Lsi03G004070.1 (mRNA) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi03G004070.1
TypemRNA
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr03: 4645662 .. 4654784 (-)
Sequence length213
RNA-Seq ExpressionLsi03G004070.1
SyntenyLsi03G004070.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTCAGGTTAATCAGATTTTGTGCCTAATTTCTTTTCAGTTTGGGAATTGCCCTGCTGCGGTTGCTGCTGAATTCCGCCGCAAACTTAGGGTTGCTCAAGATTGAGGTTATTATTTCCGTACCATTTTTTTTTCTTAATTAAAAAAGAACTCTTTATTATTTGAGTGGAAATTGTTTACTGTCTAGGTTTTAAATTTTAATATCTATAAGCAATGATTAAAACATCTCTAGATACATCTGATATCCAATATCTTTTGACTAGTAATACATTAAAAGATATATCTATTTAGTTGGATATGAATACAAATATTAATAACAATATTCATAATTTAATTTGAGAATAATAACAACTCTATTACGATAGACTGAGATTGACTTTTATTTAGAATAATCTTTCTAATAACGACCTACTTATTGATTTAAATACCTTTTATAATTTTTTTAACTTACATAAATATATTTCAATATCGACAAATTCGTAAAATTGAACTATCAATATCGATATATTAATTTTTGGTTCTAAATGAGCAAGAATGATTAATTCGAGTATAGCATAATTGGATAATTATTATTTTAAGGGTGGATATTTGAATCTAGTTGGTGAACTTAAAAATGAACTAGAATGTCATTTTCTAGATTAAATTTCAAGTTCAATCCATTAATATAGTCTTGATTGATAATGAAAAAAACTTATATTTCTTTCTTTTCAGTTTTTCAATAATTTTCATTTTAACAGAAGTACACATGAATTACTAATCACATTCTAAAAACAAAAACATCTCTAAAACAATTTTATTTTTTGTCTTCTAAGTGTGATTTGATTTTTTAAAAATATTAGTAGAAAATACATTACAAAACATAAAATTTTTGGATGGAAGTAAATTGTTATTTAATGAGTCTTAAATTATTTAAGATGGAATGCTCTACAAAGTACTAGTTAGTTTTTTTTACTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAACTTGTTAATTCTCTTCACCAATTAAGAACTTGGTTTTCCTATTTAGTTTTTAATATCTTATGAAAGTTAGTATTTTAATTAAAACTTATTTTGTAATGCACTTAACTTGAAACTACCTCTCGAGCATAAAATTTTAAGATTGATGAACTTATGGTTGGTAAATTTAAAAGGATGAAGGACATAAAAACATGAATAAAACACTGAAACTCATTTAATTAAAGGGTAATGATTATGTGCAGCGCATCTTTTTTTACACACCGAATGAAACAAATAATTGATAATTTTTTTAAAAAAAATATTTGTAATGTGTTAGAATTTTATTGGACAATTTCTTGAAATGTACAAAGATAAGTGGAGTCGAGGGAGCACCTAATTTTTTTCTTAATTAAATATCTATAAAAGTTTGGGATACATCATTAGAAACTTCACCTATTCATATTCTCAATTAAATCAACAATTTTTAGAAATTACGTAAAATCAAGTGAAAGGAGAATAAATTTCATTTTCTTCCATCCCTTTTGTGTTTTTGGCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAAGAAACCCTCTAATCAAGTATCCTTGGAGGTTGTTTATGGTGCTGAATTGAGTTTTATATGTATAAAGTTCATATATGTTATTGACTTCATATGTAGGGTATCTGCTGTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATATATATATATATATATATATATATATATAAATAATCTGTTTTTTTATAGTAATTAATTTTTTTTTGAAATTTTTTTATTCAATAATTCTGTTTATTTTTTGGACTGTTTTCAAATATCGAAAAATGAGCCAAACTATTTACAAATATAGAAAAGTTTTCGATAGAAGTTTATCACTCAAGTGATAGAATTCTATTACTGTCTATCGTTGATAGGCAGTGAAAATTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGATATTTTTTCTCTTTATAATAATTTCTCTCTTTTTTTAAATAAACTATGTATTGCAATTTGCTTTATTGTTCTTTTTAAAGTACACGTGTATTGTTGTTGGATGTTTTGGGAAATGGAGTTAGGGTTTACTTTTGAATTATTTCATTTTTTTAATTTAATCAATCATTTTACAAATTTATGCATGTAATATTTATAGTTAAGTTAGACAAAATTACATTGGACTCATTGAAACAAAACAAATTTTAATTTATATGGTAAGTAATATATCCTCAAAATATAATTGTATTATAATAACCCTATCAATGGTCATGTTACATGGTTGACACAAAAAATATATAACAAATGTCACATTCTTTGGCCCAGTTATGTAATACAAAAAAATTATATAGGATATGAGCGAACAGATGGCTAAGTCCACTTCCACAAGAAAATTACATAAACATCCATCTAAATCCTCTATCTGATAGATATGTTCGACAGCTTCCTTTTACCTTTTAAACTCCCGTTCATACTTACTTTTTTGCTATGATACAAGCTTCTGTTTGGTTTAACTTGGAAAAAAATGTCTTTCAAAAAGTCATTTTTCATTTAAACACTTTTGATAAAAATTATTTAAAATAAAAACACTATGGAGTATTTGGGGTGAGGAGAGGAGAGGAGATGAGATGAGTTGAGATATGAACTCAACTCATTGTTTGAGAGGCCAACTTTGTATCTCATCGACATTTTATACCATGTCACCAACAGTGCACTCACCTCATCGCCACTAATGCCTCGTTGCTCAACTCCAGTGACCACCTCTCGACAACCAAATTTGTCGACCACCTTTGACGGCCGACTCTGGCAACCATTGCCTATGGCCAACTTTAGCAACATTTAACCACCACTATTGGCGCCCAACTCTAGTGACCTCCGATGGCTACCACTCCACCAACTCTGTCGACCATTATTTTGAATTATGATTACAACTACTTTAGGCTTTGTTGACACACGAGTTTTTGTTTTATTGACAGTCGTGACATAAAACCGCCAATAAAACCTTAATTTAAAGTTTAAAAATAACTATTAATTTAAAAATATATAAAACATCAATAAATGTTTATATTTAAGTTGATACACAAAATTGTTAATATAAATACTTTTATTGACACAAAAGTACGTAAGTTTCGTCAAAATATTGAATTCTTGATTTTTTGATTTGTTCATAATATTTTATAATCGTTCTTTATAATGATTTAACATTAATAAAATCACTTTTACCATATAAGAAATCAAACAAACTTGCATATGTAAAAAACACTTTTGAGAAGTAATTGTCAGATACATTAGTGTTTTTATTTTAAAAAGTTTTTATCAAAAGTGTTAAAATAAAAATGATTTAACTGTACAAATTTGTAAAATAATTTCTTAAATTAAAAAAAAATTGAAATGCATGATCCAAAAGCAAACCCTAAACCTCATTTTCCAAAACTTCCAACAATACATGTGTGTTCAGAAAGCAATAAAATTATCTTGAGTTTATTGAAAAATATGAGTAGAATTATTGAATCAAAAGGTTTCCAAATAAAAATAGTCATCATAAAAACATATTATTTATTAAAAAAAATTGTACCAGACGCTCTTGACATATGAACTCTGCACCCTAAACATCCAAAGCACTGATCACACATAAACTCCACATACATATGAACTCAATTGAGCACGCCAAACAACTCTTCTGTGTCTAGCAACTCTTTCTCAAAAGTGTTTTGATGTACAAGTTTGTTTGGTTTGTATATATGCTAAAAGTTTTTTTTATTAATGTCAAATTACTATAAAGAATGACTATAAAATACTATGAATTAATAAAAAAAATAGGAATTCACGGTTCTAACGGAACTTACGCACTTTTGTGTCAACAAATGTGTTTTTATTGACGTTTTTGTGCATCAACTTAAATATAAACATTTGTGGATGATTGATAACCATAAATATATATATTTTTAAATTACTAGTTATGTTTAAGTTCTAAATTAAGGTTTTATTGACGATTTTATGTAACGAGCATCAACAAAACAAAAAACTCGTGTGTCAACAAAGCTCAACCTTGTAGTAGTGATAATTTAAAATAATGGTCGTGGGAGTTAGTTGAAGTGGCAAACGTGGAGGTCGTCGGAGTTGGCTGTAGACAGTGGCATCAATGGTGATGAGAGTTGAGTGCACTGTTGGAGGACATGAGTATAAAATATCGGTGACATACAAAATTAGCCCCTCAAACACTGTGTCAAGTTCATATTCAACTCATAGCAACTCAATACCCTCATCTCAAAATCTCTCTTGATGTCATTTGATATCATTTTTTTTTTTGAATTTTTTTTATTAGGATCAATTCAGCTCTCTTCAATTTCATCACGTTCAATTTCTAACTCTTTTGCATAAGACAGTTTTCACAGTAAAGAATTTGTGTATTCACTTGGATATAATTTTCTTCTAGAGCCAATTTTGCATTGCATTAATGTTATTTCAAATAATAATAATAATAATAATCGGAATCATAATCATAATCATAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATAATAATAATAATAATAATCGGAATCATAATCATAATCATAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATAATCATCTGGATATGGTTTCACCTTGGCAATAAATGACAGCATTGCAGATTCAAGATTTGTTAACAACCTGAACTCTTGAAGATATACATGAATAAATATAACCACATTATTCAACATTATTATCATATATATTGGTGGTGGATCTCTATGTGTTTGTTGTGGTTGTGGGTCCCACGTGGATTTGACGTTTGACTTACTTTTTCTGGCTTGGTTTCGCTTTCTGAGTTGATCTCACATTGTTGTGGCACCAAGACTACCACGCTTTGATGCTTGAGTTAGTACAGGGAGTGTATAGTTGATTGAAACACAAAAAAAATAAGGTTAATGTCCTTTGGAGACTACTACTTGCCCTCTTTGGGGTTGTTGAATGGGACGACTATTTATATTTCTCTCCCTCTGACAGTCACCTTCGGTTATGTCAGGGTAGTTTACAACGCTTGAGACTGCAGTGCGCCAAATCAAGCACAACTCGATTATTTTTCAATTGGTATATATTATTACTGACTTGACTGATTATCCTAAAATTTGGAACTCGAATTTTTTTTCTTTTAGGATGCATGTTCCATCATGTCGCTTTCCAGGTTTTTATTGGACTTGGCCTTGCTTGTGGGCTATGGGTCAAGCATTATCACCATCTTTTCGTTAATGAATAACCAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTGACAAATGTGAGGTGTGAACATTTGAAATTTCAATTTAAAGAGAGATTATAGGTCAATTATAGTTGAAATATGTTTTGACAATTAACCATCAACATAACTCAAGCAGTTTAGAACTATTAGCCAAAGGTGTATTTTCCGAAACTTAAGTGCTAATAAATAGATTTAAAAACCGATCCTTATTGATTTATACAGAAAATAATGAATAAAATTACCCAATGTTGTCAATGATTTCAACAATTAAGTCCAAAAGAAATAGGTCAAAGTGAGTTTAACTTAGTGGTATGAGCATGTGCTCTGTGCCTAGAGGTTGGAACTATAAAAACTAGAATTTAAGAATAATATATCATATCATTCACATACTAAATAGTAAATACATACAAAATTCAAATCAAGATGTATTTTGTTCGACACTATCTTTTGCTATAAAAGGATAGGTATAAGATAGATTTTATTTAGGTTTAAATACTACTTTAGTCCCATACTTTTTGCTTTGGTTCATTTTGGTCCTTGTACTTTTAAAATATCCTTATATTTTCAACTTTGGTTCATTTTGGTCCATATACTTTCAAAATATTCATTTTGGTCTTTGAACTTTCAAATATAAAAAAATCAACCAAACTATTTACAAATATAAAATTTTTTTACAATCTACCAACTATAGTTTAATATTTTTTATGTTTATAGTAATTTTTCTTTTAAGAACTTATTTTTGTTTTTTTTTTAATATAGCTAAAAAATTTAACTCTTCTACTCAAGTTAGATGAAAACATAAAAAATTAGAAAGAAATAGACTTAATTCGGAAAAAAATGGTTTAGTGCCTAAATTATTTTCATTATATCAATTTTGAGAATTAATTAATCTGTTTATGTTGAAAGAAAGAACACTTTAAACTTTTAAAATGTTATAGGTTCCACTACTTTTCTTCCCTCTTTTCCAGTGTGCGTCAGCCATTCGATAATCTACGTCATCTCATGTAAATAAAACTTTTTCTTTTTGAACAAATATATATATAGAAAATTTTTAAAAATAGAAAAATAAGAAAAATTATTTACACAAAATAGTAAAATTTTTAGATAGTTATGATAGACGCAAGTCTATTAGTAATAAAAATAATAGAAGTCTATCACTAATAGATGCTGATAAAAGACTATCAATGTCTATCAGTATTTTTTTTTTCTATTTTCTGTAAATAGTTTGATATTTTTTCTACCTGTAAAATTTTTTTAATATATATTGAAAATTCTTGAAATTTGATATATCACAATTTAAAGAATAATCACTTACAATTCTAAGAATGTTATCATTATATCATTCTAAAGATCGACCATGCAATGAAACCGTTTTAAAAAAAACGTCAGAAGAAAGGGAAAAATATATATATATATATATTTATTGAAGTTGGGTGATATTTTTATTATAGGAGATCATAGCGGCTGTTATTATATTGTGTTTCAAAAGACTGGGTTTTTCTTAAAATGAAATTATGGAAATAGTAAATTAATTAATTCCATATATTATTCCATCAAACTATTTTTAAAATGATATTATTCTTTGAATAAATTTAGAATATTTACATGTTAAATTGTTAAACGTACAAAAACTGTGTTCCTCTACTCGTATATATTCCAATTGATCTTCCCACTACTTCTGTATACATATTCCAATTTCTTTTCATCTGATGTGGCGTTTCATTATCCAAATATAACATTTTTTTTTAAAAAAAATAAACTTATTTTTTCTCCCTTTCTTATTACCAAAAACAAAAACAATTTTTTTAAAAAAAAAAATCACTTTTTTTTTAGTTTCCAAAATAGTAAAAAGTAGATATCAAAATAATAAATTTTGAGGTGGAAAGAGTATTTATAGACTTAATTTATATATAAAAAAAAAACTAAATGATTACCAAGTTAAATTCTTTGGTACATAAAATAATTATATTCTTAGTTATTGGTGTATTGTACTATATGCTTATCCAGTTAAATATATACTTTGTATTAACACTAATATAAATTTTGTGTATATATCCTTGTAAGTGGTCCACATGAGATTTGGAAGTTTATTTCGTAGAGTTGAATTCATCAATTTTGAAGTCGGACGTTCATGCACATTAAAAGTGTTCGTGAAGAGTCACTTGCCAATGTAAAGTACTTGTATGACATGTTTGAATCAACCTACAATTTAGCGTACTCACATATATCATTCATATGCATCTAACTCCCAAATAGAAGTAATAATCGGTTCGGTTTTGGAATCGACAAAGAACCAAATCAAACCAAATGGTTTTATAAAGAATAGATTCAAACCGATGTCTAATAAAGAACAATTCCAATGAATTGGTTTTTATTTGGTTTAGTTTATTATTTGTTTGATTTTTGGTTTTAACATTTTATTTTTTTCTTTTCCAAAATTTAATTTTTATTTCCAATTTTGTTTTGAATGGGTCATTTTTACTAAAAAAAATTGGGTCAATTTCTAGATTGAAATTGGACATTTTTTTTTCTTGATACTTTCTAAATAAATATCATACAAACTCTATAATAATTAATCTTTTTTCTAAACAATAAATATATATACACCATAATTATTAAAACACTAAAAGATACTTAATATTGTTAGAGTTTATTTTTTAGAGTATGTATACCCTTGGTTTGGTTCGGTTTTGATTGGTTTTTCCAATCAAAATCCAATTCGAACAAATATTTTTGGTTTTTTCAAATAAAAACCAATATGTCCAATTTTATACTAAAAACCAAACCAAACCAGTGGATCGGTTTGGATTGATTTCGTTTTTCGATTTTTTTGTAAACCAAACCAAAGCAGCTTGTCAATACTCTCTTACTGCAACCTTGACTTATGACGCTTATAGCTTTATCTGGCCACCATTAATGATATAATATTCACTTTCAATCTTGCTTGCACCTTAGTTAGGCTTTTTCAAAGGCCTCTCTTTGGTCATGTTACGACACTTTTCTCAGTCCTTGACATGGCATAAATGGGTGATACTTCATATGTCATTATCACTCGTCTACTTTGTGGGAGTCCACAACCTATTTATGGTTATGACATTTCACCTAATGACATTTTAGCATAGTAAGTTTTATCCATAAGAAAGTTATATATGATTGGTGCATATTTATGTAACATCCTAAATGATTCTCATCTATGGGAAATTGGAATTACTGCATCATCTTACTAAGCTTCTCATGATGGTATACTGTAATCACCAAGACTGTTTGGTTGAATATTTGTGAATAACAAAATAATTTACAAGAGTAAAATATGTTTGAAAACCATATTGTTGGGTGAGAATCTTTATAATCGTATCAATTATTAACTTAATTTAAATTTGGAAGATTTTCACAGATAAAAAAAATATTAAACTATTTATAGAAAATAGCAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATAGAAAAGGAAATAAAAGGGAGGAAGGGAGAAGGAAAGTTGAATCTTAAGCATAGAAAGAAAATTAAAAAAATCTTGAAAGCATATTGGGACAATATAATCCTTGTTGACGGGTATTTAATCAAGATGCCAAGAAATAGTTTATTCCCACATTTAAACTTCAAACCAAGCAAAATTACAACCTCTTTCCCATCATAAACAAGGAAGAATAAAAATGAAAACTAATTAACTTTGGATTAATTACCATTGTAATTTTTATTAGGGATTTATGAATTCCACTTGAAAGTTGATAAAGACTTATCAGAAAAGACCATTCTTTTGACACAAAGGCAACTATTTTGCCTCATTAGGAAGTGA

mRNA sequence

ATGTTCAGTTTGGGAATTGCCCTGCTGCGGTTGCTGCTGAATTCCGCCGCAAACTTAGGGTTGCTCAAGATTGAGGAGATCATAGCGGCTGTTATTATATTGTGTTTCAAAAGACTGGGGATTTATGAATTCCACTTGAAAGTTGATAAAGACTTATCAGAAAAGACCATTCTTTTGACACAAAGGCAACTATTTTGCCTCATTAGGAAGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTCAGTTTGGGAATTGCCCTGCTGCGGTTGCTGCTGAATTCCGCCGCAAACTTAGGGTTGCTCAAGATTGAGGAGATCATAGCGGCTGTTATTATATTGTGTTTCAAAAGACTGGGGATTTATGAATTCCACTTGAAAGTTGATAAAGACTTATCAGAAAAGACCATTCTTTTGACACAAAGGCAACTATTTTGCCTCATTAGGAAGTGA

Protein sequence

MFSLGIALLRLLLNSAANLGLLKIEEIIAAVIILCFKRLGIYEFHLKVDKDLSEKTILLTQRQLFCLIRK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lsi03G004070.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lsi03G004070.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lsi03G004070.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lsi03G004070.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Lsi03G004070Lsi03G004070gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lsi03G004070.1.exon.4Lsi03G004070.1.exon.4exon
Lsi03G004070.1.exon.3Lsi03G004070.1.exon.3exon
Lsi03G004070.1.exon.2Lsi03G004070.1.exon.2exon
Lsi03G004070.1.exon.1Lsi03G004070.1.exon.1exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lsi03G004070.1.CDS.4Lsi03G004070.1.CDS.4CDS
Lsi03G004070.1.CDS.3Lsi03G004070.1.CDS.3CDS
Lsi03G004070.1.CDS.2Lsi03G004070.1.CDS.2CDS
Lsi03G004070.1.CDS.1Lsi03G004070.1.CDS.1CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lsi03G004070.1Lsi03G004070.1-proteinpolypeptide