Lcy01g013540.1 (mRNA) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy01g013540.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr01: 34988433 .. 34992242 (+)
Sequence length429
RNA-Seq ExpressionLcy01g013540.1
SyntenyLcy01g013540.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCCACGTCATTCCAATTCCAGTGGGTGCTCGCACATGGGATTCTTTCCCCGGGGGCTGCGCCTCCCGTTTTCGTGGCGGACGTGTCTTATCACGTGTGGCCGCACGTACGCTCATCAACGTGCATCCACTCTACTGTTGCGGCGGGAGATTTTGATTTCCGCTGTGATGTCCCCACTGCCACGTCAAGGAACCGGAAGATCACAGCTGGCAAATCTGGACCGTTAAACGAGGTGCTTTGTCACATTGTATGAGGACTCTTTTAACAACACGTGTGACGAGAGATTTTAATAGAACAATACTTAACCGTTAACCGTATAATAATAGGTAAGAATTTCGTATCTATTTTATTAAAATATTGACAACTAAGAGAAAAAGATAGGAAATAAAATAAATTTTTTATCTATCTTATTTGTCAACATTTTAACTCTAATATATAAGGAGATATCAACGCTTCAAATGTATATAGTAAGTATTGTCCATTTTAATATTTGATTGTTTAGTTAAAGATTTATGTTGATGTTGACATGATTTTTTTAAAATTAATACTAGGTTGAACTATTAAAAATGTCTTTGAACTACTTCAATTTTTTAAAAGTTACATTTTAACCTTTGAAGTTGTGATTTTTTTCTATTCAATTCATGCACAAAAATGATGTGTTTATTTATACTCTAAATTTTGGACCATATCTGTTATTGTCTTCCTCATTTCAACTATACACCCTCAATTTTATAATAATTTCGTTTGATATGTTAGTAATTTATTAGACACAGATGGAAAGTTTAGAGGTTTATTAAATACTTGTAAAGTTTAAAAACTTATTAGAAACAAAACTAAGGAGCCAACAAAAGCTTAGCTCAACTGACATAATCATGTTTGGCCCATGGTTTAGGAATTAGAACCTTATGGGGTTTGTTCTGGCGGATTTGAAAGCCTGAGAATCAGAAAACAGTGTTAATTCTTAGGTCTCGTTTGAAAATTAAAAAGTTTTGAAAACTAAAAAAAAAAAAATAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTGGAATTTGTCTAATATTTTAAATGTGTCTTTAACAAAGATGAAAATCATCCTAAGAAAATTGAGATAAAACAAACATAATTTTCAAAGCCAAATGGTTATTAAACGAGGGCTTAAGTTTGGTCATTTTTTCCATGGATTCACATGCAAATTTTAAATTCAAAACAACAATTCATAATAATGATATTAAACCTAATGTTATAAATTAAAGTAGTTATTGAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGGTTCATGAGAAAAGAAAATTTTGGAACATAGAATTACATAGGCAGCAAATTTTCATAGTTTTTGTACTTTTAATTTTATTAAATAATAAATAAAATGCAAACTATATGTTACTTTAAAATGACTAAATTAATTTATTATTTTTTTTTAAAAAAAGACTAAATTAAATATAAAATTATGTATATTTATATTATTTTAATATAAATAAGTTCAAAATAAATATTATATGTCAAAATAAACTTAGTTTTGCGAGATGGCATTTGTTGTAGAGAAATTGTCTTATGACAAATTTAATGGCTTTTAATTCCAAGTGGACAAATTAGACCTTATATAAATTGAAATCGTGCTTTCAAGACAGGATCTCGTCGTTTTTAGAAGATGTCCCAATTTTGTTTTACCCAAGCCAAGGGTTAAAATGTCTATGTCGACGGAAATGTCGATGTCTCAATTTTATAAAATTGTCGATAAAAATAGCGACAAAATGTCGATGTCGATGGATATTTCTGAAAAAAATATTTAAAATAAAAAATTCAAAAAAATATTTGAATTAACAAATGAATGTTATAACTTTTAAAAATAAATTAAAATTATTATTATAAATATCATCTCCAAATTAGTTACATTTGGTTATTATTTTGTTTAAATTTTATGAACTTCTTGACAATATAATGGAAATGTCGATTCATCCTACATGACGATGTCGAACCCATAGACATGTGGAAATGTAGATGGAAATGTTGACATGAAACATACTCAAAGAAGGAGAAAAAAAACTAGAAATTAAGTCACTTTTGTTGTATAAATAGTTTGAAGTTAGACTTATAAATCACTTTTAATTTTTTTTTTCGAGTTCAACTGTGTATAGAGATGAAGTGATTTAAACTTTTGATCTATTGATCAAATATATATATTTTAACCCGTTGTATTATGTTCAAATCGACAATTGTATGATTTAGGTGGATTAAAACTACCCCACATTTACACTTACTTTCAAAATTTTCGGTATAAAGAGAAATAAAATAATTAAAATTGGGAGCCGGATTGGAAATTGGAAAAAATATTAACATTTAATATATTTTTTTTTTTTTGGGTTTTTGTGATAATATTATACAATTCATTTGAGTTGTCGTGTAAATACTAATTTTTATTTCATCCTCTTACCAATAAATAATTTTTTTTTAAAGTTTAATTACAAATTTAAGAAACAGGAGCGAGGGAGTTTTTCAAAGGATAGACAATCATTGTTTAAAATTGCATTAGAGATAGGGGAATAAAATTTTTGTCCCATACTAATATTCCATCAATTTAAAAATAAGTAAATAAATTAATAATTAATTAATTAAGATTTCAATGGGAAGAGTCCTACTAATCATGTCATGCGTCATCCTATTAAGAGAATAAGTTAGACCAACTTATTAATTACGAATATATATATATTTTTAGGAGAACTTATTAATTAAGAATATTTGGATTAAATTATATACTTTTAAACAAATTCGTAGAAAAAGAGATATTAAGCCAACAAGAGCTTAGCTCAACTGACATAAAGTTGTACTGATAACCACAAGGTCTGTGGTTCGAATTCTCCTCCCCACATATTGTAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAGATATTAAAAAAGAGAGAGAGAAAAATCAAATTATGCACATGTTGACTAAAGTTCATGTAGTTATTGATAATCTCAAATGTTCAATTTACATTAGAATTAGAATTGTTGTCGTTGTTTGATAGTAAAAAATTGTACAAAGTTGTAAATTTTTTTATTAGAAGCTACTTTAGTTAACCTGAAAAAATTCATCATGATTGACTCATTTACATCTCTCAAACTTCCAACCGTATAAAATTATCAGTCACATTATTCCAACCTCTTTCAATAATTTAACTTGTATAAAAATTTGTACAACATAGAAGTATTTTAAATTAATTAAAACAATAAGATAATTTAGTAGAAACTAAAAAAAAAAACTTAAGATGGATATTTCTTTCAAAATTTCTTAAATAAATAAATAAAAAAAAATAAAACTTTAAAATACTTTTAAAATTAAAAAGAAGATTAATGGACATAAGACGAGAACGCGGGCTTAAAGGATCCAAATATCGGCCCAATAGAGAGCCCAACTTGTTTATACACGGATTTGGGCCGGCCCAAGTGAGGGCTCCAAATGGATCGGCCTAAAAAGAGATAAGTCACGAGCAAAGCATGAGCTCAGCTGTATGGGATTCTCCTGACGGATGCAACCCACTGAAACTCGTTCGTTTACGGCAGCAGGCAAATCCGGCGGTCTAAGGCGCCCCCACGGCGGCTCCGTTCACCGATAACCGCCTCTAGGTGGCGGCGGCTCTGCTGCTCGGCCATGGCTGTTACAGCTGCTATTCTTTAACATCAAATCTCAGCCAAGTTCCACAACCTTCCCTTCGCTTCCTTGCTCTTTTCATTCCTGGTCCTCAAATTACATCGCAATTCGATTTTGGTGCTTGGCAGCGTCTTCGAATTGGTGCAATTCCGTGA

mRNA sequence

ATGGCCACGTCATTCCAATTCCAGTGGGTGCTCGCACATGGGATTCTTTCCCCGGGGGCTGCGCCTCCCGTTTTCGTGGCGGACGTGTCTTATCACGTGTGGCCGCACGTACGCTCATCAACGTGCATCCACTCTACTGTTGCGGCGGGAGATTTTGATTTCCGCTGTGATGTCCCCACTGCCACGTCAAGGAACCGGAAGATCACAGCTGGCAAATCTGGACCGTTAAACGAGGTGCTTTGTCACATTGTGGCGGCGGCTCTGCTGCTCGGCCATGGCTGTTACAGCTGCTATTCTTTAACATCAAATCTCAGCCAAGTTCCACAACCTTCCCTTCGCTTCCTTGCTCTTTTCATTCCTGGTCCTCAAATTACATCGCAATTCGATTTTGGTGCTTGGCAGCGTCTTCGAATTGGTGCAATTCCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCACGTCATTCCAATTCCAGTGGGTGCTCGCACATGGGATTCTTTCCCCGGGGGCTGCGCCTCCCGTTTTCGTGGCGGACGTGTCTTATCACGTGTGGCCGCACGTACGCTCATCAACGTGCATCCACTCTACTGTTGCGGCGGGAGATTTTGATTTCCGCTGTGATGTCCCCACTGCCACGTCAAGGAACCGGAAGATCACAGCTGGCAAATCTGGACCGTTAAACGAGGTGCTTTGTCACATTGTGGCGGCGGCTCTGCTGCTCGGCCATGGCTGTTACAGCTGCTATTCTTTAACATCAAATCTCAGCCAAGTTCCACAACCTTCCCTTCGCTTCCTTGCTCTTTTCATTCCTGGTCCTCAAATTACATCGCAATTCGATTTTGGTGCTTGGCAGCGTCTTCGAATTGGTGCAATTCCGTGA

Protein sequence

MATSFQFQWVLAHGILSPGAAPPVFVADVSYHVWPHVRSSTCIHSTVAAGDFDFRCDVPTATSRNRKITAGKSGPLNEVLCHIVAAALLLGHGCYSCYSLTSNLSQVPQPSLRFLALFIPGPQITSQFDFGAWQRLRIGAIP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Lcy01g013540Lcy01g013540gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lcy01g013540.1.exon1Lcy01g013540.1.exon1exon
Lcy01g013540.1.exon2Lcy01g013540.1.exon2exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lcy01g013540.1.cds1Lcy01g013540.1.cds1CDS
Lcy01g013540.1.cds2Lcy01g013540.1.cds2CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lcy01g013540.1Lcy01g013540.1-proteinpolypeptide