MELO.jh018810.1.t1 (mRNA) Melon (Harukei-3) v1.41

Overview
NameMELO.jh018810.1.t1
TypemRNA
OrganismCucumis melo var. reticulatus cv. Harukei-3 (Melon (Harukei-3) v1.41)
DescriptionSubtilisin-like protease SBT4.14
Locationchr08: 23812513 .. 23828932 (-)
Sequence length640
RNA-Seq ExpressionMELO.jh018810.1.t1
SyntenyMELO.jh018810.1.t1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonpolypeptideCDSstart_codonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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TAATTAAATTGTGGGGTGAAAAGTTTGTTGGAGATTTAATAATTATATGTATATGTGGAAATATATATTATTATGTTTAAAGAAAAGATAATTATATTTGTTGAAATATAATTATTTAAGGAAAATATAATTGTATTTTGGAGAAAGGATATTTAGTAATGGAGAAAAAGTAAAATAATTATGTTTTGGAAAAATATAATTATTTGTAAAAGGATAATTATTTTGGAGGAAGATAAATAATAATTAATTATTGTAGAAGATAATGAATTATTTTAGAGAAAGATAAATAATAATTAATTATTGTGGAAGATAATTAATTATTTTGGAGAAAGATAAATAATAATTAATTATTGTGGAAGATAATTAATTATTTTGGAGAAAGATAAATAATAATTAATTATTGTGGAAGATAATTAATTATTTTGGAGAAATATAAATAATAATTAATTATTGTAGAAGATAATTAATTGTTTTAGATAAAGATAAATAATAATTAATTATTGTGGAAGATAATTAATTATTCTACAGAAAGATAAATATTAATTCTGGAGTGAAGTTGCTATGGTTGGGTTGGGATAATTCATGTTGGAAGTTATAAGTGATTTATTGGAAAAGATTTGATTGATTAAAATAATTGAGGATTTAAGTTAATTTGAGATTTTGGAGGGAAAAGTTGGTTTTGGTGGAATTGAATTTAATTGAGTATATATATATATATATATATATTTTATTAATAATTTGGAAAAGTGAAGTTAATTATATAATGGAATATAATTATATTTGTTTGGAAAAGAAGATAATCCATGAGGAGAGAGATGGTTGATTTGATTGGACGAAAAATATATATATTTATTTATAAGAGAGAATAATGATTTAAATAAATATATATGTTTATTGTAGATTTTGGTGAGAGAAAAATAATAATAATAAATAAGTATTATTATTATTATTAATAGTTACAAATGTCGAAGATTTTGTGCATTTATTTAGGAAAGATAATGGAAATAAATATATATGTATATTTTTTGGTATTATATACATATATATCCTAAAAGAAAAAGAAAATAATAATAATAAATATTATTGTTATTATTTGGGTCTATAAATAGCATTGAAATGCTTAAGTTAGAAAGTAAAGGAAAAAGAAAAAGGTTCTTCATCTTCTTCTCTAAGATAACCCTATGTTGTTGCCCCCTCATCAGTTGAAGTTAACATTGGTCTCTTTGGAAGCTTGAGGATTTAAAGTGATGAATTTTTCCATCAAGGATAAGGGGATTTTTCAACCTCCATTTGAGTAACCCTGGTAAGCTAATGAAATTAAATTAATTTTAAGATTTAAATCTTGGATTTTTTCCAATCAAGGTTGAATTGGTTTCAACCTAAATTTTTAGAAAGTTTATTATTTTGGGAGAATTTTTGGATGTTAGCCAATTGCTAATTTCATTAATTAAGATACTGAGTTTTCCATTTATGATTAGGATCAAGTTAATTGGAGAATTTTTACTGTCAGCTAAGGAGTACTTTGTTTGGCTAAAATCTCCAGGTAAGAGATTCTCCTACTAGACCTCCGAACTGAATTTAAGAGACTGCATGTAATTATGATTACGTATTGATGGTAGCTAAAATGCGTAACTCATTATATTGATTGATGATGATGATTGATATTATGATAATGACTGTTGATGTTGATGTTAATGCATGATATATTAATCACATGATTAAGGACGTTAAGATTAATACTCATGCCATGTTATGATGTTATGTTATGCTACATGCTATGGATAGGGTGTTCTGTTAACTTTGTCTATTAGAGTCGTACCTGCATGGGTGTCCTTAGGGATCACCACCTTTTTAGGACTGCATAGTCCGACGGGATCGTCAGTCTGGCATTGACATAGACATGATTCGAGTGATTCGACGGGATCGCTCGCAGCCCGATTGTCTTAGTATTTCCTCCAGGTACACTACAGGCCAGTTTGTCCTAGGTGTTCCTTTGGGATCACCGAAGGCCAGTTATGTTCCTCCGAGATCATAGGTGTTCCTTTGGGATCACCAAAGGCTAGCTCTTGGGTACCACTTTTCAGGACTTTAATGGGAATTTAACAGACACGTAGCGGGACATGTAGTAGGTCCCTTACTGAGTATATGTTTATACTCACTTTTTCTATGTTTAATATTTCAGCTAAAGGTAAAGGTAGAGGAAAGCTGACGCGCGACAGAGAAGGATCCGTGACATGCCATATGTTTCAGTGTTTCAGTATTCCATTTTTAGTGAAAATTTAGTCTTCCCTCGTTTCAAGAAAGTGTCTATTGTTATTGTTTCTTTTTAGTAATGACCTCAGCTTAGTATAAAGAGTTGGGTTGTTACAGTTTTACCAGCCTCTTATGATTTGAACTAGCTGTTTTAGCCTTTGCATGAAAACAAAAGCAGGGAAACCTCTTGGCTTGTGCTATCCCACTATGGCTTGATATGTTTTTTTTAATTCCACATCATTGAGATATATATTGTTTGGACGAAAAGGCGTTGGGAGCTCGACTGATCTCAATGTTTAAGGACTACAAAGTAGCGATCAGATATGGTTCTTGTGAGGGGTCTTGGAGTAACGACAATTGAAAGTTTATTCCCAAGACGTGGTATATTGAAAACAATCGAGTCTTGACAGAACATGATTTATCATTAAGTTTGACCATGTAAACTTGTCGATCAAAGAAGGGTCAATTAGGTTGTTTTTAAGGATAAAACTGTTGAAAATTTTAATACTGAAAGTAGTAGGATTTCTAGCACTTGTTTCCTCTCTCCATCTAACTACATTAAAATCCCCACCAATAAGCCATCCATTGGTACACTTTGAAGAAAGGTCACTTAATTCTCTCCAAAGAGTGTTTCTCTCTCATCTTTTAGCTGGACCATATACGACTGTTATCCACCAAGAGAGGATGGGCTTGGTTGGAGAAATTAGTCGTTAGTGTAAATTACCTTCAATATAATTCTTCAAATTGTGTTTCAAAACATTCTATAAAATTAGAATGCGTTCTGAATTTCCACTCGATCTTTTGTATATGAAGTTTGAGCTTTTTAGCTTCCAGATGGAATTAATAATGGATTTCTTAATGAAAGGCATCATAGTTTCAGTAATGATAACAAAATCAGGATCATAGTAGGAAATAACTTTATTTATATGCACTACTTTGAGGGATGAGCCTAAACCACTTACATTCTATGCAAGAACTTTCATTTAAAATTGATAAAGCCCAAAGGATCCTTGTTTCTGTTGTCCCCAAGCCCAACCTCATCAGATACATTTTTCTCAACATTTTGATGTGTGTCCCCCATAATTGAAGCAGCCAGTTTCAAATTGTTTTGATGTGTGTCCCCCATAATTAGAATTTTTTTTGTATGGCTCTTTCTTCATTGGTTAATCTGTAATGTTTGGTGCTACATCCTTGTTAAGAATCATGTCAGGCATTTCTTTTACCACATATGGGCTAGAGTATGTGATATCTTCATCATGCTCTTTTTCTTTTGAGTTGAGAAGAGAGAGGTGGCCCATGTCTATTGTGAGTTCCCCTCTACTATGTTTGTCTTCATCAAAAACCATTTGGATTGACTTTATGATTAGACTAGGAATAGTGGGCTTTGGCCTGTACTCTTTCTTTTGGGCTTTCATTCCATGTTGTCATCTCTTATAATGGCTTTTATTTTTCCTTAATGACTCAACACTATCTGTCTGCTTAGCTGGAGTAAGTTTAGGGTTGTAGAAAATAGTTTTTTTTTTTCAGAAATAAAACAAATTTTCCTTTCGAAGATTCATTATCTTCTTCATTAACTTGTTCCATTGAATGCTCCTTATCATTACTCTCATCATCATTGCTTGAAATTAGTTCATTCCTTTTTTTCATCTATCTTTCTACGAATTTCAGCCTCTTGAAATCCTTCTTACCAGATTTTATAGGATTCCTAGCATTAATATCCTTGGCTATTGTGGGATTTTCTGCAGCTTTCAACTCTGCCATTAATTCACTTGGATCAACATTTCAAATACGTCATTCGGAATTGCCAAATCTTTGATGAACTGGTATTGTTCAGCTTCAAGGTTGAACTCATCGAAATCAATGGTTGCCTGCCTCTTGAAGGATCCATGAATTTTAACGTCACGTTCAGCCAACCATTTACCAGAACAAATAATGATAGTATGCACAACGAAGAAATGACCATCGTTGTCTTTTATTCTGATTGCAGTTGGGATAAGCCCACAATAATTATATCTTACTTTGTCTTGGCTTCGATGAGATTTTCCATGTTTATAGTAGGTTTTGTCTACATTAATAAATCCCTAACATGCATTACCTATTTGAGTGAAGGTGTCCATGTTCCAAGCATGAATTGGAATGCCCCCAAAGGAGTTCCAGCTTCCATAACTTAAAATTAATTTTTGGGTAGTATGTTTCTCTATAGACCAGAATTTGAACTTAACATGGAATTTCTCAACTATAGTCCACCCAACTTTACTGCATAGGGATTTTGCGTTCCATGGTTCAGAGAAAGTAATCAATGCTTTTTCTGCATGAAAGGGGTGATATGTGAAGGTTGATTCAATATGTCTTCTAAGGATGTTCATGATGATTTTCCAGTCATGATGAAAGTACATCCTGGTATTCACAACTGCATTTTCAAGGGGTAATTTTTTTATTGATCTTGGCTTTCTATTGTCAAAGCAAGAGCTTGAGTCACTTGAATAGCCCTCAAAGACTAGCTTGCATAGGATTTTCTAGATGTATCTGAGTTAGAGTCAGAGGATGCATAACTTTTACCTTTTTTGTGGAGATGATAAGTAGGCGGTCGTGCCTTTGGTTCAGTTTCAACATTTGAGTTGATCATAGACAGGATAGAAACCCATCCGCTAGTGGCTGCTCCCTCAGGTACTAAGATGCAACATTTTCTACTTTGTTCGTCAATTCTGAAAACCTCTGCAATGTTTCCATTTCTGTTCCTTGTTTTCCTTACCCAATAGCAGAATTCATGGAACCTTTTTCTGTGAAGAATCGTTTTGTTTTGGCATTTCAATAAGAGTTTTCATTGTATTTTTCAGCTAATTCATAGACTCCATAAAGAAAAGGATTGAAAAAGACTTATGGGTCCCCATTTCTGTTATCCAAAATCTTATTGCATTTTTATTTTTGTCCAAAGAGAGGACACAATCTTTTCTTTCAACCTGAAAATTGCGGGGAAGGTGCTTGAGGAGGGCCATGTATGTCGTAGCAGAAAAGGAAATTACTATTGATAGTAGAGGAGGTGAGTAGTAAAGTTAGTTTGAGTACTACCTTTTAAAGATGTTGATAGCTTCCTATATTCCAAATTGATGATATCTGACTGGTGGTTGCATGTACCATTAATGGATGACGTTGCCATTCTACTATCAATGTAGTGTGTTTGATTGTCTCTCGGGAGTGGAAAGGGCACACAGTTGCAGTTATTTGATTAAGGTTACGTTTTATAAGTACTTAGCATGCTCTCAAATCTAACTCGATCGAATTCCAATATATTTTTAAACTTTTATCTTGATTGTGTAGACTTTAGAGAAGTTGAAGTTTGTTCGTGGAAATAAAATTTGGAAAAGAAATTGTAAGTTGATTCTTCCAAAATTTATTTTTGAGTAATGTGATTTGATAAGAGTTTGAAAGTATGATTATTTGATTGGAGGATAGATTTTATAGTTGTGTATTTTAATTGTCGGGTCAAATGAAAAGTAAGTGTAGTTTAGAATTGTTTTGCATTGAAAGTATATGTTGTGGGTTTTATTTGTGTTATTATTTGAATGCAATAGTTGATTTTTTTTTAATTATTACTTATAACATATTAAGTATCATAATGTTCTAATGTTACGGCACAAAGAAGAGGTTGGAAAGTGAAGAAGTGTAGTTTGAAACAACTATTTAGAGTGTTATAATTATATATGTTTGAATACTCTACTATTTGGTAGTCATAGTTTAATTGTTGTTTATGTTTTGCATTGTCTATGCATTTTATCAAATGAATTTGTGTGTTTGATGGATTCCAATTTAATATATATTTGTATTCATCTTTCTAGAGTTAATTATCGGTTTTCTATTTTCAAGTTCAAGCTTATAAGATCTCTCTAGAATATGTTAATCTTGAGAGCTTGTAATTATAATTAAAGAAAGATAAAAGTTTCATGAAGTTATATGTTGAACACAAAAAAAAAAAGTAGGATCAAGATGTTTGAGTTCAAGTTTAGTGTGGAAAAACTGACCATAGGACTTCCTAAAACTCAAAAACTCAATTAATTAGGGTAAAAAAATCGTTTTAGAGTATTGTACCTAATTTTGTTTATTTTTTTAAAGTTGAATATAGCTCGTGGATGGACGAATAATTATATTACTTTTGTTGATGCGAATTAG

mRNA sequence

ATGATAGTATTTAGTGATGAAATGACAGTATTCATTGTAGGACCCGTGGTGTAGAATGGCGTACGAGGCTCGTTAGAAGACTACATACATCAGGAATATGGTGCAAACATCACGTCGAGGATGGTATTACCGACGCATGGATGATGTCAGATATACAAACATCGAGAATAGTTATTCCCGACATATAGCTAACTCAGAACTGTGGACATCGAAAATGCCTTGTCGTCGATGCAATTGGTCTCTCGACGCGTTTCTTTCGACGGTCTTCTCGACATCAGTTTCTACGTCAAGAGTTCAGTTCTCGACGTTTTTAACACTTACGCCAATGTTTTTATGCATCAGGAGTCACCCCACTTCTTGAAATGGATATCTCCTCATGTACACGAACACGAGACCCCACTAGACTTTACCTTTTTTGTGGAGATGATAAACAGGATAGAAACCCATCCGCTAGTGGCTGCTCCCTCAGAGAGGACACAATCTTTTCTTTCAACCTGAAAATTGCGGGGAAGGTGCTTGAGGAGGGCCATACTTATAACATATTAAGTATCATAATGTTCTAATGTTACGGCACAAAGAAGAGTTGAATATAGCTCGTGGATGGACGAATAATTATATTACTTTTGTTGATGCGAATTAG

Coding sequence (CDS)

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Protein sequence

MQLVSRRVSFDGLLDISFYVKSSVLDVFNTYANVFMHQESPHFLKWISPHVHEHETPLDFTFFVEMINRIETHPLVAAPSERTQSFLST
Homology
[Close]
BLAST of MELO.jh018810.1.t1 vs. NCBI nr
Match: TYK28456.1 (subtilisin-like protease SBT4.14 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 3.81e-07
Identity = 25/43 (58.14%), Postives = 33/43 (76.74%), Query Frame = 0 

Query: 4  VSRRVSFDGLLDISFYVKSSVLDVFNTYANVFMHQESPHFLKW 46
          +S RVS D L D++F +++SV DV NTY +VFM +ESPHFL W
Sbjct: 35 LSLRVSSDDLPDVAFCIENSVPDVINTYVDVFMRRESPHFLGW 77

[Close]
BLAST of MELO.jh018810.1.t1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DXG9 (Subtilisin-like protease SBT4.14 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold629G00880 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 1.85e-07
Identity = 25/43 (58.14%), Postives = 33/43 (76.74%), Query Frame = 0 

Query: 4  VSRRVSFDGLLDISFYVKSSVLDVFNTYANVFMHQESPHFLKW 46
          +S RVS D L D++F +++SV DV NTY +VFM +ESPHFL W
Sbjct: 35 LSLRVSSDDLPDVAFCIENSVPDVINTYVDVFMRRESPHFLGW 77

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO.jh018810.1.t1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
TYK28456.13.81e-0758.14subtilisin-like protease SBT4.14 [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of MELO.jh018810.1.t1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO.jh018810.1.t1 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3DXG91.85e-0758.14Subtilisin-like protease SBT4.14 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676... [more]
BLAST of MELO.jh018810.1.t1 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
MELO.jh018810.1MELO.jh018810.1gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO.jh018810.1.t1.exonMELO.jh018810.1.t1.exonexon
MELO.jh018810.1.t1.exonMELO.jh018810.1.t1.exon_2exon
MELO.jh018810.1.t1.exonMELO.jh018810.1.t1.exon_3exon
MELO.jh018810.1.t1.exonMELO.jh018810.1.t1.exon_4exon
MELO.jh018810.1.t1.exonMELO.jh018810.1.t1.exon_5exon
MELO.jh018810.1.t1.exonMELO.jh018810.1.t1.exon_6exon
MELO.jh018810.1.t1.exonMELO.jh018810.1.t1.exon_7exon
MELO.jh018810.1.t1.exonMELO.jh018810.1.t1.exon_8exon


The following stop_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO.jh018810.1.t1.stop_codonMELO.jh018810.1.t1.stop_codonstop_codon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO.jh018810.1.t1.cdsMELO.jh018810.1.t1.cdsCDS
MELO.jh018810.1.t1.cdsMELO.jh018810.1.t1.cds_2CDS
MELO.jh018810.1.t1.cdsMELO.jh018810.1.t1.cds_3CDS
MELO.jh018810.1.t1.cdsMELO.jh018810.1.t1.cds_4CDS
MELO.jh018810.1.t1.cdsMELO.jh018810.1.t1.cds_5CDS


The following start_codon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO.jh018810.1.t1.start_codonMELO.jh018810.1.t1.start_codonstart_codon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO.jh018810.1.t1MELO.jh018810.1.t1-proteinpolypeptide