
Tan0020579 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGAAGGGGAATTTTCCGATCAGAATCGCCTTCTTAGATCCATGGAGGATCACAATGGGGAAGATCATGATTTAGAATCGCAAGATGGAAATGGAGTTCATCCAATGAGAAATAACAGTGGAAAACGAGGTGGGTTTTTGGATCTGTTTCATCATCTCAATCGAGGAGGAAGCTTCTCTGGTCGTCGTCTCAGTTATAAGCGTCTTGATTTGGATAATCATGGCGCTAATTTCAGCCCCTCTTCTGTTAATATTGTTGGTAGAAGTCGTACGGCTTCTTCTTCTTCCGATCGTCACATCAATTTCAATTCACATTCTCTTCATGCCTCAACTGCAATCGATGGCGAAATTGACGACAGTGTTGATGATACTGCCGCTCCTGAATGGGCTTTGCTCCTTATTGCTTGTCTCCTTGGCCTCGCCACCGGTCTTTGTGTTGCAGCTTTTAACATTGGGGTTTGTTTCTCTTTTCTTTTCGGCATCTGTATATTTTTCTTGACGTTCTGATTGATGTCTGCAATAATAGTGCAACCCTTTCCTTTCATGCCTTCATTGTTTTTGATAACAAATTTGTTAGTTACTAATGACTTGATAGCTACATGCTTGTCTAATTAACTATTCAAATTTGTACCTGTATTTTGTACATTTGGTTGTTGAAGATGTTAGCAATTTAAGATGAAACCTTAGCTGCAGAAACCTATTTAGGCTCAGCCGAATTCCAAATGTTTTTAGTCACTAGGTGTTACAATGCTTCTAATATTAATAACGATGACGATGAGATTAGTGACTTTGTCTGCCATGTCGTCTTCCTAATCCTTCCCCCGAAAAGAAAGAAAAAGAAAAGTGTTAAAATATTGATATAACTTATAAGTTTAAATTTACCCTAACCTGTTAGCTTAAGTTTTTAAATTAAGTGTTGTTTTTTTTTAAAAAAGAGAATAAAGCCAATATTTCCAACTAAGTTGCATCGACTTGGTGCTAAATTGTTACTCTCCTTTTAGCAATTATGGTTTAAATAATCTTTTGGTGTCTTGGATGAACTTTTTGGCCTCTTGGAAGAACTTTTTGCAATCTCCATTGGCTTGGATTGAATTTCCTCCGTTTTTTTTTAATCAAAAAAATCTATTATTTTGTTGTAATTTTCATTCTTTCTATGAAAATATGTTTTCTGTTAAGGAAGAGCTTAACTAAGCACTTGGATGGCAATAAGCTTTATGTGAATTTTGCTGATGCCATGGTTCTCAAGTAGGTACATGTAATCCATGAGTGGGCCTGGGCTGGCACTCCAAATGAGGGTGCTGCTTGGCTTCGCTTACAGAGAATGGCCGATACTTGGCATCGCATTCTTTTGATACCGGTAACTGGAGGTGTTATAGTGGGTATGATGCATGGTTTGCTTGAGATACTCAGCCAAATAAAACAGTCAAGTACTTCACAGAGGCAAGGATTTGATTTACTTTCTGGAGTCTTTCCTACAGTTAAAGCCATTCAGGCTGCCATCACTTTAGGTACTGGCTGTTCATTGGGGCCTGAAGGACCTAGTGTAGATATTGGGAAATCATGTGCCAACGGATTCTATCTTATGATGGAAAACAACAGTGAAAAGATAAAAATAGCATTTGTTGCAGCCGGTGCAGCAGCTGGAATTGCTTCAGGTATTAGGTTTCCTCCTACCGATTATTCGTCAATATGGATTAATCTTTGTTCAGTGCTAATTCTTTTATGTCCTTTTCTTTTAGGCTTTAATGCAGCTGTTGCGGGTAGCTTCTTTGCAATAGAAACTGTATTAAGGCCTCTGCGTGCAGAAAATTCACCTCCATTTACCACTGCAATGATCATATTGGCATCTGTCATTTCTTCGACGGTCTCAAATGTTTTACTTGGCACACAGTCTGCTTTCACAGTACCTGCTTATGATTTAAAATCTGCTGCAGGTATTTTTGTGACTCTCACCCTTCGGTCTTCGTTTGGTCATTTCAATTAGCCAGCACCATCATCTATTTAATCGGCATCTTTTTGGTGCATGATACTATTCTATGCATGTCATAATCTATTCCATCCTATAATCTATCTATCTATCTATATATATATAAATGATTATTCTTTTACTTTTAAATTTGATGAAGAACATAACAAGCTTCGCTAATCTTGAGAAAATAGGCACAAAATAAAGGACAAGAGAAATAAGATACCTCCTAAAACTTAAATCTCATGGATTTCTAAAAAATAACCACAATCAACATTAATTAGAGAGAGAGAAATTACAAAATTCTGTGAGTAAAACATTGCAACTTAATGCAGTATGCTTTACTATCTCCAGAAACAATGACAGTGAATCCTAGACTAATTATGGAAGATTCTGTTTTCCCTCTCAATTCAATTTCAATCTACCTAAAGTATGACCCACCCAAACCAAAATTGAAGAACAGATGGAAGTGGAATTACATTCAAAGACGGTGCATATTAAATCTTGTTCAATTAGTTCTCTCTGGCCTCTTAACCAATTTTTTCTCTATTTTCTTTGGCCCCAAAGCCCATATCCAAGACGACAGATAAATTTATCAGATATTTCCTATGGGAAGGTTCTGGATCATATGGAAGTTGCTATCAAATTAATGGTATTGGCATCGGAAGAACTAATGAGTTAAATAAGGCTCTTTTTTTGAAATGTGAGGAGATGTTACGAGACCAAAAGATATCTGGGAAGAATTTATTTTTGGAAAACGAGAAATCTCAATGTTTGTTGAAAATAACTTACCACCCAAAAAGACATCTCAGTCATGGAAGCTTGTGGCCATGGAAATGGTTGCTGAAACCATTTTTTTTTTTTGTTTTCCAGTGAGACATCATGGACTTTGTGCACCTTGACTAATCTCACGGTTGGGAAATTTTCAAAATTGAGAAAAAAAAATCACCAGCCAAGAGCTTGAACAAAAACCTAATCATAGGAATTGTCATAAGCAGTGGCGGATCTAGAATTTTTATCGAGGGGGGCTTGAATATGACATTGGAAAAAATTATTTAAAATTGTAAAAACCAGAGATTGAACCTGTGACTTGAGGGGGGGCTTGTAACCTATTAACCACTATGGCAGAAGGCTTTTTTGTTATTTAATATGACTTTTTCTATAGATATTATTAAAGGTGAAAATTTGAGGGGGGGGGGGCTCGAGCCCCCTGGGCCCATGGTAAATCCGCCCCTGGTCAAAAGTAGTTAGTGTCCATAGGCACCAAAAGAGCTGATAAAAATGGTTGTCACGGGAGCTTTCCATTTGAAAGAAGCTAAGAGCAAGATCCAAAATTTGCCAGCTGATTCACATGATATAAGTAAATGCCCTTGGGTTTTTGTATTTTTCATGCACATGATGCACCAATTTGATGAGAAGGCTATGTTAGGAGATCTTATCTGAATAAAGTCGTGTGCTTATGACAGTGTGGTTAAGCTTCTAGAGTAAAAACTTCATTTTCTTAAGATATTTAAGCAGATCTTGCTGTAAAGTAAGTGCTTTTAGCATCATGACTGTGGGAGAGTTTCTTGAACTAAATCTTATGAAAAAGATTTTTGAGAGGTCATACGATTATATATTCATTTGTTATTGAAAGAAGTTGGGGAGATCAGGGGGAGCTTGTGGGGGACGGCAGTCCATTCAGTATTTTCTTCCCCATTTAATAACATTCGGAATTTGTTATCCCATAATAGGTAGCTGATGACTGTGGATCATTGACCATAGCTGCCATGATGGGCTATAGGACACCTACCCGTCATGCCAAAAACTGATATTAATACTCCTTTATGCAAAAGCATCTACCCTTGATGAGCTCAACAAATCTAAAAATAGTTGTCCATAGACCCTTGAAGCAGTGGTGGGGTTTGTTATAGGCAAGGATTTGCATTCATCCTCCCTATTTATCAGTAATTAATCTTCTCGAACGGGAATTTTTTTCTGTCACATATCTTCTAATCCATTTAAATATAAGCACGCACTTGGTTCTTCATTCTTATGTTGCCAATGCTGAGACCCCCACTTAATAATGGGAGTGTAACATTTTTCCCATTAACCAAGCGGATATTTTCCCCCTTTTTAAGATCCATCCATAAGAAAATTTTGAAGATTTTCTTAGGAGGATGGCTGTCAAAATTGGAATAGAGTAGAAAAAAATTACTTGGATGATTGTTAATCTACCATCTTTGGAGATCCTCCCAGGGGTGACCTCATTGGTAAGGGATTGGGGTCTCTTAGTCATACTGGCTTAGAGGTCTCAGGTTCAAGGCCTCGGGTGATTTTAATAAATAAATACCCTTGATGTCTCCTGTGTCTGGGCCTTGGGGCGGGCGGGGTGCCTCCGGTTATAGGGGAGCAAAGCTCCAACTCCCGGTTGTAAAAAAAAAAAATCTACCATCTTTGGGGATATAAGATTAATTCCATTTGAGAAGCTTGCTTTCAACCCTTTTAATTATAGGATACTCCAAAACAATATGGAGTGTTGTCTACCTGTTAAAGGACGTCCCACGTAAGATGATAGCCATCATCCCACCCCTACAGCCCAAAGCATGAGCAATGTTTCTGATGGACTAGGCCTTTAAGTTGATTCCCAGAATTAATGACTTGTCAAAATTTTTATTTTTTTTTAAAAAAAGACAATTTTTATTGATGCGTGAATCCTCTTAAATTTTCTGATAATATTGAAAAGATTCTAGATGCTACTGAAATCATTGCTTGAAAAAAGCAACGTTTTATCTACAAATTGTAAACAATTGATACAACGAGAGCCATTCTCTGGAATGAAGCTAGATATAAGTCCATGCTTAACGCTATGGGAGATTAATCTACTAAGGGAATCAACAATCAATATAAAAAGGAGAGGAGGAGGGGTCCACTTGTCTAAGGCCTCTGGAAGTCAAAATTTTTCCTTTTTATTTATCATTAATGATGATAAAAAGGAAAAAGGCACTGGAGACACTAGCATATATCCACATCCTCCATTTATGGT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ATGGCGGAAGGGGAATTTTCCGATCAGAATCGCCTTCTTAGATCCATGGAGGATCACAATGGGGAAGATCATGATTTAGAATCGCAAGATGGAAATGGAGTTCATCCAATGAGAAATAACAGTGGAAAACGAGGTGGGTTTTTGGATCTGTTTCATCATCTCAATCGAGGAGGAAGCTTCTCTGGTCGTCGTCTCAGTTATAAGCGTCTTGATTTGGATAATCATGGCGCTAATTTCAGCCCCTCTTCTGTTAATATTGTTGGTAGAAGTCGTACGGCTTCTTCTTCTTCCGATCGTCACATCAATTTCAATTCACATTCTCTTCATGCCTCAACTGCAATCGATGGCGAAATTGACGACAGTGTTGATGATACTGCCGCTCCTGAATGGGCTTTGCTCCTTATTGCTTGTCTCCTTGGCCTCGCCACCGGTCTTTGTGTTGCAGCTTTTAACATTGGGGTACATGTAATCCATGAGTGGGCCTGGGCTGGCACTCCAAATGAGGGTGCTGCTTGGCTTCGCTTACAGAGAATGGCCGATACTTGGCATCGCATTCTTTTGATACCGGTAACTGGAGGTGTTATAGTGGGTATGATGCATGGTTTGCTTGAGATACTCAGCCAAATAAAACAGTCAAGTACTTCACAGAGGCAAGGATTTGATTTACTTTCTGGAGTCTTTCCTACAGTTAAAGCCATTCAGGCTGCCATCACTTTAGGTACTGGCTGTTCATTGGGGCCTGAAGGACCTAGTGTAGATATTGGGAAATCATGTGCCAACGGATTCTATCTTATGATGGAAAACAACAGTGAAAAGATAAAAATAGCATTTGTTGCAGCCGGTGCAGCAGCTGGAATTGCTTCAGGCTTTAATGCAGCTGTTGCGGGTAGCTTCTTTGCAATAGAAACTGTATTAAGGCCTCTGCGTGCAGAAAATTCACCTCCATTTACCACTGCAATGATCATATTGGCATCTGTCATTTCTTCGACGGTCTCAAATGTTTTACTTGGCACACAGTCTGCTTTCACAGTACCTGCTTATGATTTAAAATCTGCTGCAGAACTTCCGTTGTACTTGATATTGGGAATGCTATGTGGCGTTGTGAGTGTAGCAGTGACACGTTTAGTTGCTTGGTTCGGTACATCATTTGAGTTCATCAAGGAAAGATTTGGCTTTCCTCCTGTTGTCTGTCCTGCTTTAGGCGGTTTGGGAGCTGGAATAATAGCTCTTAAGTACCCTGGAATCCTTTATTGGGGTTTCACAAACGTTGAAGAAATCCTACATACTGGGAATCGTCCTTCAGCTCCTGGGATTTGGTTATTAACTCAGATAGCAGCTGCAAAAGTTGTGGCTACCGCTCTGTGCAAGGGTTCTGGGCTCGTAGGTGGCCTTTATGCACCCAGTCTAATGATTGGCGCTGCTGTTGGTGCAGTATTTGGGGGCTCAGCTGTTGAAATTATTAATATTGCAATTCCTGGAAATGCAGCTGTCGCACAGCCACAGGCATATGCACTGGTTGGAATGGCTGCTACACTGGCCTCAGTGTGTTCGGTGCCTTTGACATCCGTTCTACTTCTGTTTGAGCTGACAAAGGATTATAGGATACTCCTTCCTCTCATGGGAGCGGTTGGCTTGGCCATATGGGTTCCTTCAGTTACAAAACAGACCAAAGAAATCGAATCAACTGATAAGCGGGGTTCAGCTAGAGGTTATAGCTCTATTTCACCTTCTGAACATAAAGATGGGGCAACTTGGAGGTATGGTAATGGTGACAGTGACTTGGAGCTCTCTGAGGTAGTACATCCATCTGACCGTGAATCTAATTATGAAGATAATCTTCTCGAAGACCTAAAGGTTTCTCAAGCGATGTCAAAGAACTGTCTGAAGGTTTCATTGTCTTTGTACTTGAAAGATGCACTAAAATATATGAAAGATAACCAGCAGAACTGTGCATTAGTGGTTGACGATGATGATTTCCTTGAGGGAATATTGACACATGGTGACATTAAACGATATCTCTTCAAGAAGTATGGTGACGCTCTAAAGGGTGATTCACTGAATGTGGATACGTGTCCCGTGTCCTCTATTTACACTCGAGGGATTAATTATCGTGGGCGAGAACGAGGAATTTTGACATGTTACCCAGACACTGCTCTGGCAACTGCTAAGGAACTAATGGAGGCAAAGGGTGTAAAGCAGTTGCCCGTTGTTAAGCGTGGCAAAGAAAGGAAAAGAAGAATTGTAGCCGTTCTCTACTATGATTCAATATTTAGCTGTCTCAGAGAGGTCATTGATCAAAGGGAAAAAGTATATCCTAGTGGAAAAGAGATAGTCGTCCAGGAGAGCGTTGCAGATGGTCATTAA MAEGEFSDQNRLLRSMEDHNGEDHDLESQDGNGVHPMRNNSGKRGGFLDLFHHLNRGGSFSGRRLSYKRLDLDNHGANFSPSSVNIVGRSRTASSSSDRHINFNSHSLHASTAIDGEIDDSVDDTAAPEWALLLIACLLGLATGLCVAAFNIGVHVIHEWAWAGTPNEGAAWLRLQRMADTWHRILLIPVTGGVIVGMMHGLLEILSQIKQSSTSQRQGFDLLSGVFPTVKAIQAAITLGTGCSLGPEGPSVDIGKSCANGFYLMMENNSEKIKIAFVAAGAAAGIASGFNAAVAGSFFAIETVLRPLRAENSPPFTTAMIILASVISSTVSNVLLGTQSAFTVPAYDLKSAAELPLYLILGMLCGVVSVAVTRLVAWFGTSFEFIKERFGFPPVVCPALGGLGAGIIALKYPGILYWGFTNVEEILHTGNRPSAPGIWLLTQIAAAKVVATALCKGSGLVGGLYAPSLMIGAAVGAVFGGSAVEIINIAIPGNAAVAQPQAYALVGMAATLASVCSVPLTSVLLLFELTKDYRILLPLMGAVGLAIWVPSVTKQTKEIESTDKRGSARGYSSISPSEHKDGATWRYGNGDSDLELSEVVHPSDRESNYEDNLLEDLKVSQAMSKNCLKVSLSLYLKDALKYMKDNQQNCALVVDDDDFLEGILTHGDIKRYLFKKYGDALKGDSLNVDTCPVSSIYTRGINYRGRERGILTCYPDTALATAKELMEAKGVKQLPVVKRGKERKRRIVAVLYYDSIFSCLREVIDQREKVYPSGKEIVVQESVADGH Homology
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RXR2 (Chloride channel protein CLC-f OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CLC-F PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 966.5 bits (2497), Expect = 1.9e-280 Identity = 529/797 (66.37%), Postives = 620/797 (77.79%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GX93 (Chloride channel protein CLC-e OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CLC-E PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 409.8 bits (1052), Expect = 6.8e-113 Identity = 260/619 (42.00%), Postives = 367/619 (59.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8XTT4 (Putative chloride channel protein ClcB-like OS=Ralstonia solanacearum (strain GMI1000) OX=267608 GN=RSp0020 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 146.7 bits (369), Expect = 1.1e-33 Identity = 130/417 (31.18%), Postives = 208/417 (49.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7N6K9 (H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA OS=Vibrio campbellii (strain ATCC BAA-1116 / BB120) OX=338187 GN=clcA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 121.3 bits (303), Expect = 4.8e-26 Identity = 117/439 (26.65%), Postives = 205/439 (46.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q87GZ9 (H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA OS=Vibrio parahaemolyticus serotype O3:K6 (strain RIMD 2210633) OX=223926 GN=clcA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 120.9 bits (302), Expect = 6.3e-26 Identity = 116/438 (26.48%), Postives = 204/438 (46.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. NCBI nr
Match: XP_038904981.1 (chloride channel protein CLC-f [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1434.9 bits (3713), Expect = 0.0e+00 Identity = 740/788 (93.91%), Postives = 760/788 (96.45%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. NCBI nr
Match: XP_008448989.1 (PREDICTED: chloride channel protein CLC-f [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1405.2 bits (3636), Expect = 0.0e+00 Identity = 725/789 (91.89%), Postives = 752/789 (95.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. NCBI nr
Match: XP_031739481.1 (chloride channel protein CLC-f [Cucumis sativus] >KGN55984.1 hypothetical protein Csa_010834 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1404.8 bits (3635), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/788 (92.13%), Postives = 749/788 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. NCBI nr
Match: XP_022143471.1 (chloride channel protein CLC-f isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1395.2 bits (3610), Expect = 0.0e+00 Identity = 712/787 (90.47%), Postives = 748/787 (95.04%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. NCBI nr
Match: XP_023005300.1 (chloride channel protein CLC-f-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1393.6 bits (3606), Expect = 0.0e+00 Identity = 721/790 (91.27%), Postives = 748/790 (94.68%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BLN3 (Chloride channel protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490996 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1405.2 bits (3636), Expect = 0.0e+00 Identity = 725/789 (91.89%), Postives = 752/789 (95.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L4N0 (Chloride channel protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G044490 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1404.8 bits (3635), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/788 (92.13%), Postives = 749/788 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQC2 (Chloride channel protein OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013347 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1395.2 bits (3610), Expect = 0.0e+00 Identity = 712/787 (90.47%), Postives = 748/787 (95.04%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KX22 (Chloride channel protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498341 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1393.6 bits (3606), Expect = 0.0e+00 Identity = 721/790 (91.27%), Postives = 748/790 (94.68%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KYS2 (Chloride channel protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498341 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1387.1 bits (3589), Expect = 0.0e+00 Identity = 721/796 (90.58%), Postives = 748/796 (93.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. TAIR 10
Match: AT1G55620.2 (chloride channel F ) HSP 1 Score: 966.5 bits (2497), Expect = 1.3e-281 Identity = 529/797 (66.37%), Postives = 620/797 (77.79%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. TAIR 10
Match: AT1G55620.1 (chloride channel F ) HSP 1 Score: 803.9 bits (2075), Expect = 1.1e-232 Identity = 424/594 (71.38%), Postives = 489/594 (82.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. TAIR 10
Match: AT4G35440.1 (chloride channel E ) HSP 1 Score: 409.8 bits (1052), Expect = 4.8e-114 Identity = 260/619 (42.00%), Postives = 367/619 (59.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0020579 vs. TAIR 10
Match: AT4G35440.2 (chloride channel E ) HSP 1 Score: 409.8 bits (1052), Expect = 4.8e-114 Identity = 260/619 (42.00%), Postives = 367/619 (59.29%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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