Chy7G137900.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview


Name	Chy7G137900.1
Type	mRNA
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Unknown protein
Location	chrH07: 14213762 .. 14220630 (-)
Sequence length	66
RNA-Seq Expression	Chy7G137900.1
Synteny	Chy7G137900.1

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGCAAGAGGGTGAAGGGAGTACGAAACAGTGCGACAATGAGGGAGACGGAGACGGAGGTTTCAGAGAAAGGAATCGACACAAGGACTCGGAGAGGGAGAGAGAATGGACATAAACAGTGCAACGGGGATTTGGGAGAGGAGTGAAAAGTGTTGGGGATTAGGGTTATTTTGTAAATAACCCTTATCCTCCAATTGGGGTTATTCGTGAGTCAAACCTAATTTGTGGGCCATATAGACTCTTAGAGTTCGTTTGGAAAAGGAAATGGGTTAGGAGAAAAAATGATTATAATAATCTTAGTGTTATAAAGTTAGGTAAGGTTGAAGTAGATAAATTTGTAGGGTTATGAAAAGATGAAGTATGATAGTTTGTAGGTTATTTAATCCTAATCCTAAAAAATGGAAATCCTTAGTATTCATTTTTCAATAAAAACTCATTTTTAATATTAGTTTTTATGTTTATTAATGGATTGAAAATAATTATAAACTGAAATTTTAAAATTAATTTTAATAGTGATGAAAACATAGTGAAATTTAATTAATTACAGAGAAAGAGTACTTAGTAAAAACAATTGGTTTTGAAGTATGTAATCATTAGAGACTAAATTGAAATCAAACCCAAAATTTGATAATTAAAATTAAAAGTCTAATATATGAAAACTAATTTACTTTTAACCTTTTTCTTAAAAGTAAAATGACATATAATAATATTTGATTCTCTTTTCAAGTACATAATGTTTGGTTCTTCATGCATACTATATCAATCTCTAATCACTATTTCCATATAAAATTTTTCTCTAATTATTTTCACATTCGTATACATTTAATTAATTTTTATTTTAAAAATTAACATGCAAAATTTGGAAAAAAAAATTATATTTAAACATATTAATTAATTGAAGTACTTGAAAGAAGAAAAGTACTTGTCATGGGATCTAACAAGCCACCTAAGTATAGTTTTTTAACACAAAATTTCAAAATCATTAACTCTTGACTTGAAAGTTTGTTAGAGTTAAAAGTGTTTTTTTTTTTAAATAAAATTGTTATGAATATTGTTGGAATGGAAAAAAAGAAAAAGATTATTATTAGAAGTACTTTTGCACTGCAATATCATATTAGATGGAAGTAGTACATTTGGTCAAAGGCTGCATGCAAACATACTCAACAAAATTTTGAGATGTAAATCATAAGGAGTGTAGTGGATGAAAACATTTAGGAGGAGATGAAATGTACAATTGTTGAACACAAAATTATAATTTGAAAAGGGTGTGTAGTGCCAAAATAATTTAACAAATAATGGAGGGGTTATAAATGATTAAAGGTGAGGGATAATGAAGATATAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATTTGGCCTTTTGGTGAGGGGTCCCTACTAATCTTCTTGGATCATGAGCTACCCACCACCTTACAAGAGCTGCATATGTGGCACATTTATAATTTAAAAAATTCAAAGATAAGTTTTCTTTCTTTTACTTTGCTTTTCTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTTTTATTGAAAAATATTTGTTGGTTAATTAAACTCAATTTAAATCTGATTTTTAACCTAATTATTTTAATTATTAATTAAATAAAATATTTGTTTCATAACCATTATTTTTAAATTTTAACTTATAGACACTATTTTCATCCAAAAAAATTCCTGTGTTTTGTTTTCTTTACTTAGATGAAGTTTTAAAAATTAAAAATAAAAAACTTTGTTTTATTTTACAAAATTAAACTCAAGTGTTTCTTCCAAAGGAAAAAGGAAAGTAAAAACTCTAATTAAAAAATGGGGAAAAACAAAACTAATTTCATAAAACTAAAATAAAAAATTATTATCAAACAAATCTCCCCATTTTAGCTTTAACATAATATTCAAATTTACTTTTACTTATAGTAGATTAATTTTAAATACTCATTAGACAAAAATTGAGTGACAAAAAATAGGATGTTGAAATTGGTGTTAAAACAATTAAACTTCGATAGAAAGGTAAGTTTACACATTTATCAATAATCTTCACAATTTCCTGCATATTTTGACATTTAACTTTTCAACATTACATAAAAGAAAGTATATTCCTTTCCATTAATTTATAGCTATTAATTTTATAATAATTAAGAAAATTTAAAAAAGGGTGAAATTGACAACAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAATTAGAAATATTCATCGATAAGCAAAATACTTATTTAGGTTTATAATATTTGAAAATAAAGAAGTTTTTTTTGAAATTGTAATGAATAGTAAAAAAAGTGAAACTAATTTGTAAATAGTTTTAATATATTTTTTATTTTTTAAAATGCCTCGATTTTTTTCCATTTAATAATAGAATATGTATTTAAAAAGGGTATATGACAAATTTGAAAATGAATAATTAGGGATTATAAGTACGGTATATAATAAATAATATGTGGCCAAAAAAATAATTATAAGAAAATGCAATAAGAGCAATAGGGCATATCATAGTGTTGAATTTAAATGAGGACCCTCTCCACTTAAATTCAATAAAACCCTCTATAAATTTATTTTATATATATTAATTTGCATGAACCAAACCCCAACATGCCAATAACACAAACCAACAAAAAACCATATAAGCATATAGTAATGGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAAAAAGAAAGTATGTATAAAGTGTGAGTATGGTGATTTAAACATATTTTGGGTTTGGGTATTTGAAGAATGAACACGTTTAGCATATTCAACATTTGGTATCATTTATGAAGTGATCGAACAATATCTGACCCTTGTGTTTTCAATTTTAGCCTTCAATTTTTATCTCTTAGTTAAGTAGCATTTAATGTCTAAAATACAAAATTATTATTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTATTTAAAACCCATAACTAATAATGTAATATTTAAAATTTTCAAAAAAACTAATACATCAATTTAAACACGGTATTAATTGAAATCTTCATTTTTTCTTTAAGTATATTAATTTACACCCTTTGTTTCGTTTCATTTGGAAAAACTTTGCTTAGAATTTTAATTGCTTCAATTAAATTCTTGTCGTTTTTATAATTAAATCAATTTAAACTTTTAGACAAACTTTTTCTTTTTCTTTTTTAAAAAAAAAATCTTCAGTATATTTACTCTATTTGTCCATTTTGTAAAACAAACTTCAAAAGAATTTAAAGATATTAAAAAATAAATGCATAGATGGTTTTGAAAGGTAATCATACATTAGATGATTTAAATCGATTTACTAATAAAAATTTAAGTTTAGTTGACTTAAATTATAAGTTTTACACCATATTAATCTAATAAAATTTGGAAGGGAAGGTAAATTATTACAGTTACGAAATTTCAAAATGAAATTTGATATAATTATTATTTTGTAATTTTTATTAGTTGAACACCCTAATAAAGTTTAAAGATATAAATTTATATTTGCTAAAAAAGATGAAAAAGGTTAAAGTATATTAAAGTATTTTTTTAATCTCTATATTTTAGTTTAATTCATTTTAGTTCTTAAATTCAAAACCGTTAATTTTGTTCCTATACATTTTATAAATTTTAAATCTTAAATTTAGTTATTCAAAATTATCTCTTTTCCAAATTAATTGAATGATAATAATAGGTTTTCGTGCCAGAAAAACGCTTAAGATGAATATACTTTCAAAATTTATAAATGAAGGGTTAAATAGAGACTATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAAGAAAGCAAACAATAAAATTTTCCTCTTATTTCCTTTTTAAAAACGTCAAATTCAAGAGGAAAAATAGGAAAAAGATCCATGTTATTAAAGAAAAAAACGATCCCAACAAACAAGAGACTCATTTCTAAATTTTTTGAATTAGAAGAGATCGCAAAAGAATGGTGAAGAGATTTAAACAATCTTTCAATAGAACCCACTGGATGAGGATAAAAATAAAGATGGTGAAAGTATCTCCAATAAATTAATTTGGAGTGGGAAGAGAAGAGTAAAAATGAAAAGAAGAGGAAGGTAAAAAGGGTAGAAAAAAGAAAAGTAAAATTGAGAAATGATTTTAATAAGGGAAAAAATTAGAAAGGATGGAAGGTCCAAATAGACATAAACAAAGAAGATAGCAACAAAGGCATCTGACTCTTTTCTTTCTCATAAATTGATGACATTGGACACTTTTTTTTCTCAAACATATTTACTTTACCCCTCACCCTTTGTCTGACAATTTATTAATATCAATTTCGAACCCTACTTCTTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTCACTCTCTCTCAAATTATTTCTATTATTATTGACAATATAGGATTAATTAAATCTATAAAAATCTCTTTTCTTTTTTCTTTTTAAATATAGCTAACATATTCATGAATATAACAAAATTTTAATTTTGTAAATTAATAAACTATTATAGGAGGACCACAGTAAACTTTATTTCAAAACTCCACATTTACTACGATATTTAATATAGTTTTTTCTATTTGAGATTTATCATTTTTTATTCTTTGTTATAATGTTTACTATTTCTTTCTAAAGTTAAAATAATCTACACGTAAAACACAATTTATTATAAGGGGCATTTTTAAAAATAATAAAATAAATTAAAATATTTACAAGCTATAGCAAAATTTTGAATTCTATCACTATAGCATATCAATGACTATCAGTGATAAAATTTGTTATAGGTTGTAAATATTTTATAAAATCTACTATTTTAAAAAATTCTCCTTGTCAATAACTTAACTATAATAACCATTTAAATCTTATCTTTCTACCATTATAATTAAATTTGAAGGTCTAATTTAAATATTTGTTTAAATTTGAGAGGTTAGTTTTTATTAAAAAAAATTAATTAAGAGAAGATATATCATGGAAGTGCGTTTTTTTTTTCTCTAAAGAAATTGTTTTGATAACC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mRNA sequence

ATGCAAGAGGGTGAAGGGAGTACGAAACAGTGCGACAATGAGGGAGACGGAGACGGAGATTACAAA

Coding sequence (CDS)

ATGCAAGAGGGTGAAGGGAGTACGAAACAGTGCGACAATGAGGGAGACGGAGACGGAGATTACAAA

Protein sequence

MQEGEGSTKQCDNEGDGDGDYK

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Chy7G137900.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy7G137900.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy7G137900.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy7G137900.1 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..22

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
Chy7G137900	Chy7G137900	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy7G137900.1.exon2	Chy7G137900.1.exon2	exon
Chy7G137900.1.exon1	Chy7G137900.1.exon1	exon

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy7G137900.1.cds2	Chy7G137900.1.cds2	CDS
Chy7G137900.1.cds1	Chy7G137900.1.cds1	CDS

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy7G137900.1	Chy7G137900.1-protein	polypeptide