Chy4G075500.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy4G075500.1
TypemRNA
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH04: 10835498 .. 10849054 (-)
Sequence length165
RNA-Seq ExpressionChy4G075500.1
SyntenyChy4G075500.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGGGTTTGATGGCTGAAAGAGGAAGAAGAAGGTCTACCATCACTCGTCGTCCACCGTTCATTGCTTGTCGTTGTCGTCGACACTTGAGAGTCGTCGTCCGCCACTCGTCGGTAAGTGTTTGTTTTTTATTTTTTTTCTTTGCTTTGGTTGGAGTTTGAGAAAAATACTAAATAGGTGTGTTTTTGCGGTTGTCAAGGCCTTCTCTTGTGTGTTTTTCACCTTGTCGTCGTCGTTCGCCCGTCTCTTGCTGGCAAGTCTTTGTTTTTAATTTTTTTATTTTGGTTTGAGGTTGAGAAAAAAATGTTAAATATGTGTGTTAGTGTTTGTTGTTGTTGTTGATTTTATTGTAATTGTTCCTGAAGATCCAATTAGATCTCTTTTGGGTTTCTTCTAATTTTGCTATTTTTCATTCGTTATCTTCTAATTTTTCATTCGTTTTTCATTCTAGATTTCTTCGAGTTACAGTATTTTTTTTTTAAAAAATAAAGGATCTCCCGATGCTATATTTTGTGCGTCGGAAGATCCTCTCTGGACTTATTTTTTCCGACTTCAATCCCGACACAAATGTATATGTTAGGAGATCCCCATTTTTTTTTTATAGTGAGAGATAAGAGTTCAAATAATCGTCTCACCTTCCGTCCTATACCAATCACTTGTCTTGTTTGAGGATCTTGAACCTGACACCCACGAGAAGAAAAGACAATGGTTAGTTCGAGATCACATAATTGGCCAACAGAGGCTAGGTTGAATGTGAGATTTGAGACATGAGGTGTTTGACAGATTTGTGGTGGGTGTATTAACAGTGCAATGTGAGAGATAGACATGTGATTACCATCAGCAGAGTGAATTGGGGGAAGGGATTGAACAGAAATAAGGGAGGATAACATCGAAATGTTAGAAATCATACGATTACAACAAGCCGAATCAAGAAGCCAAGAAGTACCTGGGGGTGACAGCAAGAGCAGTAGAGTCGGAAGGGATCACCTGTTTCAGTAAGTCATGAAAATCATTTAACTAAAAGTTTGGTGGTGCAGTGATGTCAGATGGGGTGGCAACAGCAATAATAGATTGAGAACCAGTTTTAAGGTAAGACTTGGGTTTATTTGAGTGACCAGGAGGAAGGGGTGGGCAAGTTGGCCAGTTTTCCAAGATGTGACCTCGTTTGTGACAATACATGCACTCAATAGTAGGACAATTAGCAAACTTATGACCATGAAGTTTACAATTTTTGTAGAAAGTAGACTCATTAGCAGGTCGTGGATGAGTGGTTGCAAGAGTGACATCATAGGGTAGAGAGGGGACAATGCCAAGTCATTTTTCTTCAAAATAAAATTCCCTGAACGGCAACGTCGAGAGATGGTGGAGGGTTGTGATATAACAGAATAGCATAAACTGATTCATACTCTAGGCGAAGACCCATGAGGACTTTTATGAGGCGAATATGGCCATGACTAATTTTTGCCTGGTCTAACTAAGTCCAAATTGGCTGAAGAGTGGTAAGATATTCATTCAAAGATTGTCCTCCCTCCTGGTTTAGACTAATAAGTCAAGAATGTAATTGATAATAGTGAGCAAGCCCAATAGACTGAAAACGTGTGGACAAGAAATCTCAAAGTTCTTTTTTAGTATCAAATGCATCAATCAAATTGAGTATGAATAGCTGGAATAGAAGTGCTACCCAACCAAGTGATGATTTGATGATTTTTGCTATCCTAGTCTTCAAGTCTTTCAAGGTACTTGACGTCCTCTATAGTAGTCTCTTGATTAGTGATATCAGAAGTGTCTGCATCATCAGTCTCAGAGTGTCCTTAATGGTGTTTTTCACAGGAGGAATGGGTTTGACAGGTTTGGTGATATCTCCATTAACTATATGCCATAACTTTAGACCGATAAAAAAACTCCTCATTTGGTGGGCCCAACATAGTTCGTGCATCAAGAATAGTGCTAATAGAACGTGTTATATCATTTTTCTCCCTTACAAAAACAGTAGAAACTAGGTCAACACACAAAGCACAAGTCAGATACAGATTAAACGGGATATTCAGATTTGTAAGCAAATAGTTCACAACACACAGATCACAACATATAAATAAAAAATCGAAGTAAATGAAAGCTGGAGCACAAATCCTAATTTGAGCAAAAACCGAAAACGAAATCAAGAGTCTGTGAATCAGAGATGTGCAAAGAAAATCAAACAGATTAAACAGGATAACCAAAGCAAAGCAAATCGGAGTTTTGTGGGACAGATCTAAACCAAAGCAAATCAAAATTGGAGCAAATCGAAACCAGAATCGAAAGGGAATCAGATTAATATGTTGAACAGATCTAATTAGTGAAAACTGAATCAGAGCTCTGGGCTTCGTGGGATTGCAGACGAATGGACAAGCTGCGGAAGGGGACAAAACTAGAGCAGGTCAGCGGATCTAACCTAAATCAGAATGGATCTAAGTAGAGGATCAATAGATATGCGAGTTTGCGAGTTTATGGATCAAATGAATGTTTGCTTATTTTCATGGATGTTTACCATAGATTAAAAATCTAATTATACACAAAGTCAAGCCACTTAAGGAAAAAATATGCAAAATAAATACACAAGAATTATATTCCCCAAAGATACTCTAATTATGACAATAATGTCATCTTCTTCAAACATGCTCTTTGGTCTTGCAATAACACTCTTTAGAAAGATTAATGTGGCCCTTTCAAAAGCCAAATATTTGCATAAGAAGGATCTTGTATGATATTATCCCAAGTCGAATAAATCTTCGATTAAAGGGTTATATATTTACCTCATTTGCTTATTTTGCAAGCAACAAGTATGCTAAGATTGCAACGCATGCTTATGGGAGTGTAAGTTCTCTATGAATGGTTGGGAGGCATATATTTAATCCATTTACGTGTTTTTGTATTTTGTAACGGGTCGTGGAAGTTGTTTGATTGATGGTGTTGTATGTCGGAGAAAGCTCGATACAAGATCTTCAAACAATGAATCATGATTCTCTAATGTTTGTAGTCCTATAGAAATTATCTTCTTAATTTAAGTGTTGTTAGTCTCTTGGTTTCTTTCAACAATTCAAAACCATTATTGGCAAAGGGACAGTCCCTTCAATGAGCTCAAGATGCCCCTCGTCCATCCCTAGGATTCAGAGTCCTTCAAGTCATTAAGCCTCATCAAGCTTGTCCTCAACCCCATTGGTTAGAAACGGAATGTTGATGTTTTTTGGAATGATAAAAAGATTGCAAACTTATAAAGTTAGGTGGTTTCAATATCTATGCAAAATACATAAAAGAGTTGTTCATTTAAAATTTAATAAAATGTTGGAGATGATTGTTGGAAACAAATGTCAATTGTTTTTTTGTATCGTGACGAACCATTGTCTTGAAAGAAAAATTCAGTACGACATCAGTGTTAAATTTCATATGCCAATTACTTCCCAAAGTTATATGAACAATTCACTTTTAAAACATTTTTTACTAAAATGTTTGTTAAGTATTCCTTATCAATTTAGGAACTAATTTAAGATTGTAAAGATATTTTAGGAGTTTGCATACTTTGACAACGATGTGCCATATATATTTCCTTTTCCAAGCTACCATTAAAGAATATCATCTTTACATCCGTATGATGTATTAGATGACCATGCATTGCTGAAAATACTTTTAAGGTCTATAGTGGCTATTTTAGTCATACGATAACAAATATAAAAAAATTCAATGACTTGTTTTGAATCATGACTTAATTTTGCATAAATCTCCACAACCACTAACCTTGCCTTAAGTTTGACAATTGAACTATTTGATCTAAATTTCAAGATCAACTTCTAAATTTCATCATAAGTTATCAAATCACATAACAATTATAAACCATCAATAAATATTGCACCTATGTTTCCATGATCATCTTCTTATCTAACTAATGTAGGGCTTTGATCATCACTTTTTGTCGTCGAAAAAGTAAAAATTCTTGTAGTGAGTTTCAACTAAACCTCTCGTAAAATACAAATGCACCCATTTAACTCTTATCTAGGCTAACTCCTATTTATCATAACATACTACCTATTTAATAGAGTTCAGCCATGCACAGAACATATCACGACTACTTTTAAGGTTCCATTACACCTTCGCGTTCGGCCTAAGGATTATAATAATAAGGCTAAACCAGGGACACAACTTTGATGTCACTTATTATGGACAAATTTGGGGTATAAGCCCTCATACCTTATAAAATATCACATATTTATAATTTCGACAATGTCGTCTTAAATTTTCATACAATTCAATGAGCTTAGAAAAATAACAATTTTGCATATTTTCATACTACCAACAAGGCTATAGTAATATGCAGAATAATGTTGTACGACCAAACTTAATTAAAAGTAATAGCAATACTTTTCATGTTTTCAACTTCATGAATATTAATGACCAAACATGACAATTCATGACGTAAATCATGCAGAAACTTTGTCAAATATAAGACACGTGAAATTTTATTTCTACTCATGCTAACATGCTAATAGACATGATCCAGTAGATCACAATAGTGTCTCAATTTTCACAAATTGATTTATCATTTAAACATATAAATCTATATGCAACACTATTATGAGCATAAATAGTAAACATAGTCAACGACTTTCAATCTTACCATAGATTTAATTTCTTAAACACAAGATATGCTACCTTAGCAAAACAACCCCACATTTCCAAGTATTTAAGTTCATAACAGATCCAAAGTTCAATATTACCTTTTGTTAAGAGCAATAAATTTCATGAACAAATCCAATTTAGTTCGTAAAACTCTTTATTCCAAGGTATTCGTGATCTCTCTTTGTTTAATTGATTTTACTTCTATTTTATTTCAAAAACACACATTGCCAATATTTGATTCGAGGTACAAAAAAATATTTTACATGCAAATGTGTATATAAATGTCAATTACTACTCACAAAATATTATAGTATTGAATATCACGCTCAAATGTATCAATGAAATAAAA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TAGCGGGAAAATACAGAATGAGAGTTTTTCAAAGTTTTCTTTCCAAACGGAACTAGTCCAGCGAGATGTGTTTCTGCTTTTCGTTTACCCTAAACTGATTAGTTAAATTTCAGTATCTGATGAGTGATGATGAACCGAAACCGAATAGTTTTTGAAGATTAAATCAAGAACTGTTCAAAAGCTGAGATGTGAGATAGAACTAGAGTGCTTTCTAGATGTAATTTCAGAAATTAAAAATGGTTTTTCTGTCATAGTCCTCGTACGGTTCGAATTATTGCTTGTTTTTTAATGCTTTTTTCTTCTGTTCATATGCTGGGTTTTGACCTGACTTGTGGTGGGTTTCGCTTTGTGCTTATTTCTTGAAGAAGTGTTCAATCACGAGCATTTGAATTCAATTTTAGAATTAAATCATTGCTACTTTTGGGCCATTCTTCTAGTTCATCGTTATGAAAAAGGATTCATACATAATTGTATACATGTGGGGCTTTGGTCGTTTATTATTATTATTATTTTATATTTAAACTATTTTTGGGGTGTATGACAATCAACTATTGTCTAATCAACCATCTATTTATTTGTTCTTATCCATATCTGCTGTATAGTCGTTTTTGGTTTTTTCCATTTTGAATCTTTTGAAAGGACTGTCTTTAGGTATGCGTGATTTTTGTTGAATCCTTTATGAACTTCATTAAAATCAAGTTTAATACTCATCTTGTTAATGATATAGTTTTCATATTGTCCATGTGAAAAAAGCTGACTATTTGTGCAAGACAGCTTAGGAAGATCATTCTTCTTATTCCACATTTGAATCTTCTCTTGTTCAAATACATTAGTTTTATATTATGATTGAACTTATTGTATTTGCTGTTTTGACATTTGTGTTCAAATTTCTATGGTGTAAATTCTCGAAGGGAAAGGAACAACTATTAGGATTGATAATATGTTATTTCATCTCAAGATTATTCATAGGCGTCAATTGAGAGTGGATTGTTTTGGATACCATTCAAGCTATTTTTGTGGTTGAAGTTGTCGTCTTTTCTTTGGGGATCGGTTGGTAATATGCAATTGGATTATAATGATTCCTCTAAACACTGTCTTGAAGATTTTAGATTTGTGTGCGTCTGTCGAGTCAGTTGTAGTTAATGATAATTGTTAACTTAAACCAATTTTACCAAATATGTCATCTGTTTTCAGCCAAGCCCAACAACTTCAGAAGTGATCAACCTCTAAACAGATTAACCTCTCTTAACAAACTCTTTTCAACTACTCTCAACCATTAACAAATAAAACAGAGTAACAAACTTCTCTGGTATAGTTATAAAAGGGGTTTGAAATTCTACTGACCGAAGTGTTCTTACATTTTATTTTGATGTGAATAAAATCGCTCCAAGGCTATTCGAAGTGGATGGCTTCAAGAAAGCTGAACCACTATAAAACTTGCTGTATTCTTCTTTCATGCTTTGAACTTTACTTAGAAATTTTAGTACTTGAAGTCCTTTGATGTCTTCTTCCGAAACGATGAACTAAGAAACTTGGGAATAACAATAATAATAAATTATCTAGAGGCAGCTTGAGCAATCGCAAGTTCTTATTTTCAAGCAGGTCCTAAGTCCTAAGTAAGTATAGAGTTTGCTGTTGGAATCTTAGAAAGGGTTAGCAATTCTTAAGGGTCGTTTGCAAAAATAACAAAAAAAAAAATGTTAGAATAATAGGATTCATGTCTCTACATTTTTTAAATGGCAAAATTAACAAATTAAAGTTGTAATCCTCTTATAACCCTCTATTAGTCTCTAATAACTCTCTGATAGCAATTTGATATATTTAATTAGTTGTTATATTTGCAAATGTGAAAAAAAAAAGAGGTGTTATAGACAATTTTTTTTAAAAAAAATTGTCATCTAATACAATTTCTCATTCTTAAATCACTTATTGACACTAAAATTTAAGCGGAGGAAGGAAAATTTGATGCGATGTCATCTTACAACAATACATATATCTGATACCCAATGAATCTATAGCTTTGCTTATTGCTAATTGACATGGTAATGAAATGGTTGCAAATGAAAGGATAACGAAGCTGCAGTTCCAAAATTTGGAGAATGGGATGATGGGAATGCAAAAGCACCGGAGAACTACACGGCTATTTTCAACAAGGTGCGGGAAGAGCGGCAAGATCAAACAGTGCGAGGGACACCAACACGGCCGATTGACAGCACAAACAACCAAAATCATGAACAGAATCAAAAGGTTAAGCTATACTCCATTTCTAAAATTATTGAGATTCTGATATCCTTTGTCTTACATCCTGTCTTATAAACTTTTCAGAAATGCTGTTGTTTTCCATGGCCAAGAAAATGATATTGTTCTACATCTTCATTAGCTCAGTTTTACATGGACGTGTGAATATATATATTATTTGAAGGAAAGAATCTGTTGGGCTGCAACAAATATCCTTCTGTACCATCTAATATAAGTGTTTGTTTGTGGGCAAATAAAGTGGGAAAAAGACAATCTGGGGTGTTTTGGGTTATATTATTTTTAATCATTACTTGAAATTTTTACTTTTGCTTGTGATGTATTCTTCACTCTAATAATTGTATTGTGAGGTTTGGCTTATTTGATTACTATTTAACGATCACATTAGTTTATGATCGTATGATCATAGAAACCAACCAAACCGAACTAAACCTGAAATCCTGTTTTTATTAAAGTGGTGATTTTGTTAAGAAAACTAATTTTTTTCCATTCAATTTCGTTTTAGATTTAGAAACCGAAACCAGGCTGTTTATGTTACAAATATATATAAACATATATATATGTTATACACTATATATGGTATAAAAACCAGACCATTTTTTGTATATATGATCTACTACATATAAAACCAAAAACTGAATCGAGCTTGAATATTTGGGGTTAGATTTGGAGTAAACAAACAGTTCAGGCTTTAGAGTTGGAAAGTTTCGCAAACTAATCCAATAACCAAAGAACTTTTTTATGACCGATCCATTTCTCGTGATTTTTTTGCCATATTAAATATCAATTCTATCCTCTCTCTCTCTTCAAATCCTTTATAAACCATTAGTTGCTTTTCTCTCTTCTATAAACTTGTCTGTGTTATAGAGCGAGATCCAAAAAAACGAAGATAAGTTTTACGAAATATTTTTATTCCAAGATCGCATTTATGATAATAGGAGATAAAAGATCGTTTAATAAAACTTTGGAAGAGTTTTAATAAAAGTTGGTAAATCGTTTAATAAAAGTTTGGGAGATCGTTTAATAAAAATTGGAAAAGATTGTTTAATAAAAATTAAAACTTAGGTTATTTTTATCTAGTATTTTTTCTTTTATGTTTTTTTTTTCATTTGATGTCTATTTATTCACCATTACACTATGTTACAATATTTTGCCAAACAAATATTCTGTCAAAAGATTTGTTTCCTATATTTTAGGGATCTTGGTTTATCTCTTAAAAGAATCTTAGTGTATCCTGAAATAAAAATAAGATCAAGAAGATTTTATATATTTAAATCTTAAGGAGTATATATATATATATA

mRNA sequence

ATGAAGGGTTTGATGGCTGAAAGAGGAAGAAGAAGGTCTACCATCACTCGTCGTCCACCGTTCATTGCTTGTCGTTGTCGTCGACACTTGAGAGTCGTCGTCCGCCACTCGTCGGCCTTCTCTTGTGTGTTTTTCACCTTGTCGTCGTCTATATATATATATATA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGGGTTTGATGGCTGAAAGAGGAAGAAGAAGGTCTACCATCACTCGTCGTCCACCGTTCATTGCTTGTCGTTGTCGTCGACACTTGAGAGTCGTCGTCCGCCACTCGTCGGCCTTCTCTTGTGTGTTTTTCACCTTGTCGTCGTCTATATATATATATATA

Protein sequence

MKGLMAERGRRRSTITRRPPFIACRCRRHLRVVVRHSSAFSCVFFTLSSSIYIYI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Chy4G075500Chy4G075500gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy4G075500.1.exon3Chy4G075500.1.exon3exon
Chy4G075500.1.exon2Chy4G075500.1.exon2exon
Chy4G075500.1.exon1Chy4G075500.1.exon1exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy4G075500.1.cds3Chy4G075500.1.cds3CDS
Chy4G075500.1.cds2Chy4G075500.1.cds2CDS
Chy4G075500.1.cds1Chy4G075500.1.cds1CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy4G075500.1Chy4G075500.1-proteinpolypeptide