Chy12G212140.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1
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Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTACTTCTTCTCTCTCTCTTCCTTCTCTTCCTTTTGTTTAAAGATAAAAGAGAGATTAAATACACACAGACGAACAACAAAAACAGAGCCTCCTCTGTTTCTGTTTCTCTGTTTCTACCATTAACGCCTTTTCAATGTCCTCGAAAACCCCGCCCAACCAAGATTCCTCCGCCGCCGATAAGTTCAATGGCGGCGGTGAACTGCCGTCCGAGGACCGTTGCCCGGTGGAGGAGGTGGCTCTGGTGGTCCCAGAGACTGATGACCCATCTCTTCCGGTGATGACTTTCCGATCATGGGTTCTTGGTCTGGCGTCTTGTTGCCTTCTCATTTTCCTTAACACTTTCTTTACCTACCGTTCTCAGCCGCTTGCCATTTCTGCCATTCTTATGCAGATCGCCGTTCTCCCAATTGGCCGCTTAATGGCCTCCACTCTTCCAAACAGAGACTTCCATTTTCTCCGATGGAAGTTCAGTCTCAATCCTGGCCCTTTCAATATGAAGGAGCATGTTATTATCACCATTTTTGCCAACTGTGGCATCTCCTATGGCGGCGGTGATGCTTATTCCATCGGCGCCATTACTGTCATGAAAGCTTATTATAAACAGAGCTTGAATTTCTTCTTGGCTCTTCTCATTGTCTTAACAACCCAGGTTTGTGCTTTTCCTTTTTTTTCTCCTGATCTTCCCCCTTTTTGCCTCTTTTTGGTTGTTTGGTTTGATTTCTACTGTCGTTTTCTTCGTTGTTCTTTTCTCTTCCCTAAAGTGGTGAAGAAAAAAAAACGGCTAATTCAAAAGCTCCGTTTTTTAAAATACTCGCATGGATAAGATCTAACCCTTTACTTAAATTCCCCTGTTTTGAATCGTTTTTAAAACTTTGGTGTTGGTCTAGGTTTTGGGGTATGGATGGGCTGGAATGCTCAGAAGGTACTTGGTGGATCCTGTTGAAATGTGGTGGCCTGCAAATCTGGCTCAGGTTTCTCTGTTTAGGTACGGTTTCTTCATCTTTGTACAGATTTGGAGCTCAGAAACAAACTTAGCAGCTTTCACTCGTTTTTTTGTTTGTTCTGTTCTAATGCATATTCCGATTTACTACTGTTCTGTTTTCCCCTGTCTTAGAGCTCTTCATGAGAAGGAGGACAAATCAAAAGGAATGACAAGAATGAAATTCTTTCTAATCTTCATGGGAGCAAGCTTTATATACTATGCTTTTCCAGGTTACTTGCTTCAAATCTTATCATTCTTCTCGTGGGTTTGTTGGGTTTGGCCTCACAGCATCACGGCTCAGCAAATTGGGTCGAGCAAAGGTGGGCTTGGGCTCGGTGCTTTCAGCTTCGATTGGGCTGGGATTTCAGCCTACCATGGAAGCCCACTGGTTTCTCCATGGTTCTCAATTCTAAATGTTGGAGTTGGGTTTGTGATGTTCATTTATATCATCGTCCCTGTTTGCTACTGGAAATTCAACACCTTCGATGCTCGCAAATTCCCCATCTTCTCTAATCAGCTCTTCACCAGAACCGGCCAGAAATACGATACCAAAAAGGTTTTGACGCCGGATTTTGAACTTAATGTTGCTGCTTATAATAGCTATGGAAAGCTTTATCTTAGTCCCCTATTCGCCCTCTCCATTGGATCTGGTTTTGCCAGGTTTACTGCTACTCTCACTCATGTCGCCTTGTTCCATGGACGGTATGCTCTCTCTTTCCTTGCACTGTCAATCTTTTGTTTGATTCTGCCATATTTTGTTGTTTCTTACGTCAAGTTACTGAGTTTAGTTTAGTTCATGAACTTATTACGATGGTTGCTGTGTTTGTTTTGGTCTTTGAACTTATTGTTCCATGAATTTGTGCTGCCATTTTGTGTTTGTTTAGTTCATATTTTGCTGTGTTCGTTTACCTTCTACGGATGAAGTGATAATCTCAGATGTGTTTATAGAATTTAGACTACATTTCTAAAAGTTATCTACGATTTTTGCCCTTCGTTTCCAAAATGCATCTATTCTCTCAAAAGTTGACGTTATCCATGACTTTTCACAAACGTCTCATAACTCTTTTGGTAGACTTCGGTTAGAGTTTTGGGTGGAAGTAGAGATCAGGAACGAGTGTGACAATGACTTGGAGTAGTGAGGGTGTGGTCAACTCTCAATTTTCATTCTAGGTCACTACTGCTCCCTTCAAGTTCTAATTTGTGTTCAACATTAGTATGAATTTCTACAAAGGAGTTTTAAAACTTTTATGAAAGGTTAAAGAAGAATATTGTAACTCTTTGAAAGAATAGGGGTATTTGTATTTCTAGAACATAGAGCAAAGTTTAGTGGTTTTTTTTAATTCTTTGAGTAATTTAGTCTGGTGGCTGATTTGACATGTGATAGAAAGTGAAAAAAGAAAATAGACAATTTGGATCATTTAAATTGACAATTCCAATATATTACTCCATTAGAATTGACGTGTCAAATCAGCTAATATTTATTCAACATGTTATGTCGTGTTTGATCACAATTCGAAGTTTATTGTAATTAAAACCTTTTAAAGTTTAGAGATTAGAGATTAAATAGATATAGTAGCCACTAAAATTAGAAAACCCAACTTTATTTGATGACATGATTATCTGAGTGGAAAGTGAACTGCTGAGTGACAAATGGAATGGGGGAGGCTGCTGGAAGGGGGAATGAATTTGTAAGGGGAGAGAAAATAAATGCAAAGAAAAGAAAAGTGGGTCCTAGTAGAATGGAGAATGAGAATGTCATTCTCTGATCATCTTAAGATGAGAAGAATATCATTCTTTTTCAAACTATAAATGATTTTAAATTTTGGAATGGGGAAAAAAAATAAAATAAAACTTCAACTGGTGGAATAAATCCATGTGACATGATTCTTATTCTGGGATCTCAATCCTAATTAGTAAATATGGTTCTATAAACATAATGTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTTACACTCATGCTTGAATTTTTAAAAGATTTGAATTCCGTGTGTATGATATAGAAGAATTGTCTCATAATCTGCTCAGAAGTTGAACAAAGGTGGATCTTGAGAATCAATCCAGGTTTAGATGATAGTCAGAGTTGTTAATAGACTGAACTTAATGAGAAAAAAGTCAAGATTTGAGTTCTTAAAGTGAGGATTATTCTCTTTCATTTTTCTAGGGACATATGGAAGCAAAGCAGAGCGGCAATCAAGAATGCAAAATTGGACATTCATGCAAAGCTGATGCAAAGATACAAACAAGTGCCAGAATGGTGGTTCTTGATCTTATTATTTGGAAGCATTGCACTGTCGCTTCTGATGTCGTTTGTGTGGAAGGACACTGTTCAACTGCCATGGTGGGGGATGCTATTTGCCTTCGCTATGGCTTGGATTGTTACCCTTCCAATTGGGGTGATTCAAGCAACAACTAATCAGGTAATTGGACGGGAATTAGTAGTAGTAGTACTCACTCGTCTTTCTTTAGGTTCTCTTGAGCATATTCTAAAACAATCTATATGGAATCTTATATGCAGCAACCTGGATACGATATTATAGCACAGTTCATTATTGGTTATATTCTTCCTGGAAAGCCAATTGCAAATCTTCTTTTCAAGATCTATGGGAGGATCAGTACAGTTCATGCTTTGTCTTTCTTATCTGATCTTAAACTTGGTCATTATATGAAAATTCCACCAAGATGCATGTACACTGCCCAGGTGATCGTTTTGCTAACTTCCAACATTCATACCATTCTCTTTTGAGAATTTATCAGAATAAGTTTGACTGGTTGTTTTACCTCCTCTTCCTCAGTTAGTTGGGACGCTAGTTGCTGGGACGATTAACCTGGCTGTTGCTTGGTGGATGCTGGACAGTATAGAGAACATCTGTGATGATGATGCTCTCCATGCTGAAAGTCCATGGACTTGTCCAAAATATCGAGTCACATTTGATGCTTCTGTTATATGGGGACTGATTGGACCAAGGCGGTTGTTCGGACCCGGTGGGCTGTATCGCAACTTGGTGTGGCTATTCCTGATCGGAGCTGTCCTTCCGGTTCCCATCTGGGCATTGAGTAAAGCTTTCCCTGAAAAGAAATGGATTGCGCTGATAAACATACCAGTTATATCCTATGGCTTTGCAGGGATGCCACCAGCAACTCCTACAAACATAGCAAGCTGGCTCATGACTGGAACTGTTTTCAACTACTTCGTCTTCCGATACCAGAAGCGCTGGTGGCAGAAGTACAATTACGTTCTCTCGGCTGCCCTCGATGCAGGGACAGCTTTCATGGGTGTGCTGCTTTTCTTTGCACTGCAGAATGCAGGCCATAACTTGAGATGGTGGGGATCACAACCAGATCATTGTCCTTTGGCAAAGTGTCCAACCGCCCCTGGGATCGCAGTGAAAGGATGTCCAGTATTCTAGCTTCAGTGAACTGATCATGGTTGTGAAAGAAAAGGGAATTTCTGGAGACCATCCAAGTGGGGGGGACGATGAAACAGATAAAAGTATGTTGCTACAGAGTTAGGTTCAGATTCTTGCTTTGCTTTTGATGTTCGTAATTGCTATTTGATTGTAATGAGAGGTTCAAGTGATTTGGGTGGGCTTTTATATGGGATACAAGTTGTGTTGCATCATTTTGGTTTGTCTATGCAAGTCTAGATGGGCCTACTTCTTCTCTCTCTCTTCCTTCTCTTCCTTTTGTTTAAAGATAAAAGAGAGATTAAATACACACAGACGAACAACAAAAACAGAGCCTCCTCTGTTTCTGTTTCTCTGTTTCTACCATTAACGCCTTTTCAATGTCCTCGAAAACCCCGCCCAACCAAGATTCCTCCGCCGCCGATAAGTTCAATGGCGGCGGTGAACTGCCGTCCGAGGACCGTTGCCCGGTGGAGGAGGTGGCTCTGGTGGTCCCAGAGACTGATGACCCATCTCTTCCGGTGATGACTTTCCGATCATGGGTTCTTGGTCTGGCGTCTTGTTGCCTTCTCATTTTCCTTAACACTTTCTTTACC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CTACTTCTTCTCTCTCTCTTCCTTCTCTTCCTTTTGTTTAAAGATAAAAGAGAGATTAAATACACACAGACGAACAACAAAAACAGAGCCTCCTCTGTTTCTGTTTCTCTGTTTCTACCATTAACGCCTTTTCAATGTCCTCGAAAACCCCGCCCAACCAAGATTCCTCCGCCGCCGATAAGTTCAATGGCGGCGGTGAACTGCCGTCCGAGGACCGTTGCCCGGTGGAGGAGGTGGCTCTGGTGGTCCCAGAGACTGATGACCCATCTCTTCCGGTGATGACTTTCCGATCATGGGTTCTTGGTCTGGCGTCTTGTTGCCTTCTCATTTTCCTTAACACTTTCTTTACCTACCGTTCTCAGCCGCTTGCCATTTCTGCCATTCTTATGCAGATCGCCGTTCTCCCAATTGGCCGCTTAATGGCCTCCACTCTTCCAAACAGAGACTTCCATTTTCTCCGATGGAAGTTCAGTCTCAATCCTGGCCCTTTCAATATGAAGGAGCATGTTATTATCACCATTTTTGCCAACTGTGGCATCTCCTATGGCGGCGGTGATGCTTATTCCATCGGCGCCATTACTGTCATGAAAGCTTATTATAAACAGAGCTTGAATTTCTTCTTGGCTCTTCTCATTGTCTTAACAACCCAGGTTTTGGGGTATGGATGGGCTGGAATGCTCAGAAGGTACTTGGTGGATCCTGTTGAAATGTGGTGGCCTGCAAATCTGGCTCAGGTTTCTCTGTTTAGAGCTCTTCATGAGAAGGAGGACAAATCAAAAGGAATGACAAGAATGAAATTCTTTCTAATCTTCATGGGAGCAAGCTTTATATACTATGCTTTTCCAGGTTACTTGCTTCAAATCTTATCATTCTTCTCGTGGGTTTGTTGGGTTTGGCCTCACAGCATCACGGCTCAGCAAATTGGGTCGAGCAAAGGTGGGCTTGGGCTCGGTGCTTTCAGCTTCGATTGGGCTGGGATTTCAGCCTACCATGGAAGCCCACTGGTTTCTCCATGGTTCTCAATTCTAAATGTTGGAGTTGGGTTTGTGATGTTCATTTATATCATCGTCCCTGTTTGCTACTGGAAATTCAACACCTTCGATGCTCGCAAATTCCCCATCTTCTCTAATCAGCTCTTCACCAGAACCGGCCAGAAATACGATACCAAAAAGGTTTTGACGCCGGATTTTGAACTTAATGTTGCTGCTTATAATAGCTATGGAAAGCTTTATCTTAGTCCCCTATTCGCCCTCTCCATTGGATCTGGTTTTGCCAGGTTTACTGCTACTCTCACTCATGTCGCCTTGTTCCATGGACGGGACATATGGAAGCAAAGCAGAGCGGCAATCAAGAATGCAAAATTGGACATTCATGCAAAGCTGATGCAAAGATACAAACAAGTGCCAGAATGGTGGTTCTTGATCTTATTATTTGGAAGCATTGCACTGTCGCTTCTGATGTCGTTTGTGTGGAAGGACACTGTTCAACTGCCATGGTGGGGGATGCTATTTGCCTTCGCTATGGCTTGGATTGTTACCCTTCCAATTGGGGTGATTCAAGCAACAACTAATCAGCAACCTGGATACGATATTATAGCACAGTTCATTATTGGTTATATTCTTCCTGGAAAGCCAATTGCAAATCTTCTTTTCAAGATCTATGGGAGGATCAGTACAGTTCATGCTTTGTCTTTCTTATCTGATCTTAAACTTGGTCATTATATGAAAATTCCACCAAGATGCATGTACACTGCCCAGTTAGTTGGGACGCTAGTTGCTGGGACGATTAACCTGGCTGTTGCTTGGTGGATGCTGGACAGTATAGAGAACATCTGTGATGATGATGCTCTCCATGCTGAAAGTCCATGGACTTGTCCAAAATATCGAGTCACATTTGATGCTTCTGTTATATGGGGACTGATTGGACCAAGGCGGTTGTTCGGACCCGGTGGGCTGTATCGCAACTTGGTGTGGCTATTCCTGATCGGAGCTGTCCTTCCGGTTCCCATCTGGGCATTGAGTAAAGCTTTCCCTGAAAAGAAATGGATTGCGCTGATAAACATACCAGTTATATCCTATGGCTTTGCAGGGATGCCACCAGCAACTCCTACAAACATAGCAAGCTGGCTCATGACTGGAACTGTTTTCAACTACTTCGTCTTCCGATACCAGAAGCGCTGGTGGCAGAAGTACAATTACGTTCTCTCGGCTGCCCTCGATGCAGGGACAGCTTTCATGGGTGTGCTGCTTTTCTTTGCACTGCAGAATGCAGGCCATAACTTGAGATGGTGGGGATCACAACCAGATCATTGTCCTTTGGCAAAGTGTCCAACCGCCCCTGGGATCGCAGTGAAAGGATGTCCAGTATTCTAGCTTCAGTGAACTGATCATGGTTGTGAAAGAAAAGGGAATTTCTGGAGACCATCCAAGTGGGGGGGACGATGAAACAGATAAAAGTATGTTGCTACAGAGTTAGGTTCAGATTCTTGCTTTGCTTTTGATGTTCGTAATTGCTATTTGATTGTAATGAGAGGTTCAAGTGATTTGGGTGGGCTTTTATATGGGATACAAGTTGTGTTGCATCATTTTGGTTTGTCTATGCAAGTCTAGATGGGC LLLLSLFLLFLLFKDKREIKYTQTNNKNRASSVSVSLFLPLTPFQCPRKPRPTKIPPPPISSMAAVNCRPRTVARWRRWLWWSQRLMTHLFR**LSDHGFLVWRLVAFSFSLTLSLPTVLSRLPFLPFLCRSPFSQLAA*WPPLFQTETSIFSDGSSVSILALSI*RSMLLSPFLPTVASPMAAVMLIPSAPLLS*KLIINRA*ISSWLFSLS*QPRFWGMDGLECSEGTWWILLKCGGLQIWLRFLCLELFMRRRTNQKE*QE*NSF*SSWEQALYTMLFQVTCFKSYHSSRGFVGFGLTASRLSKLGRAKVGLGSVLSASIGLGFQPTMEAHWFLHGSQF*MLELGL*CSFISSSLFATGNSTPSMLANSPSSLISSSPEPARNTIPKRF*RRILNLMLLLIIAMESFILVPYSPSPLDLVLPGLLLLSLMSPCSMDGTYGSKAERQSRMQNWTFMQS*CKDTNKCQNGGS*SYYLEALHCRF*CRLCGRTLFNCHGGGCYLPSLWLGLLPFQLG*FKQQLISNLDTIL*HSSLLVIFFLESQLQIFFSRSMGGSVQFMLCLSYLILNLVII*KFHQDACTLPS*LGR*LLGRLTWLLLGGCWTV*RTSVMMMLSMLKVHGLVQNIESHLMLLLYGD*LDQGGCSDPVGCIATWCGYS*SELSFRFPSGH*VKLSLKRNGLR**TYQLYPMALQGCHQQLLQT*QAGS*LELFSTTSSSDTRSAGGRSTITFSRLPSMQGQLSWVCCFSLHCRMQAIT*DGGDHNQIIVLWQSVQPPLGSQ*KDVQYSSFSELIMVVKEKGISGDHPSGGDDETDKSMLLQS*VQILALLLMFVIAI*L**EVQVIWVGFYMGYKLCCIILVCLCKSRWX Homology
BLAST of Chy12G212140.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6N2KAI3 (Uncharacterized protein OS=Salix viminalis OX=40686 GN=SVIM_LOCUS4686 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 3.5e-04 Identity = 38/97 (39.18%), Postives = 49/97 (50.52%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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