HG10017758.1 (mRNA) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10017758.1
TypemRNA
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr03: 21357836 .. 21365533 (+)
Sequence length480
RNA-Seq ExpressionHG10017758.1
SyntenyHG10017758.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTTGGAGAATATCTTTCTTCACAAGCATTAGACGATAACTTTCTTCAACGAGCATCGAACGGCAAACATCGAAAGACCAAAAATCTTTCTTCAACAAGCATCGAACGGCAACTTTCGATCACTTCGCAGCAACTTCCAACGGTGTATGTTAGGCTTGCAACACCAAAGGTTTTTGTTCATCTTTTTTTAAAAATTTTATTCAAGATTGGGTTTTCTGTCTATCCTTTCTCTAAAATGTTGTTTAGAATTGGTTTACTTTAATATTTATTCTTAGTCTTCTGACTCAAAATATTTCCATGATTGATTGTACGGTTTCGAAGGAATTATAGTTTGTTCAGCAAAACCGCTTTGGTTTTCCATACTGCTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTAAATATGATTTTTAAGTTTGTTTGTGCTATTTGCTTTTGTACTAAAAAAAAAAAAATGAGTTTGGTACGGTACCAAAATTTCTCAACTTTTAGTAAATTCTAGCTTAGGTTTGCAATTGAATGTGAAAGTAATTGTCTAGAATTAGAATCCGAAACACCATCTAGTGTCGCACCTTCCTTGAGTCGCTACTTGAAAAATTAGAATTGGATCAACTAGAATGAGCTCATAAACAAGTCTCCTCTTCCATCAAAAGAAGAAGCCTCAATAGATTTGGATGGAAATTCTAAGTTATGTGAAAGAAATCGTCTAAAATTAGAATTTATATATATATATATTTTTTTCACAGTGTTCCGCAAGTCTAATTTTGAAAAGTTGGAATTGGAACTTTATCTTTGTGCATTTGTTCTTTTGAGAGTATACAATACATAATTCTAAGAATTTAAAATTTTGTTGTTAGATGTGTTTTTAAATGTTCTATTGGTTATATATAAAAATTTAGAATTGCGTGATTGACTATATACGTTTGTTGCGTTGAATATGATAAAAGTTCTTGCCCGTTAGTAGTTAGTTCTAAATACATACGTACGTACGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTAATTTTAAGAATGGATAATGTAGATCTTATATTTCATTATAATGGTTGACTTGTTGTAGCTGAAAAGTTTGACTATGTTGGGAGGACTGAGGTTGTGTTGACTGCTGATAGGGATATATTGTCAATCATTGAGCTAAATAATTATATGGCAGAAGCAAATGTATTTAACGTCCATAGCTATTGGTATCTTTAACCTGAATTCAAATTATTTTGTGGTTAACATTTGCTATGTAATGATAATGATAGTTTAAATATGGTAAATCAAAGTCTTAGAAACAAGACTTTTCATATCTATGTTCAACACAATCCAAATGAGGAAGTGAAGGGCCAGTGGCTAAAAGGAAGAAACAAACTAGTGGAGGAACCACTTTCATGGGATTCATGATCCCAAACATGGTATAAGTTATTCTCTTCACTATATGACTATTCTTTAAAAATAGTGTTCAATGAACCGTTTATTATTTTATTTTTCCTTTTTTTGTTTAGGTATCTCCTCATCTTGGATCTGCACAATCTGGATCTTCTCAACATGTTCGCATTCTGAAGTTACAGTCCCAAACGCGGTAACTAAAGTATTTGATTTATTTCATATTTTTTCAAAAATAAAAAAAATTGGTTACTCATTCTTTGAGCTCCTATATTTTATATATGACATTTTCATGGGCGTAAACATAGTAATAAATGGTATGAAAATGAAATAAAATATGTTTAATTAACTTTATTATAATTTTGTTTTATGTAGGAACCTTTGTCACCCCAATCTTCTCCACTCGGATCTTTACCATCTTGAGCTTCACTACCCAATATATTCTAAGTGATGTGATGAGATGAAGATGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAGAGTGCTCCTATGAATAATTTTGTTAAACACTCATTTTGGGGATAGTTTTGATTTGGGTTCTCTAATCTCTTCCATTGGTCTGGACAACTCTATTAATTGCTTAATTCCCTGCTACAGGTCTGACTATGGTTCTATTGCATCCTTGAATTGAAGTTTTCGTTCGTTAATTCTCACACCGAGTTTATTTCTCTTACCATCTTTTGGAGTGGGAAGCTTTTGATCCAATTCAAAGGTGGATGCATTTGGGATGGATTCGAATGAATGTTTCATGTGCTCGGATAAGGAATCCTTGGGAGTGGGAACTGATCTTCTTGTTTTTGGTAACTTCATTTTGTAACTATTTCTAGACATATATATATAGTCTTTTGTAAACACAAGTTGGGGCCACTTTGAATTGTTGGCAAGATTATTTTTTTAAAACTATTTCAATTACCTTTGATTATGATGATTTCTGAAATACTTTTATAATTGAATATGTTGCTTTCATTTGAATTCTTAAGCTTCTCATTTAAAAATACTGTTACTACAGAAACTTTTCATGATCACATTCCAAGAGAGTAAATGAACACATGTATATACTTAACAAGAGTAAATGTATCCAGCTAAAGAGAGAGAATGATGGATTCAATTGTATTATCTAGTAAACAAAGCGCATTGCCTTATATATAGGCGAAGTATGTAAACTAATGATAAAATAGAAATTACAAATTAATTATATAAGATAATATTCATACACTTGTAACTAAATATAATTGGAACTATCTTTTGCCAATCAAAATCTGTACTTAGAAAACTTTCACAAAGCCACAATTTCTTTTGATCCTGTATACATAAAATGTGTCTCTTGTTCTTGTAAAGTTTAAGCATCTATTTTTCTTGATTGCTTTGCTTCTTTTGTCTAGGTGTATTGCAAAGTTCAAGATCTTCACCTCACATGATGAACCTGCAATCATTTTAGATAACGTTTTATTTTAGATCCCATCAAACAAGTAGGGAAGACATCCAAAAATATTAATCTCCTAAGGTGAATCATATTCACTATTTGCTTTGCTAGACAAATGGGAAGAATGTTAAAGTAGGAATAATACAACATTATTACAATTTAAGTTAACCTATTGTTAGACTGTTTAAATTGAAACTCGTTAATTTGTTTCAGCAAGAAATATCAAAAGAATGCTTTCAACAAAATGTGAATGAAAATTTTTCATCACTAATATCACACTAATTTTCTTTTGATTTGGGAATACCATGAAAAAATCAAGTTAAAATTCTGCGGACCATCACTTTGACATCATCAAAATTGCAATATTGAACCCTATTTAATTGCAGTCAAATGTTATCAAATTAAAGTAAAAAAAAAAATCCTAAATTTATTTTTAATAAAAAACTAAAACTAAAATGAAAATCCTATCTTGAAAACCCAATCTTGAATAAAATTTTAAAGAAAAGATAGAATAAAAAACTTGTTGTTGCGGGCCTAAGCATACACCGTTGGAAATTGCTGCGAAGTGATCGAAAGTTGTCGTCCGATGCTTCTTGAAGAAAAATTTTGGTGCTTGTTGTTCGATGCTTGTCGAAGAGAGTTGCCTTCGATGTTTGTGAAGATAGATATTCTCCCAGCGTGATTTTTGGTCATTTAAAATTTTAATCTTAACCTAATAAATTTCTAATTCATATAATTTTATATTAAAAATTGACACATAAGCAAGTATACATCATCATTTAACAGCTTAGTCAACAATCCGTTAAGTCAATTAACGGTGAAATGGGTGTAGGGACGATTTAAAACCATTATTCAAACTTCAAGGACTAAAAATGCATATTATAAAACCTCAGACACTAAATAGACACCTACTTCAAACCTCATGGATGTATTTTGTCCTAATTTTTTTTTAGTTTGAAACCAATTGATTTATGTGCAATTCATCTTCTGAATTGTGTAATAAATTGTGGGTCTTGTAGTAATTTTTATTTAAATGTTATTTTGATGCCTTTTCTGTAAGTACAATTTTTCTCAAGTTGAAAAATTCTAGAGAAAATCATATATCAAAATTCTATGTTTTCTTATTTTTAAGGTCATATTACTCGTTGGGTTTAATGAGAAGAAAGTTAAGAAACATTGTTGGATGGAAGAACAATGGGAGATTGTATTTTCTAAACTTTAAAGATTAAAGTGTCTGTTTTGAAACTTCGAGGACTAAAAATATATTTTACCAAAAAAAAATGATATGTCAATAATGAACAAAGTAATAAAAATTAATCACAATAAATAATTAATCAATAATGATTATATGTTCATAATAAATGATTAAATTCAAAATAATCTCAATAAATAATTGTTTGATTATAAAATAACAATAAGCAATTAATTATTCATATTGAAAAATAGATATTTGTACTAACTAAATTTAATTAATCCTAGTTAACTAATTAAATATATTTAAGATATTATTAGCTATAAAATTAATAATTTATGTAAATAAGTAATTACATTTATTTACTAAATTTTTATTGTAAAAAAAGTTAAAGTAAATATTTTACTAGATTATTGTTGATTCATTAAAATAAAAAATTATTAATTAAAATGAGAATGTCTAGGAATAGCTTATTCTAGGCAAAGTTTGGATGCCTTTGTCAATTCCCATTCAGAAAAACTTCCAACCAAACGACCTCTTAGGAAATGGAGAAATGGAAAAATGACGAAAAACTTTTACCTTTTCTTTCTTGTCTTGTTTTCTTCTTTTCAGAAGTCCAATTTCAAAAAAAAAAAATTGTGTTTATGTATAATAAGTATCTAAACTTTAGATTAACCGATCTCTAAACTTTAGAAATGTTAAATAAATCAAACTTTCAATTTTGTTTATTCTAATAGGTCTATGACATTCAACCTTCTTTTTTAAGGTCATAAATTTATTAGGCATGAAATTGAACTGTATCTAATAAAGCATTGAACTTTTAATTTTATGTTTAATAGGTTTATTAATTTCAAAAATGTCGAGTATACAAAGTATCTATTAAACACAAAATTGTGAGTTGAAATTTATTAAACAAGATCAAATTTAGAGATTTATTGCAAGGCTCATTATTAAAT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mRNA sequence

ATGCTTGGAGAATATCTTTCTTCACAAGCATTAGACGATAACTTTCTTCAACGAGCATCGAACGGCAAACATCGAAAGACCAAAAATCTTTCTTCAACAAGCATCGAACGGCAACTTTCGATCACTTCGCAGCAACTTCCAACGGTGTATGTTAGGCTTGCAACACCAAAGGTATCTCCTCATCTTGGATCTGCACAATCTGGATCTTCTCAACATGTTCGCATTCTGAAGTTACAGTCCCAAACGCGGGTTTCAGCCTTGGCTGCGGATTCAATATTTAGGGTCGGCCTCGGGGCTGAGGCGGACGTCCTATGTGGTCATTTGGCTTTGGACTTTTATGGTCTTCCCTCAAAAGCCCACATATGTCCTAATCCAACCTGTGCACCCAAATGGATGGGCTCAACCTCGACTTCGGTGTTGAGGCCGATCGGGTCGGCTTGGCCCCAGTTCACTTTGGCCCACTCCTTTACTTGTCCTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCTTGGAGAATATCTTTCTTCACAAGCATTAGACGATAACTTTCTTCAACGAGCATCGAACGGCAAACATCGAAAGACCAAAAATCTTTCTTCAACAAGCATCGAACGGCAACTTTCGATCACTTCGCAGCAACTTCCAACGGTGTATGTTAGGCTTGCAACACCAAAGGTATCTCCTCATCTTGGATCTGCACAATCTGGATCTTCTCAACATGTTCGCATTCTGAAGTTACAGTCCCAAACGCGGGTTTCAGCCTTGGCTGCGGATTCAATATTTAGGGTCGGCCTCGGGGCTGAGGCGGACGTCCTATGTGGTCATTTGGCTTTGGACTTTTATGGTCTTCCCTCAAAAGCCCACATATGTCCTAATCCAACCTGTGCACCCAAATGGATGGGCTCAACCTCGACTTCGGTGTTGAGGCCGATCGGGTCGGCTTGGCCCCAGTTCACTTTGGCCCACTCCTTTACTTGTCCTTAG

Protein sequence

MLGEYLSSQALDDNFLQRASNGKHRKTKNLSSTSIERQLSITSQQLPTVYVRLATPKVSPHLGSAQSGSSQHVRILKLQSQTRVSALAADSIFRVGLGAEADVLCGHLALDFYGLPSKAHICPNPTCAPKWMGSTSTSVLRPIGSAWPQFTLAHSFTCP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
HG10017758HG10017758gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
HG10017758.1-cdsHG10017758.1-cds-Chr03:21357836..21358006CDS
HG10017758.1-cdsHG10017758.1-cds-Chr03:21359355..21359431CDS
HG10017758.1-cdsHG10017758.1-cds-Chr03:21365302..21365533CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
HG10017758.1HG10017758.1-proteinpolypeptide