Cp4.1LG07g03200.1 (mRNA) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview
NameCp4.1LG07g03200.1
TypemRNA
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG07: 2080927 .. 2084156 (+)
Sequence length219
RNA-Seq ExpressionCp4.1LG07g03200.1
SyntenyCp4.1LG07g03200.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCTGTTCCTCCATGAAATGGTGTGTTGTTGATTTGAATTTTGAGCGGCTTTGTTGTGTTTGATACTCTGGATCTGGCTCGCCTTCGTCTTCTTCGTGCTGTTGGATCTTTATCTCGTCTCTCTATGCGGTTTCTATGTGTTCTTTTTTTTGTCTTCGTTACACATGTGAAAGATTCTTCACTGAAAATTATTTGTTTATCGTTCTTGATAGTGTTTTTATCTTCGATTCATTGTGGCTTGGTCTTGGAATTTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGAGGCGCTTGGTATAAAGTGTATGCTAAGGCTTTTGCGTGCTCACTACTCTCTCTGTCAGATTCGAACGATGGATCGAAATTCTTCATATTCTGTAGCGCAATGTTATCGGACTCAGAATTATATGTTACTTTCATCTGATGAATCGGATTTGCAGTTATCTAGCGTGGCTTTTTCATGGTGCTAACTGACCGGAATCGTTGGCACAGTCATGAAAACAACGTCCAACGGGACCTCTCTCAAGCTAGATAGGCGGGTCCTCTCCCTATCGGTATCTCCTTCTCTTTCTTCTTTTCTCTCTCTCGAGCAATTAGTTTTTGTTTCTCCTCTTAGTTTTTGACATGTGTTCATGGCCTTAGTCATTTGATGCACTAATTAATTTTTGTGCGCATGCTTTGAATGAAATTCGACTACGGAGTCTGTTTTCTTTTCCTGAAATTTTCTCCGAGTACGATTGGTGGGAGGTTCATATCAAATAGTTTGTTGAGGTTGTTTGACAGGCCCTATGTTACCTAGCAATAGAATGTCGTTGTTATTAGTGTACAAATGGAGGGTTCAGAAGCGTTAAAGAGAATTCCTAACGTAATTTCCGCCTGTGTCTTCTTCAAATCCGATTCTTGGTTGTTTTTTCTGTTGTTATGATTATTTATATGCATTAATTAATTGGAGAACTTGATAATCTTGTAATATCATGCTTTGTAAATATAGCAAGCCTATTGATTTTAATGTCTTGTTCATTTTATATTTGTAGAAAATCCTATTCGTTTCAACTTTGTTGGTGTAGAATACTAGTTTTCAGTTGAATTTTAGACCTCTGCAGGCCTCACTAAAGTAGATTGGTTTAATGCAATTAATTGCCCCAACACAATAGTTTGTGCCTAACGTTTTAATTTACTAGCTCAAATTTCTGAATTCGTCGTGTGGTAGTCATTTCCCCCTTTTCGTGGTTTAGCAATTGATGAAATTTACTTGCTAAATCACTTTTGTTACAATTTGGTTGCAGGTTATCTTACTAACATTTATAGGGTTAAAATTTTAAAAATTGAGAAGCAAATTGGTCTAAATATTGTTCTTGTTATCTTTTTCTTATAGTGGTGCGTTTATTCATACAACGGTGAGGTTAATGAAAATACGAATGTGTTTAACTGAGTAAGCTGTTTGTGTGACAGGCTTCGTACAATTTTGACCTTTAAGCTCAAGAATTTTCATTATTTTCCGAAGTTTGCTGTGCATAGATGGTGGTGACGTTTTTGTGCTATGATTTCAATTCTCATTTGAGTAATAATTGTTGGTAGGACACTGGGGAAAAATATTACACAAGGGATATAATTTAATGCACATATAACTGCAGCTTCTGTTGATGCTGTGAAGAATATTTTAAATTAAATGAGATCGTTTAAAATCTATGATTTTTATAATTAGGATATTGATTAAAGGTAATTTAGTACGTACTTCCATATGAGAATTCAAATCCTATTGTGCTTTTTAGACCTTTCCTAGCCAGATCTTATTAATAATTTTGCTGAACCCTACAAAGTTTAAATTTCATGTGGAAGGGAAAAATATTGATTTTGAACTTTTAGAAGTGTCGGGATTAATGCAGCTAGTGATAATCATAGCTTTTTACTTGCTAGTTAGTTGAGTGAGGATGGATGCTTGCATGTCTTCGTTATTATTTAGTGTGATTTGATTTGTTTCTTACAGAAATAATGGCATTATGCGTGTTAGTCAATTCTATACCACTAGTCTAGCGCTGCATGATGACACTTCTATCACACTACCCTCTTGATTACTTTAAGGCCCTTCCAATTCCTCCAATCTTCCCTAAATAATTGAATGATTGAATAACTATATATAATAGCAGCAGGTTCTTTTGCCCTTTCATTTCAGCCAAAAGTCTCCTCTTTCTGAGGCCTAATGCTCATCTAATTTACCATTTAGTGGACTGTTGTATGGAACCTTTCACCTTGGAAATGTCCAGGCAAGTTAAAGGCAATTCGGAATGGAAGTGAGTGTGGACTTTGAGTGCCGAATGGACTTAAGTCCATTGCTAACATATAATTTACTTTTGAACTTTTCTTGAATTTTTCCTCGAGGTCTTTTAAGAAACCTTTATTAGGGAGAGGTTTGCACACCTTTATAAGAAATGTTTTGTTTCTCTCTTCAACTGATATTATTTGTAACAATGCAAGTCTATCGCTAGGCAATACTGTTCTCCTTGGGCTTCGATTTTATAACACTTTTGCGTTGAGAGGTTTTTACATTTTTATAAGTAATGTTTCGTTCCTCTCCAACTCCAACCAATATAGGATCTCACCGTTAAGAGTATTCTAAGCCTTAAGAGTATTCTAATTCTTCTATGAAGGCTTCTATTTATTTCTCTCAGGTACCGAAGAGGAGCGTGAGCCCATATGCTTTCCAGGCTCCAGAATGTCTTGTGGCTGTAAGTAATTTGATTGTTAGTGCGTGTAATTTTATACTTAAAAGCACGTTTAACTTTAGAGTTCTTACTTGAGTCATCGAAAAGCGACTATGGTCTCAGTAAATATATGTACCCTTTCTTTTCTCGGGGTCACATGCCCACGCACCAACTACCACATTTTAGTGTAGAAAAAGATTTCTAAAAGAAAGAGTAAAGAATAGAATGAGAGAATAAAAAAAATAGAAAGGCTTGGAAAATGAGAGAGTAGTTTGAGACTTTAGCTATTGTCCTCGAAATAGGAGTATTTTTTAGTGGGTTGTGAGAGAATAAATTTAGTCGGAAACTTGGAAACATGTTCAGAAACTGGTGGAGGAATTATTTTATTATAGCATTGTTTGGAAACTTCACTAACATTGCTTCCTAATTGACTTAACTAAAATATAATCATGCAAATTTCAGATTATATTCCTACTGCTACAATAATGTTTATCCATCGCATTTTATTTTTTATTTTTGTTTTTGAAAGCTTTAG

mRNA sequence

ATGTCTTGTTTTTATCTTCGATTCATTGTGGCTTGGTCTTGGAATTTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGAGGCGCTTGGTATAAATGTACAAATGGAGGGTTCAGAAGCGTTAAAGAGAATTCCTAACTGGTGCGTTTATTCATACAACGGTGAGGTACCGAAGAGGAGCGTGAGCCCATATGCTTTCCAGGCTCCAGAATGTCTTGTGGCTCTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTCTTGTTTTTATCTTCGATTCATTGTGGCTTGGTCTTGGAATTTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGAGGCGCTTGGTATAAATGTACAAATGGAGGGTTCAGAAGCGTTAAAGAGAATTCCTAACTGGTGCGTTTATTCATACAACGGTGAGGTACCGAAGAGGAGCGTGAGCCCATATGCTTTCCAGGCTCCAGAATGTCTTGTGGCTCTTTAG

Protein sequence

MSCFYLRFIVAWSWNLTEESEHPEALGINVQMEGSEALKRIPNWCVYSYNGEVPKRSVSPYAFQAPECLVAL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cp4.1LG07g03200.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cp4.1LG07g03200.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cp4.1LG07g03200.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cp4.1LG07g03200.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG07g03200Cp4.1LG07g03200gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG07g03200.1:exon:001Cp4.1LG07g03200.1:exon:001exon
Cp4.1LG07g03200.1:exon:002Cp4.1LG07g03200.1:exon:002exon
Cp4.1LG07g03200.1:exon:003Cp4.1LG07g03200.1:exon:003exon
Cp4.1LG07g03200.1:exon:004Cp4.1LG07g03200.1:exon:004exon
Cp4.1LG07g03200.1:exon:005Cp4.1LG07g03200.1:exon:005exon
Cp4.1LG07g03200.1:exon:006Cp4.1LG07g03200.1:exon:006exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG07g03200.1:cds:001Cp4.1LG07g03200.1:cds:001CDS
Cp4.1LG07g03200.1:cds:002Cp4.1LG07g03200.1:cds:002CDS
Cp4.1LG07g03200.1:cds:003Cp4.1LG07g03200.1:cds:003CDS
Cp4.1LG07g03200.1:cds:004Cp4.1LG07g03200.1:cds:004CDS
Cp4.1LG07g03200.1:cds:005Cp4.1LG07g03200.1:cds:005CDS
Cp4.1LG07g03200.1:cds:006Cp4.1LG07g03200.1:cds:006CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG07g03200.1Cp4.1LG07g03200.1-proteinpolypeptide