Chy7G132810.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy7G132810.1
TypemRNA
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH07: 3528752 .. 3531570 (+)
Sequence length346
RNA-Seq ExpressionChy7G132810.1
SyntenyChy7G132810.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTACCCATTGTAATGCTTATGAGAGGTCTTGCAATGATTCTCGTGGTAATAATTCTCCTGTGTTGCCTCCGGATGAAGGTGAGTCTGTTTGTGCATGTTTATGTTTAGTTAAACTATATATTTGGCTTATTACTTGCCTTTAATTTCTTCCCAAGATAGTATATGTGTATAATTCATAGCAATTTCACATTGAATTTTTAATTAAATTTTCATGTTCTTTTTTCTAACTTATCTACAGAGTAATGGTAAAAAAACGCTTATCAAAGCATGAAAGTAATTTTTTTAGTTTAGAAATTATAATAGAAAAATTATTATAAATGACAAAATTGAGGAAAATACAATAAAATTTCATTTTTTTTTATCGTTAATATAGAATATGAAAATGATAGATATATATAAAATTTTGCTATATTTTGGTTCCCTTTACTATTCATTGTCCTATTTTCTTTTACTAAAATATGACATATTTTACTTATTATTAACCAACTTGAGTTTATTCAGTGGAAGGTTTAAAACATATGGCAAAGACATTGGGAATGAAAGATTTAAACTTTGGTCAAGATTCATGCGGAGAACGATATATATCTTGCGATTGTACATATATGAATCGTAGCCTTTGCCATATCACTGATATGTATGCTCTCTCACCTACCAAACATTTTAAATATCAATGTTTACATAAATATAGAAGTCTCGGTTTTCTTATAAAAATGTCAATAAAATTTTGAAAATTTGAAATTTCTAAAGAGGTTTTGAAAACAAAAAGAAAATATTTTAATTAATAAACAAACCAGTTTGTATGGTTTTCAAATTAGTTAAAAGGTTTGTTGTTTATATTATATTCACGTAATGAACATTTTTATGCTTATTTAGTTGTTTCTATGTTTTATAGATTTTTTCTGATCATATAATGAAAATATAAATTCTAAGTTTCTCAAATTTTATCCGTCTCTTTAAATTCTTCTCTAATATATCAAATCTTTTACCGCTTGAAATTCAAATTGATTTTTCTTAATCATACTAATTCGATTTTGACCTCAAAAAAAAAAAAATGTATTCCTCCTGCTTACAAGAGGTAGTTGTCATCGTCTATGTCATTAGCGACAATAGTTGCCTATAGTAGTTGCCAAAGTTAGGCATTAGAGGTGTCACACATAGTTTATCGTCGAAGGTTGTTGGTGTAGAGGCATTGGGAAACATTGGAGAGTGTGAGGGAGAAATTGAAGTTCTTAGGTAAATGTGTAAACTTCGATAATAAATATTGTTGAAGTTGGTGTAGTTTTTTTTATTATTTAAAACCAACTTGTGAAATTGGTGGGTCACGAAGCTCGGTTAAAAAATCAACTCAACTTAGTCTTTAAACATCTTTTATATATATTTAATAATTTTGAAAAAAACTACGATACTTAAAAAGTTCTTATATACCCTAAAATTTAACGTGGATCATCAAAAATAGTAAATTTGACAAAATATTTACAATATATAGCAAAAATTTCAGATTCTATTAATAATAGACATTGATAGTTACTGATATGCTTCTATAAGTGACAGTGATAGACAGTGATAGAAATCTTTCAATGACTATATCATTATAGAATCCAAAATTTTGTAAATATTTTAATTTATTTTACTATTTTTAAAAATATTTCTAAATTTAAATTAAATTGCAAAATTAGTTTATATATTTAGAAAAATTAGAATTTAGTGTATATAGTTTGATAATTACAAAGGTAATCCTTACGACATTTTATCAAATAATCACATAAACTTAATTTTAAGTTAGTTTAACTTAATTTTAAGTTAGTTTAAAAAAAAACTATGAGATCAAAATTTCAATAATTTAATATAAAATTTACGTAAATATCCTTAGACAAGAAGATATTGAAAAATACAATTTTATTAATAGGTATATGAATTTAAAATTTAAACTTTAATTATAAATTATTAATTTAATGAGGATATCATTGGCATAACTGATAGAAAAATATGATTTGTATAAGTAATAGAAAGATATAATCGTTGATGTGAAATGGAGAATGAAATTTTGCTTATAATTTAAATATTTTGTTAAATTTGATATTTTTTATAATAGGTTTACACTTTTATTTTACACTCTTATAACATAAACTTTGTTTTACACTCTTGAATAAATATTTTGTCAAATCTTTATATCTTACCTAAAATTTAGATTTAATTGCAATTTACAAAATTAGTTTCTATGTTTTGAAAAGAAAAGAAAAATAGTCCATAGTTTGATAATTTCGAAGGTAATCCTTATGAAATTTTATCAAATAATCCCATCGACTTAATTCTAAGCTAGTTTCTCCAAAAACCATGGGATCAAAATTACGATAATTTAATCTGAAGTTTACGTAAATATTCAGAGCAAAAAGATAAAGAAAAATGCTATTTTTTTAATATTAAACTAATATAAAGTTTAAACTTTAAATATAAATATATTAATTTAAATTTCCACTTCTCTTATGTTTTACAATTTACATAACGGTGTTCATAGAGATTTAAATTGATATTTAAAAAATAACCACCACTGATTTTGAAATATTTGTTGGGAAATGCAGAAATTGGTCATCGGCGAATTTGGAAGGGACTCTTCCATCTCAACTCTTGCCCTACCTTACGGATCTGTCAGTTCTCTTTCTCTCTGCTTTGCAATCCATTTTCTCTTTTTGTCCATCTCACTGCCCTACCAATCAATTTTAACCCCTTCCTTCATATTTCCTCTATTTCAGTTATCTCCATGGGAACAAACTTCACAGCGAAATCCCACGACAATGGGGATCCACCAAGCTTGTCAATCT

mRNA sequence

TTACCCATTGTAATGCTTATGAGAGGTCTTGCAATGATTCTCGTGGTAATAATTCTCCTGTGTTGCCTCCGGATGAAGTGGAAGGTTTAAAACATATGGCAAAGACATTGGGAATGAAAGATTTAAACTTTGGTCAAGATTCATGCGGAGAACGATATATATCTTGCGATTGTACATATATGAATCGTAGCCTTTGCCATATCACTGATATAAATTGGTCATCGGCGAATTTGGAAGGGACTCTTCCATCTCAACTCTTGCCCTACCTTACGGATCTTTATCTCCATGGGAACAAACTTCACAGCGAAATCCCACGACAATGGGGATCCACCAAGCTTGTCAATCT

Coding sequence (CDS)

TTACCCATTGTAATGCTTATGAGAGGTCTTGCAATGATTCTCGTGGTAATAATTCTCCTGTGTTGCCTCCGGATGAAGTGGAAGGTTTAAAACATATGGCAAAGACATTGGGAATGAAAGATTTAAACTTTGGTCAAGATTCATGCGGAGAACGATATATATCTTGCGATTGTACATATATGAATCGTAGCCTTTGCCATATCACTGATATAAATTGGTCATCGGCGAATTTGGAAGGGACTCTTCCATCTCAACTCTTGCCCTACCTTACGGATCTTTATCTCCATGGGAACAAACTTCACAGCGAAATCCCACGACAATGGGGATCCACCAAGCTTGTCAATCT

Protein sequence

LPIVMLMRGLAMILVVIILLCCLRMKWKV*NIWQRHWE*KI*TLVKIHAENDIYLAIVHI*IVAFAISLI*IGHRRIWKGLFHLNSCPTLRIFISMGTNFTAKSHDNGDPPSLSIX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Chy7G132810Chy7G132810gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy7G132810.1.exon1Chy7G132810.1.exon1exon
Chy7G132810.1.exon2Chy7G132810.1.exon2exon
Chy7G132810.1.exon3Chy7G132810.1.exon3exon
Chy7G132810.1.exon4Chy7G132810.1.exon4exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy7G132810.1.cds1Chy7G132810.1.cds1CDS
Chy7G132810.1.cds2Chy7G132810.1.cds2CDS
Chy7G132810.1.cds3Chy7G132810.1.cds3CDS
Chy7G132810.1.cds4Chy7G132810.1.cds4CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy7G132810.1Chy7G132810.1-proteinpolypeptide