ClCG01G011230.1 (mRNA) Watermelon (Charleston Gray) v2.5

Overview
NameClCG01G011230.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr01: 18273772 .. 18284703 (-)
Sequence length285
RNA-Seq ExpressionClCG01G011230.1
SyntenyClCG01G011230.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

ATGGACTCGCACAAGTTGATCCTTGCTAAGAGATATAGCAAGGAAAGCCTATTGGACTTTTTCAACCAACGTTGGAGGAAGATTTTTGTATCAAAAGAATTTCTACAAAGTCATTTTGTGTCACCTATCAAGGATATTGAGCATGTGAAGCCATTAGGATGGTTCAGATGCATTTCGAGCTTAAATGGGAGAATTAGCAAGCAAAACTTAGCAAATGCGCAAGGAGGCCAACAAGCAGCTTGGCACTGCGGCGCTAGCCTAATACTAATGTTGCGCTTTTCTCAG

Coding sequence (CDS)

ATGGACTCGCACAAGTTGATCCTTGCTAAGAGATATAGCAAGGAAAGCCTATTGGACTTTTTCAACCAACGTTGGAGGAAGATTTTTGTATCAAAAGAATTTCTACAAAGTCATTTTGTGTCACCTATCAAGGATATTGAGCATGTGAAGCCATTAGGATGGTTCAGATGCATTTCGAGCTTAAATGGGAGAATTAGCAAGCAAAACTTAGCAAATGCGCAAGGAGGCCAACAAGCAGCTTGGCACTGCGGCGCTAGCCTAATACTAATGTTGCGCTTTTCTCAG

Protein sequence

MDSHKLILAKRYSKESLLDFFNQRWRKIFVSKEFLQSHFVSPIKDIEHVKPLGWFRCISSLNGRISKQNLANAQGGQQAAWHCGASLILMLRFSQ
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
ClCG01G011230ClCG01G011230gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG01G011230.1-exonClCG01G011230.1-exon-CG_Chr01:18273772..18273924exon
ClCG01G011230.1-exonClCG01G011230.1-exon-CG_Chr01:18274413..18274434exon
ClCG01G011230.1-exonClCG01G011230.1-exon-CG_Chr01:18283846..18283951exon
ClCG01G011230.1-exonClCG01G011230.1-exon-CG_Chr01:18284700..18284703exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG01G011230.1-cdsClCG01G011230.1-cds-CG_Chr01:18273772..18273924CDS
ClCG01G011230.1-cdsClCG01G011230.1-cds-CG_Chr01:18274413..18274434CDS
ClCG01G011230.1-cdsClCG01G011230.1-cds-CG_Chr01:18283846..18283951CDS
ClCG01G011230.1-cdsClCG01G011230.1-cds-CG_Chr01:18284700..18284703CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG01G011230.1ClCG01G011230.1-proteinpolypeptide