGAAACTGAGGAATAAGTTTTCCCTTGGGTATAGAGAGGGAGAAGTCTAATTTTTAGAAGTTGCCATGTTTCACGTTGATGGCTAATTGGTAACCAATTGATCAAACTCATCTTATAGAAGTTGGTAACCAATTGATCAAGCCACATGCGAGCTACACATTGACTAGCAACAAACGAGCTAAGTTTTGCAAGTTTCTGAAATCAGTTAAGTTTCCTGATGGATTTGTTTCCAAAATATCGCAATGTGTAAATGAAAGAGAGGGGAAAATATCAAAATTCAAAACGCACAATTTTTATGGTTTATTACATCGACTACTATCTATTGGTATTCAAGTATTCTTACCAAAAAACATGTACAATACTATTACCGAACTATGTAGTTTTTTTGTGACTTGTGCGCTAGAACGATAAAAGTAAGTGATTTGGATAGATTGATAGAAGACATCATAACCATACTTTGTAAGTTGGAAAGAATATTTTCACCTGCCTTTTTTAGCGTTATGGTACCCCTAGCCGTACACTTACCATATGAAATCAAGGTTATTGGTTCGATATCTTAGAGTTGAATGTATCCCATTGAAAGAAGTCTACACACTTTAAAATAGTATGTTCGAAACAAAGCACGTCCCGAGGGATCCATTGCGGAAGCGTATGCGATACATGAATCGAACACATTTTATTCATGTTACCTAGGTGGTTTAGAGACTCGATTCACAAGAGATGAGAGAAATGATGATACCATTCTAAAGGACGAGGTGATTGGTGAGTTTGAAATTTTCAAGCAGAAATACGACCCTTAGTTGTCAAGTATTCGTATTATATCACAGAAAGAGAAATACGTCTTTCATTGGTACATCCTCAACAATGTAAACAAAATATCAGAGTATCGTAAGTAAGCATTTCTTAGCTTCGTATTTCTGAGGTATAGTTGTTGAGTATTTGATATACATTGTTGTTACACAAATTAAACTCATAATCATCCCCGTTAGAAAACATTTGAGGCTAATACTTCAACATGCTCAAAATGCTACTGATATGTATAAAAGACATCAACGGAGATTCCCTGAATGGTCTCGAGCACAAGTATATAGCAAGTTTTCTTGTGACATGTATGCACTAACGTATTTAAGCACGTGAATGTGTATAATCGTTGTCACATTGATTTCAGGTTATAGAACTGCGTGAGTCAAGAAATCTATCTCACGATTTCTTCTCACTTACGATGGGACCAGCATTTGATGTTCGTTGTTACAATGGATGCATTGTGGGTGTGCTGAGATTTCATACATCAAAACGTGATTCCCAGCCACTACACAAAACATTGAAGTGATGGTCATTGATGAATGTGGTATAAGTGAAAGTGGCGACGATAGTTTCTATGGTGTTTTGGACGATGTGTTGCACATTCAGTAGCTATTAGAAAGAAATGTTTGGCTATTTAAGTGTCAGTGGTATGACATGGATGTCAACAAAATACAAAGAACACATGTTGAATTAGGATACAAATCTCACAACACGTCCCGTTTTTGGTTTGTCGAGGAACCTGTAATTCTTGCGGTGCAAGTACAACAAGTTTTTTTTATCTAGATGACTAAAAAATGGTAGTAATTGGAAAGTAGTACAAATCATCTCCCAGAAGTGGACGATGTTGAGAATGAGTACCTCAATGTACTAGAATCGTTATCAGCTATCAAGTGGATAAACATCTTGAGGATGACACTCTGTATAGGATTGGCATTGATCCCACAATCGTTAAAAGATCGGTTGTACGTCATGTCATTGACGACTTCATCAACGATATGGATGAACACTGGTCACATGAAAGCAGAGCAATCAATGACAAATAATAGTGACAAACCATATACCCACATATTTATGTAGTTTATATATTTTGATTCATATTTGTTTATTGAATGTTTGTTTATATGTACAGAAATAGTATGTCGTCATTCTCGAGCGATTTTGATGAGATGAAGCCATGTTCCACGAGTTTGTAGAGGAGCTAAATAACCCTATGGGAGGGTCGTCGTTGGTAGGTAACAATACGGGTAAGTCTAATAATGGTATACATTTTTACTTAGAATTATTTGAACTTTTTTCTAATATTGTATGTTCTTATAATTTATTCAGAGGTACTTCTCAACCATCTACGACTCTGACTCCTAGGAGACGTGCATAGTCCCAACTCCTAGAGTTGGAGTGCTACGTTGCAACCAATGGGTGGATTTCAATGACGATCGCCTCTGGCATGAAGAAGTCTATCTGCCTATGTGTCGTTCGTTTTAGCCAGACGATATGCATGTCTGTGTGAAAGACAATTCCCATTCGCTACCTTAAGTGGGTGAACGTAGGAAGAGAATACATCGAGGTCATCAAGGCCGACCTCTAGGTAAGTCTGCTACACATTTCCGTTTTCATTTGAAACATATTTAAGTTAGTCAAGCTAAAGTGTTGTTTTTGTAATGTGTAGCAGTTTTTTGTGTTTGATTTCAATGATCAACCAATGAATAGGTTTGTTGAGCATTAAATACTCAACACCTTTAAAGAGTTCCAAAAACAACTGCCACAGGCACTTCGAAAAGTACAGTGATCCCGAAAAGGCCATTGCAAACACACTACACTTTTTGGTGGAACGTAATGAAGATCGGCACTACCTCTGTGACCACTGCATGAGTCGTGCATTGCAGTGAGCAACTGAATCCTTTGTAAATGTTAATTATGATTTAAGAAATAATATGTATAAGAAATAAACAATATAATTGTTTTCATGCAGGAACAATCATGGACGAACAAGGCTGCTAGACAGAAGCAGCCTTACAATCATAGCAGCGGGTCGAAGTCGTTTTTACAACAACAGCACGAGCTCTTTGAAAAAACAGGGGAATCAATCGATCGTGTGGAGTTATTGCACACATTCAAGATGGGATGTTTGTGTCGCAGGCCGGAAGGATGCGCATATAAGTTATCCAAGCAACACTTCTGCCCTTATTTATACTCTTTAATAATATATTTTTTACTTACTAACTTAGTTTCTAAATTTGTTGTAGAACCAAATGTTGGAACTTTAGTTCCAGCCTACCCTAGAGGGTACTCAACCACTCTCTAGGGACGAGATATGTGATACGGTGTTGGATAGACGACCAAGCTACTCAAAAGGCCTTGAATGGGGACCCAAGCCCAAGGTCCCGCAAGACGGTCAGTGCGAGCAATAAATATAGAAATAGTATGTTATGAAGTACAACTTTA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mRNA sequence

ATGACAGCAATAGTGGTGCAATGCAATTACGCGGAGTTGGTAAATGCTACGTTATGCATTGAAAAGAGTTCAGGTGGAAAAAGATTAAGTTTAGAGTTAGATGATGAAGAAGAAGATGAGGAAAAAGAAAGTATAGTCGCCACACAGACTTTGACGATGACCCATGATATTTTAATGATGACCCACGGGACTTCAATGATGACTAATGATACTCCGACAGTGACCCACGACATTCACCTTCCTCGCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGACAGCAATAGTGGTGCAATGCAATTACGCGGAGTTGGTAAATGCTACGTTATGCATTGAAAAGAGTTCAGGTGGAAAAAGATTAAGTTTAGAGTTAGATGATGAAGAAGAAGATGAGGAAAAAGAAAGTATAGTCGCCACACAGACTTTGACGATGACCCATGATATTTTAATGATGACCCACGGGACTTCAATGATGACTAATGATACTCCGACAGTGACCCACGACATTCACCTTCCTCGCTAG

Protein sequence

MTAIVVQCNYAELVNATLCIEKSSGGKRLSLELDDEEEDEEKESIVATQTLTMTHDILMMTHGTSMMTNDTPTVTHDIHLPR

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Pay0018110.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Pay0018110.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Pay0018110.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Pay0018110.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 63..82

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
Pay0018110	Pay0018110	gene

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Pay0018110.1-cds	Pay0018110.1-cds-chr06:30489667..30489798	CDS
Pay0018110.1-cds	Pay0018110.1-cds-chr06:30498089..30498205	CDS

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Pay0018110.1-exon	Pay0018110.1-exon-chr06:30489667..30489798	exon
Pay0018110.1-exon	Pay0018110.1-exon-chr06:30498089..30498205	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Pay0018110.1	Pay0018110.1-protein	polypeptide