Chy11G193120.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy11G193120.1
TypemRNA
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH11: 9795027 .. 9799106 (-)
Sequence length798
RNA-Seq ExpressionChy11G193120.1
SyntenyChy11G193120.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTCAATCTAGGCAGATTTAAGGCAAACATGTTACATATAGCATTTGATTATGAGATCATTGAGTATGGTGTCTTAATTGTTCTCTATGACATATGCTTTGCGCTGGTATGCCAAAATATCAGTTATATTGTAGAACATGTAGTTGGAACCGATTCTTTTGTTGTTGTCTTTCAAGTAAGTAGTAGGGGTATGCGATGCTTATTCTATGATTCTTGCATGTGGCTTCCTTGTGGTATGTACAAGTTACAACTTTAAGAGAGTTTGCATCATTCGAGTTAGTGAATGAAGGTATATGGAATGGTAGTTTCTGAATTGAGATTGTAAAATTTGGTGGAACAAGTTTGGTTACTTCTGTTATAGTGGCCACTCCACATTGTGTCTCTATAGTATAGAAAACGGTCATATTTACACTCCTCTTAATGGAAGGGCTCTTGTCCCATTTTCTTGTCGAATTATTTCTATGTGACTAGCTCTTGAAGGTTTCTGCTAATGTGTTAGGCTTCTGGGATGCATATGTTTTTGCGTGTCTCTATAGTATAGAAAGCGATCATATTTACACTCCTCTTAATGGAAGGGCTCTTGTCCCATTTTCTTGTCGAATTATTTCTATGTGACTTGCTATTGAAGGTTTCTGCTAATGTGTTAGGCTTCTGAGAAGCATATGTTTTTACATGTAACAATGTTATAAGTTAATAACAAACATAATTTTGGTTTCCAGATCAATATTATGTGGATTTTATTGTTTGATAATTTTACTATTAGAGTCTTATGATCATTTATCTTTTATGGTGCAAATATGTAGGGCACTGTCTTGCATACATAATTACATTGGTATCTATCATCAGGATATCAATCCTCAGAACTTACTTGTAAAATTTTTTTCCTCACAAGTTTGAGGTTTACATTTGATACTTATTGCATATGAACTTAGAGCATAATGTTCATAATTGTTTCATGTTTACATGCTTTTCTTCTTACATCACCCTAAGAAAAAACCCCCTTTAATGGATCATATCAACAACTTAGTCCAGTGGAGGCTTTTCTCCTTCACCAACGGTTACCCCTCAATTAGAAGGATCAATTTTCAGTAGTTCTTGGTAAAATAGAAGAGGCAATTAGTTGATTCTTGTTTTTTATATCTAAAATATTTGCTTTGTGCTAATCCCCATTATTGCTTCTCTATTTATTGGCATTAATAAACTATGGATACTTTCTACCTAAACTTAGTCTATAAAGTCCCATTTTCCCTCGTCATCGATTGCGAGAAAATAAAATTTTAAAGTTCAATCAAGGCATATCTCTACCCTTGTATTTTTTTTTACTTTCTGTTGCGAAAGTGCTTAAAATTGGGTCTTTTTTACATACATGTCATTTTTAGAGTCTTAATTCTTGAAGCTCAATTTCGACGTTAGTATTGTCATTAGAGTTAACAATTTTATAATTGTAATTGTAGAGTCAACAGGAGTTCGATTTACCTCACATGTCATCAACGTAAAACCGGAAGAGGTTCGTATTTTTGTCTGTTTTATGTTTCTTTAATTCTTCAGTGTATGGATTTGAATTAACTAGAACCAAGTTAGTCTTTCATGGTACTTCCCCATCTAGGAATGGAAGAAGAAAAAGAGACTTAGAGTTTCTATTTTGTTTCTATTTTGTTTCTATTTCAAGGACATGATTCTTAGACTTAAAAGATAAATTTCTTAGTTTTAATGCTATTCTCATTTTTTTTTTGTAGATTTTAAAGAGTTGAAGATAACAATCGGTGAGACTTTGAGTTTGGAGTTATTTGAGAGTTCTTTTAACTAAGGTAAAAGAGTTGAAGATAACAATCGGTGAGACTTTGAGTTTGGAGTTATTTGAGAGTTCTTTTAACTAAGGTAACTCTCTCTCTTGTTTCTTCATTGATTAATTATGATTTAATGCGTCTGCTAGTGATTTAGTATGCTACAAGATGAACACTTATCTGTTCTAAGTTAGCTCTAATTGATTGCTTATTTTTAACTTGACATTGTTGTATTTTGGTTTAAGTTGTGGAATCCAAGTTTGTATTTGAAGCCAAGTTCATAGAAGGCCATTGAGTTTCAAGCTTCTTTAATTAAGTTTATGTTTCTTGAACTAAAATTGTAGTGACCAACTATATGTATGTTCAAGGATATATATGCAATTTGTTAGTTATTTGATTGAAAGTTTGGGTTGATTCAAGAAACTTAAATAGTTTAATTGACAGAAAGCTTAAATTCTTGCTTATGTGATGTTTGAGTTGATCATGTTGTATATCATTGTTGGACTGCAAAACAAACGCAATATAATTATCTTTGACATTTTATAACAAGTTTATATAATAAATTGGACATTATTTTTTATATAATAAATAAAATACTTTTAAAAGCATTGGTTTTTTTTCAAAAAAAAAATTGTTGGAATTTTTAGTGGCGCACTTCAATACGTTGCAAAAGATGCTTGTAACGATTTCTAATTAACCTTTATTAACAACATTATTTGTCACTAGAACATCACATTTAGTGGCGACTACAATACGTCACTAAAAAATATAAATAGACATAACATATGTTACTAAAAGTAAGATTTTAGTAATGCGGAAACATCACTAAAAGTATATCTTTTGCAGCGCGTAATTATGTGTCGCTAAAACTTTTAGCGACGTGGAATTAACGACACTCCTAGCGACGAATGGCTTTGCATCGCTAATGCTTTTAGAGACATATTTTTTGTTTTAGTGACGTTTTTGGTGCGCCACTAAAAACACAATTTCTTGTAGTAATAACACATCAAGGAATGATGTAACACCCAAAAATTTAGGTAATTTAATTATCTTAGATTTATATAGTTATGTTGGAAATTTTGGGTGTTATTTTAAGTAATTGTTGAGAGTTAGGTGTTTTTTTTTTCTTGGGAATTTAGATTTACTAAGTATTTATTGGAAGATTAATTAAATAATTTTTTCTTTAAATTGGAATATTTTTGGTGTTGTTATAGAATGGTTGTTGATGGATTGATATTTGTTAATTATATCTTAAATAATGGAAGAGAATAATAATTATATTAAGGATAATATAATTATTAAGATTTTATGTTTGGTTTTTGAAAAAAAATATTTAAAAAAAGGTGATTTGATGGATTAGAGATAACGACGAGAGAAGGTATTGATTTTTGTTTTTTTGAAAGGTAAAAGAGGAGAAGGAAATAAAATAAAGAAAAGATATAATAATAATAGTATTATTATATATTAATTAGAGACCCTTGTTAAACGTGCAAAGAAGAAAGGGAACTATTCATCTTCTTCCTCCATCATTCATGTTTTGAAACCCTACACGTCGGTCCTATTCTTCTTCTCCGTCCACCATCTCCGGCCGTTGCACAACGCAAGCCGCACCATCTTCTCCATCGCGAATCACCCAACCGTTCGCGTTCAGTCAAGCCGTGCGAAGACTCCATTAGAAAACCCGAGCCAGACTTCTTCATTGTCGGCCTTCACGTCCGTCGGCTTCAGCCACGTCGACGCCTCCATTGACCTGAGCTTCATCAGCGTCTTCATTCCGGCAAGCCTCGCGTCGTCATCCCTTCGCCGCTCCCATCGTCTGAAGAAGCCGAAGCCAACTGCGAAGTTCACAAACCTGATCCGATCTTCAGTCCGAGCCGGATTTCTTCGTCGTCAGCCATTCACGTCTGTCGACTTCAGCTCGTTCGCGCTGCAAGCTCCACTGTTCGGCAAGCTGTTCCTTCACTATAAAGCCGCACGTCTCCAAGTCGCACGCGTGCAAGCCATTCGAGTCGGTCCTCTTTCACGAGCCATGTGCCCGAGCCATCCCTACGAAGTCATCTGTGTCGGTCTCGAATTAACCCAAGCTGCCTCCAAGCCGACCCTTTTTAATCCTAGCCAACCCTTCCTTTTTGAGCCGTTTCCAAGCCACTTCCTTGCAAGGAGCCAAGTTGAGCAAATTCCTTACATTTTGGTAAGTTTTATGGGTTTAGTATACCCATCACAATTAATAATTATTGGTTTGAAATATTTTCACAATTTGATTAAGTTGGTTTATTTACTTGAAGGTTGACTAA

mRNA sequence

ATGGTCAATCTAGGCAGATTTAAGGCAAACATGTTACATATAGCATTTGATTATGAGATCATTGAGTATGGTGTCTTAATTGTTCTCTATGACATATGCTTTGCGCTGGTATGCCAAAATATCAGTTATATTGTAGAACATGTAGTTGGAACCGATTCTTTTGTTGTTGTCTTTCAAGTAAGTAGTAGGGGTATGCGATGCTTATTCTATGATTCTTGCATGTGGCTTCCTTGTGAGTCAACAGGAGTTCGATTTACCTCACATGTCATCAACGTAAAACCGGAAGAGACTTCTTCATTGTCGGCCTTCACGTCCGTCGGCTTCAGCCACGTCGACGCCTCCATTGACCTGAGCTTCATCAGCGTCTTCATTCCGGCAAGCCTCGCGTCGTCATCCCTTCGCCGCTCCCATCGTCTGAAGAAGCCGAAGCCAACTGCGAAGTTCACAAACCTGATCCGATCTTCAGTCCGAGCCGGATTTCTTCGTCGTCAGCCATTCACGTCTGTCGACTTCAGCTCGTTCGCGCTGCAAGCTCCACTGTTCGGCAAGCTGTTCCTTCACTATAAAGCCGCACGTCTCCAAGTCGCACGCGTGCAAGCCATTCGAGTCGGTCCTCTTTCACGAGCCATGTGCCCGAGCCATCCCTACGAAGTCATCTGTGTCGGTCTCGAATTAACCCAAGCTGCCTCCAAGCCGACCCTTTTTAATCCTAGCCAACCCTTCCTTTTTGAGCCGTTTCCAAGCCACTTCCTTGCAAGGAGCCAAGTTGAGCAAATTCCTTACATTTTGGTTGACTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTCAATCTAGGCAGATTTAAGGCAAACATGTTACATATAGCATTTGATTATGAGATCATTGAGTATGGTGTCTTAATTGTTCTCTATGACATATGCTTTGCGCTGGTATGCCAAAATATCAGTTATATTGTAGAACATGTAGTTGGAACCGATTCTTTTGTTGTTGTCTTTCAAGTAAGTAGTAGGGGTATGCGATGCTTATTCTATGATTCTTGCATGTGGCTTCCTTGTGAGTCAACAGGAGTTCGATTTACCTCACATGTCATCAACGTAAAACCGGAAGAGACTTCTTCATTGTCGGCCTTCACGTCCGTCGGCTTCAGCCACGTCGACGCCTCCATTGACCTGAGCTTCATCAGCGTCTTCATTCCGGCAAGCCTCGCGTCGTCATCCCTTCGCCGCTCCCATCGTCTGAAGAAGCCGAAGCCAACTGCGAAGTTCACAAACCTGATCCGATCTTCAGTCCGAGCCGGATTTCTTCGTCGTCAGCCATTCACGTCTGTCGACTTCAGCTCGTTCGCGCTGCAAGCTCCACTGTTCGGCAAGCTGTTCCTTCACTATAAAGCCGCACGTCTCCAAGTCGCACGCGTGCAAGCCATTCGAGTCGGTCCTCTTTCACGAGCCATGTGCCCGAGCCATCCCTACGAAGTCATCTGTGTCGGTCTCGAATTAACCCAAGCTGCCTCCAAGCCGACCCTTTTTAATCCTAGCCAACCCTTCCTTTTTGAGCCGTTTCCAAGCCACTTCCTTGCAAGGAGCCAAGTTGAGCAAATTCCTTACATTTTGGTTGACTAA

Protein sequence

MVNLGRFKANMLHIAFDYEIIEYGVLIVLYDICFALVCQNISYIVEHVVGTDSFVVVFQVSSRGMRCLFYDSCMWLPCESTGVRFTSHVINVKPEETSSLSAFTSVGFSHVDASIDLSFISVFIPASLASSSLRRSHRLKKPKPTAKFTNLIRSSVRAGFLRRQPFTSVDFSSFALQAPLFGKLFLHYKAARLQVARVQAIRVGPLSRAMCPSHPYEVICVGLELTQAASKPTLFNPSQPFLFEPFPSHFLARSQVEQIPYILVD*
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy11G193120.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy11G193120.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy11G193120.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy11G193120.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Chy11G193120Chy11G193120gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy11G193120.1.exon4Chy11G193120.1.exon4exon
Chy11G193120.1.exon3Chy11G193120.1.exon3exon
Chy11G193120.1.exon2Chy11G193120.1.exon2exon
Chy11G193120.1.exon1Chy11G193120.1.exon1exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy11G193120.1.cds4Chy11G193120.1.cds4CDS
Chy11G193120.1.cds3Chy11G193120.1.cds3CDS
Chy11G193120.1.cds2Chy11G193120.1.cds2CDS
Chy11G193120.1.cds1Chy11G193120.1.cds1CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Chy11G193120.1Chy11G193120.1-proteinpolypeptide