Moc05g22850.1 (mRNA) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc05g22850.1
TypemRNA
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5: 16333045 .. 16336736 (+)
Sequence length525
RNA-Seq ExpressionMoc05g22850.1
SyntenyMoc05g22850.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTCCATCATGCTGAGAAGATGTTGCAGCAACATGATGCTGAGGTTGTTCTTTCACTGCAAGTTCAACAAACTTGTTTAACTAGGGGCTTATTTCAATGCTCCCTCTTGTCCTCATTTTCTTTTGTGTTTTTTTTCCTTCTGGACAACTTTTACTGTTTTGCTAGTGAAGCTATGAGGGCCTCATCCCGTAAAAAGGATACTATACACTATAAAAAATAAGACTTTCTGCGGCAGCGTTTTAGCGACGTTTTACTGTGGATGTCACTATAACTCATTTTCAACTACATTTTTTATAATGGGCGTCGCTGAAAACCGTTAATAGTGGCGTCGCTGATTAGATTTTCAGCGACGCACTGTTGACTTTCAATGTCACTTAAAACAATTTTCAGCGACACCACTATTAAAGATGTCGCTGAAAACAATTTTTAGGACACATTTATTAAATGTGTCACTGAAAATACTTTTAGAGACGCCGCTGAAAGTTTTAGATTAGAAACCCCAACCCCTTTCCCTTCCTCTTTCGTGATTTTTTTCCAAACCCTCGCCGTTTTGTTCTTCAGTTGCCCGTCGATGCTCCTTTGCCATTCCATCTTCGCTCCATCGCCGTTTCGTCTTCGTGGGTCTTGTCGTCAGTCTTCACCGCTCTTTCGCAGTTCCGTCGTTGGCGATTTTCACCGTGGGTCGCTAACATCGCCACTACCATCTCATCACCACCGTTGCTATCACAGTGGGTCCTGCCTTGGGTTGCACTATGGGTATTGTCGTGCCTTTTCTCCGTGTGCCTCGTTGCTGCGTTGAGGTTTGCTTCAAAACTATGGATGTCTTTTATATTTTCTTTGAAATTGACATTATGGATCTTAAATAAGTATTGAAGTGTTTGTGTACTTATTATAATGTAAATTGAATGTATATTGTTTTGAGATGTTGCTGAAATTTATTTTTATGTGGTTTGCGGGAGTAAAAAAGTGATGGAGTGGGTTGGCTCGAGCAAAGTTATATGGAAGGGAGTTGAAATTGAAATTTTTGTGAAGTAGGTCGTATTGAAGTGGTAACTATGTCTTGAAACAGAAAATTTGTTCGTGAATTGATCTCGGAGAAATGGAATGAATGGTTAATATTTTACCTGTTGGGACCAAATTTAAGGTGATGTTTTGAGGAGATTAATAAGCTATATTTTTTTTCCCTCGACGTAATCTTTTGGGTTAGAGCTTTAGCTTTTATGGTGATCCAACATAGACGTTGTATTCTTTTATCTTATTTATGGTGAATGTTTATGAGTTTGAATTTTATGTTTGGATATGAATTTTACAATTTTTATTTTGAATTTTATGTTGGACATGACTATGAAGTTTATATATATGAATTTGATGTTTATGTTTTAGAGTTTTTTATTCAAACTCTAATGGTTTAAGAATATATATGAATCACCTCCAATTTTGATCTCTTTCTTGTAGGTTATATGAAAACTATTCCCGAAGAACCACGGGAAGTAGAAGTTTTTCTCTTTTGGGGTTATGAGAAATATTTTGATGTGTTGATGAGTGTGGCGTGAGTTTGGTGATGAAGTTGATGGATTTTGGTGATGGATTTTATTTTGGTGATGGATTTAGAAATTTATGTGTGAGTAATGGAGTTCATAGATTTTGAAGTTTATGTGTGAGTATGGGATGGATTTTATGTGCTGAGTTTGATGAATTTTGAAGTTTATTTGATTGGATTGTGAAGTTTTTTATTTTGAAGTTAATGTTGGATATGGATTATAACAAAACATTATTAATTAGAGTTTGATTTTTATGTCTAGTGACACATTATTAATTAGAGTTTGATTTTTTTCATTATTCTGTTATAGGATGTAATTGTCAAATCATAGAAAACGCTCACCAAGAAGATGTGGGTGAACATGTTAATCATAATGCACAGAGTATGTATTGATTTATATGAAAACAGTTTTTATTCCGTATGAGCTTGTTAGTATATTCACAAGTTCGGAGCATTTGAGTTGTCTATATTGTTCAAAGAGCATGACTATATATTTGTTCCATGTACTTATTTATATAAATTTTGATATAGTTGAGGTGTCAAGACTATCCCGAAGTTATTGTAATCATAGATTATGTTATGTCCATATGGGTTAGTTAGTATATTTACAAGTTAGCGGAGTATTTGAGTTGTTGATATTGTTTATAGATCAGCGTGGCTATATATTTGATGTGTGTACTTATTTATATCGATTTTGATATAGTTAAAGTGTTGTGAGTATCCTGCAGCTATGGTAGTCATTGTTTATGTTATATAGTCATAGTTGAAGTGTTGTGACTATCCTACACATATAGTTTAATTATGGTAGTCATATATTATCTTCATAAGGTTTCTATTTGTGTTCACTTCGTACGGTTTCATTATTTAGTGAGTTGGTGTATATATATTATTTTCATAGGTTTTGAAAGAGAGTTTGATTGTATTATCAAGTTAAATAAGTTTTGTTGTTAACATAAGTCGTGTTTTCATTTTTTTCACAGGATAGATTTTCTATGTCAATAGCGGCTGTGCAACAATCTTTGGGAAGAAGAACATCGTGGTGTTATTATTATTTTTTTTTGTTTTATGTAAATGAAGCTAATACTAAGACAACTTCTTCTTCGTTTCTATGAAAAAATATATTTTTTAATGTTATAACATATTTATAAAAGGCCTACACATTTGGAGGACTTTATGTACTCTTTTTTATATTATAAATAATTTTATTCACGTTTAATATATGTCGGTATTAATCACCAAAAGTATTAAAAAAGTGAAGTTGAAATGTCGGTTTGTAAAAACACTTTCAGTAACTCACGGAAATGCCACTGAAAGTAACTTTCAGAGACGCATGGATACGTCGCTGAAAGTAACTTTCAGTGGCATTTCCCTGAGTTACTGAAAGTGTTTTTACAAACCGCTGAAAGTAACTTTTAGAGAGACATGGGTATGTCGCTGAAATTATCTTTAGCGACAACCATTGGTGTCGCTAATAGTATTTTTAGCGACAAGGTCAAAATGTCGCTGAAAGTTAAAATGACACGGAATCAGCGACGTTCTTAGCGACGAAATACCAAACGTTGTTAAATTTTTAGCAATTTTTTTTAGCTTTCAACGACGTTTTTAAAGCGTCTCTGAAAGTCTTTTTTCTTGTGGTGTATTATAGTCTCAGGTGACTATGCTACTAACATTTTCTTTAAAATATCAAGGTGATCTTCTGCTCCCATATTCATGCTCCTTAAGAGCTTCACGTTGCCCTTCCTCAGTTACAGCATTAACCTTGTCCCCTTGGTTACCAGCATTGGATGCCTTTGTTCAAGCATCATCTCCAGATTGGGTAACTGCAAACATTTCTTCGGTGTTTTCAGCCCTATAGTCTTTACAAATTTTCCTAGATTGGTGAATGACTTTGTGCACGATTGCCTCTCACTCTTCTTCTTCCAGGGGTTTGTGTTACTTCAGATGGGCCCAAATTACCCTCTTATCTTTGTTCAGACGTACTCCCTTATCTATCAGATGCAGAGAATTAGTGCATACAATTGTGGTGCGCGCAGTGCCACAACATATCCATCACTTAAGTTAGTTGGGTCACCTCCATATCATTTGGTTTTACCCATCTTTGTTTGTTTCCTTTAATTTTAGTTACTGTTTCTATTAGGACTCCTAATTGA

mRNA sequence

ATGTTCCATCATGCTGAGAAGATGTTGCAGCAACATGATGCTGAGTTGCCCGTCGATGCTCCTTTGCCATTCCATCTTCGCTCCATCGCCGTTTCGTCTTCGTGGGTCTTGTCGTCAGTCTTCACCGCTCTTTCGCAGTTCCGTCGTTGGCGATTTTCACCGTGGGTCGCTAACATCGCCACTACCATCTCATCACCACCGTTGCTATCACAGTGGGTCCTGCCTTGGGTTGCACTATGGGTATTGTCGTGCCTTTTCTCCGTGTGCCTCGTTGCTGCGTTGAGAGCTTCACGTTGCCCTTCCTCAGTTACAGCATTAACCTTGTCCCCTTGGTTACCAGCATTGGATGCCTTTGTTCAAGCATCATCTCCAGATTGGGGGTTTGTGTTACTTCAGATGGGCCCAAATTACCCTCTTATCTTTGTTCAGACGTACTCCCTTATCTATCAGATGCAGAGAATTAGTGCATACAATTGTGGTGCGCGCAGTGCCACAACATATCCATCACTTAAGACTCCTAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTCCATCATGCTGAGAAGATGTTGCAGCAACATGATGCTGAGTTGCCCGTCGATGCTCCTTTGCCATTCCATCTTCGCTCCATCGCCGTTTCGTCTTCGTGGGTCTTGTCGTCAGTCTTCACCGCTCTTTCGCAGTTCCGTCGTTGGCGATTTTCACCGTGGGTCGCTAACATCGCCACTACCATCTCATCACCACCGTTGCTATCACAGTGGGTCCTGCCTTGGGTTGCACTATGGGTATTGTCGTGCCTTTTCTCCGTGTGCCTCGTTGCTGCGTTGAGAGCTTCACGTTGCCCTTCCTCAGTTACAGCATTAACCTTGTCCCCTTGGTTACCAGCATTGGATGCCTTTGTTCAAGCATCATCTCCAGATTGGGGGTTTGTGTTACTTCAGATGGGCCCAAATTACCCTCTTATCTTTGTTCAGACGTACTCCCTTATCTATCAGATGCAGAGAATTAGTGCATACAATTGTGGTGCGCGCAGTGCCACAACATATCCATCACTTAAGACTCCTAATTGA

Protein sequence

MFHHAEKMLQQHDAELPVDAPLPFHLRSIAVSSSWVLSSVFTALSQFRRWRFSPWVANIATTISSPPLLSQWVLPWVALWVLSCLFSVCLVAALRASRCPSSVTALTLSPWLPALDAFVQASSPDWGFVLLQMGPNYPLIFVQTYSLIYQMQRISAYNCGARSATTYPSLKTPN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Moc05g22850Moc05g22850gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Moc05g22850.1.exon1Moc05g22850.1.exon1exon
Moc05g22850.1.exon2Moc05g22850.1.exon2exon
Moc05g22850.1.exon3Moc05g22850.1.exon3exon
Moc05g22850.1.exon4Moc05g22850.1.exon4exon
Moc05g22850.1.exon5Moc05g22850.1.exon5exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
cds.Moc05g22850.1cds.Moc05g22850.1CDS
cds.Moc05g22850.1cds.Moc05g22850.1_2CDS
cds.Moc05g22850.1cds.Moc05g22850.1_3CDS
cds.Moc05g22850.1cds.Moc05g22850.1_4CDS
cds.Moc05g22850.1cds.Moc05g22850.1_5CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Moc05g22850.1Moc05g22850.1-proteinpolypeptide