MS025304.1 (mRNA) Bitter gourd (TR) v1

Overview
NameMS025304.1
TypemRNA
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold25: 59810 .. 64698 (+)
Sequence length399
RNA-Seq ExpressionMS025304.1
SyntenyMS025304.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGAGAAAATCAGGCGTTTCTGTTTGAGATTTGCGGGAAAGATTTGTGGAAGTGGCAGCATTGCAGCAAGAGAGTTCATGTCCATTGCGAAATGGGTTTCCGTTCAAACGGCCGGAAGAACAAACCGCCGCTCACATCTCGATGTGAGCCAAATCCTAATAGACGGGGTCAACGAAAGGATGATTATGTGAAGATGAACAGTGATATTGGGATCCGAGGACCAGAAAATGGAAACTGAAAAAGGGGATTGGATTGTGCGCTAACCTTTGCGAAACAATTTCATTCTGTTTGGGATCCATTTTGAAGATAAGGAAGAGTTGGATTGTGGGGATTGAGCTTGGCTTCTTCGATTACAGGTTGAGGTTGCAAATCAGTTAATTCGAAGAACTGGGGATGATGATTTTGAGAGCTCCATGGTGTGTGGCTTCAGGAAATTCAACAGCCTCTGAGAAGTGAGAACGATAATTTAGTCGGACCGAGTCGGTTTTTTTCTGAAACTTTTAGGACCAGTTTGCCCCTCTCAAAATTCGGATGGCTATGGTGCTGTCACGTGGAATTGAAAGAATCTCCTCTAAGGATCAAAGCAAATATGCAACTTTTGCGGGGGGAGAAACCATAGTTTTGTCCAAATTATTGATTCTTTTCGAGCTAACTTGAGTTTTAGGCTTATCCATTGGTAATCCAACAACACGGACGAAGTTCCAATACCACTAGCAGTCTTTGCTTGGTCCTAAGGGGAAGGTTAAAGTCTAAAATCGAGTTTCGAAAAGCATAGAAATATGATTCCAACGAAAACGAACATGACACAACAAGTTACTAGTATAACTTGCTCACATAGGGGTTTGAGAGCAAAATGGGAGTCGTCAGCGTGGCGTAAAGTGAAGATGGAGGGAAATGCTTTCGTCCTTTGTTTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTTAATAAAATAAAATAAAATTACATGGCCACCAACACATAAAACAATATTTTTATTTACGTTGGAACAAATTGGAAATGAAAATAAGAAACAAGTAACTTTAGGCTGGTAATGGTTCTAGAAAAATGAAGTGCATTGTCTCAACCTTCATGAATCCTGGATGGGTATGATAAAACAATCTTTCTATCAGAAAAAAGAAATTTGTTTTGGTTGTTTCTAAATTTTTTATTCAATTTTAAGAATGTTTCGAAAAAGTGAGAAACAAAATATATAATTAATTACAGAAGGGTTAGATTTCTTAAGAAAATTAATAAGGGAACGTTACCAAACGAGCATGTTGAGTTATTTCCTTTTTCAAATGGAACTTGAAACCAGTGGGATTCACAAGATCTTCACTTCTTGAAACTGAAATTGAAAATTTGAATCAAATTGGAGAGAGAGATTCATTGTGATCTTTCACTCTTAAAATTGAAATTGAAATAGAGGTTAATTTTTGTATTTATAAAAATACCATTGCTTTTTGTTTTCCCCCCCTTAAATGGGGTGTTTTTTATTAATAATGTTAATAATAAAAGTTATTTTAAAAATATTGTATTTTAATTAAAAATGTTTAAAATATGGTATATTTTGAAACTTTTTTTAAAAATATAGTAGTTTTAAAAATGTGAAGGGTGGTCAAGAGACGACCATCCAACATGGTCGTCTCTTGAAGAGACGACCATGCAACGTGGCGCCACGCTGGACGCCACGTAAATTTGTTTTAAATTTAGGAGGTGGTCGTCTCTTGAAGAGACGACCATGTGGGATGGTCCAAGAGACGACCATTCGGTCGGTTCATTTTTGGAAAAAAAAAATAACATTTGGTATATTATATATTATTTAGTAGTCTAAATCAAAAAACTGCTTAGTGGTGCAGTTGGTGTACTGCTACCTTGATATCACTCCCATCCCAAGTTCAAATCTTGGGTCATGCAACTTTTACTTTTATAACCATTAATCATCTATTTTCTTTTTTTTACTTAATATAAATAATAGTATAAACAATAATATATAAAATAAAAGAACATACAATAATATAAATAATAATAACTTTATTATTATTAAATGAATAATAATATATAGAATAGAAAAAAAGAAGTTTGGATGGAAATGGTAATATTAGGTAAAAAAGAGACAAATAAATAATAATAATAATATATATATATATAAAAAGAGAAATGATTTAATGGTTATAAAATAAAAAAGTGTGTTACCCAAGATTCGAACTTGGGATGGAGGAAATAATAGAGTAGTAGTACATCCACTACACCACTAAGCAGTTTTTAATATTAAAACTACTAAATAATATATAATATAACAAATTTTATTTTATTTTTCCAAAAATTAACCGACCAGATGGTCGTCGTCAGACCATCCCACATGGTCGTCTCTTGAAGAGACGACCACATTCAAATTTTTAAAAAAATTTACGTGGCGCCCACGTGGCGCCACGTCTAAATGGTCGTCTCTTCAAGAGACGACCAACCTTCTATTTTTTAAAAGTACAATATTTTTAAAATAAGTTTCAAAATCTACAATATTTTTAATATTTTTAATTAAACAACTATATTTTTAAAATAAGTTTCATTTAGAACAATATTTAAAAAAAAAATCCCCCTTAAATGTCACCAAAGAGTAATTTTACTTTTTATTGGCCTAGTATGATTGCTAAGTTTGTAATTTATGCTCTCTTTTAAAAATTTTAAACAAATACATTACGTATTCCCTCCCTATTTTTGTACTGCTTTGTCCTCAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAATCACAAAAATAGTAAAATAAAAGTTAAATTACGGGTTTCACAAAGTTGAAACAATTATCGAGGCATGGTACCTTTTCGTCTCTTATTTTTTATTTCTTGTTTTAGTCTCTTGAAAATATAAGCATGTGGTAACTATTTTTGTTCAAAACAGAAAGAGGTGTAACAAGTGAGTAAAAAGCAGGGCAAGAGAGCGACTTCAAATCGTGAATGATTAGTAAGTAAAGGATTGACCTTTTTATGCAAATTGTCAGTATTATTGTGAGACTAGTACTTGGCGATTCATGATCAACTTAGAGACTATTCTCTTTCTATTTTTAAAAAATTGTTTTCAAAATTGTGTAGAAATTTTGAAAATGATAAAACTTTCCGTTTCTAACATTTTTTTGAGATGTATTATCAGTTTTTACTTAGAAAATGCATAATAAATATTAAAAAGTAATACATCATAATTTTTTTGTTGGGAAAACACCACTTTTTCAATATTTTTTAAACACAAAATTGGAAAGTTAGGAATCTATTATTAGACATTTTCAAAGTTAAAAAGACTATTAAACCTAACACTAAAAGTTTAATGACAAATTTTGTAATTTAACCTCAAATAAAGGTGAGATTTGGAATATTTTTTTTCAGTCCAATAAGTGATGGGAGAATTTTTTTTTCTTTTTTAGTTCAATATGTAGTGGTTGGAATTCAAACTCACTATCTCTTAGTTGGAGATAGTTGTCTTAACAAGTTGAACTCATGTTGACAAGATATAGAATAATTGAAAAAATCATGGGTGGCTTATTTGGTCTAAAAGGGGTAGGGTAATTAAGAGGGAATGAGTTCAAATCCCATGATGGTCGACGTGACATATTTTTTTTAGTACAAGAAAATTAAAAGGAAACATAGTTCCTCTCGACTACTTTTTTCAAATAGATTTGTTGCGTCTGATGAGTCCAGTGAAAACACTTTTCCATTCATATTTCAGTGTGATTCAATTCTGCAGGTCATGCAGAATTGCTAGAGTATTTGCAAGTTGGTTGCCACTCCGAAAGGTAATAGAAATTCATTTGAGAGAGCTTCACTATATTGTTAATGTGGCATGTTAGATTGGATTAATAAGTACTAATTGGTGCAAGAATATGATTAACAAGTTTTCTACTAAAAAAAAGTTTTAAACTAAAAATAGAAAGAAATTATAAGAGATAAAGGGAGGAAATGTATCATATAGAGAGAGATAAAATGCTATTTAGAAAAAACACCAAATCCAACAAAATTTTCTCTTTTATGTGATCTGATTAATTTGTTTAATAATTTATTGGATGATAAAGAAATGTGAATTATTCACCACAAACTTTATATTATATTATATTTTCCCCCTTCATTGCCTTTAAAATTGGTCACCTCTTCTACCATTGGATTTTAAAATTTAAAAATGGAAAGCTCCAAAGATTTTTCTCTTTATGCATATGATATGATTTTTTTTTGTTTAATAATTTATTGATGACAAGGAAATGTGTGAATTATTGACCACAAACTTTATTATATTATATTTTTCCCCTCCTTTGGCTTTTGGGGTGGTGGGAACTAGTTGTTTGCCAAAATTTTATCCACTATATATTAAAAATTTTGAATTGAAAATAAACAAGTGACCTAAATCATTTTCAAACCCTTGTGGATTTGTGTTGTAAGACAATTGACATCCTTAAATGATCCTCTAGTTTGAGGTTGGTTTTAATTATACACCTATCCTATTTTAAATAGTTCACTAATACACTGAATCTTTAAAATTATTGATTCGAATATATGTTATTTGAACGATTTTACTCATAAAATAAATTATTAAAATTGACGTGATTGCTAAATCGTAATTGTTGAGGGTAAATTCGAACAGGGCGTGTGTTCCACTCAAAGAGGTGTAGGACCACAGACGGTTATGCATTGTACGCTGCGATGGCAGGGGAGATGCGTTTCCACTCCTACGGTATGGGGAGCATGCCGAGCCCGCGACCTGCCACTGATAGGCGACAGGCTCACAGCCTGCAGGCGGAGGCACCACCCGCCTATTGTTGGAGATGTACAACCCCGATAGGCATTGTACCCCGAGGCGCCGCCCCTGCCATCCCAACTGTTATCCTCCTTGGTTGA

mRNA sequence

ATGGGAGAAAATCAGGCGTTTCTGTTTGAGATTTGCGGGAAAGATTTGTGGAAGTGGCAGCATTGCAGCAAGAGAGTTCATGTCCATTGCGAAATGGGTTTCCGTTCAAACGGCCGGAAGAACAAACCGCCGCTCACATCTCGATGGCGTGTGTTCCACTCAAAGAGGTGTAGGACCACAGACGGTTATGCATTGTACGCTGCGATGGCAGGGGAGATGCGTTTCCACTCCTACGGTATGGGGAGCATGCCGAGCCCGCGACCTGCCACTGATAGGCGACAGGCTCACAGCCTGCAGGCGGAGGCACCACCCGCCTATTGTTGGAGATGTACAACCCCGATAGGCATTGTACCCCGAGGCGCCGCCCCTGCCATCCCAACTGTTATCCTCCTTGGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGAAAATCAGGCGTTTCTGTTTGAGATTTGCGGGAAAGATTTGTGGAAGTGGCAGCATTGCAGCAAGAGAGTTCATGTCCATTGCGAAATGGGTTTCCGTTCAAACGGCCGGAAGAACAAACCGCCGCTCACATCTCGATGGCGTGTGTTCCACTCAAAGAGGTGTAGGACCACAGACGGTTATGCATTGTACGCTGCGATGGCAGGGGAGATGCGTTTCCACTCCTACGGTATGGGGAGCATGCCGAGCCCGCGACCTGCCACTGATAGGCGACAGGCTCACAGCCTGCAGGCGGAGGCACCACCCGCCTATTGTTGGAGATGTACAACCCCGATAGGCATTGTACCCCGAGGCGCCGCCCCTGCCATCCCAACTGTTATCCTCCTTGGTTGA

Protein sequence

MGENQAFLFEICGKDLWKWQHCSKRVHVHCEMGFRSNGRKNKPPLTSRWRVFHSKRCRTTDGYALYAAMAGEMRFHSYGMGSMPSPRPATDRRQAHSLQAEAPPAYCWRCTTPIGIVPRGAAPAIPTVILLG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
MS025304MS025304gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MS025304.1-cdsMS025304.1-cds-scaffold25:59810..59954CDS
MS025304.1-cdsMS025304.1-cds-scaffold25:64445..64698CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MS025304.1MS025304.1-proteinpolypeptide