CmaCh06G007030.1 (mRNA) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh06G007030.1
TypemRNA
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr06: 3525229 .. 3528859 (+)
Sequence length288
RNA-Seq ExpressionCmaCh06G007030.1
SyntenyCmaCh06G007030.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCATTACAAAGGCTGGCGTAACACCGTGGACCGCTTCGTTCGTCGTTCCACCGCCGTTGGCTGTAAAACTCATAGCTCCGCCGCTGCTGGTTTCACATTTTTGCTGCGTTTGCAAGGAAGACGCGACCAGCTATTGTATGTTCGTATCAATCGATCCATTCGATTCAAATTTCTTCGAGTTTTTGAACACGACGATGTTACTATGATCGAGCTCTAGATGATCGCTAAATACTTTTAGTAACGAGGAGTCATTTTATGACTACCCGTGTATATATTTTACTTAGTTCATCTACGGAGTTGCTCCTTTCATATTTATGACGTTGTTAGGTTGGATCTTTAAAGGGTCATCAAGGAGTCATAGTTTATGTTAACATGTAGTTTAGTTGAGTTTGAGTATTTTTATAATCACTCATCTTAATCTTATCCTTTCCGACGGGTATTTAGTGATACGTAACACATGATGAAAAACATTACAGAGCAATGAAGTTATGGGACAGAGACGTATCAAAATCTGGTTCTGGGTTTTGGTAGTCTTTGTCCATGTTCGATTGTTTCTTCTTTGATGTAAACAATTTTAAGAACATTTTGATGTAGAAACCTTATAAAAATTGTGATTGATAGTTTGATCGTATTTACGAGAACCAAAAACTTGTAAACATTATAATATTCTGAGTCATCTTGGATCTAGAATCTCGAGCATTATATGACCACGATAATACGATATGGGTTCAAAAGTTTTTAAAATGAATACTCAAAATTTGGATTAAGAGATCAAGTCGACTCGGAGACCTAAAAAACTCTTAACGCGATTGAAAAAGAAAAAGTTAGGACAAATGATAGGTATGATGTCGGTTTTTGGATGTGATATGAATATGGACTATGGTGTTGTCCTTGGTATGGGTTGGTTGGCTAAGAACCCTGTCAACATGTATGGTCAAAGGAGTTGTAATCATACCTAAAAAGGAATCGATTTTAAATTTAATGGAAAAAGTAAGTACAATATTAAATTTCAACATTGTCATATAAAAATTAAATAATTACATTTTTGACGTAGAAAATTAATTTAGTCCTTTTTTTTATACCATTGAATTAGTCAAATTAATTTAACAAAAATAAGTACTTTCACACCAAATACCTCATTACATCTCAATAAATACACTGTTAGGATCGATACCAGTTTTTAATTCTGATATCAGCAATGCACACACTCGATCAAGATAAACACAAAGAACAAAAGAGAGAAAATATAAGGAGGAATATTCGATAAAGGTTTTATATGGCTAACTTCAAGAGAAGTACATTTTGAGAGCACTAGCTAATGAGTATATATATAGTTTCAATTTACTAAATCTAGTTTTCAAAATTTAAATATAAATATTCCTCTATTTACTTATTTTAAATATACAATCTAGAGTTCCAACCTCATAACCTTATAGTCAGTGAGTTATCACATCGGTCTAAATGAGGAACAAAACATTTCTTATAAAGGTGTGAAAACTTTTATTTAGTAGACTTATTTTAAAACGTTGCGAGTAAGCCCTTGAAGGAAAAGTTCGAAAAGAACAATATGTAGTAGCAGTAGGCTTGGGTATAAAATCACGAGAAATTATGATATTTGAATTTAGGTACCAAATAAAGAAAACGGAGATGGGTTGTTTGTCGTGTAGCTACAGTTTTGTGTTTTTATCATCAATTTTTCAACCAAAAAACAAAAGTGAATAAAAAACCGACATTTTGGGGGGAGCCGTCACCCAAATCTCTTAGTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTCTCTCTCCTCTTTTTATTAATATTAATTAATAAATTCATATATTTCTAAAATTTCAAATCTTAATATTATAACCTAATTTATAATAGTTAAAAAAGTATTTACATAAATATTATAATAAATATCTCAAAATTAACTAATTTATTTTTTAATATAGCCGACGGAAAATTAGGTGGAATAGAGAATATAATTACGTCTACTGTAACAGGGAAAAAATATTCTCCTCTCCCTCCTACATTCCCCGTCTCTAAACGGAAAACTTTATCGTTTGGGGAGGTATTGGCTCCGTGGCTAAAATGAAAATCCTTACTAATTGTGAGTTAATTGGTAGAGTTAAGATATATTTTTTGTTTAAATATTAAAATTTTTAAGAATGAAGGTGAGTTGAGTTATTTATTTTTAAATATTTAATTAAAATTGCTAGGCTCTAAATAGTTAAAAAAAAATATATCTTTGTGAGTTGTTATCGAATAAATAACAAAAAAAATATATATATATATATATATGTATATAATAAACTCGAGTTTATTCCATTCAACTCAATCTAGTTTTACTGCAAATCATATGTTGAAGATGGTTGGATCATGAGTATATAAGAAAAATTAAAAATATAGTCATAGGAACGTTCAAAGTAGATAATATGAACGTGAAGAGTCGTTTTTAACACCATGCAAGTTAGGTTGGATTGATCACGTTTTTGACAATACATCGAGTGTTTTGAACACTTGTATGAAAACGTTTGATAACATAATTGGACTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAAGAGATTTATTACAAAATAAATAAATGAACGAATTGTGAGTAGTTTTAATTAATATTTAAATTAATTAAAGAGGAAAGAGAGAAAATGGAATGGAGAAGTGGAGTAGGGGAATTTGGTAGGAGGCGTGTTTAGACAGCTTTCTGTATTGTTTGTGTTAAAAGTCATTGTACACAATTCTACAGAGAAGAAAATAAAAAACTCACCTTTTTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCATTATTGGCTCTCTCTCTCTCTCCTCCTCCACAAAGAGTCGGGTCTGTTGACGCATATTCACAAGTGAATCGTGGTGTGTTTAGCGCTACAAAGCTTTGCTTTTTTCTGATGATACACAGAGGAGAGAGAACAACAAAACACAAAACAAAACAAAGAACCTGATGCCCCCTTTTTGATGTGTTAGTGGGTGGTGCTGTTTTTTCCTCTCTTCTCCCTCTCCTCTTCTCTATTTCCCCTCTCCCCAACACCCTCCTCCTATCCACTTCCCCCTCATTTCTTCCCCAGATGCGTAGGTTTGTGTTCTAACTCCTCTGTCTCCATCATTTCTCTTCTGGGTGTTCTGTTTTTCCCTTCAATTTCCTCTTCTCTTTTTCCAGCTAGATTCTGGGGGGTTTTTTCTTGTTTGGTTTCTTCAGTCGCCTGTTCATTTCTTGTTCTTTGATGGGTTTCATGTTTTGATTCTGAAACTTCTTCTAATTTTGTGCCTTTTCGTTTCCTCATCTGGCCCTTCAGATTTTGAAACTTCTGTTAATTTCATGCCTATTTTGAGGACTTTTAGACTCTTGATTTTGATTTTGAGCTCGGGGTTTAAACCGCATGAAATGATGTTCATATATCTTTTTGGTTCTTTTCCTAAGCGATTCATTGCTTAACCTTTCTAAATCTCACTTCCATCACATAAAATAACGTTCTACTTAGTTCTACACCCTTCTATTCTGCCCTCTATTGCCTTGGATCTCTCTTATAATTCATGATTTCATGTTAATTTCTTCACTTTTTGCAGGTTAATGGATGAAAATTCTGGTGGGGTTGCTTGA

mRNA sequence

ATGCATTACAAAGGCTGGCGTAACACCGTGGACCGCTTCGTTCGTCGTTCCACCGCCGTTGGCTGTAAAACTCATAGCTCCGCCGCTGCTGGTTTCACATTTTTGCTGCGTTTGCAAGGAAGACGCGACCAGCTATTGTATGTTCTGGGTGGTGCTGTTTTTTCCTCTCTTCTCCCTCTCCTCTTCTCTATTTCCCCTCTCCCCAACACCCTCCTCCTATCCACTTCCCCCTCATTTCTTCCCCAGATGCGTAGGTTAATGGATGAAAATTCTGGTGGGGTTGCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCATTACAAAGGCTGGCGTAACACCGTGGACCGCTTCGTTCGTCGTTCCACCGCCGTTGGCTGTAAAACTCATAGCTCCGCCGCTGCTGGTTTCACATTTTTGCTGCGTTTGCAAGGAAGACGCGACCAGCTATTGTATGTTCTGGGTGGTGCTGTTTTTTCCTCTCTTCTCCCTCTCCTCTTCTCTATTTCCCCTCTCCCCAACACCCTCCTCCTATCCACTTCCCCCTCATTTCTTCCCCAGATGCGTAGGTTAATGGATGAAAATTCTGGTGGGGTTGCTTGA

Protein sequence

MHYKGWRNTVDRFVRRSTAVGCKTHSSAAAGFTFLLRLQGRRDQLLYVLGGAVFSSLLPLLFSISPLPNTLLLSTSPSFLPQMRRLMDENSGGVA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmaCh06G007030CmaCh06G007030gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh06G007030.1:exon:1234CmaCh06G007030.1:exon:1234exon
CmaCh06G007030.1:exon:1235CmaCh06G007030.1:exon:1235exon
CmaCh06G007030.1:exon:1236CmaCh06G007030.1:exon:1236exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh06G007030.1:cdsCmaCh06G007030.1:cdsCDS
CmaCh06G007030.1:cdsCmaCh06G007030.1:cds_2CDS
CmaCh06G007030.1:cdsCmaCh06G007030.1:cds_3CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmaCh06G007030.1CmaCh06G007030.1-proteinpolypeptide