CcUC10G202280.1 (mRNA) Watermelon (PI 537277) v1
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Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAAAGTATTTCCTATATGTATATCATTCAGTATACTTGTTCTGTAAAAGATAATGCAACTCAGCATCAAATAAAATTATGAAAGAATATAAGGGCACAAAAACCAACACTCACAAAAAATCCCTAAAGAAAGGGGCTCCAACTAAGTAAATTTTGAGGACCAAAGCCTTTAACAGGTTCCCCATAAGATTACAATTCTCTATTAAATTTTTGTTGAACGTAGATGCCCTTGGTACCTAAATATTGATGATACTCTCATTTTCATATCTTCCACAATTTTCCTATATAATACCATTGCCTTCTGGATGTTTTCTTGAAGGAAAAAAACTCTCAAACCCAATTTGAATTACTGTTGGTTATAAGACTTGGGTACTTCAGCTAAAAAACATTGTGACGAAGATGTGGGAGGAAATCCAATTTGTTTCAAGTTGATGTAGGTCCAATTTCTTCCTACAAGTTCAACCAGTCAAAATGTCCATTAAAATTTAGAAAGAAATTCAGCTAGTCATCACTCTAAATTGGTGATTGGAACTCCTGAGTCTCACTTGAATTTTCTTTTTCCTTTTTATATCCATATCTTAACTATCCTTATGGGACAATCACTTGACCCTATTACATTTGGTTGTCAAGATAACATGTAGAATATTAAATCCTATGTAGGTGGCCACCATGGGATGACCAAGTCGATCCTCATTTGAAATAGAAAACCTTATTCACCCTAAGAAACCCTATCTTGTTGTTTAAAGAAAAAAATGATAGTTTCATCCAAAAAAAAAGAGCAAGGTTAGGGAGATAATGTAACAAGTGTACAAAGAAGCCTAAACTAAAGAATGTAAAGTTCAAATAACAAAATATTTACATCAATAATATAATAATTGTATATATTTTAATATATGCATCGAGTAGATTTCACAAAACTACACATTGAATAGCAAGATAACATGGAAATCTTGATTAACAGCCAAGTGATTATAAGCACTGCAAAGGATATTGTGCCTTATCATCGACCAAACATGTAGAAGCAACCACTTGTAAGGTATTTTCCCTCACAAAATATCAGATTACTAGGTCAAAGGGCCCCTAGGCATACGAGGATCACAAGATGGTTCGGGGAAGATACCATTTTCTTTCCTATCTTTTTGGGCCCTTAATTTGAAGCTTTTATGTAATCACTCTCAATGTTATTAACTAGTTAGAAATCTCTCTTATACCCCACAATCGTTTCTCGTGAATGATATTTCTAAATTTCTTATAAAAAAATGTGAAATTTTTTTTACGTCTTAGGCAAAAGACAAAATTTACTCCCTAAATATCCTGAACTCCCTAAACAAAAGTACACAAAAGTGCTTAATCAACTTAATCTCCCAAGCTTATCTTTTTTTTCTTTTTCTGAAAGGAAACAAAACTTGATATAATGAAAAGAGGCTAATGCTCAAAATACATGGAAACAAAAAAATCCAAGAATAGATGGAATACAATGAAATGTGAGCAAACTCATCCCAATGACAACAATAAAACATAAGAGGAAAATGCCCCCCAAGCTATATGAGTCAATAAACATTTTGGCGAAAAAAGAAAATGACAAGGGAATGACAATTTAACTTGAAATTCTTTTTGGCACTTTGGTTCATAACAAATGCTTAGTTTCACAACTTGAAATCTTTCAGAAATTTGGTGTTGTGCTACCTCGCCAAAGGGATGTTCGTTGACTGAGGAGTTCCTCCTCCATCTGCCTTTCAATGAGAAAGGGCGTTTTTTGTGGTTTGTCATGGTAAGTGCCTTGTTGTGGGATCTTTAGGGGACGAGGAACAACATAGTATTTAGAGGTGTGGATGGGGACCCTTGTGAGGTTTGGTCCTTGGTAAGGTCTCATTTCTCTCTTTGGGCTTCGGTTTCGAAGATTTTTTGTAATTATTCCTAGGCAATATCTTACTTAGTTGGAAACTCTATCGTTTGCTCTTGTATTCTTTCATTCTTTTCTCAATAAAAGCAGTCATTTATTCAAAAAAAAATGCTTAGTTTCACAACTAAAATCAATTTTGTGACAGTTTCATTCGTAAAGTGGAAACAAAATCATAAATTAAATTCATGAAGAAAAGTGTGAACACAATTAATTCTTACATCTAAGAAGCAAGATTTCATCTGCTGCAAGCACGTAGCCAACACTTCATCTTTTCTCTTAGTGCCCTCACTAACTGCTTTCATCTCAAGCTCCATTATTGCTCTAAGGTGTGGTTTCCACAGGTTATACCTAGGAAAAAGAGAATGAAAAAAGAAAACAATTTAGAACTAGAATTATCAACCTGTAAAGGAAGGTAACCGATGAGAGAAAGGATTTGTTTTCTGGAGGGGGGGGGAAAAAAAAGACAATATATAAATAGGTTAAAATAAAACTCTAAGAAGGATATATGAAAGTGCTCCAATTAAGAGAGAGAAATTCAGACAAGAAAATCCCACAAACAATTTGTATAAAGAAGAATATTTTTAGAACACAAGGCCACATTTGTATAATCTATAGAACAAATCCTGTTCAAGTAAGGTCGTGTATAAAGAAGGATATTATTTCTCTGTGATATTTATATCGCTGCTTTTAGCCACAACAATTGATGACGTTCTTTGTATTAATAGGACAGGGTGCTTAACTCTAACTATTTCTTCTAAAGAAATTTCCTTTGCGGTGAAAATTTTTTTTTTTTCTTTTTTGATATCTATGAGCGTCCAGGCCAATTTACACGCACCTCGACTGATCTCACAAGACAACCCATCTGACCCTACAACAGTTGGGTGTCATGGAAACTCGTTGGAAATTAATTCCTAAGTAAGTGGTCACCATGGATTGAACCATTGATCTCTTAGTCATTCATTGAGACTATGTCTCCTTTTTACCACTAGGCCAACCCATGATGGTTGAAAAAAAATATTAATTATAGATTTGAGAATGTACAATTAATACATGTGAATCTTTACACTAATTAACTTCCAGATAGAAAATATCCAGTCATGTGCAAATACCAATCGCCTATCTGACCTTCATACATTATTGATCTTTTACGGTACCAAAAATCAAGCCAAGACACATGCAGTGAAGTCTAATTATGAAAACCATAACAGATTAAAAAAAACTCCATTCCAAAGAGGATTTTCTTCAGAATTTTACTACAAATGATTGGATCACACATTTTGTCATGCTTTAAAATATCGTTGCATCTACCATTATACTCTCAAATATACCCTCTTAATTTCTTTAGTACTTATTTAAAAAGATATGAACTTCTCGTTGATTAATGAAAAGGAACAAAATTGATTGGAGGATACAAGCCCCCAGGGAATAGAGAAAGAACAAAACAAAAAGAAAAAGAAATGAGAAAACAGGAGACCAAAGAGGAACATCATCCCAAACAAACAAGAAGTATAAATGACACAATTTCTTTAGTACTGATCTCAGTTAAATCAGTTTCTCAAATTCCAAAGATAAATTAGTGTTCATTAAGTACCTATTAATTATAAATGTAGATGAGCTTCAAGCTTTTAATGGTGATAGAATCAAAAGCTTAAGCTAATGGATTATGGTAACTTTAATTATATTGACACTTTAACACTCCTCTTCACTTGTGGGCTTGAGAATTTGAAGACCCAACAAGTGGAAATCAATATTAATTGGAGAGGAAATGACATTGCAACGGTCTTTGATGCCATGTTAAATCACTGACTAACCCAAAAGTTTAAGCTGATGAACTACAGGAAATTTAATTAATAGACACTATAACAAAATCTAACAAAGAATTATCTTATTTTCTAAAATATCTAAATGACAAACTACTAGGCTGCTATGATTTTTCTCTATAATACTCTAAAGAAAAGTACTCACCCCATGTCATCATATCCCATAACCAGAGCCTCACCCTGAAAAAATTGTAAAATTTTTAGAACAGAAAAAACTAAATGATTGTAAAGAAAGAAAGCAAACCATAAAGTACTTCAAAAGCTCCTAAAAGATACCGTAAGAAATGTAATCCAACAAAAGATCAAGCGTTAAAATGAGCTTTTGGACTTGCACGGTCTATGCTGCCTATTTCGGCTCCTAAGAGGAGATTTTAATATCATTTGTCGGACACAAGAAGATTCGTGACCAGTAAGAGGAAGTTCAACGACTCCATTATGTCCTTAGAACTCATCAATTATGGAATAAAAATACTATCTAATCAGATTTCAGGGAAGTTTCAATTTATTTCCAGCTGGATAGATTTCCCTTCACAAAAGAGGGGTAGGACAAGTTTTTAAAATTAAAGCGCTATGAAATTTTTAAAGCTTTTCCTAATTTTCTAAAACTATTTGAAGTCACGACGCTTTGGGAATAGGTACAGGGGGAGTTTTGTCACAAGAAGGTCACCCAATTGAATTTTCAATGATAAAAATTAAGTGAGGCCCGTAAAAAATGGAACACCTACAAGCAAGAGTTGTATTCTTTAGTTCATATAGTGAAACAATGGGAACATTATTTACTTAGCAGAAATTATTCTCCTAACAGATCATGTTTCCTTGAAATTTCTTCAATCTCAAAAACAAATCAGTTCTATGCATCTTCATTGGATTCAATATCTTCAACATTCTGACTTCATAATTAAATACACAGCTGGTTCTAGTAATAAGGTGGCCAATGCCTTGAGCATTAGACCTCTGATAGAACTATAATGAATGGTAGTTAACTTTTTCCCATGGTGGTCTTCTCCAATGCTTCCTTGTACGAAAGGTTAGCTTTTATGGGGGCTGGTTGGTTAGGTGAGAAGGTTGTTATAGATGAATAAGAAGTTGGTCAAACCCAGTTTGCATTGCTCCCAACTAGAATGATGAGCTTATTTAAACCCCCATTGACCCCAATCCACAATCTCAACCCAATGTCCCTTTCTATTTGTTTTTCCACCCGAAGCACAAATTCATCAAGTCGTGAGTCCATGAAGAATTTTTGGCTATGAGGGTCATCTGCAAGGGAG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TCTCATTTCTTCCTCCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGAACCAAAACATTTTATTGGAAAAAATGAAAAGAGACTACCTTCGAGAGAGAAGAGAAACAAAGTAAAACGGAGATAGACAAACCTATTGACATACAAAGTAAAGAAAACTCCAAAAAAGTAAACTCTTAAGAACCTAACAAAATAACTCCCGAAGAGAATCCAGTGCTATAGATCACAAAATTTTTAAAACCAACGCCAACAAAAGATCAGTGAGCAACCTAGGACAATAATCTTTGAAAACCAAAAATGTGAGCGTCAATCCACAACCAAATGGGAGCAAGATACCTTGAATTAACAAGGAAACCGAGACTTCAAAATTCAGCAAAAACCAAAGAAACAAACCAACTGCTATGCGTCTACAGGTTCTAAGCTTGCAAACTGCTAGAAAAAAGACAATTGTGAATTCAGGAGTAGAGTATGGGATTTTTTTGGAAATTTGATCGGCCTCCAGTGGTCTAAGCAGGACGATTGGCTGGTGGAGTCCCTCAATGGTTGGGGGCTTAGAGATAACATAAAGGTGTTATGGTCAAATGTGGCTAAAGCAAATGTGTGGTTAATTTGGAAGGAAAGGAGTGATCGGGACTTTAAAGCTAAGTTCAAATCTTTTGTTTATCAACTCACAGCTTCTGATTGGGGTAGCATCACTAGTCCTTTTGTAATTATTCCACTTTAACCACCTAGATTGGAAGGTGTTTTTGTAACCTCTTCTTATCAAGTTAGGAACTCCTTGTCCCTTTACTCGTTAGGTTGTTCTTTTTGTCCCCTTTTTGGAATGAAGTGATCTCTTATTACTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAGAAGAAACAAATGTACTACAAAACCTAATAATTGTGCTTGTTCTGTAAGAAACAAGAGTGGAGAAAATTAACATGCTGGTCTGTCATGTACGTGCAGCTCATCCCAGCTTGCCAATCAACCAAGGCATATTAGCCCTTTTTAAAAATAAAAGATTCAGAAAATTTATGTACAGAACTTACTGCTAGTATCATTCTCCCAGATGTAGAAAACAATTCACCGGCAATATCAATTTCAACAGTAGTCACAGCACCGACTGCTGGCTGTGAGACACATGCAAGGAAATGGCGAACGACTAGCTCATATAATTTCTGTGAAGAAAAAATCTCACAATTATTGATGACAAAGGACTACAAGATGACAATATACAGGACCAAAATAAACACAAATATGCAATTTAAAAGACAGTAAAGCAAAACTTTTACATGGTGATCTTGGCTCCATCCGCATTCCCCAGCCGAGAACTTGGTTGGGTGAATAGGTGGATGGGCTTTGTCATCATGCCCACCACCACTAGGATTCCTCCAAAGTCCTGATCCAGGATCCAGCAACCTTTGTGCATATGCTCCCCATATTTGGTGTTCTTGTTGTTCTCGCACAATGCCCTATATTATTGAAACTCATAAGCACCCATTACGGGCAGGTTTTGGAATGATTTTAAAATGACCAAAATCACTCTTGACATGTCTAAAATCACTTTTCTTCTTGTGATGTTTGGCAATGATGCAAAAGTGTCCAAAATCACTTCAAGTGATTCTAGGTCAATCTTTGGGAGGTGATTTTTCAAGTGATATTGTTATGTGATTGTAAGTGATTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTATCATTTCATATTAAATGATTCTACTCCTATTTCATTTTATTTTATCCAAAAAAATTGGAAAACAATGTATTTTTCATTTTAAAAGTTTTAGCTCAAAACACTTATTCTAAAAGTCAATCCCAAACAAGTCATTGAAAATCACTTTTGGTCATACAAAATCACTTTTAAAAGTATAAAAACAAACATTAAAATGATTGTATGTTAATCACTTTTAACAAATCACTTCTTATTAAATCAATTTTGTTAGAATCATTATTTCTGAAAACACTCCCAAACATGCCATAATTCAACAAGTTGAAGAGAAAAAAGTCTTCCCATTTTTCACGAGAAAATGTTGTGATCGCATGGATAAAGTTAAATATCCATTTGTAAGATAAACGTTATGCATAACTAATAGCTTTAGACTCCGACTTTCAAGTAAACTAGAAAGCTTCCAATTAAACAAAAGTTTTCTTTTAGAATATTATGGGAGAGGTTGTGAACCTACAACCTATAATGGGAAACATCATGGCTGACCACTTGAGCTATACTCAACGAAAACTAAGGAGCCTTTGTTCAAATTCAGTGTTAGTAAAGGCTAATGGTTGATTCCAAAGACGGGAAAACACAAAAGTATTAGACACCTTATCTCACAATAAATACATTATTCCAATGACAGTTCTTTAAGTTTAATTCAATTAAAAAATTTACTGAATCTATGCCCATGGAAAACTAGGAGTTCAGCCAAATAGCTCAAACTCAAATTGTTGGCTCAAGTAAGAAAAAGATGCCAGTGAGATTGGTAGTGGAGACCATCACCAAAACATATACCTACATGAAGATCGGTCCTTTGAGAAAAGCAATCAGTCTCTGTACGAGGATAACTAATGAAACCTGCTTGGTATAGATCTTCAGCCACCTTAAAACAACCAAAAAAATTTAGAGCTTGTTTATTGCCAATATGAAAAGGGTTTAATGGTAAATTAAATAGTGATGTCAATGGTAAATTAAATAGTAATGACACAAACAAGAGATCCATTATTCGTTACCTAGTATACCAATTTCCTTAAAACATTCTTGTATGAGAAACTCAGAATGCTCAATGAAATGAAATAAGTTGATGAATGCAAACATAGTGGTAATGAAGCAAAGTTTTTCTTTTTTGTTTTCTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGATGAAAACGACAACTTTCATAGAGAAAACAAATGAAATAATACAACGGCATAACAAGGACCAAGCCCACAGCAGAAGGGATCCCTACTAAAGAAATTGGCTCCGGCATGCATTATGGATTAGTAATGAAGAAAAGATAAAATCTTGGCTGTAACCTTCATGGTGTGTTCAGAACTCATTCGGAAGTATCGTGAAGCTCGTTTTTCAAGCTCAATTGTATTCAGTGGATGAGGAGGGTACTTTAACGTCTCTTGTCGTCTAACATTTACAACCTAAATAGAATTGAAAGATTATAAGTCCAGACTAAACAGCATGCATTATGGATTATTACACCTGGTTAAATTTCAACATACTCACTGTAGCAGTAGATTCTTGTACGCACATTTCATAAAATACAACAGCACACGTATAATCAAATAGATTCCCTCTTCTGCAAAATGAATAAACCAAATAATTACCAACAGTTACACTTTGACTAGAAAAAGATTGAAATTATCAAATAAATCAAGTCATTTGCAATTTACGTCCAACAAAATGTAGAAATCCCATCGTCAGAATTGTGTGAACAGTTGATCGTCCAAAATTCTTCTGGCTCATGGGATTGAATCTCCCAGTACCGCTCAACAACAAAGCCAAGAGTAGGAAACTACGGACAAAAGGAAGCAAGAAGGCATTCAAGTAAGCATCACCAGCAGTGGAATACAAGTAATTAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAATGCACCTACACATACCTGACATGGCCCATAACTCAAAACAATATTTTTGTCATCTGCGACAGAGTCAATATTAAATGCATCTTTCAACAGCATAGTTTGGAACCTAGTGAAAGAAGCTCCAATTCTTAGATCAATTTCCTGCAAGAGTATAAAAGTAACCGTAGTTATAGTAGTAAACAATTACAACAAAATGGAAGTTCTACAAGAAGTGCAATTACTTGTCTAGCATCAACTGCATCAGCAAACCATTTATTTGGTTGGACAAGATTTTGCACGGCTTCATGAATATCCCTGAACTCGAGATTATCATTTACAATGTAGAAGTAATGAACTTTTGAAAACTACATGGCAAAATAGAAAAGAGGTTTAAGATATGGAACCTTTCAATCAAAGCAGAGAAGTGGGCTCTCTTAATGTTAAGATGATGATTAACTGCTGTGCAAACTTCCACCACTTCAAATGCAATATTCTCTCCTTCTCTATCACAATCAAGCCAAAGGACGAGCCATTGACACCTTCTAGCTTCTTGTTCCAAAGTCCTCTTTATATCCATCTTGTCCTAACAACAGTTTTAACTTCAATGAAAATCCAGCTCACAATTTGACATAAACAGCATGGACTACAATACAGAACTTAAACAGCTTTGTGCCATGACGTGAATTTTAATGGCATGCCCACGTGGCAATTATGGGACTTGTGGGGTGAAAGTTACTTGATGAGGTATGAAAATATTTGTTAGATAGTGCTTGGATGTGGAAGGAGAGTGATCAACAAAAGGAAAAATAAGCTAAGACAAGTTTTTATAGGTTAACAGAGTTTTACAAGTGGGGGGAGCTCAAGGAGAGCAATTAGATTTCTAAGGGTATTTGGCCCAAGGAGTTCGTGGTCCTTTCAGCTAAAAAACATCAATTTTATACTTCATTAACTTCTTACACTATGGGACTCACAAAATCACAATTTCCCAAATTTCACAACCCCTTAGAGTTTACAACTCCACTCCTTGCTCTAAACGCTCCCTTAGAGTTTTTGGAGTACACGTTTCAAGAGAATGATGGAAGCCTATAGGTCTTTGCCTCTTGCCATAGCGATCAACCCAATTTAATGGTGCAGATTGCTTTCTCAATATTTTCCACCTGATCTAATCTACATCCGACATTAAAAATAAAATTAAATAAAAGTCCAAGAATACAAGTGAATGGACAAGCTTAGATATTAAAACATTGTCGATAGCTTTAATTTGCATAAGGGATGTAGTAGTAAAAGTTACATAACCGTAGAGAACTCAAGATTATAATTAGTTCCGTGGAGCTGTTTAAAATCATATTAAAGCCTTGTTTACATGTTTACTTGGTAATCTGAACTCTTGTAAGTAACTTCTTAGCTATCCTACAT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BLAST of CcUC10G202280.1 vs. NCBI nr
Match: PON86227.1 (hypothetical protein TorRG33x02_179460, partial [Trema orientale]) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 1.6e-08 Identity = 34/59 (57.63%), Postives = 43/59 (72.88%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G202280.1 vs. NCBI nr
Match: PON32608.1 (hypothetical protein PanWU01x14_359770 [Parasponia andersonii]) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 3.9e-07 Identity = 33/59 (55.93%), Postives = 41/59 (69.49%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G202280.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5EKY8 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Trema orientale OX=63057 GN=TorRG33x02_179460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 7.6e-09 Identity = 34/59 (57.63%), Postives = 43/59 (72.88%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC10G202280.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5A7U6 (Uncharacterized protein OS=Parasponia andersonii OX=3476 GN=PanWU01x14_359770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 1.9e-07 Identity = 33/59 (55.93%), Postives = 41/59 (69.49%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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